RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000416453.6

GTF3C2-AS1-201, GTF3C2 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene GTF3C2-AS1, Length 863 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 HSPA1LP34931 641 aa14.85□□□□□ -0.03
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 NEUROD1Q13562 356 aa14.85□□□□□ -0.03
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa14.85□□□□□ -0.03
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa14.85□□□□□ -0.03
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 C19orf44Q9H6X5 657 aa14.84□□□□□ -0.03
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 ABCC11Q96J66 1382 aa14.84□□□□□ -0.03
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 MST1RQ04912 1400 aa14.83□□□□□ -0.03
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 FAM135BQ49AJ0 1406 aa14.83□□□□□ -0.03
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 DLC1Q96QB1 1528 aa14.83□□□□□ -0.04
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 ATF3P18847 181 aa14.83□□□□□ -0.04
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 PHLPP1O60346 1717 aa14.83□□□□□ -0.04
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 CADPS2Q86UW7 1296 aa14.82□□□□□ -0.04
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa14.81□□□□□ -0.04
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 FMN2Q9NZ56 1722 aa14.81□□□□□ -0.04
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 WAPLQ7Z5K2 1190 aa14.81□□□□□ -0.04
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 L3MBTL2Q969R5 705 aa14.81□□□□□ -0.04
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 STAC3Q96MF2 364 aa14.81□□□□□ -0.04
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 SLAIN2Q9P270 581 aa14.81□□□□□ -0.04
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 NHSL1Q5SYE7 1610 aa14.8□□□□□ -0.04
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP14.79□□□□□ -0.04
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP14.79□□□□□ -0.04
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 ADGRB2O60241 1585 aa14.78□□□□□ -0.04
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 C1orf167Q5SNV9 1468 aa14.77□□□□□ -0.04
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 TONSLQ96HA7 1378 aa14.77□□□□□ -0.04
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 PRAM1Q96QH2 718 aa14.77□□□□□ -0.05
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 TRAK1Q9UPV9 953 aa14.77□□□□□ -0.05
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP14.76□□□□□ -0.05
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 BRINP3Q76B58 766 aa14.75□□□□□ -0.05
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 NBPF1Q3BBV0 1214 aa14.74□□□□□ -0.05
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 QRICH2Q9H0J4 1663 aa14.74□□□□□ -0.05
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 USP32Q8NFA0 1604 aa14.74□□□□□ -0.05
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 SIRT1Q96EB6 747 aa14.73□□□□□ -0.05
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 POGKQ9P215 609 aa14.73□□□□□ -0.05
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 KIF1AQ12756 1690 aa14.71□□□□□ -0.05
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 NUTM2FA1L443 756 aa14.71□□□□□ -0.05
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 SHPRHQ149N8 1683 aa14.71□□□□□ -0.06
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 NBPF8Q3BBV2 869 aa14.7□□□□□ -0.06
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 RALGAPBQ86X10 1494 aa14.69□□□□□ -0.06
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 ORAI2Q96SN7 254 aa14.69□□□□□ -0.06
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 TULP4Q9NRJ4 1543 aa14.68□□□□□ -0.06
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 ITSN1Q15811 1721 aa14.67□□□□□ -0.06
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa14.66□□□□□ -0.06
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 JCADQ9P266 1359 aa14.66□□□□□ -0.06
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 ESCO1Q5FWF5 840 aa14.66□□□□□ -0.06
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 ANKARQ7Z5J8 1434 aa14.66□□□□□ -0.06
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 GPRASP1Q5JY77 1395 aa14.65□□□□□ -0.06
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 CLSPNQ9HAW4 1339 aa14.65□□□□□ -0.06
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 ATP7BP35670 1465 aa14.64□□□□□ -0.07
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 PXDNQ92626 1479 aa14.64□□□□□ -0.07
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 DISP3Q9P2K9 1392 aa14.64□□□□□ -0.07
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 LRP6O75581 1613 aa14.63□□□□□ -0.07
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 PRR36Q9H6K5 1346 aa14.63□□□□□ -0.07
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 WASLO00401 505 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 RNF39Q9H2S5 420 aa14.62□□□□□ -0.07
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 NPHP3Q7Z494 1330 aa14.61□□□□□ -0.07
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 PNPLA6Q8IY17 1366 aa14.6□□□□□ -0.07
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 FOXO3O43524 673 aa14.59□□□□□ -0.07
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 CARD11Q9BXL7 1154 aa14.59□□□□□ -0.07
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 PHF8Q9UPP1 1060 aa14.59□□□□□ -0.07
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa14.57□□□□□ -0.08
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 CDK19Q9BWU1 502 aa14.57□□□□□ -0.08
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa14.57□□□□□ -0.08
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 ABCA3Q99758 1704 aa14.57□□□□□ -0.08
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 TNS3Q68CZ2 1445 aa14.55□□□□□ -0.08
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 ALS2Q96Q42 1657 aa14.55□□□□□ -0.08
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 CABP2Q9NPB3 220 aa14.54□□□□□ -0.08
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa14.53□□□□□ -0.08
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa14.53□□□□□ -0.08
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 KRT28Q7Z3Y7 464 aa14.53□□□□□ -0.08
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa14.53□□□□□ -0.08
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 USP47Q96K76 1375 aa14.51□□□□□ -0.09
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa14.51□□□□□ -0.09
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 EVC2Q86UK5 1308 aa14.51□□□□□ -0.09
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa14.51□□□□□ -0.09
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 AKAP12Q02952 1782 aa14.5□□□□□ -0.09
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 SBNO1A3KN83 1393 aa14.5□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.7 ms