RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000412161.1

SYNE1-AS1-201, SYNE1 antisense RNA 1, humanhuman

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Gene SYNE1-AS1, Length 553 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP12.38□□□□□ -0.43
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa12.37□□□□□ -0.43
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP12.37□□□□□ -0.43
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP12.37□□□□□ -0.43
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 C1orf167Q5SNV9 1468 aa12.36□□□□□ -0.43
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP12.36□□□□□ -0.43
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 FMN2Q9NZ56 1722 aa12.36□□□□□ -0.43
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 CLSPNQ9HAW4 1339 aa12.36□□□□□ -0.43
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 KIF1AQ12756 1690 aa12.35□□□□□ -0.43
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 TMEM132EQ6IEE7 984 aa12.35□□□□□ -0.43
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa12.35□□□□□ -0.43
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 BRINP3Q76B58 766 aa12.34□□□□□ -0.43
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 STK26Q9P289 416 aa12.34□□□□□ -0.43
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 SHPRHQ149N8 1683 aa12.34□□□□□ -0.43
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP12.34□□□□□ -0.43
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 JCADQ9P266 1359 aa12.33□□□□□ -0.44
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ANKARQ7Z5J8 1434 aa12.33□□□□□ -0.44
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa12.33□□□□□ -0.44
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 POGKQ9P215 609 aa12.32□□□□□ -0.44
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 TONSLQ96HA7 1378 aa12.31□□□□□ -0.44
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 L3MBTL2Q969R5 705 aa12.31□□□□□ -0.44
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa12.3□□□□□ -0.44
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 WAPLQ7Z5K2 1190 aa12.3□□□□□ -0.44
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 PRAM1Q96QH2 718 aa12.3□□□□□ -0.44
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa12.3□□□□□ -0.44
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 NPHP3Q7Z494 1330 aa12.3□□□□□ -0.44
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ITSN1Q15811 1721 aa12.29□□□□□ -0.44
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 TULP4Q9NRJ4 1543 aa12.29□□□□□ -0.44
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP12.28□□□□□ -0.44
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP12.28□□□□□ -0.44
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 SIN3AQ96ST3 1273 aa12.28□□□□□ -0.44
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa12.28□□□□□ -0.44
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 TRAK1Q9UPV9 953 aa12.28□□□□□ -0.44
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 GPRASP1Q5JY77 1395 aa12.28□□□□□ -0.44
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 DISP3Q9P2K9 1392 aa12.28□□□□□ -0.44
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 NEUROD1Q13562 356 aa12.27□□□□□ -0.45
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 RALGAPBQ86X10 1494 aa12.27□□□□□ -0.45
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP12.26□□□□□ -0.45
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP12.26□□□□□ -0.45
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP12.26□□□□□ -0.45
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ESCO1Q5FWF5 840 aa12.25□□□□□ -0.45
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 PXDNQ92626 1479 aa12.25□□□□□ -0.45
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 QRICH2Q9H0J4 1663 aa12.25□□□□□ -0.45
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 USP32Q8NFA0 1604 aa12.24□□□□□ -0.45
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP12.24□□□□□ -0.45
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP12.23□□□□□ -0.45
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa12.23□□□□□ -0.45
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 WASLO00401 505 aaPredicted RBP12.23□□□□□ -0.45
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ORAI2Q96SN7 254 aa12.23□□□□□ -0.45
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 PCGF6Q9BYE7 350 aa12.23□□□□□ -0.45
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP12.23□□□□□ -0.45
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa12.22□□□□□ -0.45
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ATP7BP35670 1465 aa12.22□□□□□ -0.45
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 PNPLA6Q8IY17 1366 aa12.22□□□□□ -0.45
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP12.22□□□□□ -0.45
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 NBPF1Q3BBV0 1214 aa12.22□□□□□ -0.45
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP12.22□□□□□ -0.45
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP12.21□□□□□ -0.45
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 SLC24A1O60721 1099 aa12.21□□□□□ -0.45
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 PHF8Q9UPP1 1060 aa12.21□□□□□ -0.45
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 SBNO1A3KN83 1393 aa12.2□□□□□ -0.46
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 PSME1Q06323 249 aa12.2□□□□□ -0.46
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ARHGEF10O15013 1369 aa12.19□□□□□ -0.46
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 TNS3Q68CZ2 1445 aa12.19□□□□□ -0.46
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP12.18□□□□□ -0.46
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 FOXO3O43524 673 aa12.18□□□□□ -0.46
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 LRP6O75581 1613 aa12.18□□□□□ -0.46
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 EVC2Q86UK5 1308 aa12.17□□□□□ -0.46
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP12.17□□□□□ -0.46
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 CARD11Q9BXL7 1154 aa12.17□□□□□ -0.46
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP12.17□□□□□ -0.46
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP12.17□□□□□ -0.46
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa12.16□□□□□ -0.46
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 NUTM2FA1L443 756 aa12.16□□□□□ -0.46
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 NBPF8Q3BBV2 869 aa12.16□□□□□ -0.46
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP12.16□□□□□ -0.46
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 CCDC61Q9Y6R9 512 aa12.16□□□□□ -0.46
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP12.16□□□□□ -0.46
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 PRR36Q9H6K5 1346 aa12.15□□□□□ -0.46
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 KRT28Q7Z3Y7 464 aa12.15□□□□□ -0.46
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP12.15□□□□□ -0.46
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP12.15□□□□□ -0.46
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 CDK19Q9BWU1 502 aa12.15□□□□□ -0.46
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ALS2Q96Q42 1657 aa12.15□□□□□ -0.46
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ATAD2Q6PL18 1390 aa12.15□□□□□ -0.46
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 PLEKHG3A1L390 1219 aa12.14□□□□□ -0.47
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP12.14□□□□□ -0.47
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP12.13□□□□□ -0.47
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP12.13□□□□□ -0.47
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP12.13□□□□□ -0.47
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP12.13□□□□□ -0.47
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ABCA3Q99758 1704 aa12.13□□□□□ -0.47
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa12.11□□□□□ -0.47
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP12.11□□□□□ -0.47
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 NINLQ9Y2I6 1382 aa12.11□□□□□ -0.47
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa12.11□□□□□ -0.47
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 NWD2Q9ULI1 1742 aa12.1□□□□□ -0.47
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP12.09□□□□□ -0.47
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa12.09□□□□□ -0.47
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP12.09□□□□□ -0.47
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