RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000392991.8

OLFM1-208, Transcript of olfactomedin 1, human

TSL 2 BASIC

Gene OLFM1, Length 1,057 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
OLFM1-208	ENST00000392991	TONSL	Q96HA7	1378 aa		45.8	■■■■■ 4.92
OLFM1-208	ENST00000392991	NBPF1	Q3BBV0	1214 aa		45.79	■■■■■ 4.92
OLFM1-208	ENST00000392991	PRAM1	Q96QH2	718 aa		45.79	■■■■■ 4.92
OLFM1-208	ENST00000392991	TRPM1	Q7Z4N2	1603 aa		45.74	■■■■■ 4.91
OLFM1-208	ENST00000392991	ARHGEF28	Q8N1W1	1705 aa	Known RBP	45.73	■■■■■ 4.91
OLFM1-208	ENST00000392991	C1orf167	Q5SNV9	1468 aa		45.72	■■■■■ 4.91
OLFM1-208	ENST00000392991	SAFB2	Q14151	953 aa	Known RBP eCLIP	45.7	■■■■■ 4.91
OLFM1-208	ENST00000392991	BRINP3	Q76B58	766 aa		45.7	■■■■■ 4.91
OLFM1-208	ENST00000392991	POGK	Q9P215	609 aa		45.69	■■■■■ 4.9
OLFM1-208	ENST00000392991	NBPF8	Q3BBV2	869 aa		45.68	■■■■■ 4.9
OLFM1-208	ENST00000392991	CLSPN	Q9HAW4	1339 aa		45.68	■■■■■ 4.9
OLFM1-208	ENST00000392991	AHDC1	Q5TGY3	1603 aa	Predicted RBP	45.63	■■■■■ 4.9
OLFM1-208	ENST00000392991	FMN2	Q9NZ56	1722 aa		45.63	■■■■■ 4.89
OLFM1-208	ENST00000392991	ADGRB2	O60241	1585 aa		45.62	■■■■■ 4.89
OLFM1-208	ENST00000392991	PHLPP1	O60346	1717 aa		45.62	■■■■■ 4.89
OLFM1-208	ENST00000392991	COL16A1	Q07092	1604 aa	Predicted RBP	45.56	■■■■■ 4.88
OLFM1-208	ENST00000392991	ROCK2	O75116	1388 aa	Known RBP	45.56	■■■■■ 4.88
OLFM1-208	ENST00000392991	NHSL1	Q5SYE7	1610 aa		45.55	■■■■■ 4.88
OLFM1-208	ENST00000392991	CCER1	Q8TC90	406 aa	Predicted RBP	45.54	■■■■■ 4.88
OLFM1-208	ENST00000392991	ORAI2	Q96SN7	254 aa		45.54	■■■■■ 4.88
OLFM1-208	ENST00000392991	MINK1	Q8N4C8	1332 aa	Predicted RBP	45.53	■■■■■ 4.88
OLFM1-208	ENST00000392991	HIRIP3	Q9BW71	556 aa	Predicted RBP	45.52	■■■■■ 4.88
OLFM1-208	ENST00000392991	GPRASP1	Q5JY77	1395 aa		45.51	■■■■■ 4.88
OLFM1-208	ENST00000392991	NUTM2F	A1L443	756 aa		45.51	■■■■■ 4.88
OLFM1-208	ENST00000392991	RALGAPB	Q86X10	1494 aa		45.49	■■■■■ 4.87
OLFM1-208	ENST00000392991	DDX17	Q92841	729 aa	Known RBP	45.45	■■■■■ 4.87
OLFM1-208	ENST00000392991	ESCO1	Q5FWF5	840 aa		45.44	■■■■■ 4.86
OLFM1-208	ENST00000392991	USP32	Q8NFA0	1604 aa		45.43	■■■■■ 4.86
OLFM1-208	ENST00000392991	CENPJ	Q9HC77	1338 aa	Predicted RBP	45.4	■■■■■ 4.86
OLFM1-208	ENST00000392991	WASL	O00401	505 aa	Predicted RBP	45.39	■■■■■ 4.86
OLFM1-208	ENST00000392991	RGPD8	O14715	1765 aa	Predicted RBP	45.39	■■■■■ 4.86
OLFM1-208	ENST00000392991	ANKAR	Q7Z5J8	1434 aa		45.39	■■■■■ 4.86
OLFM1-208	ENST00000392991	TIMELESS	Q9UNS1	1208 aa		45.38	■■■■■ 4.86
OLFM1-208	ENST00000392991	QRICH2	Q9H0J4	1663 aa		45.37	■■■■■ 4.85
OLFM1-208	ENST00000392991	TULP4	Q9NRJ4	1543 aa		45.37	■■■■■ 4.85
OLFM1-208	ENST00000392991	KIF1A	Q12756	1690 aa		45.34	■■■■■ 4.85
OLFM1-208	ENST00000392991	JCAD	Q9P266	1359 aa		45.34	■■■■■ 4.85
OLFM1-208	ENST00000392991	EIF3A	Q14152	1382 aa	Known RBP	45.33	■■■■■ 4.85
OLFM1-208	ENST00000392991	CARD11	Q9BXL7	1154 aa		45.33	■■■■■ 4.85
OLFM1-208	ENST00000392991	MED1	Q15648	1581 aa	Predicted RBP	45.33	■■■■■ 4.85
OLFM1-208	ENST00000392991	PRR36	Q9H6K5	1346 aa		45.32	■■■■■ 4.85
OLFM1-208	ENST00000392991	SOS2	Q07890	1332 aa	Predicted RBP	45.29	■■■■■ 4.84
OLFM1-208	ENST00000392991	SHPRH	Q149N8	1683 aa		45.28	■■■■■ 4.84
OLFM1-208	ENST00000392991	NPHP3	Q7Z494	1330 aa		45.27	■■■■■ 4.84
OLFM1-208	ENST00000392991	PXDN	Q92626	1479 aa		45.27	■■■■■ 4.84
OLFM1-208	ENST00000392991	FOXO3	O43524	673 aa		45.26	■■■■■ 4.84
OLFM1-208	ENST00000392991	PHF8	Q9UPP1	1060 aa		45.26	■■■■■ 4.84
OLFM1-208	ENST00000392991	ATP7B	P35670	1465 aa		45.25	■■■■■ 4.83
OLFM1-208	ENST00000392991	CDK19	Q9BWU1	502 aa		45.25	■■■■■ 4.83
OLFM1-208	ENST00000392991	LRRC59	Q96AG4	307 aa	Known RBP	45.22	■■■■■ 4.83
OLFM1-208	ENST00000392991	XPC	Q01831	940 aa	Predicted RBP	45.18	■■■■■ 4.82
OLFM1-208	ENST00000392991	NUDT16	Q96DE0	195 aa	Known RBP	45.17	■■■■■ 4.82
OLFM1-208	ENST00000392991	TOPAZ1	Q8N9V7	1692 aa		45.15	■■■■■ 4.82
OLFM1-208	ENST00000392991	ITSN1	Q15811	1721 aa		45.15	■■■■■ 4.82
OLFM1-208	ENST00000392991	PMFBP1	Q8TBY8	1022 aa		45.15	■■■■■ 4.82
OLFM1-208	ENST00000392991	PNPLA6	Q8IY17	1366 aa		45.15	■■■■■ 4.82
OLFM1-208	ENST00000392991	DISP3	Q9P2K9	1392 aa		45.13	■■■■■ 4.82
OLFM1-208	ENST00000392991	SPATA31A6	Q5VVP1	1343 aa		45.12	■■■■■ 4.81
OLFM1-208	ENST00000392991	LRP6	O75581	1613 aa		45.1	■■■■■ 4.81
OLFM1-208	ENST00000392991	SBNO2	Q9Y2G9	1366 aa		45.09	■■■■■ 4.81
OLFM1-208	ENST00000392991	CABP2	Q9NPB3	220 aa		45.09	■■■■■ 4.81
OLFM1-208	ENST00000392991	SRPK2	P78362	688 aa	Known RBP	45.08	■■■■■ 4.81
OLFM1-208	ENST00000392991	KRT28	Q7Z3Y7	464 aa		45.07	■■■■■ 4.81
OLFM1-208	ENST00000392991	EVC2	Q86UK5	1308 aa		45.06	■■■■■ 4.8
OLFM1-208	ENST00000392991	CCDC61	Q9Y6R9	512 aa		45.04	■■■■■ 4.8
OLFM1-208	ENST00000392991	COL22A1	Q8NFW1	1626 aa	Predicted RBP	45.03	■■■■■ 4.8
OLFM1-208	ENST00000392991	PSME1	Q06323	249 aa		45	■■■■■ 4.79
OLFM1-208	ENST00000392991	SPATA31A3	Q5VYP0	1347 aa		45	■■■■■ 4.79
OLFM1-208	ENST00000392991	TRPM3	Q9HCF6	1732 aa	Predicted RBP	44.98	■■■■■ 4.79
OLFM1-208	ENST00000392991	USP47	Q96K76	1375 aa		44.98	■■■■■ 4.79
OLFM1-208	ENST00000392991	SBNO1	A3KN83	1393 aa		44.97	■■■■■ 4.79
OLFM1-208	ENST00000392991	NGDN	Q8NEJ9	315 aa	Known RBP	44.97	■■■■■ 4.79
OLFM1-208	ENST00000392991	TNS3	Q68CZ2	1445 aa		44.97	■■■■■ 4.79
OLFM1-208	ENST00000392991	PPIP5K1	Q6PFW1	1433 aa		44.97	■■■■■ 4.79
OLFM1-208	ENST00000392991	ST20-MTHFS	A0A0A6YYL1	179 aa		44.96	■■■■■ 4.79
OLFM1-208	ENST00000392991	PLEKHG3	A1L390	1219 aa		44.96	■■■■■ 4.79
OLFM1-208	ENST00000392991	POLR3A	O14802	1390 aa	Predicted RBP	44.95	■■■■■ 4.79
OLFM1-208	ENST00000392991	NUTM2B	A6NNL0	878 aa	Predicted RBP	44.95	■■■■■ 4.79
OLFM1-208	ENST00000392991	NUTM2E	B1AL46	878 aa	Predicted RBP	44.95	■■■■■ 4.79
OLFM1-208	ENST00000392991	NUTM2A	Q8IVF1	878 aa	Predicted RBP	44.95	■■■■■ 4.79
OLFM1-208	ENST00000392991	TESK2	Q96S53	571 aa		44.92	■■■■■ 4.78
OLFM1-208	ENST00000392991	PHF23	Q9BUL5	403 aa	Predicted RBP	44.91	■■■■■ 4.78
OLFM1-208	ENST00000392991	ACE	P12821	1306 aa		44.91	■■■■■ 4.78
OLFM1-208	ENST00000392991	ALS2	Q96Q42	1657 aa		44.86	■■■■■ 4.77
OLFM1-208	ENST00000392991	CABP1	Q9NZU7	370 aa		44.85	■■■■■ 4.77
OLFM1-208	ENST00000392991	ATAD2	Q6PL18	1390 aa		44.84	■■■■■ 4.77
OLFM1-208	ENST00000392991	MEX3C	Q5U5Q3	659 aa	Known RBP	44.84	■■■■■ 4.77
OLFM1-208	ENST00000392991	RGS17	Q9UGC6	210 aa	Predicted RBP	44.83	■■■■■ 4.77
OLFM1-208	ENST00000392991	ARHGEF10	O15013	1369 aa		44.82	■■■■■ 4.77
OLFM1-208	ENST00000392991	LMOD2	Q6P5Q4	547 aa		44.78	■■■■■ 4.76
OLFM1-208	ENST00000392991	ADAMTS2	O95450	1211 aa		44.75	■■■■■ 4.75
OLFM1-208	ENST00000392991	PAK3	O75914	559 aa	Predicted RBP	44.74	■■■■■ 4.75
OLFM1-208	ENST00000392991	ABCA3	Q99758	1704 aa		44.74	■■■■■ 4.75
OLFM1-208	ENST00000392991	SLC24A1	O60721	1099 aa		44.71	■■■■■ 4.75
OLFM1-208	ENST00000392991	PUS7	Q96PZ0	661 aa	Known RBP	44.71	■■■■■ 4.75
OLFM1-208	ENST00000392991	USP6	P35125	1406 aa		44.7	■■■■■ 4.75
OLFM1-208	ENST00000392991	CABLES1	Q8TDN4	633 aa		44.7	■■■■■ 4.75
OLFM1-208	ENST00000392991	AKAP12	Q02952	1782 aa		44.69	■■■■■ 4.74
OLFM1-208	ENST00000392991	C8orf37	Q96NL8	207 aa		44.68	■■■■■ 4.74
OLFM1-208	ENST00000392991	MARF1	Q9Y4F3	1742 aa	Known RBP	44.67	■■■■■ 4.74

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