RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384154.1

RNU6-190P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 190, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-190P, Length 102 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-190P-201ENST00000384154 ST8SIA5O15466 376 aa6.72□□□□□ -1.33
RNU6-190P-201ENST00000384154 CTC1Q2NKJ3 1217 aa6.71□□□□□ -1.34
RNU6-190P-201ENST00000384154 MORN1Q5T089 497 aa6.71□□□□□ -1.34
RNU6-190P-201ENST00000384154 RSPH4AQ5TD94 716 aa6.71□□□□□ -1.34
RNU6-190P-201ENST00000384154 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
RNU6-190P-201ENST00000384154 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
RNU6-190P-201ENST00000384154 FAM160A2Q8N612 972 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
RNU6-190P-201ENST00000384154 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
RNU6-190P-201ENST00000384154 WIPF1O43516 503 aa6.67□□□□□ -1.34
RNU6-190P-201ENST00000384154 PUS10Q3MIT2 529 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
RNU6-190P-201ENST00000384154 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
RNU6-190P-201ENST00000384154 PHOX2BQ99453 314 aa6.67□□□□□ -1.34
RNU6-190P-201ENST00000384154 CLCN1P35523 988 aa6.66□□□□□ -1.34
RNU6-190P-201ENST00000384154 ATP6V1AP38606 617 aa6.66□□□□□ -1.34
RNU6-190P-201ENST00000384154 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
RNU6-190P-201ENST00000384154 MSS51Q4VC12 460 aa6.66□□□□□ -1.34
RNU6-190P-201ENST00000384154 BRICD5Q6PL45 260 aa6.66□□□□□ -1.34
RNU6-190P-201ENST00000384154 DACH1Q9UI36 760 aa6.66□□□□□ -1.34
RNU6-190P-201ENST00000384154 FCF1Q9Y324 198 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
RNU6-190P-201ENST00000384154 AXIN1O15169 862 aa6.65□□□□□ -1.34
RNU6-190P-201ENST00000384154 GCGRP47871 477 aa6.65□□□□□ -1.34
RNU6-190P-201ENST00000384154 FUT2Q10981 343 aa6.65□□□□□ -1.34
RNU6-190P-201ENST00000384154 FOXC1Q12948 553 aa6.65□□□□□ -1.34
RNU6-190P-201ENST00000384154 GPCPD1Q9NPB8 672 aa6.65□□□□□ -1.34
RNU6-190P-201ENST00000384154 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
RNU6-190P-201ENST00000384154 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
RNU6-190P-201ENST00000384154 DDRGK1Q96HY6 314 aa6.64□□□□□ -1.35
RNU6-190P-201ENST00000384154 REPIN1Q9BWE0 567 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
RNU6-190P-201ENST00000384154 SLC27A5Q9Y2P5 690 aa6.64□□□□□ -1.35
RNU6-190P-201ENST00000384154 PLEKHG3A1L390 1219 aa6.63□□□□□ -1.35
RNU6-190P-201ENST00000384154 WNT7AO00755 349 aa6.63□□□□□ -1.35
RNU6-190P-201ENST00000384154 WFS1O76024 890 aa6.63□□□□□ -1.35
RNU6-190P-201ENST00000384154 CYP4X1Q8N118 509 aa6.63□□□□□ -1.35
RNU6-190P-201ENST00000384154 FAM117AQ9C073 453 aa6.63□□□□□ -1.35
RNU6-190P-201ENST00000384154 GMPR2Q9P2T1 348 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
RNU6-190P-201ENST00000384154 MS4A1P11836 297 aa6.62□□□□□ -1.35
RNU6-190P-201ENST00000384154 MMP16P51512 607 aa6.62□□□□□ -1.35
RNU6-190P-201ENST00000384154 STK17AQ9UEE5 414 aa6.62□□□□□ -1.35
RNU6-190P-201ENST00000384154 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
RNU6-190P-201ENST00000384154 SMPD1P17405 629 aa6.61□□□□□ -1.35
RNU6-190P-201ENST00000384154 SULF1Q8IWU6 871 aa6.61□□□□□ -1.35
RNU6-190P-201ENST00000384154 NLRP7Q8WX94 980 aa6.61□□□□□ -1.35
RNU6-190P-201ENST00000384154 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
RNU6-190P-201ENST00000384154 LCE2CQ5TA81 110 aa6.6□□□□□ -1.35
RNU6-190P-201ENST00000384154 SNIP1Q8TAD8 396 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
RNU6-190P-201ENST00000384154 IL27Q8NEV9 243 aa6.59□□□□□ -1.35
RNU6-190P-201ENST00000384154 PRDM9Q9NQV7 894 aa6.59□□□□□ -1.35
RNU6-190P-201ENST00000384154 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa6.59□□□□□ -1.35
RNU6-190P-201ENST00000384154 RDH13Q8NBN7 331 aa6.58□□□□□ -1.36
RNU6-190P-201ENST00000384154 TRIM47Q96LD4 638 aa6.58□□□□□ -1.36
RNU6-190P-201ENST00000384154 ATP13A2Q9NQ11 1180 aa6.58□□□□□ -1.36
RNU6-190P-201ENST00000384154 DDX11L8A8MPP1 907 aa6.57□□□□□ -1.36
RNU6-190P-201ENST00000384154 INSM1Q01101 510 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
RNU6-190P-201ENST00000384154 TRIM32Q13049 653 aa6.57□□□□□ -1.36
RNU6-190P-201ENST00000384154 SH3D19Q5HYK7 790 aa6.57□□□□□ -1.36
RNU6-190P-201ENST00000384154 RNF19BQ6ZMZ0 732 aa6.57□□□□□ -1.36
RNU6-190P-201ENST00000384154 GOPCQ9HD26 462 aa6.57□□□□□ -1.36
RNU6-190P-201ENST00000384154 ZBTB24O43167 697 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
RNU6-190P-201ENST00000384154 DXOO77932 396 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
RNU6-190P-201ENST00000384154 SSTR3P32745 418 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
RNU6-190P-201ENST00000384154 Q3C1V9 767 aa6.56□□□□□ -1.36
RNU6-190P-201ENST00000384154 GRIPAP1Q4V328 841 aa6.56□□□□□ -1.36
RNU6-190P-201ENST00000384154 TTC24A2A3L6 582 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
RNU6-190P-201ENST00000384154 TERTO14746 1132 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
RNU6-190P-201ENST00000384154 MRGPRX2Q96LB1 330 aa6.55□□□□□ -1.36
RNU6-190P-201ENST00000384154 BEGAINQ9BUH8 593 aa6.55□□□□□ -1.36
RNU6-190P-201ENST00000384154 SENP2Q9HC62 589 aa6.55□□□□□ -1.36
RNU6-190P-201ENST00000384154 SNRPBP14678 240 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
RNU6-190P-201ENST00000384154 CD46P15529 392 aa6.54□□□□□ -1.36
RNU6-190P-201ENST00000384154 WNT7BP56706 349 aa6.53□□□□□ -1.36
RNU6-190P-201ENST00000384154 KIFC2Q96AC6 838 aa6.53□□□□□ -1.36
RNU6-190P-201ENST00000384154 ERICH6Q7L0X2 663 aa6.52□□□□□ -1.37
RNU6-190P-201ENST00000384154 USB1Q9BQ65 265 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
RNU6-190P-201ENST00000384154 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa6.52□□□□□ -1.37
RNU6-190P-201ENST00000384154 J3QL48 77 aa6.51□□□□□ -1.37
RNU6-190P-201ENST00000384154 MYSM1Q5VVJ2 828 aa6.51□□□□□ -1.37
RNU6-190P-201ENST00000384154 NPAS3Q8IXF0 933 aa6.51□□□□□ -1.37
RNU6-190P-201ENST00000384154 RSPH6AQ9H0K4 717 aa6.51□□□□□ -1.37
RNU6-190P-201ENST00000384154 USP46P62068 366 aa6.5□□□□□ -1.37
RNU6-190P-201ENST00000384154 SKOR1P84550 965 aa6.5□□□□□ -1.37
RNU6-190P-201ENST00000384154 HPS1Q92902 700 aa6.5□□□□□ -1.37
RNU6-190P-201ENST00000384154 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
RNU6-190P-201ENST00000384154 TBC1D2Q9BYX2 928 aa6.5□□□□□ -1.37
RNU6-190P-201ENST00000384154 LORP23490 312 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
RNU6-190P-201ENST00000384154 DIXDC1Q155Q3 683 aa6.49□□□□□ -1.37
RNU6-190P-201ENST00000384154 SIAH2O43255 324 aa6.48□□□□□ -1.37
RNU6-190P-201ENST00000384154 KDM4AO75164 1064 aa6.48□□□□□ -1.37
RNU6-190P-201ENST00000384154 CLK2P49760 499 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
RNU6-190P-201ENST00000384154 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
RNU6-190P-201ENST00000384154 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
RNU6-190P-201ENST00000384154 SPIRE2Q8WWL2 714 aa6.47□□□□□ -1.37
RNU6-190P-201ENST00000384154 GJA5P36382 358 aa6.46□□□□□ -1.38
RNU6-190P-201ENST00000384154 TUSC1Q2TAM9 212 aa6.46□□□□□ -1.38
RNU6-190P-201ENST00000384154 C14orf37Q86TY3 774 aa6.46□□□□□ -1.38
RNU6-190P-201ENST00000384154 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP6.46□□□□□ -1.38
RNU6-190P-201ENST00000384154 SPTLC1O15269 473 aa6.45□□□□□ -1.38
RNU6-190P-201ENST00000384154 HOXA2O43364 376 aa6.45□□□□□ -1.38
RNU6-190P-201ENST00000384154 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
RNU6-190P-201ENST00000384154 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
RNU6-190P-201ENST00000384154 NUTM1Q86Y26 1132 aa6.44□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.4 ms