RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000381223.9

ZBED1-203, Transcript of zinc finger BED-type containing 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene ZBED1, Length 4,510 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED1-203ENST00000381223 USP35Q9P2H5 1018 aa18.04■□□□□ 0.48
ZBED1-203ENST00000381223 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa18.03■□□□□ 0.48
ZBED1-203ENST00000381223 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP18.03■□□□□ 0.48
ZBED1-203ENST00000381223 PSME1Q06323 249 aa18.03■□□□□ 0.48
ZBED1-203ENST00000381223 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP18.02■□□□□ 0.48
ZBED1-203ENST00000381223 DUSP27Q5VZP5 1158 aa18.02■□□□□ 0.48
ZBED1-203ENST00000381223 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP18.02■□□□□ 0.48
ZBED1-203ENST00000381223 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP18.01■□□□□ 0.47
ZBED1-203ENST00000381223 ADGRL1O94910 1474 aa18.01■□□□□ 0.47
ZBED1-203ENST00000381223 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa18.01■□□□□ 0.47
ZBED1-203ENST00000381223 DCTN1Q14203 1278 aa18.01■□□□□ 0.47
ZBED1-203ENST00000381223 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP18.01■□□□□ 0.47
ZBED1-203ENST00000381223 TESK2Q96S53 571 aa18■□□□□ 0.47
ZBED1-203ENST00000381223 CD109Q6YHK3 1445 aa18■□□□□ 0.47
ZBED1-203ENST00000381223 NPHP1O15259 732 aa17.99■□□□□ 0.47
ZBED1-203ENST00000381223 TMPOP42166 694 aaKnown RBP17.99■□□□□ 0.47
ZBED1-203ENST00000381223 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa17.98■□□□□ 0.47
ZBED1-203ENST00000381223 CFAP44Q96MT7 982 aa17.98■□□□□ 0.47
ZBED1-203ENST00000381223 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa17.98■□□□□ 0.47
ZBED1-203ENST00000381223 MIS18AQ9NYP9 233 aa17.97■□□□□ 0.47
ZBED1-203ENST00000381223 ST18O60284 1047 aa17.97■□□□□ 0.47
ZBED1-203ENST00000381223 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP17.97■□□□□ 0.47
ZBED1-203ENST00000381223 ABTB2Q8N961 1025 aa17.97■□□□□ 0.47
ZBED1-203ENST00000381223 NOS1P29475 1434 aa17.97■□□□□ 0.47
ZBED1-203ENST00000381223 C1orf141Q5JVX7 400 aa17.97■□□□□ 0.47
ZBED1-203ENST00000381223 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP17.97■□□□□ 0.47
ZBED1-203ENST00000381223 WDR63Q8IWG1 891 aa17.97■□□□□ 0.47
ZBED1-203ENST00000381223 WDR62O43379 1518 aa17.96■□□□□ 0.47
ZBED1-203ENST00000381223 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP17.96■□□□□ 0.47
ZBED1-203ENST00000381223 CFAP43Q8NDM7 1665 aa17.96■□□□□ 0.47
ZBED1-203ENST00000381223 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa17.96■□□□□ 0.47
ZBED1-203ENST00000381223 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP17.96■□□□□ 0.47
ZBED1-203ENST00000381223 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa17.96■□□□□ 0.46
ZBED1-203ENST00000381223 MVPQ14764 893 aaKnown RBP17.95■□□□□ 0.46
ZBED1-203ENST00000381223 ANO2Q9NQ90 1003 aa17.95■□□□□ 0.46
ZBED1-203ENST00000381223 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP17.95■□□□□ 0.46
ZBED1-203ENST00000381223 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa17.95■□□□□ 0.46
ZBED1-203ENST00000381223 RARSP54136 660 aaKnown RBP17.95■□□□□ 0.46
ZBED1-203ENST00000381223 NME9Q86XW9 330 aa17.95■□□□□ 0.46
ZBED1-203ENST00000381223 SSH1Q8WYL5 1049 aa17.95■□□□□ 0.46
ZBED1-203ENST00000381223 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP17.95■□□□□ 0.46
ZBED1-203ENST00000381223 SYCP2Q9BX26 1530 aa17.95■□□□□ 0.46
ZBED1-203ENST00000381223 FANCAO15360 1455 aa17.94■□□□□ 0.46
ZBED1-203ENST00000381223 TMEM57Q8N5G2 664 aa17.94■□□□□ 0.46
ZBED1-203ENST00000381223 DISP1Q96F81 1524 aa17.94■□□□□ 0.46
ZBED1-203ENST00000381223 SLC4A2P04920 1241 aa17.93■□□□□ 0.46
ZBED1-203ENST00000381223 MSNP26038 577 aaKnown RBP17.93■□□□□ 0.46
ZBED1-203ENST00000381223 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa17.93■□□□□ 0.46
ZBED1-203ENST00000381223 PZPP20742 1482 aa17.93■□□□□ 0.46
ZBED1-203ENST00000381223 GORABQ5T7V8 394 aa17.93■□□□□ 0.46
ZBED1-203ENST00000381223 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP17.92■□□□□ 0.46
ZBED1-203ENST00000381223 KIAA0556O60303 1618 aa17.92■□□□□ 0.46
ZBED1-203ENST00000381223 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP17.92■□□□□ 0.46
ZBED1-203ENST00000381223 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP17.92■□□□□ 0.46
ZBED1-203ENST00000381223 ARID3AQ99856 593 aa17.92■□□□□ 0.46
ZBED1-203ENST00000381223 ADAMTS12P58397 1594 aa17.92■□□□□ 0.46
ZBED1-203ENST00000381223 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa17.92■□□□□ 0.46
ZBED1-203ENST00000381223 PRAG1Q86YV5 1406 aa17.91■□□□□ 0.46
ZBED1-203ENST00000381223 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa17.91■□□□□ 0.46
ZBED1-203ENST00000381223 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP17.91■□□□□ 0.46
ZBED1-203ENST00000381223 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP17.91■□□□□ 0.46
ZBED1-203ENST00000381223 ESCO1Q5FWF5 840 aa17.9■□□□□ 0.46
ZBED1-203ENST00000381223 MCM10Q7L590 875 aa17.9■□□□□ 0.46
ZBED1-203ENST00000381223 CHMP5Q9NZZ3 219 aa17.9■□□□□ 0.46
ZBED1-203ENST00000381223 CCDC61Q9Y6R9 512 aa17.9■□□□□ 0.46
ZBED1-203ENST00000381223 IGHDP01880 384 aa17.9■□□□□ 0.46
ZBED1-203ENST00000381223 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa17.9■□□□□ 0.46
ZBED1-203ENST00000381223 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP17.9■□□□□ 0.46
ZBED1-203ENST00000381223 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP17.89■□□□□ 0.46
ZBED1-203ENST00000381223 RALGAPBQ86X10 1494 aa17.89■□□□□ 0.45
ZBED1-203ENST00000381223 TNNQ9UQP3 1299 aa17.89■□□□□ 0.45
ZBED1-203ENST00000381223 CARD14Q9BXL6 1004 aa17.89■□□□□ 0.45
ZBED1-203ENST00000381223 TAF7LQ5H9L4 462 aa17.88■□□□□ 0.45
ZBED1-203ENST00000381223 GPATCH3Q96I76 525 aa17.88■□□□□ 0.45
ZBED1-203ENST00000381223 NLRP2Q9NX02 1062 aa17.88■□□□□ 0.45
ZBED1-203ENST00000381223 BRPF3Q9ULD4 1205 aa17.88■□□□□ 0.45
ZBED1-203ENST00000381223 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP17.88■□□□□ 0.45
ZBED1-203ENST00000381223 FAM135AQ9P2D6 1515 aa17.87■□□□□ 0.45
ZBED1-203ENST00000381223 PLCH2O75038 1416 aa17.87■□□□□ 0.45
ZBED1-203ENST00000381223 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP17.87■□□□□ 0.45
ZBED1-203ENST00000381223 FCHSD2O94868 740 aa17.86■□□□□ 0.45
ZBED1-203ENST00000381223 REC8O95072 547 aa17.86■□□□□ 0.45
ZBED1-203ENST00000381223 DDX11L8A8MPP1 907 aa17.86■□□□□ 0.45
ZBED1-203ENST00000381223 CHMP4AQ9BY43 222 aa17.86■□□□□ 0.45
ZBED1-203ENST00000381223 ATAD2Q6PL18 1390 aa17.86■□□□□ 0.45
ZBED1-203ENST00000381223 DRC7Q8IY82 874 aa17.86■□□□□ 0.45
ZBED1-203ENST00000381223 IL27Q8NEV9 243 aa17.85■□□□□ 0.45
ZBED1-203ENST00000381223 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa17.85■□□□□ 0.45
ZBED1-203ENST00000381223 FAM83GA6ND36 823 aa17.85■□□□□ 0.45
ZBED1-203ENST00000381223 PARD3Q8TEW0 1356 aa17.85■□□□□ 0.45
ZBED1-203ENST00000381223 SURF6O75683 361 aaKnown RBP17.84■□□□□ 0.45
ZBED1-203ENST00000381223 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP17.84■□□□□ 0.45
ZBED1-203ENST00000381223 NFE2L2Q16236 605 aa17.84■□□□□ 0.45
ZBED1-203ENST00000381223 TRIM27P14373 513 aa17.83■□□□□ 0.45
ZBED1-203ENST00000381223 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP17.83■□□□□ 0.45
ZBED1-203ENST00000381223 AAMPQ13685 434 aa17.83■□□□□ 0.44
ZBED1-203ENST00000381223 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa17.83■□□□□ 0.44
ZBED1-203ENST00000381223 CDC45O75419 566 aa17.83■□□□□ 0.44
ZBED1-203ENST00000381223 TTC5Q8N0Z6 440 aa17.83■□□□□ 0.44
ZBED1-203ENST00000381223 GPRASP1Q5JY77 1395 aa17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.6 ms