RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000379615.3

PGGT1B-202, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PGGT1B, Length 903 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-202ENST00000379615 TRAK1Q9UPV9 953 aa22.01■■□□□ 1.11
PGGT1B-202ENST00000379615 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa22.01■■□□□ 1.11
PGGT1B-202ENST00000379615 KNDC1Q76NI1 1749 aa22■■□□□ 1.11
PGGT1B-202ENST00000379615 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa22■■□□□ 1.11
PGGT1B-202ENST00000379615 PRAM1Q96QH2 718 aa21.99■■□□□ 1.11
PGGT1B-202ENST00000379615 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP21.98■■□□□ 1.11
PGGT1B-202ENST00000379615 DLC1Q96QB1 1528 aa21.98■■□□□ 1.11
PGGT1B-202ENST00000379615 NBPF1Q3BBV0 1214 aa21.97■■□□□ 1.11
PGGT1B-202ENST00000379615 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP21.96■■□□□ 1.11
PGGT1B-202ENST00000379615 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa21.94■■□□□ 1.1
PGGT1B-202ENST00000379615 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP21.93■■□□□ 1.1
PGGT1B-202ENST00000379615 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP21.93■■□□□ 1.1
PGGT1B-202ENST00000379615 NBPF8Q3BBV2 869 aa21.92■■□□□ 1.1
PGGT1B-202ENST00000379615 NALCNQ8IZF0 1738 aa21.92■■□□□ 1.1
PGGT1B-202ENST00000379615 MST1RQ04912 1400 aa21.89■■□□□ 1.1
PGGT1B-202ENST00000379615 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa21.88■■□□□ 1.09
PGGT1B-202ENST00000379615 PHLPP1O60346 1717 aa21.88■■□□□ 1.09
PGGT1B-202ENST00000379615 BRINP3Q76B58 766 aa21.87■■□□□ 1.09
PGGT1B-202ENST00000379615 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP21.86■■□□□ 1.09
PGGT1B-202ENST00000379615 C1orf167Q5SNV9 1468 aa21.86■■□□□ 1.09
PGGT1B-202ENST00000379615 CARD11Q9BXL7 1154 aa21.86■■□□□ 1.09
PGGT1B-202ENST00000379615 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa21.86■■□□□ 1.09
PGGT1B-202ENST00000379615 GPRASP1Q5JY77 1395 aa21.86■■□□□ 1.09
PGGT1B-202ENST00000379615 POTEAQ6S8J7 498 aa21.85■■□□□ 1.09
PGGT1B-202ENST00000379615 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP21.85■■□□□ 1.09
PGGT1B-202ENST00000379615 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP21.84■■□□□ 1.09
PGGT1B-202ENST00000379615 ESCO1Q5FWF5 840 aa21.83■■□□□ 1.09
PGGT1B-202ENST00000379615 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.09
PGGT1B-202ENST00000379615 RALGAPBQ86X10 1494 aa21.83■■□□□ 1.08
PGGT1B-202ENST00000379615 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP21.81■■□□□ 1.08
PGGT1B-202ENST00000379615 NUTM2FA1L443 756 aa21.81■■□□□ 1.08
PGGT1B-202ENST00000379615 WASLO00401 505 aaPredicted RBP21.81■■□□□ 1.08
PGGT1B-202ENST00000379615 ORAI2Q96SN7 254 aa21.8■■□□□ 1.08
PGGT1B-202ENST00000379615 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP21.79■■□□□ 1.08
PGGT1B-202ENST00000379615 ADGRB2O60241 1585 aa21.78■■□□□ 1.08
PGGT1B-202ENST00000379615 ANKARQ7Z5J8 1434 aa21.78■■□□□ 1.08
PGGT1B-202ENST00000379615 FMN2Q9NZ56 1722 aa21.76■■□□□ 1.07
PGGT1B-202ENST00000379615 JCADQ9P266 1359 aa21.75■■□□□ 1.07
PGGT1B-202ENST00000379615 CDK19Q9BWU1 502 aa21.75■■□□□ 1.07
PGGT1B-202ENST00000379615 NPHP3Q7Z494 1330 aa21.75■■□□□ 1.07
PGGT1B-202ENST00000379615 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP21.74■■□□□ 1.07
PGGT1B-202ENST00000379615 PHF8Q9UPP1 1060 aa21.74■■□□□ 1.07
PGGT1B-202ENST00000379615 LRP6O75581 1613 aa21.73■■□□□ 1.07
PGGT1B-202ENST00000379615 SLC24A1O60721 1099 aa21.73■■□□□ 1.07
PGGT1B-202ENST00000379615 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP21.73■■□□□ 1.07
PGGT1B-202ENST00000379615 FOXO3O43524 673 aa21.72■■□□□ 1.07
PGGT1B-202ENST00000379615 EVC2Q86UK5 1308 aa21.72■■□□□ 1.07
PGGT1B-202ENST00000379615 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP21.71■■□□□ 1.07
PGGT1B-202ENST00000379615 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP21.71■■□□□ 1.07
PGGT1B-202ENST00000379615 TULP4Q9NRJ4 1543 aa21.7■■□□□ 1.07
PGGT1B-202ENST00000379615 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP21.69■■□□□ 1.06
PGGT1B-202ENST00000379615 CCDC61Q9Y6R9 512 aa21.69■■□□□ 1.06
PGGT1B-202ENST00000379615 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP21.69■■□□□ 1.06
PGGT1B-202ENST00000379615 PSME1Q06323 249 aa21.68■■□□□ 1.06
PGGT1B-202ENST00000379615 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP21.68■■□□□ 1.06
PGGT1B-202ENST00000379615 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa21.68■■□□□ 1.06
PGGT1B-202ENST00000379615 QRICH2Q9H0J4 1663 aa21.68■■□□□ 1.06
PGGT1B-202ENST00000379615 KIF1AQ12756 1690 aa21.67■■□□□ 1.06
PGGT1B-202ENST00000379615 NHSL1Q5SYE7 1610 aa21.67■■□□□ 1.06
PGGT1B-202ENST00000379615 PRR36Q9H6K5 1346 aa21.67■■□□□ 1.06
PGGT1B-202ENST00000379615 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa21.65■■□□□ 1.06
PGGT1B-202ENST00000379615 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP21.65■■□□□ 1.06
PGGT1B-202ENST00000379615 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP21.65■■□□□ 1.06
PGGT1B-202ENST00000379615 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP21.65■■□□□ 1.06
PGGT1B-202ENST00000379615 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP21.65■■□□□ 1.06
PGGT1B-202ENST00000379615 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa21.65■■□□□ 1.06
PGGT1B-202ENST00000379615 CABP2Q9NPB3 220 aa21.65■■□□□ 1.06
PGGT1B-202ENST00000379615 KRT28Q7Z3Y7 464 aa21.64■■□□□ 1.05
PGGT1B-202ENST00000379615 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP21.64■■□□□ 1.05
PGGT1B-202ENST00000379615 USP47Q96K76 1375 aa21.63■■□□□ 1.05
PGGT1B-202ENST00000379615 SHPRHQ149N8 1683 aa21.63■■□□□ 1.05
PGGT1B-202ENST00000379615 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa21.63■■□□□ 1.05
PGGT1B-202ENST00000379615 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP21.62■■□□□ 1.05
PGGT1B-202ENST00000379615 ATP7BP35670 1465 aa21.62■■□□□ 1.05
PGGT1B-202ENST00000379615 USP32Q8NFA0 1604 aa21.62■■□□□ 1.05
PGGT1B-202ENST00000379615 PLEKHG3A1L390 1219 aa21.61■■□□□ 1.05
PGGT1B-202ENST00000379615 PXDNQ92626 1479 aa21.59■■□□□ 1.05
PGGT1B-202ENST00000379615 ITSN1Q15811 1721 aa21.59■■□□□ 1.05
PGGT1B-202ENST00000379615 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP21.59■■□□□ 1.05
PGGT1B-202ENST00000379615 ATAD2Q6PL18 1390 aa21.59■■□□□ 1.05
PGGT1B-202ENST00000379615 TESK2Q96S53 571 aa21.58■■□□□ 1.05
PGGT1B-202ENST00000379615 SBNO1A3KN83 1393 aa21.57■■□□□ 1.04
PGGT1B-202ENST00000379615 PNPLA6Q8IY17 1366 aa21.57■■□□□ 1.04
PGGT1B-202ENST00000379615 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa21.56■■□□□ 1.04
PGGT1B-202ENST00000379615 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa21.56■■□□□ 1.04
PGGT1B-202ENST00000379615 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP21.56■■□□□ 1.04
PGGT1B-202ENST00000379615 TMF1P82094 1093 aa21.56■■□□□ 1.04
PGGT1B-202ENST00000379615 CDCA8Q53HL2 280 aa21.56■■□□□ 1.04
PGGT1B-202ENST00000379615 CABP1Q9NZU7 370 aa21.56■■□□□ 1.04
PGGT1B-202ENST00000379615 ACEP12821 1306 aa21.55■■□□□ 1.04
PGGT1B-202ENST00000379615 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP21.54■■□□□ 1.04
PGGT1B-202ENST00000379615 ARHGEF10O15013 1369 aa21.53■■□□□ 1.04
PGGT1B-202ENST00000379615 LMOD2Q6P5Q4 547 aa21.53■■□□□ 1.04
PGGT1B-202ENST00000379615 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP21.52■■□□□ 1.04
PGGT1B-202ENST00000379615 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP21.52■■□□□ 1.04
PGGT1B-202ENST00000379615 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP21.52■■□□□ 1.04
PGGT1B-202ENST00000379615 TNS3Q68CZ2 1445 aa21.52■■□□□ 1.04
PGGT1B-202ENST00000379615 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP21.51■■□□□ 1.03
PGGT1B-202ENST00000379615 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa21.51■■□□□ 1.03
PGGT1B-202ENST00000379615 AFF2P51816 1311 aa21.51■■□□□ 1.03
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