RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000365280.1

RNU6-407P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 407, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-407P, Length 104 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-407P-201ENST00000365280 REPIN1Q9BWE0 567 aaKnown RBP5.07□□□□□ -1.6
RNU6-407P-201ENST00000365280 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa5.07□□□□□ -1.6
RNU6-407P-201ENST00000365280 SLC27A5Q9Y2P5 690 aa5.07□□□□□ -1.6
RNU6-407P-201ENST00000365280 TRIM32Q13049 653 aa5.06□□□□□ -1.6
RNU6-407P-201ENST00000365280 GRIPAP1Q4V328 841 aa5.06□□□□□ -1.6
RNU6-407P-201ENST00000365280 BRICD5Q6PL45 260 aa5.06□□□□□ -1.6
RNU6-407P-201ENST00000365280 PRDM9Q9NQV7 894 aa5.06□□□□□ -1.6
RNU6-407P-201ENST00000365280 DDX11L8A8MPP1 907 aa5.05□□□□□ -1.6
RNU6-407P-201ENST00000365280 SNRPBP14678 240 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
RNU6-407P-201ENST00000365280 GCGRP47871 477 aa5.05□□□□□ -1.6
RNU6-407P-201ENST00000365280 Q3C1V9 767 aa5.04□□□□□ -1.6
RNU6-407P-201ENST00000365280 VSIG10Q8N0Z9 540 aa5.04□□□□□ -1.6
RNU6-407P-201ENST00000365280 SLC16A10Q8TF71 515 aa5.04□□□□□ -1.6
RNU6-407P-201ENST00000365280 MRGPRX2Q96LB1 330 aa5.04□□□□□ -1.6
RNU6-407P-201ENST00000365280 GNPATO15228 680 aa5.03□□□□□ -1.6
RNU6-407P-201ENST00000365280 FECHP22830 423 aa5.03□□□□□ -1.6
RNU6-407P-201ENST00000365280 MMP16P51512 607 aa5.03□□□□□ -1.6
RNU6-407P-201ENST00000365280 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP5.03□□□□□ -1.6
RNU6-407P-201ENST00000365280 LCE2CQ5TA81 110 aa5.03□□□□□ -1.6
RNU6-407P-201ENST00000365280 RNF19BQ6ZMZ0 732 aa5.03□□□□□ -1.6
RNU6-407P-201ENST00000365280 J3QL48 77 aa5.02□□□□□ -1.61
RNU6-407P-201ENST00000365280 SEMA3EO15041 775 aa5.01□□□□□ -1.61
RNU6-407P-201ENST00000365280 WNT7BP56706 349 aa5.01□□□□□ -1.61
RNU6-407P-201ENST00000365280 SMYD5Q6GMV2 418 aa5.01□□□□□ -1.61
RNU6-407P-201ENST00000365280 NPAS3Q8IXF0 933 aa5.01□□□□□ -1.61
RNU6-407P-201ENST00000365280 HPS1Q92902 700 aa5.01□□□□□ -1.61
RNU6-407P-201ENST00000365280 DXOO77932 396 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
RNU6-407P-201ENST00000365280 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
RNU6-407P-201ENST00000365280 ZSCAN1Q8NBB4 408 aa4.99□□□□□ -1.61
RNU6-407P-201ENST00000365280 IRF7Q92985 503 aa4.99□□□□□ -1.61
RNU6-407P-201ENST00000365280 USB1Q9BQ65 265 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
RNU6-407P-201ENST00000365280 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP4.98□□□□□ -1.61
RNU6-407P-201ENST00000365280 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP4.98□□□□□ -1.61
RNU6-407P-201ENST00000365280 NLRP7Q8WX94 980 aa4.98□□□□□ -1.61
RNU6-407P-201ENST00000365280 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP4.97□□□□□ -1.61
RNU6-407P-201ENST00000365280 GPR37O15354 613 aa4.97□□□□□ -1.61
RNU6-407P-201ENST00000365280 ALDH1A1P00352 501 aa4.96□□□□□ -1.62
RNU6-407P-201ENST00000365280 GMPRP36959 345 aa4.96□□□□□ -1.62
RNU6-407P-201ENST00000365280 USP46P62068 366 aa4.96□□□□□ -1.62
RNU6-407P-201ENST00000365280 SKOR1P84550 965 aa4.96□□□□□ -1.62
RNU6-407P-201ENST00000365280 CCDC24Q8N4L8 307 aa4.96□□□□□ -1.62
RNU6-407P-201ENST00000365280 PHOX2BQ99453 314 aa4.96□□□□□ -1.62
RNU6-407P-201ENST00000365280 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa4.96□□□□□ -1.62
RNU6-407P-201ENST00000365280 LOC100996750A0A140TA64 210 aa4.95□□□□□ -1.62
RNU6-407P-201ENST00000365280 H3BM21 787 aa4.95□□□□□ -1.62
RNU6-407P-201ENST00000365280 KDM4AO75164 1064 aa4.95□□□□□ -1.62
RNU6-407P-201ENST00000365280 CD46P15529 392 aa4.95□□□□□ -1.62
RNU6-407P-201ENST00000365280 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa4.95□□□□□ -1.62
RNU6-407P-201ENST00000365280 CAPN5O15484 640 aaPredicted RBP4.94□□□□□ -1.62
RNU6-407P-201ENST00000365280 LORP23490 312 aaPredicted RBP4.94□□□□□ -1.62
RNU6-407P-201ENST00000365280 WASF2Q9Y6W5 498 aa4.94□□□□□ -1.62
RNU6-407P-201ENST00000365280 BMP1P13497 986 aa4.93□□□□□ -1.62
RNU6-407P-201ENST00000365280 JUNDP17535 347 aa4.93□□□□□ -1.62
RNU6-407P-201ENST00000365280 TRIM46Q7Z4K8 759 aa4.93□□□□□ -1.62
RNU6-407P-201ENST00000365280 EHBP1Q8NDI1 1231 aa4.93□□□□□ -1.62
RNU6-407P-201ENST00000365280 SIAH2O43255 324 aa4.92□□□□□ -1.62
RNU6-407P-201ENST00000365280 HOXA2O43364 376 aa4.91□□□□□ -1.62
RNU6-407P-201ENST00000365280 GPIHBP1Q8IV16 184 aa4.91□□□□□ -1.62
RNU6-407P-201ENST00000365280 SLC24A1O60721 1099 aa4.9□□□□□ -1.63
RNU6-407P-201ENST00000365280 VEGFBP49765 207 aa4.9□□□□□ -1.63
RNU6-407P-201ENST00000365280 NUDT12Q9BQG2 462 aa4.9□□□□□ -1.63
RNU6-407P-201ENST00000365280 ERBB4Q15303 1308 aa4.9□□□□□ -1.63
RNU6-407P-201ENST00000365280 VSIG8P0DPA2 414 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-407P-201ENST00000365280 MAP2K5Q13163 448 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-407P-201ENST00000365280 RETREG3Q86VR2 466 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-407P-201ENST00000365280 HLA-CQ95604 372 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-407P-201ENST00000365280 ZFP42Q96MM3 310 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU6-407P-201ENST00000365280 PLEKHG3A1L390 1219 aa4.88□□□□□ -1.63
RNU6-407P-201ENST00000365280 SCARF1Q14162 830 aa4.88□□□□□ -1.63
RNU6-407P-201ENST00000365280 CCNYL3P0C7X3 344 aa4.87□□□□□ -1.63
RNU6-407P-201ENST00000365280 SH3BP2P78314 561 aa4.87□□□□□ -1.63
RNU6-407P-201ENST00000365280 PTCRAQ6ISU1 281 aaPredicted RBP4.87□□□□□ -1.63
RNU6-407P-201ENST00000365280 MRPL14Q6P1L8 145 aaKnown RBP4.87□□□□□ -1.63
RNU6-407P-201ENST00000365280 MPNDQ8N594 471 aa4.87□□□□□ -1.63
RNU6-407P-201ENST00000365280 MS4A1P11836 297 aa4.86□□□□□ -1.63
RNU6-407P-201ENST00000365280 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP4.86□□□□□ -1.63
RNU6-407P-201ENST00000365280 SUZ12Q15022 739 aaKnown RBP4.86□□□□□ -1.63
RNU6-407P-201ENST00000365280 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
RNU6-407P-201ENST00000365280 ADH1CP00326 375 aa4.85□□□□□ -1.63
RNU6-407P-201ENST00000365280 VARSP26640 1264 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
RNU6-407P-201ENST00000365280 GUCA2AQ02747 115 aa4.85□□□□□ -1.63
RNU6-407P-201ENST00000365280 KCNMA1Q12791 1236 aa4.85□□□□□ -1.63
RNU6-407P-201ENST00000365280 NNTQ13423 1086 aa4.85□□□□□ -1.63
RNU6-407P-201ENST00000365280 PTPRNQ16849 979 aa4.85□□□□□ -1.63
RNU6-407P-201ENST00000365280 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
RNU6-407P-201ENST00000365280 TLL2Q9Y6L7 1015 aa4.85□□□□□ -1.63
RNU6-407P-201ENST00000365280 IRF6O14896 467 aa4.84□□□□□ -1.63
RNU6-407P-201ENST00000365280 CLCN1P35523 988 aa4.84□□□□□ -1.63
RNU6-407P-201ENST00000365280 NUTM1Q86Y26 1132 aa4.84□□□□□ -1.63
RNU6-407P-201ENST00000365280 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.63
RNU6-407P-201ENST00000365280 UNC93B1Q9H1C4 597 aa4.84□□□□□ -1.63
RNU6-407P-201ENST00000365280 GPCPD1Q9NPB8 672 aa4.84□□□□□ -1.63
RNU6-407P-201ENST00000365280 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP4.83□□□□□ -1.64
RNU6-407P-201ENST00000365280 C6orf229H3BNL8 230 aa4.83□□□□□ -1.64
RNU6-407P-201ENST00000365280 FDX1P10109 184 aa4.83□□□□□ -1.64
RNU6-407P-201ENST00000365280 TIMP2P16035 220 aa4.83□□□□□ -1.64
RNU6-407P-201ENST00000365280 WDR4P57081 412 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
RNU6-407P-201ENST00000365280 ZNF511Q8NB15 262 aa4.83□□□□□ -1.64
RNU6-407P-201ENST00000365280 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP4.83□□□□□ -1.64
RNU6-407P-201ENST00000365280 EVA1BQ9NVM1 165 aa4.83□□□□□ -1.64
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.2 ms