RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361543.3

SGMS1-201, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SGMS1, Length 1,096 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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SGMS1-201ENST00000361543 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa11.25□□□□□ -0.61
SGMS1-201ENST00000361543 TMEM132EQ6IEE7 984 aa11.23□□□□□ -0.61
SGMS1-201ENST00000361543 STK26Q9P289 416 aa11.23□□□□□ -0.61
SGMS1-201ENST00000361543 ABCC11Q96J66 1382 aa11.23□□□□□ -0.61
SGMS1-201ENST00000361543 ADGRB1O14514 1584 aa11.23□□□□□ -0.61
SGMS1-201ENST00000361543 LRP6O75581 1613 aa11.23□□□□□ -0.61
SGMS1-201ENST00000361543 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP11.23□□□□□ -0.61
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SGMS1-201ENST00000361543 DLC1Q96QB1 1528 aa11.22□□□□□ -0.61
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SGMS1-201ENST00000361543 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa11.21□□□□□ -0.61
SGMS1-201ENST00000361543 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP11.21□□□□□ -0.61
SGMS1-201ENST00000361543 ADGRB2O60241 1585 aa11.2□□□□□ -0.62
SGMS1-201ENST00000361543 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP11.2□□□□□ -0.62
SGMS1-201ENST00000361543 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa11.2□□□□□ -0.62
SGMS1-201ENST00000361543 CFAP70Q5T0N1 1121 aa11.2□□□□□ -0.62
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SGMS1-201ENST00000361543 DCAF11Q8TEB1 546 aa11.19□□□□□ -0.62
SGMS1-201ENST00000361543 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP11.19□□□□□ -0.62
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SGMS1-201ENST00000361543 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP11.18□□□□□ -0.62
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SGMS1-201ENST00000361543 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa11.18□□□□□ -0.62
SGMS1-201ENST00000361543 USP32Q8NFA0 1604 aa11.17□□□□□ -0.62
SGMS1-201ENST00000361543 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP11.17□□□□□ -0.62
SGMS1-201ENST00000361543 PXDNQ92626 1479 aa11.17□□□□□ -0.62
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SGMS1-201ENST00000361543 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP11.16□□□□□ -0.62
SGMS1-201ENST00000361543 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP11.16□□□□□ -0.62
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SGMS1-201ENST00000361543 STAC3Q96MF2 364 aa11.16□□□□□ -0.62
SGMS1-201ENST00000361543 ITSN1Q15811 1721 aa11.15□□□□□ -0.62
SGMS1-201ENST00000361543 PRAM1Q96QH2 718 aa11.15□□□□□ -0.62
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SGMS1-201ENST00000361543 NPHP3Q7Z494 1330 aa11.14□□□□□ -0.63
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SGMS1-201ENST00000361543 ESCO1Q5FWF5 840 aa11.14□□□□□ -0.63
SGMS1-201ENST00000361543 NUTM2FA1L443 756 aa11.13□□□□□ -0.63
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SGMS1-201ENST00000361543 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP11.13□□□□□ -0.63
SGMS1-201ENST00000361543 POGKQ9P215 609 aa11.13□□□□□ -0.63
SGMS1-201ENST00000361543 ABCA3Q99758 1704 aa11.12□□□□□ -0.63
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SGMS1-201ENST00000361543 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa11.12□□□□□ -0.63
SGMS1-201ENST00000361543 QRICH2Q9H0J4 1663 aa11.11□□□□□ -0.63
SGMS1-201ENST00000361543 ANKARQ7Z5J8 1434 aa11.11□□□□□ -0.63
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SGMS1-201ENST00000361543 EP400Q96L91 3159 aa11.11□□□□□ -0.63
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SGMS1-201ENST00000361543 AFF2P51816 1311 aa11.09□□□□□ -0.63
SGMS1-201ENST00000361543 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP11.09□□□□□ -0.63
SGMS1-201ENST00000361543 ALS2Q96Q42 1657 aa11.08□□□□□ -0.64
SGMS1-201ENST00000361543 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP11.08□□□□□ -0.64
SGMS1-201ENST00000361543 C8orf37Q96NL8 207 aa11.08□□□□□ -0.64
SGMS1-201ENST00000361543 PHF8Q9UPP1 1060 aa11.08□□□□□ -0.64
SGMS1-201ENST00000361543 TNS3Q68CZ2 1445 aa11.08□□□□□ -0.64
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SGMS1-201ENST00000361543 PLCH1Q4KWH8 1693 aa11.06□□□□□ -0.64
SGMS1-201ENST00000361543 ADAMTS2O95450 1211 aa11.06□□□□□ -0.64
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SGMS1-201ENST00000361543 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa11.06□□□□□ -0.64
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SGMS1-201ENST00000361543 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP11.05□□□□□ -0.64
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SGMS1-201ENST00000361543 NWD2Q9ULI1 1742 aa11.04□□□□□ -0.64
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SGMS1-201ENST00000361543 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP11.01□□□□□ -0.65
SGMS1-201ENST00000361543 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP11.01□□□□□ -0.65
SGMS1-201ENST00000361543 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP11.01□□□□□ -0.65
SGMS1-201ENST00000361543 RGS12O14924 1447 aa11.01□□□□□ -0.65
SGMS1-201ENST00000361543 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP11□□□□□ -0.65
SGMS1-201ENST00000361543 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP11□□□□□ -0.65
SGMS1-201ENST00000361543 USP21Q9UK80 565 aa11□□□□□ -0.65
SGMS1-201ENST00000361543 NRAPQ86VF7 1730 aa11□□□□□ -0.65
SGMS1-201ENST00000361543 ATRNO75882 1429 aa11□□□□□ -0.65
SGMS1-201ENST00000361543 BCL9LQ86UU0 1499 aa11□□□□□ -0.65
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