RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000329078.7

SPNS2-201, Transcript of sphingolipid transporter 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SPNS2, Length 3,447 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS2-201ENST00000329078 STAC3Q96MF2 364 aa25.39■■□□□ 1.66
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SPNS2-201ENST00000329078 SLC24A1O60721 1099 aa25.37■■□□□ 1.65
SPNS2-201ENST00000329078 EVC2Q86UK5 1308 aa25.37■■□□□ 1.65
SPNS2-201ENST00000329078 RARSP54136 660 aaKnown RBP25.36■■□□□ 1.65
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SPNS2-201ENST00000329078 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa25.35■■□□□ 1.65
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SPNS2-201ENST00000329078 PLXNC1O60486 1568 aa25.34■■□□□ 1.65
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SPNS2-201ENST00000329078 CYB5RLQ6IPT4 315 aa25.3■■□□□ 1.64
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SPNS2-201ENST00000329078 OSCARQ8IYS5 282 aa25.28■■□□□ 1.64
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SPNS2-201ENST00000329078 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa25.27■■□□□ 1.64
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SPNS2-201ENST00000329078 TRPM2O94759 1503 aa25.27■■□□□ 1.64
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SPNS2-201ENST00000329078 ZMYND15Q9H091 742 aa25.24■■□□□ 1.63
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SPNS2-201ENST00000329078 WAPLQ7Z5K2 1190 aa25.22■■□□□ 1.63
SPNS2-201ENST00000329078 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP25.19■■□□□ 1.62
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SPNS2-201ENST00000329078 C1orf115Q9H7X2 142 aa25.19■■□□□ 1.62
SPNS2-201ENST00000329078 TERF2IPQ9NYB0 399 aa25.19■■□□□ 1.62
SPNS2-201ENST00000329078 NPATQ14207 1427 aa25.19■■□□□ 1.62
SPNS2-201ENST00000329078 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP25.18■■□□□ 1.62
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SPNS2-201ENST00000329078 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa25.15■■□□□ 1.62
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SPNS2-201ENST00000329078 SHROOM2Q13796 1616 aa25.13■■□□□ 1.61
SPNS2-201ENST00000329078 FYB1O15117 783 aa25.13■■□□□ 1.61
SPNS2-201ENST00000329078 INSRP06213 1382 aa25.13■■□□□ 1.61
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SPNS2-201ENST00000329078 FAM43AQ8N2R8 423 aa25.05■■□□□ 1.6
SPNS2-201ENST00000329078 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa25.05■■□□□ 1.6
SPNS2-201ENST00000329078 FAM69CQ0P6D2 419 aa25.05■■□□□ 1.6
SPNS2-201ENST00000329078 ANKRD45Q5TZF3 282 aa25.05■■□□□ 1.6
SPNS2-201ENST00000329078 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa25.05■■□□□ 1.6
SPNS2-201ENST00000329078 TRIM35Q9UPQ4 493 aa25.03■■□□□ 1.6
SPNS2-201ENST00000329078 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa25.03■■□□□ 1.6
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