RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000326294.3

PTPRCAP-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRCAP, Length 1,292 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCAP-201ENST00000326294 DLC1Q96QB1 1528 aa28.47■■■□□ 2.15
PTPRCAP-201ENST00000326294 SIRT1Q96EB6 747 aa28.43■■■□□ 2.14
PTPRCAP-201ENST00000326294 FMN2Q9NZ56 1722 aa28.41■■■□□ 2.14
PTPRCAP-201ENST00000326294 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa28.41■■■□□ 2.14
PTPRCAP-201ENST00000326294 JCADQ9P266 1359 aa28.39■■■□□ 2.14
PTPRCAP-201ENST00000326294 SHPRHQ149N8 1683 aa28.39■■■□□ 2.14
PTPRCAP-201ENST00000326294 SIN3AQ96ST3 1273 aa28.38■■■□□ 2.13
PTPRCAP-201ENST00000326294 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP28.36■■■□□ 2.13
PTPRCAP-201ENST00000326294 PRAM1Q96QH2 718 aa28.36■■■□□ 2.13
PTPRCAP-201ENST00000326294 ORAI2Q96SN7 254 aa28.35■■■□□ 2.13
PTPRCAP-201ENST00000326294 ADGRB2O60241 1585 aa28.35■■■□□ 2.13
PTPRCAP-201ENST00000326294 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP28.33■■■□□ 2.13
PTPRCAP-201ENST00000326294 TRAK1Q9UPV9 953 aa28.32■■■□□ 2.12
PTPRCAP-201ENST00000326294 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP28.31■■■□□ 2.12
PTPRCAP-201ENST00000326294 ILDR2Q71H61 639 aa28.31■■■□□ 2.12
PTPRCAP-201ENST00000326294 L3MBTL2Q969R5 705 aa28.3■■■□□ 2.12
PTPRCAP-201ENST00000326294 POGKQ9P215 609 aa28.29■■■□□ 2.12
PTPRCAP-201ENST00000326294 NEUROD1Q13562 356 aa28.28■■■□□ 2.12
PTPRCAP-201ENST00000326294 LRP6O75581 1613 aa28.28■■■□□ 2.12
PTPRCAP-201ENST00000326294 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP28.27■■■□□ 2.12
PTPRCAP-201ENST00000326294 NUTM2FA1L443 756 aa28.27■■■□□ 2.12
PTPRCAP-201ENST00000326294 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP28.27■■■□□ 2.12
PTPRCAP-201ENST00000326294 KIF1AQ12756 1690 aa28.26■■■□□ 2.12
PTPRCAP-201ENST00000326294 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa28.25■■■□□ 2.11
PTPRCAP-201ENST00000326294 ESCO1Q5FWF5 840 aa28.25■■■□□ 2.11
PTPRCAP-201ENST00000326294 USP32Q8NFA0 1604 aa28.25■■■□□ 2.11
PTPRCAP-201ENST00000326294 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP28.24■■■□□ 2.11
PTPRCAP-201ENST00000326294 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa28.24■■■□□ 2.11
PTPRCAP-201ENST00000326294 NBPF1Q3BBV0 1214 aa28.23■■■□□ 2.11
PTPRCAP-201ENST00000326294 PXDNQ92626 1479 aa28.22■■■□□ 2.11
PTPRCAP-201ENST00000326294 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP28.22■■■□□ 2.11
PTPRCAP-201ENST00000326294 PNPLA6Q8IY17 1366 aa28.22■■■□□ 2.11
PTPRCAP-201ENST00000326294 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP28.19■■■□□ 2.1
PTPRCAP-201ENST00000326294 ANKARQ7Z5J8 1434 aa28.19■■■□□ 2.1
PTPRCAP-201ENST00000326294 NPHP3Q7Z494 1330 aa28.18■■■□□ 2.1
PTPRCAP-201ENST00000326294 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP28.18■■■□□ 2.1
PTPRCAP-201ENST00000326294 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP28.18■■■□□ 2.1
PTPRCAP-201ENST00000326294 TULP4Q9NRJ4 1543 aa28.17■■■□□ 2.1
PTPRCAP-201ENST00000326294 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP28.15■■■□□ 2.1
PTPRCAP-201ENST00000326294 FOXO3O43524 673 aa28.15■■■□□ 2.1
PTPRCAP-201ENST00000326294 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP28.13■■■□□ 2.09
PTPRCAP-201ENST00000326294 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP28.12■■■□□ 2.09
PTPRCAP-201ENST00000326294 WASLO00401 505 aaPredicted RBP28.11■■■□□ 2.09
PTPRCAP-201ENST00000326294 PHF8Q9UPP1 1060 aa28.11■■■□□ 2.09
PTPRCAP-201ENST00000326294 PRR36Q9H6K5 1346 aa28.11■■■□□ 2.09
PTPRCAP-201ENST00000326294 TONSLQ96HA7 1378 aa28.11■■■□□ 2.09
PTPRCAP-201ENST00000326294 QRICH2Q9H0J4 1663 aa28.1■■■□□ 2.09
PTPRCAP-201ENST00000326294 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP28.1■■■□□ 2.09
PTPRCAP-201ENST00000326294 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP28.1■■■□□ 2.09
PTPRCAP-201ENST00000326294 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP28.1■■■□□ 2.09
PTPRCAP-201ENST00000326294 ATP7BP35670 1465 aa28.08■■■□□ 2.09
PTPRCAP-201ENST00000326294 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP28.08■■■□□ 2.09
PTPRCAP-201ENST00000326294 ITSN1Q15811 1721 aa28.08■■■□□ 2.09
PTPRCAP-201ENST00000326294 NBPF8Q3BBV2 869 aa28.07■■■□□ 2.08
PTPRCAP-201ENST00000326294 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP28.07■■■□□ 2.08
PTPRCAP-201ENST00000326294 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa28.06■■■□□ 2.08
PTPRCAP-201ENST00000326294 GPRASP1Q5JY77 1395 aa28.04■■■□□ 2.08
PTPRCAP-201ENST00000326294 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP28.04■■■□□ 2.08
PTPRCAP-201ENST00000326294 PCGF6Q9BYE7 350 aa28.04■■■□□ 2.08
PTPRCAP-201ENST00000326294 POTEAQ6S8J7 498 aa28.03■■■□□ 2.08
PTPRCAP-201ENST00000326294 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP28.02■■■□□ 2.08
PTPRCAP-201ENST00000326294 KRT28Q7Z3Y7 464 aa28.02■■■□□ 2.08
PTPRCAP-201ENST00000326294 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa28.02■■■□□ 2.08
PTPRCAP-201ENST00000326294 RALGAPBQ86X10 1494 aa28.02■■■□□ 2.08
PTPRCAP-201ENST00000326294 TNS3Q68CZ2 1445 aa28.01■■■□□ 2.08
PTPRCAP-201ENST00000326294 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa28.01■■■□□ 2.07
PTPRCAP-201ENST00000326294 CDK19Q9BWU1 502 aa28■■■□□ 2.07
PTPRCAP-201ENST00000326294 SOCS7O14512 581 aa27.99■■■□□ 2.07
PTPRCAP-201ENST00000326294 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP27.98■■■□□ 2.07
PTPRCAP-201ENST00000326294 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP27.98■■■□□ 2.07
PTPRCAP-201ENST00000326294 SBNO1A3KN83 1393 aa27.98■■■□□ 2.07
PTPRCAP-201ENST00000326294 ABCA3Q99758 1704 aa27.95■■■□□ 2.07
PTPRCAP-201ENST00000326294 ALS2Q96Q42 1657 aa27.95■■■□□ 2.07
PTPRCAP-201ENST00000326294 ADAMTS2O95450 1211 aa27.95■■■□□ 2.06
PTPRCAP-201ENST00000326294 PSME1Q06323 249 aa27.95■■■□□ 2.06
PTPRCAP-201ENST00000326294 AFF2P51816 1311 aa27.94■■■□□ 2.06
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP27.94■■■□□ 2.06
PTPRCAP-201ENST00000326294 C8orf37Q96NL8 207 aa27.94■■■□□ 2.06
PTPRCAP-201ENST00000326294 ARHGEF10O15013 1369 aa27.9■■■□□ 2.06
PTPRCAP-201ENST00000326294 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP27.89■■■□□ 2.06
PTPRCAP-201ENST00000326294 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP27.88■■■□□ 2.05
PTPRCAP-201ENST00000326294 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP27.88■■■□□ 2.05
PTPRCAP-201ENST00000326294 CARD11Q9BXL7 1154 aa27.88■■■□□ 2.05
PTPRCAP-201ENST00000326294 CCDC61Q9Y6R9 512 aa27.88■■■□□ 2.05
PTPRCAP-201ENST00000326294 CLSPNQ9HAW4 1339 aa27.88■■■□□ 2.05
PTPRCAP-201ENST00000326294 CABP2Q9NPB3 220 aa27.87■■■□□ 2.05
PTPRCAP-201ENST00000326294 NGLY1Q96IV0 654 aa27.86■■■□□ 2.05
PTPRCAP-201ENST00000326294 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa27.86■■■□□ 2.05
PTPRCAP-201ENST00000326294 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa27.85■■■□□ 2.05
PTPRCAP-201ENST00000326294 PLEKHG3A1L390 1219 aa27.84■■■□□ 2.05
PTPRCAP-201ENST00000326294 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa27.84■■■□□ 2.05
PTPRCAP-201ENST00000326294 LMOD2Q6P5Q4 547 aa27.83■■■□□ 2.05
PTPRCAP-201ENST00000326294 ACEP12821 1306 aa27.83■■■□□ 2.05
PTPRCAP-201ENST00000326294 EVC2Q86UK5 1308 aa27.83■■■□□ 2.05
PTPRCAP-201ENST00000326294 CABLES1Q8TDN4 633 aa27.82■■■□□ 2.04
PTPRCAP-201ENST00000326294 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP27.81■■■□□ 2.04
PTPRCAP-201ENST00000326294 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP27.78■■■□□ 2.04
PTPRCAP-201ENST00000326294 PLEKHG5O94827 1062 aa27.78■■■□□ 2.04
PTPRCAP-201ENST00000326294 USP21Q9UK80 565 aa27.78■■■□□ 2.04
PTPRCAP-201ENST00000326294 PLCH1Q4KWH8 1693 aa27.78■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.3 ms