RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000322326.12

IFT20-201, Transcript of intraflagellar transport 20, humanhuman

TSL 2

Gene IFT20, Length 820 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT20-201ENST00000322326 NGLY1Q96IV0 654 aa23.2■■□□□ 1.3
IFT20-201ENST00000322326 RGS12O14924 1447 aa23.19■■□□□ 1.3
IFT20-201ENST00000322326 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP23.19■■□□□ 1.3
IFT20-201ENST00000322326 ADAMTS2O95450 1211 aa23.19■■□□□ 1.3
IFT20-201ENST00000322326 ORAI2Q96SN7 254 aa23.18■■□□□ 1.3
IFT20-201ENST00000322326 PPLO60437 1756 aa23.17■■□□□ 1.3
IFT20-201ENST00000322326 FOXD1Q16676 465 aa23.15■■□□□ 1.3
IFT20-201ENST00000322326 USP21Q9UK80 565 aa23.13■■□□□ 1.29
IFT20-201ENST00000322326 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa23.13■■□□□ 1.29
IFT20-201ENST00000322326 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP23.11■■□□□ 1.29
IFT20-201ENST00000322326 NPHP3Q7Z494 1330 aa23.1■■□□□ 1.29
IFT20-201ENST00000322326 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa23.1■■□□□ 1.29
IFT20-201ENST00000322326 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP23.1■■□□□ 1.29
IFT20-201ENST00000322326 ESCO1Q5FWF5 840 aa23.09■■□□□ 1.29
IFT20-201ENST00000322326 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP23.08■■□□□ 1.29
IFT20-201ENST00000322326 ATAD2Q6PL18 1390 aa23.08■■□□□ 1.29
IFT20-201ENST00000322326 CCDC144AA2RUR9 1427 aa23.06■■□□□ 1.28
IFT20-201ENST00000322326 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP23.04■■□□□ 1.28
IFT20-201ENST00000322326 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa23.04■■□□□ 1.28
IFT20-201ENST00000322326 MYOM2P54296 1465 aa23.04■■□□□ 1.28
IFT20-201ENST00000322326 ATRNO75882 1429 aa23.03■■□□□ 1.28
IFT20-201ENST00000322326 PXDNQ92626 1479 aa23.03■■□□□ 1.28
IFT20-201ENST00000322326 TECPR2O15040 1411 aa23.02■■□□□ 1.28
IFT20-201ENST00000322326 FOXO3O43524 673 aa23.02■■□□□ 1.28
IFT20-201ENST00000322326 STK26Q9P289 416 aa23.02■■□□□ 1.28
IFT20-201ENST00000322326 RGL3Q3MIN7 710 aa23.01■■□□□ 1.27
IFT20-201ENST00000322326 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP23.01■■□□□ 1.27
IFT20-201ENST00000322326 SIN3AQ96ST3 1273 aa23■■□□□ 1.27
IFT20-201ENST00000322326 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP22.99■■□□□ 1.27
IFT20-201ENST00000322326 WAPLQ7Z5K2 1190 aa22.99■■□□□ 1.27
IFT20-201ENST00000322326 ABCC11Q96J66 1382 aa22.99■■□□□ 1.27
IFT20-201ENST00000322326 IFT172Q9UG01 1749 aa22.99■■□□□ 1.27
IFT20-201ENST00000322326 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa22.99■■□□□ 1.27
IFT20-201ENST00000322326 NUTM2FA1L443 756 aa22.98■■□□□ 1.27
IFT20-201ENST00000322326 NEUROD1Q13562 356 aa22.98■■□□□ 1.27
IFT20-201ENST00000322326 KNDC1Q76NI1 1749 aa22.98■■□□□ 1.27
IFT20-201ENST00000322326 BCL9LQ86UU0 1499 aa22.97■■□□□ 1.27
IFT20-201ENST00000322326 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP22.95■■□□□ 1.26
IFT20-201ENST00000322326 TMEM132EQ6IEE7 984 aa22.95■■□□□ 1.26
IFT20-201ENST00000322326 KIF1AQ12756 1690 aa22.94■■□□□ 1.26
IFT20-201ENST00000322326 PIK3C2GO75747 1445 aa22.94■■□□□ 1.26
IFT20-201ENST00000322326 FMN2Q9NZ56 1722 aa22.94■■□□□ 1.26
IFT20-201ENST00000322326 TONSLQ96HA7 1378 aa22.93■■□□□ 1.26
IFT20-201ENST00000322326 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa22.93■■□□□ 1.26
IFT20-201ENST00000322326 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
IFT20-201ENST00000322326 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
IFT20-201ENST00000322326 CCDC125Q86Z20 511 aa22.92■■□□□ 1.26
IFT20-201ENST00000322326 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
IFT20-201ENST00000322326 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa22.91■■□□□ 1.26
IFT20-201ENST00000322326 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa22.91■■□□□ 1.26
IFT20-201ENST00000322326 ZRANB1Q9UGI0 708 aa22.9■■□□□ 1.26
IFT20-201ENST00000322326 SIRT1Q96EB6 747 aa22.89■■□□□ 1.25
IFT20-201ENST00000322326 KRT28Q7Z3Y7 464 aa22.88■■□□□ 1.25
IFT20-201ENST00000322326 UNC5CLQ8IV45 518 aa22.88■■□□□ 1.25
IFT20-201ENST00000322326 SLIT2O94813 1529 aa22.87■■□□□ 1.25
IFT20-201ENST00000322326 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP22.85■■□□□ 1.25
IFT20-201ENST00000322326 PSME1Q06323 249 aa22.85■■□□□ 1.25
IFT20-201ENST00000322326 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
IFT20-201ENST00000322326 USP32Q8NFA0 1604 aa22.85■■□□□ 1.25
IFT20-201ENST00000322326 PHF8Q9UPP1 1060 aa22.84■■□□□ 1.25
IFT20-201ENST00000322326 RALGAPBQ86X10 1494 aa22.84■■□□□ 1.25
IFT20-201ENST00000322326 TNS3Q68CZ2 1445 aa22.83■■□□□ 1.25
IFT20-201ENST00000322326 GLI3P10071 1580 aa22.83■■□□□ 1.25
IFT20-201ENST00000322326 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP22.83■■□□□ 1.24
IFT20-201ENST00000322326 NRXN1Q9ULB1 1477 aa22.8■■□□□ 1.24
IFT20-201ENST00000322326 CFAP70Q5T0N1 1121 aa22.8■■□□□ 1.24
IFT20-201ENST00000322326 SBNO1A3KN83 1393 aa22.79■■□□□ 1.24
IFT20-201ENST00000322326 L3MBTL2Q969R5 705 aa22.79■■□□□ 1.24
IFT20-201ENST00000322326 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP22.79■■□□□ 1.24
IFT20-201ENST00000322326 PRAM1Q96QH2 718 aa22.78■■□□□ 1.24
IFT20-201ENST00000322326 ARHGEF10O15013 1369 aa22.77■■□□□ 1.24
IFT20-201ENST00000322326 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP22.77■■□□□ 1.24
IFT20-201ENST00000322326 LMOD2Q6P5Q4 547 aa22.77■■□□□ 1.24
IFT20-201ENST00000322326 NWD2Q9ULI1 1742 aa22.77■■□□□ 1.23
IFT20-201ENST00000322326 VPS72Q15906 364 aa22.76■■□□□ 1.23
IFT20-201ENST00000322326 CABLES1Q8TDN4 633 aa22.76■■□□□ 1.23
IFT20-201ENST00000322326 POGKQ9P215 609 aa22.76■■□□□ 1.23
IFT20-201ENST00000322326 BRWD3Q6RI45 1802 aa22.75■■□□□ 1.23
IFT20-201ENST00000322326 PLCH1Q4KWH8 1693 aa22.75■■□□□ 1.23
IFT20-201ENST00000322326 PLEKHG5O94827 1062 aa22.75■■□□□ 1.23
IFT20-201ENST00000322326 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP22.75■■□□□ 1.23
IFT20-201ENST00000322326 SEPT12Q8IYM1 358 aa22.75■■□□□ 1.23
IFT20-201ENST00000322326 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP22.75■■□□□ 1.23
IFT20-201ENST00000322326 DLC1Q96QB1 1528 aa22.75■■□□□ 1.23
IFT20-201ENST00000322326 ANKARQ7Z5J8 1434 aa22.74■■□□□ 1.23
IFT20-201ENST00000322326 ABCA3Q99758 1704 aa22.74■■□□□ 1.23
IFT20-201ENST00000322326 DCAF11Q8TEB1 546 aa22.73■■□□□ 1.23
IFT20-201ENST00000322326 STAC3Q96MF2 364 aa22.73■■□□□ 1.23
IFT20-201ENST00000322326 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa22.71■■□□□ 1.23
IFT20-201ENST00000322326 ADGRB2O60241 1585 aa22.71■■□□□ 1.23
IFT20-201ENST00000322326 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP22.69■■□□□ 1.22
IFT20-201ENST00000322326 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
IFT20-201ENST00000322326 KRT27Q7Z3Y8 459 aa22.68■■□□□ 1.22
IFT20-201ENST00000322326 DEFB132Q7Z7B7 95 aa22.68■■□□□ 1.22
IFT20-201ENST00000322326 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa22.68■■□□□ 1.22
IFT20-201ENST00000322326 GPRASP1Q5JY77 1395 aa22.67■■□□□ 1.22
IFT20-201ENST00000322326 FAM83GA6ND36 823 aa22.67■■□□□ 1.22
IFT20-201ENST00000322326 EP400Q96L91 3159 aa22.66■■□□□ 1.22
IFT20-201ENST00000322326 A0A0G2JS52 829 aa22.66■■□□□ 1.22
IFT20-201ENST00000322326 MYT1Q01538 1121 aa22.66■■□□□ 1.22
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