RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000292211.4

UBE2Q1-201, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 Q1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UBE2Q1, Length 3,210 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2Q1-201ENST00000292211 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP27.61■■■□□ 2.01
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UBE2Q1-201ENST00000292211 ADGRB1O14514 1584 aa27.6■■■□□ 2.01
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UBE2Q1-201ENST00000292211 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa27.59■■■□□ 2.01
UBE2Q1-201ENST00000292211 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP27.59■■■□□ 2.01
UBE2Q1-201ENST00000292211 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa27.58■■■□□ 2
UBE2Q1-201ENST00000292211 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP27.57■■■□□ 2
UBE2Q1-201ENST00000292211 PRAM1Q96QH2 718 aa27.57■■■□□ 2
UBE2Q1-201ENST00000292211 RNF123Q5XPI4 1314 aa27.57■■■□□ 2
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UBE2Q1-201ENST00000292211 QRICH2Q9H0J4 1663 aa27.56■■■□□ 2
UBE2Q1-201ENST00000292211 APAF1O14727 1248 aa27.54■■■□□ 2
UBE2Q1-201ENST00000292211 PLIN1O60240 522 aa27.54■■■□□ 2
UBE2Q1-201ENST00000292211 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa27.54■■■□□ 2
UBE2Q1-201ENST00000292211 PREX1Q8TCU6 1659 aa27.53■■■□□ 2
UBE2Q1-201ENST00000292211 MYO5BQ9ULV0 1848 aa27.52■■■□□ 2
UBE2Q1-201ENST00000292211 PLPPR3Q6T4P5 718 aa27.52■■■□□ 2
UBE2Q1-201ENST00000292211 CGNL1Q0VF96 1302 aa27.52■■■□□ 2
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UBE2Q1-201ENST00000292211 MYO3AQ8NEV4 1616 aa27.51■■□□□ 1.99
UBE2Q1-201ENST00000292211 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa27.49■■□□□ 1.99
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UBE2Q1-201ENST00000292211 NEUROD2Q15784 382 aa27.49■■□□□ 1.99
UBE2Q1-201ENST00000292211 PPP6R1Q9UPN7 881 aa27.47■■□□□ 1.99
UBE2Q1-201ENST00000292211 INSRP06213 1382 aa27.46■■□□□ 1.99
UBE2Q1-201ENST00000292211 MTHFSP49914 203 aa27.45■■□□□ 1.99
UBE2Q1-201ENST00000292211 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa27.45■■□□□ 1.98
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UBE2Q1-201ENST00000292211 ZFYVE9O95405 1425 aa27.43■■□□□ 1.98
UBE2Q1-201ENST00000292211 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP27.42■■□□□ 1.98
UBE2Q1-201ENST00000292211 WAPLQ7Z5K2 1190 aa27.42■■□□□ 1.98
UBE2Q1-201ENST00000292211 CFAP53Q96M91 514 aa27.41■■□□□ 1.98
UBE2Q1-201ENST00000292211 GGNBP2Q9H3C7 697 aa27.41■■□□□ 1.98
UBE2Q1-201ENST00000292211 TULP4Q9NRJ4 1543 aa27.4■■□□□ 1.98
UBE2Q1-201ENST00000292211 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP27.4■■□□□ 1.98
UBE2Q1-201ENST00000292211 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP27.4■■□□□ 1.98
UBE2Q1-201ENST00000292211 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa27.39■■□□□ 1.97
UBE2Q1-201ENST00000292211 CDK19Q9BWU1 502 aa27.39■■□□□ 1.97
UBE2Q1-201ENST00000292211 DUSP27Q5VZP5 1158 aa27.38■■□□□ 1.97
UBE2Q1-201ENST00000292211 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa27.38■■□□□ 1.97
UBE2Q1-201ENST00000292211 TERF2IPQ9NYB0 399 aa27.38■■□□□ 1.97
UBE2Q1-201ENST00000292211 ZMYM3Q14202 1370 aa27.37■■□□□ 1.97
UBE2Q1-201ENST00000292211 AGLP35573 1532 aa27.37■■□□□ 1.97
UBE2Q1-201ENST00000292211 RIMS2Q9UQ26 1411 aa27.36■■□□□ 1.97
UBE2Q1-201ENST00000292211 PODXL2Q9NZ53 605 aa27.36■■□□□ 1.97
UBE2Q1-201ENST00000292211 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP27.35■■□□□ 1.97
UBE2Q1-201ENST00000292211 CABP1Q9NZU7 370 aa27.34■■□□□ 1.97
UBE2Q1-201ENST00000292211 BRPF3Q9ULD4 1205 aa27.34■■□□□ 1.97
UBE2Q1-201ENST00000292211 A0A1W2PP64 1363 aa27.34■■□□□ 1.97
UBE2Q1-201ENST00000292211 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP27.34■■□□□ 1.97
UBE2Q1-201ENST00000292211 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP27.33■■□□□ 1.97
UBE2Q1-201ENST00000292211 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP27.33■■□□□ 1.97
UBE2Q1-201ENST00000292211 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP27.33■■□□□ 1.97
UBE2Q1-201ENST00000292211 CRBNQ96SW2 442 aa27.33■■□□□ 1.97
UBE2Q1-201ENST00000292211 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP27.33■■□□□ 1.97
UBE2Q1-201ENST00000292211 SLFN5Q08AF3 891 aa27.33■■□□□ 1.97
UBE2Q1-201ENST00000292211 A2ML1A8K2U0 1454 aa27.32■■□□□ 1.96
UBE2Q1-201ENST00000292211 ALKQ9UM73 1620 aa27.32■■□□□ 1.96
UBE2Q1-201ENST00000292211 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP27.31■■□□□ 1.96
UBE2Q1-201ENST00000292211 ATAD2Q6PL18 1390 aa27.31■■□□□ 1.96
UBE2Q1-201ENST00000292211 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP27.31■■□□□ 1.96
UBE2Q1-201ENST00000292211 ZNF521Q96K83 1311 aa27.31■■□□□ 1.96
UBE2Q1-201ENST00000292211 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP27.31■■□□□ 1.96
UBE2Q1-201ENST00000292211 TXNDC2Q86VQ3 553 aa27.3■■□□□ 1.96
UBE2Q1-201ENST00000292211 C20orf194Q5TEA3 1177 aa27.3■■□□□ 1.96
UBE2Q1-201ENST00000292211 PTPRMP28827 1452 aa27.3■■□□□ 1.96
UBE2Q1-201ENST00000292211 REREQ9P2R6 1566 aa27.29■■□□□ 1.96
UBE2Q1-201ENST00000292211 DMRT2Q9Y5R5 561 aa27.28■■□□□ 1.96
UBE2Q1-201ENST00000292211 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP27.28■■□□□ 1.96
UBE2Q1-201ENST00000292211 TCP11L2Q8N4U5 519 aa27.28■■□□□ 1.96
UBE2Q1-201ENST00000292211 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP27.28■■□□□ 1.96
UBE2Q1-201ENST00000292211 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP27.27■■□□□ 1.96
UBE2Q1-201ENST00000292211 RUNDC1Q96C34 613 aa27.27■■□□□ 1.96
UBE2Q1-201ENST00000292211 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa27.27■■□□□ 1.96
UBE2Q1-201ENST00000292211 HDGFP51858 240 aaKnown RBP27.26■■□□□ 1.95
UBE2Q1-201ENST00000292211 E9PSI1 815 aa27.26■■□□□ 1.95
UBE2Q1-201ENST00000292211 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP27.26■■□□□ 1.95
UBE2Q1-201ENST00000292211 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP27.26■■□□□ 1.95
UBE2Q1-201ENST00000292211 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP27.25■■□□□ 1.95
UBE2Q1-201ENST00000292211 FYB1O15117 783 aa27.24■■□□□ 1.95
UBE2Q1-201ENST00000292211 WWC1Q8IX03 1113 aa27.24■■□□□ 1.95
UBE2Q1-201ENST00000292211 VSIG10Q8N0Z9 540 aa27.23■■□□□ 1.95
UBE2Q1-201ENST00000292211 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa27.23■■□□□ 1.95
UBE2Q1-201ENST00000292211 TNRQ92752 1358 aa27.22■■□□□ 1.95
UBE2Q1-201ENST00000292211 NSD2O96028 1365 aa27.22■■□□□ 1.95
UBE2Q1-201ENST00000292211 NINLQ9Y2I6 1382 aa27.22■■□□□ 1.95
UBE2Q1-201ENST00000292211 CANXP27824 592 aaKnown RBP27.2■■□□□ 1.94
UBE2Q1-201ENST00000292211 ABCC11Q96J66 1382 aa27.2■■□□□ 1.94
UBE2Q1-201ENST00000292211 BCAR3O75815 825 aa27.2■■□□□ 1.94
UBE2Q1-201ENST00000292211 METP08581 1390 aa27.19■■□□□ 1.94
UBE2Q1-201ENST00000292211 FBLN1P23142 703 aa27.18■■□□□ 1.94
UBE2Q1-201ENST00000292211 NGEFQ8N5V2 710 aa27.18■■□□□ 1.94
UBE2Q1-201ENST00000292211 NEFMP07197 916 aa27.17■■□□□ 1.94
UBE2Q1-201ENST00000292211 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP27.17■■□□□ 1.94
UBE2Q1-201ENST00000292211 NUTM2FA1L443 756 aa27.16■■□□□ 1.94
UBE2Q1-201ENST00000292211 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP27.15■■□□□ 1.94
UBE2Q1-201ENST00000292211 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa27.14■■□□□ 1.94
UBE2Q1-201ENST00000292211 WASLO00401 505 aaPredicted RBP27.13■■□□□ 1.93
UBE2Q1-201ENST00000292211 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP27.13■■□□□ 1.93
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