RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000263012.10

NOMO3-201, Transcript of NODAL modulator 3, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene NOMO3, Length 3,911 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOMO3-201ENST00000263012 TESK2Q96S53 571 aa21.79■■□□□ 1.08
NOMO3-201ENST00000263012 KDM6BO15054 1643 aa21.79■■□□□ 1.08
NOMO3-201ENST00000263012 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa21.78■■□□□ 1.08
NOMO3-201ENST00000263012 STK31Q9BXU1 1019 aa21.78■■□□□ 1.08
NOMO3-201ENST00000263012 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa21.77■■□□□ 1.08
NOMO3-201ENST00000263012 NEK4P51957 841 aa21.77■■□□□ 1.08
NOMO3-201ENST00000263012 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP21.77■■□□□ 1.08
NOMO3-201ENST00000263012 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP21.76■■□□□ 1.07
NOMO3-201ENST00000263012 SSFA2P28290 1259 aa21.76■■□□□ 1.07
NOMO3-201ENST00000263012 RRAGDQ9NQL2 400 aaPredicted RBP21.76■■□□□ 1.07
NOMO3-201ENST00000263012 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP21.76■■□□□ 1.07
NOMO3-201ENST00000263012 CCDC27Q2M243 656 aa21.76■■□□□ 1.07
NOMO3-201ENST00000263012 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP21.76■■□□□ 1.07
NOMO3-201ENST00000263012 RNF123Q5XPI4 1314 aa21.76■■□□□ 1.07
NOMO3-201ENST00000263012 TRIM27P14373 513 aa21.75■■□□□ 1.07
NOMO3-201ENST00000263012 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP21.75■■□□□ 1.07
NOMO3-201ENST00000263012 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa21.75■■□□□ 1.07
NOMO3-201ENST00000263012 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP21.75■■□□□ 1.07
NOMO3-201ENST00000263012 CHD1LQ86WJ1 897 aa21.74■■□□□ 1.07
NOMO3-201ENST00000263012 NUTM2GQ5VZR2 741 aa21.74■■□□□ 1.07
NOMO3-201ENST00000263012 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP21.74■■□□□ 1.07
NOMO3-201ENST00000263012 FBXW7Q969H0 707 aa21.74■■□□□ 1.07
NOMO3-201ENST00000263012 PKNOX2Q96KN3 472 aa21.74■■□□□ 1.07
NOMO3-201ENST00000263012 MIS18AQ9NYP9 233 aa21.73■■□□□ 1.07
NOMO3-201ENST00000263012 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP21.73■■□□□ 1.07
NOMO3-201ENST00000263012 KIF16BQ96L93 1317 aa21.73■■□□□ 1.07
NOMO3-201ENST00000263012 UGGT2Q9NYU1 1516 aa21.72■■□□□ 1.07
NOMO3-201ENST00000263012 HMMRO75330 724 aa21.72■■□□□ 1.07
NOMO3-201ENST00000263012 ARHGAP5Q13017 1502 aa21.72■■□□□ 1.07
NOMO3-201ENST00000263012 VGFO15240 615 aaPredicted RBP21.72■■□□□ 1.07
NOMO3-201ENST00000263012 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP21.72■■□□□ 1.07
NOMO3-201ENST00000263012 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP21.72■■□□□ 1.07
NOMO3-201ENST00000263012 FOSBP53539 338 aa21.72■■□□□ 1.07
NOMO3-201ENST00000263012 TBC1D32Q96NH3 1257 aa21.72■■□□□ 1.07
NOMO3-201ENST00000263012 CABP1Q9NZU7 370 aa21.72■■□□□ 1.07
NOMO3-201ENST00000263012 TMPOP42166 694 aaKnown RBP21.71■■□□□ 1.07
NOMO3-201ENST00000263012 NSD3Q9BZ95 1437 aa21.71■■□□□ 1.07
NOMO3-201ENST00000263012 PRAM1Q96QH2 718 aa21.71■■□□□ 1.07
NOMO3-201ENST00000263012 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP21.7■■□□□ 1.06
NOMO3-201ENST00000263012 HECW1Q76N89 1606 aa21.7■■□□□ 1.06
NOMO3-201ENST00000263012 PARD3Q8TEW0 1356 aa21.7■■□□□ 1.06
NOMO3-201ENST00000263012 CDC45O75419 566 aa21.7■■□□□ 1.06
NOMO3-201ENST00000263012 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP21.7■■□□□ 1.06
NOMO3-201ENST00000263012 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP21.7■■□□□ 1.06
NOMO3-201ENST00000263012 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP21.7■■□□□ 1.06
NOMO3-201ENST00000263012 TSHZ3Q63HK5 1081 aa21.69■■□□□ 1.06
NOMO3-201ENST00000263012 ZNF592Q92610 1267 aa21.69■■□□□ 1.06
NOMO3-201ENST00000263012 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP21.68■■□□□ 1.06
NOMO3-201ENST00000263012 AMPHP49418 695 aa21.68■■□□□ 1.06
NOMO3-201ENST00000263012 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP21.68■■□□□ 1.06
NOMO3-201ENST00000263012 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP21.68■■□□□ 1.06
NOMO3-201ENST00000263012 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP21.68■■□□□ 1.06
NOMO3-201ENST00000263012 IQGAP2Q13576 1575 aa21.68■■□□□ 1.06
NOMO3-201ENST00000263012 DTNBO60941 627 aa21.67■■□□□ 1.06
NOMO3-201ENST00000263012 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP21.67■■□□□ 1.06
NOMO3-201ENST00000263012 COG3Q96JB2 828 aa21.67■■□□□ 1.06
NOMO3-201ENST00000263012 GDPD2Q9HCC8 539 aa21.67■■□□□ 1.06
NOMO3-201ENST00000263012 NGEFQ8N5V2 710 aa21.67■■□□□ 1.06
NOMO3-201ENST00000263012 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP21.67■■□□□ 1.06
NOMO3-201ENST00000263012 CARD14Q9BXL6 1004 aa21.67■■□□□ 1.06
NOMO3-201ENST00000263012 PTMSP20962 102 aa21.66■■□□□ 1.06
NOMO3-201ENST00000263012 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP21.66■■□□□ 1.06
NOMO3-201ENST00000263012 CFAP43Q8NDM7 1665 aa21.66■■□□□ 1.06
NOMO3-201ENST00000263012 SCAPERQ9BY12 1400 aa21.65■■□□□ 1.06
NOMO3-201ENST00000263012 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP21.65■■□□□ 1.06
NOMO3-201ENST00000263012 WDR63Q8IWG1 891 aa21.65■■□□□ 1.06
NOMO3-201ENST00000263012 REC8O95072 547 aa21.65■■□□□ 1.06
NOMO3-201ENST00000263012 PRDM10Q9NQV6 1147 aa21.65■■□□□ 1.06
NOMO3-201ENST00000263012 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP21.65■■□□□ 1.06
NOMO3-201ENST00000263012 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa21.64■■□□□ 1.06
NOMO3-201ENST00000263012 SYCE3A1L190 88 aa21.64■■□□□ 1.05
NOMO3-201ENST00000263012 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP21.64■■□□□ 1.05
NOMO3-201ENST00000263012 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP21.63■■□□□ 1.05
NOMO3-201ENST00000263012 FIBPO43427 364 aa21.63■■□□□ 1.05
NOMO3-201ENST00000263012 NUCB2P80303 420 aa21.63■■□□□ 1.05
NOMO3-201ENST00000263012 KDM2BQ8NHM5 1336 aa21.63■■□□□ 1.05
NOMO3-201ENST00000263012 SPC24Q8NBT2 197 aa21.62■■□□□ 1.05
NOMO3-201ENST00000263012 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa21.62■■□□□ 1.05
NOMO3-201ENST00000263012 GNAI1P63096 354 aa21.61■■□□□ 1.05
NOMO3-201ENST00000263012 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP21.61■■□□□ 1.05
NOMO3-201ENST00000263012 GPRASP1Q5JY77 1395 aa21.61■■□□□ 1.05
NOMO3-201ENST00000263012 FAM83GA6ND36 823 aa21.61■■□□□ 1.05
NOMO3-201ENST00000263012 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP21.61■■□□□ 1.05
NOMO3-201ENST00000263012 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa21.61■■□□□ 1.05
NOMO3-201ENST00000263012 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa21.6■■□□□ 1.05
NOMO3-201ENST00000263012 TEX14Q8IWB6 1497 aa21.6■■□□□ 1.05
NOMO3-201ENST00000263012 SLC4A2P04920 1241 aa21.6■■□□□ 1.05
NOMO3-201ENST00000263012 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP21.6■■□□□ 1.05
NOMO3-201ENST00000263012 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP21.59■■□□□ 1.05
NOMO3-201ENST00000263012 TSPYL4Q9UJ04 414 aa21.59■■□□□ 1.05
NOMO3-201ENST00000263012 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP21.59■■□□□ 1.05
NOMO3-201ENST00000263012 SULT6B1Q6IMI4 303 aa21.59■■□□□ 1.05
NOMO3-201ENST00000263012 CUL7Q14999 1698 aa21.59■■□□□ 1.05
NOMO3-201ENST00000263012 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP21.58■■□□□ 1.05
NOMO3-201ENST00000263012 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP21.58■■□□□ 1.05
NOMO3-201ENST00000263012 LMOD3Q0VAK6 560 aa21.58■■□□□ 1.04
NOMO3-201ENST00000263012 F6X3S4 739 aa21.57■■□□□ 1.04
NOMO3-201ENST00000263012 RAPGEF3O95398 923 aa21.57■■□□□ 1.04
NOMO3-201ENST00000263012 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa21.57■■□□□ 1.04
NOMO3-201ENST00000263012 PZPP20742 1482 aa21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 54 ms