RNA–Protein interactions for RNA: YOL052C-A

DDR2, Transcript of Multi-stress response protein, yeast

Gene DDR2, Length 186 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
DDR2	YOL052C-A	BSC4	P53841	131 aa		7.1	□□□□□ -1.27
DDR2	YOL052C-A	YDR381C-A	Q3E6R5	114 aa		7.1	□□□□□ -1.27
DDR2	YOL052C-A	YLR415C	O13578	112 aa		7.09	□□□□□ -1.27
DDR2	YOL052C-A	RPL36B	O14455	100 aa	Known RBP	7.09	□□□□□ -1.27
DDR2	YOL052C-A	YAR1	P46683	200 aa		7.09	□□□□□ -1.27
DDR2	YOL052C-A	MMS2	P53152	137 aa		7.09	□□□□□ -1.27
DDR2	YOL052C-A	SLO1	Q3E784	85 aa		7.09	□□□□□ -1.27
DDR2	YOL052C-A	EDC2	P40023	145 aa	Predicted RBP	7.08	□□□□□ -1.28
DDR2	YOL052C-A	YHR007C-A	Q07074	71 aa		7.08	□□□□□ -1.28
DDR2	YOL052C-A	YOR072W	Q08486	104 aa		7.08	□□□□□ -1.28
DDR2	YOL052C-A	YFR009W-A	P0C5M9	85 aa		7.07	□□□□□ -1.28
DDR2	YOL052C-A	SPG1	P50088	95 aa		7.07	□□□□□ -1.28
DDR2	YOL052C-A	YBL112C	Q3E7Y4	105 aa		7.07	□□□□□ -1.28
DDR2	YOL052C-A	INO4	P13902	151 aa		7.06	□□□□□ -1.28
DDR2	YOL052C-A	SKI6	P46948	246 aa	Predicted RBP	7.06	□□□□□ -1.28
DDR2	YOL052C-A	YHR139C-A	O13536	103 aa		7.05	□□□□□ -1.28
DDR2	YOL052C-A	KRE1	P17260	313 aa		7.05	□□□□□ -1.28
DDR2	YOL052C-A	RSM19	P53733	91 aa	Predicted RBP	7.04	□□□□□ -1.28
DDR2	YOL052C-A	MDN1	Q12019	4910 aa	Known RBP	7.03	□□□□□ -1.28
DDR2	YOL052C-A	YJR085C	P47131	105 aa	Known RBP	7	□□□□□ -1.29
DDR2	YOL052C-A	RUB1	Q03919	77 aa		7	□□□□□ -1.29
DDR2	YOL052C-A	TDA8	Q6B2U8	126 aa		7	□□□□□ -1.29
DDR2	YOL052C-A	ICS3	P47034	131 aa		6.99	□□□□□ -1.29
DDR2	YOL052C-A	ISD11	Q6Q560	94 aa		6.99	□□□□□ -1.29
DDR2	YOL052C-A	RSM18	P40033	138 aa		6.98	□□□□□ -1.29
DDR2	YOL052C-A	YAL063C-A	Q3E791	96 aa		6.98	□□□□□ -1.29
DDR2	YOL052C-A	YHR213W-B	Q8TGK1	99 aa		6.98	□□□□□ -1.29
DDR2	YOL052C-A	RAD6	P06104	172 aa		6.96	□□□□□ -1.3
DDR2	YOL052C-A	SHH4	Q06236	168 aa		6.96	□□□□□ -1.3
DDR2	YOL052C-A	YOR268C	Q08734	132 aa		6.95	□□□□□ -1.3
DDR2	YOL052C-A	COX23	P38824	151 aa		6.94	□□□□□ -1.3
DDR2	YOL052C-A	DDR48	P18899	430 aa	Known RBP	6.93	□□□□□ -1.3
DDR2	YOL052C-A	TDA2	P40045	126 aa		6.93	□□□□□ -1.3
DDR2	YOL052C-A	EDC1	P53080	175 aa	Predicted RBP	6.93	□□□□□ -1.3
DDR2	YOL052C-A	YGL149W	P53116	101 aa		6.93	□□□□□ -1.3
DDR2	YOL052C-A	YNL184C	P53876	108 aa		6.93	□□□□□ -1.3
DDR2	YOL052C-A	EMC6	Q12431	108 aa		6.93	□□□□□ -1.3
DDR2	YOL052C-A	YJL133C-A	Q3E7A3	74 aa		6.93	□□□□□ -1.3
DDR2	YOL052C-A	YFL041W-A	Q3E817	63 aa		6.93	□□□□□ -1.3
DDR2	YOL052C-A	YMR230W-A	Q3E7B5	62 aa		6.92	□□□□□ -1.3
DDR2	YOL052C-A	RPL38	P49167	78 aa	Known RBP	6.91	□□□□□ -1.3
DDR2	YOL052C-A	YFL065C	P43539	102 aa		6.9	□□□□□ -1.3
DDR2	YOL052C-A	YPR203W	Q08994	102 aa		6.9	□□□□□ -1.3
DDR2	YOL052C-A	YBR027C	P38220	110 aa		6.89	□□□□□ -1.31
DDR2	YOL052C-A	ECM19	Q06011	112 aa		6.89	□□□□□ -1.31
DDR2	YOL052C-A	YLR162W	Q06235	118 aa		6.89	□□□□□ -1.31
DDR2	YOL052C-A	YJL197C-A	P0C5P0	93 aa		6.87	□□□□□ -1.31
DDR2	YOL052C-A	YHL042W	P38729	150 aa		6.87	□□□□□ -1.31
DDR2	YOL052C-A	MIC10	Q96VH5	97 aa		6.87	□□□□□ -1.31
DDR2	YOL052C-A	YEL045C	P32616	141 aa		6.85	□□□□□ -1.31
DDR2	YOL052C-A	ATP20	Q12233	115 aa		6.85	□□□□□ -1.31
DDR2	YOL052C-A	YSY6	P38374	65 aa		6.84	□□□□□ -1.31
DDR2	YOL052C-A	SAP30	P38429	201 aa		6.84	□□□□□ -1.31
DDR2	YOL052C-A	YOL014W	Q08110	124 aa		6.84	□□□□□ -1.31
DDR2	YOL052C-A	YFL067W	P43537	175 aa		6.83	□□□□□ -1.32
DDR2	YOL052C-A	YLR285C-A	Q3E771	56 aa		6.83	□□□□□ -1.32
DDR2	YOL052C-A	YBR182C-A	Q8TGU6	64 aa		6.83	□□□□□ -1.32
DDR2	YOL052C-A	YCR050C	P25630	102 aa		6.82	□□□□□ -1.32
DDR2	YOL052C-A	RPP2A	P05319	106 aa	Known RBP	6.81	□□□□□ -1.32
DDR2	YOL052C-A	YLR157W-D	P0CE99	70 aa		6.8	□□□□□ -1.32
DDR2	YOL052C-A	YOL097W-A	Q3E7Y9	61 aa		6.8	□□□□□ -1.32
DDR2	YOL052C-A	COF1	Q03048	143 aa	Known RBP	6.79	□□□□□ -1.32
DDR2	YOL052C-A	KTI11	Q3E840	82 aa		6.79	□□□□□ -1.32
DDR2	YOL052C-A	KSH1	Q8TGJ3	72 aa		6.79	□□□□□ -1.32
DDR2	YOL052C-A	YOR304C-A	O14468	76 aa		6.77	□□□□□ -1.33
DDR2	YOL052C-A	YDR010C	Q12426	110 aa		6.76	□□□□□ -1.33
DDR2	YOL052C-A	YKL183C-A	Q3E765	70 aa		6.74	□□□□□ -1.33
DDR2	YOL052C-A	HOT13	P36078	116 aa		6.73	□□□□□ -1.33
DDR2	YOL052C-A	SOH1	P38633	127 aa		6.71	□□□□□ -1.34
DDR2	YOL052C-A	YCR043C	P25361	127 aa		6.69	□□□□□ -1.34
DDR2	YOL052C-A	YGR039W	P53225	103 aa		6.67	□□□□□ -1.34
DDR2	YOL052C-A	YDR119W-A	Q2V2P9	66 aa		6.66	□□□□□ -1.34
DDR2	YOL052C-A	YHL018W	P38744	120 aa	Predicted RBP	6.65	□□□□□ -1.34
DDR2	YOL052C-A	YHL005C	P38752	130 aa		6.65	□□□□□ -1.34
DDR2	YOL052C-A	RPL36A	P05745	100 aa	Predicted RBP	6.63	□□□□□ -1.35
DDR2	YOL052C-A	YAR064W	P39563	99 aa		6.63	□□□□□ -1.35
DDR2	YOL052C-A	YPL038W-A	Q3E7B4	63 aa		6.63	□□□□□ -1.35
DDR2	YOL052C-A	YIL002W-A	Q3E7Z5	69 aa		6.63	□□□□□ -1.35
DDR2	YOL052C-A	YOR314W	Q12506	109 aa		6.61	□□□□□ -1.35
DDR2	YOL052C-A	COX7	P10174	60 aa		6.55	□□□□□ -1.36
DDR2	YOL052C-A	YPL080C	Q02826	108 aa		6.55	□□□□□ -1.36
DDR2	YOL052C-A	NOP10	Q6Q547	58 aa	Predicted RBP	6.54	□□□□□ -1.36
DDR2	YOL052C-A	YHR073W-A	P0C5N7	58 aa		6.53	□□□□□ -1.36
DDR2	YOL052C-A	YDL012C	Q12489	107 aa		6.53	□□□□□ -1.36
DDR2	YOL052C-A	YKL069W	P36088	180 aa		6.51	□□□□□ -1.37
DDR2	YOL052C-A	YOL013W-A	P0C272	63 aa	Predicted RBP	6.5	□□□□□ -1.37
DDR2	YOL052C-A	YPR153W	Q06537	140 aa		6.49	□□□□□ -1.37
DDR2	YOL052C-A	YDR246W-A	Q3E763	66 aa		6.49	□□□□□ -1.37
DDR2	YOL052C-A	LIP1	Q03579	150 aa		6.47	□□□□□ -1.37
DDR2	YOL052C-A	YER187W	P40102	141 aa		6.46	□□□□□ -1.38
DDR2	YOL052C-A	TOM6	P33448	61 aa		6.45	□□□□□ -1.38
DDR2	YOL052C-A	YIL102C	P40488	101 aa		6.45	□□□□□ -1.38
DDR2	YOL052C-A	YLR361C-A	Q3E795	98 aa		6.45	□□□□□ -1.38
DDR2	YOL052C-A	CMC4	Q3E7A9	73 aa		6.45	□□□□□ -1.38
DDR2	YOL052C-A	AIM4	P38305	123 aa	Predicted RBP	6.44	□□□□□ -1.38
DDR2	YOL052C-A	YNL122C	P53921	115 aa	Predicted RBP	6.44	□□□□□ -1.38
DDR2	YOL052C-A	YDR182W-A	Q3E796	67 aa		6.43	□□□□□ -1.38
DDR2	YOL052C-A	YOL166W-A	Q8TGJ1	51 aa		6.41	□□□□□ -1.38
DDR2	YOL052C-A	YGR164W	P53291	111 aa		6.39	□□□□□ -1.39
DDR2	YOL052C-A	YOR316C-A	Q3E806	69 aa		6.36	□□□□□ -1.39

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 82.4 ms