RNA–Protein interactions for RNA: YLR057W

MNL2, Transcript of Putative mannosidase involved in ER-associated protein degradation, yeast

Gene MNL2, Length 2,550 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
MNL2	YLR057W	YOR034C-A	Q3E735	80 aa		0.8	□□□□□ -2.28
MNL2	YLR057W	YGR121W-A	Q3E816	71 aa		0.8	□□□□□ -2.28
MNL2	YLR057W	YBL071C	P38185	102 aa		0.79	□□□□□ -2.28
MNL2	YLR057W	MPC2	P38857	129 aa		0.79	□□□□□ -2.28
MNL2	YLR057W	DCV1	P43595	202 aa		0.79	□□□□□ -2.28
MNL2	YLR057W	HUR1	P45820	110 aa		0.79	□□□□□ -2.28
MNL2	YLR057W	CCW12	Q12127	133 aa		0.79	□□□□□ -2.28
MNL2	YLR057W	YOR343C	Q12484	108 aa		0.79	□□□□□ -2.28
MNL2	YLR057W	NOP10	Q6Q547	58 aa	Predicted RBP	0.79	□□□□□ -2.28
MNL2	YLR057W	YAL065C	O13511	128 aa		0.79	□□□□□ -2.28
MNL2	YLR057W	SPI1	P40092	148 aa		0.79	□□□□□ -2.28
MNL2	YLR057W	RPL37A	P49166	88 aa	Known RBP	0.79	□□□□□ -2.28
MNL2	YLR057W	YMR122C	Q03879	124 aa		0.79	□□□□□ -2.28
MNL2	YLR057W	YMR321C	Q04898	105 aa		0.79	□□□□□ -2.28
MNL2	YLR057W	YLR194C	Q05777	254 aa		0.79	□□□□□ -2.28
MNL2	YLR057W	YPR153W	Q06537	140 aa		0.79	□□□□□ -2.28
MNL2	YLR057W	CCW14	O13547	238 aa		0.78	□□□□□ -2.28
MNL2	YLR057W	YER188C-A	P0C0V2	99 aa		0.78	□□□□□ -2.28
MNL2	YLR057W	FYV5	P25585	152 aa		0.78	□□□□□ -2.28
MNL2	YLR057W	YHL005C	P38752	130 aa		0.78	□□□□□ -2.28
MNL2	YLR057W	SPC1	P46965	94 aa		0.78	□□□□□ -2.28
MNL2	YLR057W	MRPS12	P53732	153 aa		0.78	□□□□□ -2.28
MNL2	YLR057W	MGR2	Q02889	113 aa		0.78	□□□□□ -2.28
MNL2	YLR057W	YOR314W	Q12506	109 aa		0.78	□□□□□ -2.28
MNL2	YLR057W	YGR035W-A	Q45U48	73 aa		0.78	□□□□□ -2.28
MNL2	YLR057W	YOR032W-A	Q8TGS1	66 aa		0.78	□□□□□ -2.28
MNL2	YLR057W	OST5	Q92316	86 aa		0.78	□□□□□ -2.28
MNL2	YLR057W	RPS30A	P0CX33	63 aa	Known RBP	0.78	□□□□□ -2.28
MNL2	YLR057W	RPS30B	P0CX34	63 aa	Known RBP	0.78	□□□□□ -2.28
MNL2	YLR057W	SHU1	P38751	150 aa		0.78	□□□□□ -2.28
MNL2	YLR057W	IRC21	Q04772	201 aa		0.78	□□□□□ -2.28
MNL2	YLR057W	VAM10	Q08474	114 aa		0.78	□□□□□ -2.28
MNL2	YLR057W	YIL156W-B	Q2V2P4	73 aa		0.78	□□□□□ -2.28
MNL2	YLR057W	YPR117W	Q06116	2489 aa		0.78	□□□□□ -2.29
MNL2	YLR057W	YIR020C	P40575	100 aa		0.77	□□□□□ -2.29
MNL2	YLR057W	RPL38	P49167	78 aa	Known RBP	0.77	□□□□□ -2.29
MNL2	YLR057W	YOL166W-A	Q8TGJ1	51 aa		0.77	□□□□□ -2.29
MNL2	YLR057W	SEN1	Q00416	2231 aa	Known RBP	0.77	□□□□□ -2.29
MNL2	YLR057W	YOL013W-A	P0C272	63 aa	Predicted RBP	0.77	□□□□□ -2.29
MNL2	YLR057W	TOS6	P48560	102 aa		0.77	□□□□□ -2.29
MNL2	YLR057W	YDR010C	Q12426	110 aa		0.77	□□□□□ -2.29
MNL2	YLR057W	RPL36B	O14455	100 aa	Known RBP	0.76	□□□□□ -2.29
MNL2	YLR057W	RPL36A	P05745	100 aa	Predicted RBP	0.76	□□□□□ -2.29
MNL2	YLR057W	YJR107C-A	P0CT86	78 aa		0.76	□□□□□ -2.29
MNL2	YLR057W	MRPL38	P35996	138 aa	Predicted RBP	0.76	□□□□□ -2.29
MNL2	YLR057W	QCR10	P37299	77 aa		0.76	□□□□□ -2.29
MNL2	YLR057W	NCE101	Q02820	53 aa		0.76	□□□□□ -2.29
MNL2	YLR057W	YGL258W-A	Q3E740	77 aa		0.76	□□□□□ -2.29
MNL2	YLR057W	YOR008C-A	Q3E7B9	74 aa		0.76	□□□□□ -2.29
MNL2	YLR057W	SPG1	P50088	95 aa		0.76	□□□□□ -2.29
MNL2	YLR057W	YGR025W	P53216	100 aa		0.76	□□□□□ -2.29
MNL2	YLR057W	SEC16	P48415	2195 aa	Known RBP	0.75	□□□□□ -2.29
MNL2	YLR057W	COX23	P38824	151 aa		0.75	□□□□□ -2.29
MNL2	YLR057W	POR2	P40478	281 aa		0.75	□□□□□ -2.29
MNL2	YLR057W	SOM1	Q05676	74 aa		0.75	□□□□□ -2.29
MNL2	YLR057W	YKL065W-A	Q2V2P2	73 aa		0.75	□□□□□ -2.29
MNL2	YLR057W	YDR182W-A	Q3E796	67 aa		0.75	□□□□□ -2.29
MNL2	YLR057W	RTC6	O14464	93 aa		0.75	□□□□□ -2.29
MNL2	YLR057W	YGL014C-A	P0C5N1	53 aa		0.75	□□□□□ -2.29
MNL2	YLR057W	RPS27A	P35997	82 aa	Known RBP	0.75	□□□□□ -2.29
MNL2	YLR057W	RPS27B	P38711	82 aa		0.75	□□□□□ -2.29
MNL2	YLR057W	YIL102C	P40488	101 aa		0.75	□□□□□ -2.29
MNL2	YLR057W	YCR095W-A	Q3E787	52 aa		0.75	□□□□□ -2.29
MNL2	YLR057W	YNL042W-B	Q3E7Z2	85 aa		0.75	□□□□□ -2.29
MNL2	YLR057W	IRA1	P18963	3092 aa		0.75	□□□□□ -2.29
MNL2	YLR057W	YFR009W-A	P0C5M9	85 aa		0.74	□□□□□ -2.29
MNL2	YLR057W	RPS11A	P0CX47	156 aa	Known RBP	0.74	□□□□□ -2.29
MNL2	YLR057W	RPS11B	P0CX48	156 aa	Known RBP	0.74	□□□□□ -2.29
MNL2	YLR057W	YGL149W	P53116	101 aa		0.74	□□□□□ -2.29
MNL2	YLR057W	YLR342W-A	Q3E810	57 aa		0.74	□□□□□ -2.29
MNL2	YLR057W	RPL33A	P05744	107 aa	Known RBP	0.74	□□□□□ -2.29
MNL2	YLR057W	YAR064W	P39563	99 aa		0.74	□□□□□ -2.29
MNL2	YLR057W	ATP18	P81450	59 aa		0.74	□□□□□ -2.29
MNL2	YLR057W	POL2	P21951	2222 aa	Known RBP	0.73	□□□□□ -2.29
MNL2	YLR057W	YSF3	P0C074	85 aa	Predicted RBP	0.73	□□□□□ -2.29
MNL2	YLR057W	YCR001W	P25347	104 aa		0.73	□□□□□ -2.29
MNL2	YLR057W	MRX7	P53869	86 aa		0.73	□□□□□ -2.29
MNL2	YLR057W	YPR010C-A	A5Z2X5	72 aa		0.73	□□□□□ -2.29
MNL2	YLR057W	SNA2	P56508	79 aa		0.73	□□□□□ -2.29
MNL2	YLR057W	YLR157W-D	P0CE99	70 aa		0.72	□□□□□ -2.29
MNL2	YLR057W	SIP18	P50263	79 aa		0.72	□□□□□ -2.29
MNL2	YLR057W	BSC4	P53841	131 aa		0.72	□□□□□ -2.29
MNL2	YLR057W	YBR200W-A	Q3E755	54 aa		0.72	□□□□□ -2.29
MNL2	YLR057W	YLL006W-A	Q3E814	58 aa		0.72	□□□□□ -2.29
MNL2	YLR057W	YMR122W-A	Q3E842	84 aa		0.72	□□□□□ -2.29
MNL2	YLR057W	YMR001C-A	Q8TGS9	76 aa		0.72	□□□□□ -2.29
MNL2	YLR057W	YNL122C	P53921	115 aa	Predicted RBP	0.72	□□□□□ -2.29
MNL2	YLR057W	Q0032	Q9ZZX7	96 aa		0.72	□□□□□ -2.29
MNL2	YLR057W	HFA1	P32874	2273 aa		0.72	□□□□□ -2.29
MNL2	YLR057W	YJL197C-A	P0C5P0	93 aa		0.71	□□□□□ -2.3
MNL2	YLR057W	HHY1	P39982	102 aa		0.71	□□□□□ -2.3
MNL2	YLR057W	SDH6	Q3E785	79 aa		0.71	□□□□□ -2.3
MNL2	YLR057W	HUB1	Q6Q546	73 aa		0.71	□□□□□ -2.3
MNL2	YLR057W	YHR213W-B	Q8TGK1	99 aa		0.71	□□□□□ -2.3
MNL2	YLR057W	YMR105W-A	Q8TGS8	64 aa		0.71	□□□□□ -2.3
MNL2	YLR057W	URA2	P07259	2214 aa	Known RBP	0.71	□□□□□ -2.3
MNL2	YLR057W	RPL39	P04650	51 aa		0.71	□□□□□ -2.3
MNL2	YLR057W	ATP17	Q06405	101 aa		0.71	□□□□□ -2.3
MNL2	YLR057W	SGF11	Q03067	99 aa		0.7	□□□□□ -2.3
MNL2	YLR057W	YJL133C-A	Q3E7A3	74 aa		0.7	□□□□□ -2.3

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