RNA–Protein interactions for RNA: YJL033W

HCA4, Transcript of DEAD box RNA helicase, yeastyeast

Gene HCA4, Length 2,313 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HCA4YJL033W YLR162WQ06235 118 aa2.78□□□□□ -1.96
HCA4YJL033W YLR236CA0A023PZG4 107 aa2.77□□□□□ -1.97
HCA4YJL033W YOR314WQ12506 109 aa2.77□□□□□ -1.97
HCA4YJL033W SPG4Q04438 115 aa2.77□□□□□ -1.97
HCA4YJL033W YPR013CQ12145 317 aa2.77□□□□□ -1.97
HCA4YJL033W YBR200W-AQ3E755 54 aa2.77□□□□□ -1.97
HCA4YJL033W YOR011W-AQ3E807 68 aa2.77□□□□□ -1.97
HCA4YJL033W YEL008WP40001 126 aa2.76□□□□□ -1.97
HCA4YJL033W YHL005CP38752 130 aa2.76□□□□□ -1.97
HCA4YJL033W YFR035CP43608 114 aa2.76□□□□□ -1.97
HCA4YJL033W UTP20P35194 2493 aaKnown RBP2.76□□□□□ -1.97
HCA4YJL033W RPL36BO14455 100 aaKnown RBP2.75□□□□□ -1.97
HCA4YJL033W RPL36AP05745 100 aaPredicted RBP2.75□□□□□ -1.97
HCA4YJL033W YIR020CP40575 100 aa2.75□□□□□ -1.97
HCA4YJL033W MPC3P53311 146 aa2.75□□□□□ -1.97
HCA4YJL033W ATP18P81450 59 aa2.75□□□□□ -1.97
HCA4YJL033W YMR122CQ03879 124 aa2.75□□□□□ -1.97
HCA4YJL033W YOL166W-AQ8TGJ1 51 aa2.75□□□□□ -1.97
HCA4YJL033W TDA2P40045 126 aa2.74□□□□□ -1.97
HCA4YJL033W YPL278CQ08990 100 aa2.74□□□□□ -1.97
HCA4YJL033W YGR035W-AQ45U48 73 aa2.74□□□□□ -1.97
HCA4YJL033W YFR009W-AP0C5M9 85 aa2.74□□□□□ -1.97
HCA4YJL033W RPS30AP0CX33 63 aaKnown RBP2.74□□□□□ -1.97
HCA4YJL033W RPS30BP0CX34 63 aaKnown RBP2.74□□□□□ -1.97
HCA4YJL033W POR2P40478 281 aa2.74□□□□□ -1.97
HCA4YJL033W YDR182W-AQ3E796 67 aa2.74□□□□□ -1.97
HCA4YJL033W OST5Q92316 86 aa2.74□□□□□ -1.97
HCA4YJL033W YOR020W-AQ3E824 90 aa2.73□□□□□ -1.97
HCA4YJL033W YER188C-AP0C0V2 99 aa2.73□□□□□ -1.97
HCA4YJL033W TOS8P53147 276 aa2.73□□□□□ -1.97
HCA4YJL033W YKL065W-AQ2V2P2 73 aa2.73□□□□□ -1.97
HCA4YJL033W YML100W-AQ8TGT0 57 aa2.73□□□□□ -1.97
HCA4YJL033W YPR153WQ06537 140 aa2.72□□□□□ -1.97
HCA4YJL033W YER135CP40082 130 aa2.71□□□□□ -1.97
HCA4YJL033W YLL006W-AQ3E814 58 aa2.71□□□□□ -1.97
HCA4YJL033W TAR1Q8TGM6 124 aa2.7□□□□□ -1.98
HCA4YJL033W YAL064WP39711 94 aa2.7□□□□□ -1.98
HCA4YJL033W YBR219CP38317 127 aa2.69□□□□□ -1.98
HCA4YJL033W YPS5P53057 165 aa2.69□□□□□ -1.98
HCA4YJL033W CCW12Q12127 133 aa2.69□□□□□ -1.98
HCA4YJL033W TSC3Q3E790 80 aa2.69□□□□□ -1.98
HCA4YJL033W Q0297Q9ZZV8 51 aa2.69□□□□□ -1.98
HCA4YJL033W YOL014WQ08110 124 aa2.69□□□□□ -1.98
HCA4YJL033W VAM10Q08474 114 aa2.69□□□□□ -1.98
HCA4YJL033W YIL102CP40488 101 aa2.68□□□□□ -1.98
HCA4YJL033W LIP1Q03579 150 aa2.68□□□□□ -1.98
HCA4YJL033W YMR244WQ04018 355 aa2.68□□□□□ -1.98
HCA4YJL033W YMR122W-AQ3E842 84 aa2.68□□□□□ -1.98
HCA4YJL033W YGL193CP53097 103 aa2.67□□□□□ -1.98
HCA4YJL033W YPR010C-AA5Z2X5 72 aa2.66□□□□□ -1.98
HCA4YJL033W IGD1P43598 195 aa2.66□□□□□ -1.98
HCA4YJL033W HOR7Q05827 59 aa2.66□□□□□ -1.98
HCA4YJL033W DDR48P18899 430 aaKnown RBP2.65□□□□□ -1.98
HCA4YJL033W YDR010CQ12426 110 aa2.65□□□□□ -1.98
HCA4YJL033W PMP3P87284 55 aa2.65□□□□□ -1.99
HCA4YJL033W YIL156W-BQ2V2P4 73 aa2.65□□□□□ -1.99
HCA4YJL033W YNL146C-AQ3E7Z1 64 aa2.65□□□□□ -1.99
HCA4YJL033W YCR001WP25347 104 aa2.64□□□□□ -1.99
HCA4YJL033W FYV5P25585 152 aa2.64□□□□□ -1.99
HCA4YJL033W SPC1P46965 94 aa2.64□□□□□ -1.99
HCA4YJL033W YDL012CQ12489 107 aa2.64□□□□□ -1.99
HCA4YJL033W YCR095W-AQ3E787 52 aa2.64□□□□□ -1.99
HCA4YJL033W COX23P38824 151 aa2.64□□□□□ -1.99
HCA4YJL033W SPG1P50088 95 aa2.64□□□□□ -1.99
HCA4YJL033W MRPS8Q03799 155 aa2.63□□□□□ -1.99
HCA4YJL033W RPS11AP0CX47 156 aaKnown RBP2.63□□□□□ -1.99
HCA4YJL033W RPS11BP0CX48 156 aaKnown RBP2.63□□□□□ -1.99
HCA4YJL033W YHR212W-AP0CX91 67 aa2.63□□□□□ -1.99
HCA4YJL033W YHR213W-BQ8TGK1 99 aa2.63□□□□□ -1.99
HCA4YJL033W EDC2P40023 145 aaPredicted RBP2.62□□□□□ -1.99
HCA4YJL033W RPL43AP0CX25 92 aaKnown RBP2.62□□□□□ -1.99
HCA4YJL033W RPL43BP0CX26 92 aa2.62□□□□□ -1.99
HCA4YJL033W HUB1Q6Q546 73 aa2.62□□□□□ -1.99
HCA4YJL033W RPL29P05747 59 aaPredicted RBP2.61□□□□□ -1.99
HCA4YJL033W YLR157W-DP0CE99 70 aa2.61□□□□□ -1.99
HCA4YJL033W YNL042W-BQ3E7Z2 85 aa2.61□□□□□ -1.99
HCA4YJL033W YJL133C-AQ3E7A3 74 aa2.6□□□□□ -1.99
HCA4YJL033W YAR023CD6VPM8 179 aa2.6□□□□□ -1.99
HCA4YJL033W MVB12P42939 101 aa2.6□□□□□ -1.99
HCA4YJL033W YOL013W-AP0C272 63 aaPredicted RBP2.59□□□□□ -1.99
HCA4YJL033W YMR001C-AQ8TGS9 76 aa2.59□□□□□ -1.99
HCA4YJL033W AQY2P0CD90 149 aa2.59□□□□□ -2
HCA4YJL033W SDH6Q3E785 79 aa2.58□□□□□ -2
HCA4YJL033W YJL127C-BQ3E828 52 aa2.58□□□□□ -2
HCA4YJL033W YHR125WP38831 101 aa2.57□□□□□ -2
HCA4YJL033W YBR230W-AQ3E762 66 aa2.57□□□□□ -2
HCA4YJL033W CUP1-1P0CX80 61 aa2.57□□□□□ -2
HCA4YJL033W CUP1-2P0CX81 61 aa2.57□□□□□ -2
HCA4YJL033W YDR115WQ04598 105 aa2.57□□□□□ -2
HCA4YJL033W ECM19Q06011 112 aa2.57□□□□□ -2
HCA4YJL033W QCR10P37299 77 aa2.56□□□□□ -2
HCA4YJL033W MRX7P53869 86 aa2.56□□□□□ -2
HCA4YJL033W YCL042WP25572 119 aa2.55□□□□□ -2
HCA4YJL033W AUA1P32450 94 aa2.55□□□□□ -2
HCA4YJL033W YBR027CP38220 110 aa2.55□□□□□ -2
HCA4YJL033W YGL149WP53116 101 aa2.55□□□□□ -2
HCA4YJL033W YDL241WQ07738 123 aa2.55□□□□□ -2
HCA4YJL033W LCL2Q08045 131 aa2.55□□□□□ -2
HCA4YJL033W YBL039W-BP0C268 59 aa2.54□□□□□ -2
HCA4YJL033W BSC4P53841 131 aa2.54□□□□□ -2
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