RNA–Protein interactions for RNA: YER143W

DDI1, Transcript of DNA damage-inducible v-SNARE binding protein, yeastyeast

Gene DDI1, Length 1,287 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
DDI1YER143W ATP18P81450 59 aa5.71□□□□□ -1.5
DDI1YER143W YFR009W-AP0C5M9 85 aa5.7□□□□□ -1.5
DDI1YER143W BSC4P53841 131 aa5.7□□□□□ -1.5
DDI1YER143W YDR381C-AQ3E6R5 114 aa5.7□□□□□ -1.5
DDI1YER143W YHR007C-AQ07074 71 aa5.69□□□□□ -1.5
DDI1YER143W EDC2P40023 145 aaPredicted RBP5.68□□□□□ -1.5
DDI1YER143W YGR121W-AQ3E816 71 aa5.68□□□□□ -1.5
DDI1YER143W YLR415CO13578 112 aa5.67□□□□□ -1.5
DDI1YER143W PBI2P0CT04 75 aaKnown RBP5.67□□□□□ -1.5
DDI1YER143W ATX1P38636 73 aa5.67□□□□□ -1.5
DDI1YER143W YOR072WQ08486 104 aa5.67□□□□□ -1.5
DDI1YER143W RPL36BO14455 100 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
DDI1YER143W TSC3Q3E790 80 aa5.66□□□□□ -1.5
DDI1YER143W YCR085WP25650 117 aa5.65□□□□□ -1.5
DDI1YER143W YBL112CQ3E7Y4 105 aa5.65□□□□□ -1.5
DDI1YER143W SPG1P50088 95 aa5.64□□□□□ -1.51
DDI1YER143W YMR230W-AQ3E7B5 62 aa5.64□□□□□ -1.51
DDI1YER143W YJR085CP47131 105 aaKnown RBP5.63□□□□□ -1.51
DDI1YER143W INO4P13902 151 aa5.62□□□□□ -1.51
DDI1YER143W SLO1Q3E784 85 aa5.62□□□□□ -1.51
DDI1YER143W TDA8Q6B2U8 126 aa5.62□□□□□ -1.51
DDI1YER143W DDR48P18899 430 aaKnown RBP5.61□□□□□ -1.51
DDI1YER143W SKI6P46948 246 aaPredicted RBP5.61□□□□□ -1.51
DDI1YER143W EDC1P53080 175 aaPredicted RBP5.61□□□□□ -1.51
DDI1YER143W YHR139C-AO13536 103 aa5.6□□□□□ -1.51
DDI1YER143W RSM18P40033 138 aa5.6□□□□□ -1.51
DDI1YER143W RSM19P53733 91 aaPredicted RBP5.6□□□□□ -1.51
DDI1YER143W YAR1P46683 200 aa5.59□□□□□ -1.51
DDI1YER143W ICS3P47034 131 aa5.59□□□□□ -1.51
DDI1YER143W YOR268CQ08734 132 aa5.59□□□□□ -1.51
DDI1YER143W YHR213W-BQ8TGK1 99 aa5.59□□□□□ -1.51
DDI1YER143W YJL197C-AP0C5P0 93 aa5.58□□□□□ -1.52
DDI1YER143W KRE1P17260 313 aa5.58□□□□□ -1.52
DDI1YER143W SHH4Q06236 168 aa5.58□□□□□ -1.52
DDI1YER143W YAL063C-AQ3E791 96 aa5.58□□□□□ -1.52
DDI1YER143W YNL184CP53876 108 aa5.57□□□□□ -1.52
DDI1YER143W YBR027CP38220 110 aa5.56□□□□□ -1.52
DDI1YER143W COX23P38824 151 aa5.55□□□□□ -1.52
DDI1YER143W YJL133C-AQ3E7A3 74 aa5.55□□□□□ -1.52
DDI1YER143W YGL149WP53116 101 aa5.54□□□□□ -1.52
DDI1YER143W RUB1Q03919 77 aa5.54□□□□□ -1.52
DDI1YER143W ECM19Q06011 112 aa5.54□□□□□ -1.52
DDI1YER143W YOL014WQ08110 124 aa5.54□□□□□ -1.52
DDI1YER143W RAD6P06104 172 aa5.53□□□□□ -1.52
DDI1YER143W ISD11Q6Q560 94 aa5.53□□□□□ -1.52
DDI1YER143W YLR162WQ06235 118 aa5.52□□□□□ -1.53
DDI1YER143W YEL045CP32616 141 aa5.51□□□□□ -1.53
DDI1YER143W RPL38P49167 78 aaKnown RBP5.51□□□□□ -1.53
DDI1YER143W YFL041W-AQ3E817 63 aa5.51□□□□□ -1.53
DDI1YER143W YFL067WP43537 175 aa5.5□□□□□ -1.53
DDI1YER143W MIC10Q96VH5 97 aa5.5□□□□□ -1.53
DDI1YER143W TDA2P40045 126 aa5.49□□□□□ -1.53
DDI1YER143W YFL065CP43539 102 aa5.49□□□□□ -1.53
DDI1YER143W YPR203WQ08994 102 aa5.49□□□□□ -1.53
DDI1YER143W EMC6Q12431 108 aa5.47□□□□□ -1.53
DDI1YER143W YDR010CQ12426 110 aa5.45□□□□□ -1.54
DDI1YER143W ATP20Q12233 115 aa5.43□□□□□ -1.54
DDI1YER143W YSY6P38374 65 aa5.42□□□□□ -1.54
DDI1YER143W YHL042WP38729 150 aa5.42□□□□□ -1.54
DDI1YER143W YLR285C-AQ3E771 56 aa5.42□□□□□ -1.54
DDI1YER143W YIL002W-AQ3E7Z5 69 aa5.42□□□□□ -1.54
DDI1YER143W HOT13P36078 116 aa5.41□□□□□ -1.54
DDI1YER143W COF1Q03048 143 aaKnown RBP5.41□□□□□ -1.54
DDI1YER143W YOL097W-AQ3E7Y9 61 aa5.41□□□□□ -1.54
DDI1YER143W YCR050CP25630 102 aa5.4□□□□□ -1.54
DDI1YER143W YLR157W-DP0CE99 70 aa5.39□□□□□ -1.55
DDI1YER143W KSH1Q8TGJ3 72 aa5.37□□□□□ -1.55
DDI1YER143W YBR182C-AQ8TGU6 64 aa5.37□□□□□ -1.55
DDI1YER143W YCR043CP25361 127 aa5.36□□□□□ -1.55
DDI1YER143W YDR119W-AQ2V2P9 66 aa5.34□□□□□ -1.55
DDI1YER143W KTI11Q3E840 82 aa5.34□□□□□ -1.55
DDI1YER143W YHL018WP38744 120 aaPredicted RBP5.31□□□□□ -1.56
DDI1YER143W YHL005CP38752 130 aa5.3□□□□□ -1.56
DDI1YER143W YAR064WP39563 99 aa5.3□□□□□ -1.56
DDI1YER143W YKL183C-AQ3E765 70 aa5.3□□□□□ -1.56
DDI1YER143W YDL012CQ12489 107 aa5.29□□□□□ -1.56
DDI1YER143W YOR304C-AO14468 76 aa5.28□□□□□ -1.56
DDI1YER143W RPL36AP05745 100 aaPredicted RBP5.28□□□□□ -1.56
DDI1YER143W YPL080CQ02826 108 aa5.27□□□□□ -1.57
DDI1YER143W YPL038W-AQ3E7B4 63 aa5.27□□□□□ -1.57
DDI1YER143W YGR039WP53225 103 aa5.26□□□□□ -1.57
DDI1YER143W YDR246W-AQ3E763 66 aa5.25□□□□□ -1.57
DDI1YER143W YHR073W-AP0C5N7 58 aa5.23□□□□□ -1.57
DDI1YER143W YOR314WQ12506 109 aa5.22□□□□□ -1.57
DDI1YER143W NOP10Q6Q547 58 aaPredicted RBP5.22□□□□□ -1.57
DDI1YER143W YPR153WQ06537 140 aa5.19□□□□□ -1.58
DDI1YER143W YOL013W-AP0C272 63 aaPredicted RBP5.17□□□□□ -1.58
DDI1YER143W COX7P10174 60 aa5.17□□□□□ -1.58
DDI1YER143W YLR361C-AQ3E795 98 aa5.16□□□□□ -1.58
DDI1YER143W YNL122CP53921 115 aaPredicted RBP5.15□□□□□ -1.59
DDI1YER143W LIP1Q03579 150 aa5.15□□□□□ -1.59
DDI1YER143W YOL166W-AQ8TGJ1 51 aa5.14□□□□□ -1.59
DDI1YER143W YER187WP40102 141 aa5.12□□□□□ -1.59
DDI1YER143W YIL102CP40488 101 aa5.12□□□□□ -1.59
DDI1YER143W YGR164WP53291 111 aa5.11□□□□□ -1.59
DDI1YER143W CMC4Q3E7A9 73 aa5.11□□□□□ -1.59
DDI1YER143W YOR316C-AQ3E806 69 aa5.11□□□□□ -1.59
DDI1YER143W AIM4P38305 123 aaPredicted RBP5.09□□□□□ -1.59
DDI1YER143W TOM6P33448 61 aa5.08□□□□□ -1.6
DDI1YER143W YDR182W-AQ3E796 67 aa5.08□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 88.4 ms