RNA–Protein interactions for RNA: YCR093W

CDC39, Transcript of Component of the CCR4-NOT1 core complex, yeastyeast

Gene CDC39, Length 6,327 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CDC39YCR093W ICY1Q04329 127 aa0.42□□□□□ -2.34
CDC39YCR093W RSM18P40033 138 aa0.42□□□□□ -2.34
CDC39YCR093W YLR285C-AQ3E771 56 aa0.42□□□□□ -2.34
CDC39YCR093W YHR130CP38834 111 aa0.41□□□□□ -2.34
CDC39YCR093W YLR255CO13574 117 aa0.41□□□□□ -2.34
CDC39YCR093W PAU16P35994 123 aa0.41□□□□□ -2.34
CDC39YCR093W YNL198CP40166 100 aa0.41□□□□□ -2.34
CDC39YCR093W PAU15P40585 124 aa0.41□□□□□ -2.34
CDC39YCR093W YMR103CQ04436 120 aa0.41□□□□□ -2.34
CDC39YCR093W TOM6P33448 61 aa0.41□□□□□ -2.34
CDC39YCR093W YOR289WQ12012 251 aaPredicted RBP0.41□□□□□ -2.34
CDC39YCR093W MRX7P53869 86 aa0.41□□□□□ -2.34
CDC39YCR093W YER137CP40083 148 aaKnown RBP0.4□□□□□ -2.35
CDC39YCR093W YCL001W-BQ96VH2 84 aa0.4□□□□□ -2.35
CDC39YCR093W PAU1P0CE88 120 aa0.4□□□□□ -2.35
CDC39YCR093W PAU14P0CE89 120 aa0.4□□□□□ -2.35
CDC39YCR093W PAU6P0CE90 120 aa0.4□□□□□ -2.35
CDC39YCR093W PAU18P0CE91 120 aa0.4□□□□□ -2.35
CDC39YCR093W PAU8P0CE92 120 aa0.4□□□□□ -2.35
CDC39YCR093W PAU11P0CE93 120 aa0.4□□□□□ -2.35
CDC39YCR093W PAU2P32612 120 aa0.4□□□□□ -2.35
CDC39YCR093W PAU24P38155 120 aa0.4□□□□□ -2.35
CDC39YCR093W PAU13P38725 120 aa0.4□□□□□ -2.35
CDC39YCR093W PAU12P53343 120 aa0.4□□□□□ -2.35
CDC39YCR093W PAU10Q03050 120 aa0.4□□□□□ -2.35
CDC39YCR093W PAU9Q3E770 120 aa0.4□□□□□ -2.35
CDC39YCR093W YDR210WQ03482 75 aa0.4□□□□□ -2.35
CDC39YCR093W YKL065W-AQ2V2P2 73 aa0.39□□□□□ -2.35
CDC39YCR093W YCR095W-AQ3E787 52 aa0.39□□□□□ -2.35
CDC39YCR093W RPS11AP0CX47 156 aaKnown RBP0.39□□□□□ -2.35
CDC39YCR093W RPS11BP0CX48 156 aaKnown RBP0.39□□□□□ -2.35
CDC39YCR093W HMRA1P0CY11 126 aa0.38□□□□□ -2.35
CDC39YCR093W YBR032WP38223 100 aa0.38□□□□□ -2.35
CDC39YCR093W MSL1P40567 111 aaPredicted RBP0.38□□□□□ -2.35
CDC39YCR093W AIM4P38305 123 aaPredicted RBP0.38□□□□□ -2.35
CDC39YCR093W EDC1P53080 175 aaPredicted RBP0.38□□□□□ -2.35
CDC39YCR093W BSC4P53841 131 aa0.38□□□□□ -2.35
CDC39YCR093W MRPL38P35996 138 aaPredicted RBP0.37□□□□□ -2.35
CDC39YCR093W PAU4P53427 120 aa0.37□□□□□ -2.35
CDC39YCR093W KSH1Q8TGJ3 72 aa0.37□□□□□ -2.35
CDC39YCR093W MIC10Q96VH5 97 aa0.37□□□□□ -2.35
CDC39YCR093W YOR376W-AQ3E805 51 aa0.37□□□□□ -2.35
CDC39YCR093W YNL042W-BQ3E7Z2 85 aa0.37□□□□□ -2.35
CDC39YCR093W YOR343CQ12484 108 aa0.36□□□□□ -2.35
CDC39YCR093W LCL1Q02786 101 aa0.36□□□□□ -2.35
CDC39YCR093W ECM12O13529 151 aa0.36□□□□□ -2.35
CDC39YCR093W POC4Q12245 148 aaPredicted RBP0.36□□□□□ -2.35
CDC39YCR093W BUD23P25627 275 aaPredicted RBP0.36□□□□□ -2.35
CDC39YCR093W YGR035W-AQ45U48 73 aa0.35□□□□□ -2.35
CDC39YCR093W YNL190WP53872 204 aa0.35□□□□□ -2.35
CDC39YCR093W SCP1Q08873 200 aa0.35□□□□□ -2.35
CDC39YCR093W FPR2P32472 135 aa0.34□□□□□ -2.35
CDC39YCR093W COA2Q3E823 68 aa0.34□□□□□ -2.35
CDC39YCR093W YBR201C-AQ2V2Q3 67 aa0.34□□□□□ -2.36
CDC39YCR093W SDH6Q3E785 79 aa0.34□□□□□ -2.36
CDC39YCR093W OLI1P61829 76 aa0.34□□□□□ -2.36
CDC39YCR093W YDR042CQ03205 200 aa0.34□□□□□ -2.36
CDC39YCR093W Q0297Q9ZZV8 51 aa0.34□□□□□ -2.36
CDC39YCR093W YHR214C-DP0CX93 97 aa0.33□□□□□ -2.36
CDC39YCR093W LSM2P38203 95 aaKnown RBP0.33□□□□□ -2.36
CDC39YCR093W YNR034W-AQ3E841 98 aa0.33□□□□□ -2.36
CDC39YCR093W YMR122W-AQ3E842 84 aa0.33□□□□□ -2.36
CDC39YCR093W YCR085WP25650 117 aa0.33□□□□□ -2.36
CDC39YCR093W AUA1P32450 94 aa0.33□□□□□ -2.36
CDC39YCR093W YBL071CP38185 102 aa0.32□□□□□ -2.36
CDC39YCR093W PAU5P43575 122 aa0.32□□□□□ -2.36
CDC39YCR093W ATP18P81450 59 aa0.32□□□□□ -2.36
CDC39YCR093W YOL164W-AQ3E7A5 60 aa0.32□□□□□ -2.36
CDC39YCR093W YPR010C-AA5Z2X5 72 aa0.31□□□□□ -2.36
CDC39YCR093W SGF11Q03067 99 aa0.31□□□□□ -2.36
CDC39YCR093W BPH1P25356 2167 aa0.31□□□□□ -2.36
CDC39YCR093W Q0032Q9ZZX7 96 aa0.31□□□□□ -2.36
CDC39YCR093W YOR008C-AQ3E7B9 74 aa0.31□□□□□ -2.36
CDC39YCR093W YFR010W-AP0C5N0 62 aa0.31□□□□□ -2.36
CDC39YCR093W RPA12P32529 125 aaKnown RBP0.3□□□□□ -2.36
CDC39YCR093W RPS29AP41057 56 aaKnown RBP0.3□□□□□ -2.36
CDC39YCR093W YKL018C-AQ3E7A7 99 aa0.3□□□□□ -2.36
CDC39YCR093W YIL134C-AQ45U18 67 aa0.3□□□□□ -2.36
CDC39YCR093W YFR009W-AP0C5M9 85 aa0.3□□□□□ -2.36
CDC39YCR093W SPC1P46965 94 aa0.3□□□□□ -2.36
CDC39YCR093W ERI1P62651 68 aaKnown RBP0.3□□□□□ -2.36
CDC39YCR093W YOR314WQ12506 109 aa0.3□□□□□ -2.36
CDC39YCR093W YBR016WP38216 128 aa0.29□□□□□ -2.36
CDC39YCR093W YMR082CQ04276 118 aa0.29□□□□□ -2.36
CDC39YCR093W YAL065CO13511 128 aa0.29□□□□□ -2.36
CDC39YCR093W YDR381C-AQ3E6R5 114 aa0.29□□□□□ -2.36
CDC39YCR093W YMR105W-AQ8TGS8 64 aa0.29□□□□□ -2.36
CDC39YCR093W RPC10P40422 70 aa0.29□□□□□ -2.36
CDC39YCR093W YOR105WQ08504 108 aa0.29□□□□□ -2.36
CDC39YCR093W YJR107C-AP0CT86 78 aa0.28□□□□□ -2.36
CDC39YCR093W RPS27AP35997 82 aaKnown RBP0.28□□□□□ -2.36
CDC39YCR093W RPS27BP38711 82 aa0.28□□□□□ -2.36
CDC39YCR093W NCE101Q02820 53 aa0.28□□□□□ -2.36
CDC39YCR093W YPR108W-AQ3E7B3 70 aa0.28□□□□□ -2.36
CDC39YCR093W SIP18P50263 79 aa0.27□□□□□ -2.37
CDC39YCR093W YCR075W-AQ3E830 75 aa0.27□□□□□ -2.37
CDC39YCR093W Q0017Q9ZZX8 53 aa0.27□□□□□ -2.37
CDC39YCR093W YMR175W-AQ3E766 64 aa0.26□□□□□ -2.37
CDC39YCR093W HUB1Q6Q546 73 aa0.26□□□□□ -2.37
CDC39YCR093W HOR7Q05827 59 aa0.26□□□□□ -2.37
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