RNA–Protein interactions for RNA: YCL057W

PRD1, Transcript of Zinc metalloendopeptidase, yeastyeast

Gene PRD1, Length 2,139 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PRD1YCL057W YBR121C-AP0C5L4 52 aa3.2□□□□□ -1.9
PRD1YCL057W ERG28P40030 148 aa3.2□□□□□ -1.9
PRD1YCL057W ERI1P62651 68 aaKnown RBP3.2□□□□□ -1.9
PRD1YCL057W ICY1Q04329 127 aa3.2□□□□□ -1.9
PRD1YCL057W YMR122W-AQ3E842 84 aa3.2□□□□□ -1.9
PRD1YCL057W TDA2P40045 126 aa3.19□□□□□ -1.9
PRD1YCL057W RSM19P53733 91 aaPredicted RBP3.19□□□□□ -1.9
PRD1YCL057W NOP10Q6Q547 58 aaPredicted RBP3.19□□□□□ -1.9
PRD1YCL057W KSH1Q8TGJ3 72 aa3.19□□□□□ -1.9
PRD1YCL057W YCR001WP25347 104 aa3.19□□□□□ -1.9
PRD1YCL057W YFL019CP43576 117 aa3.19□□□□□ -1.9
PRD1YCL057W UBC4P15731 148 aa3.18□□□□□ -1.9
PRD1YCL057W TSC3Q3E790 80 aa3.18□□□□□ -1.9
PRD1YCL057W RPS28BP0C0X0 67 aaKnown RBP3.17□□□□□ -1.9
PRD1YCL057W YBL081WP38180 368 aaKnown RBP3.17□□□□□ -1.9
PRD1YCL057W MVB12P42939 101 aa3.17□□□□□ -1.9
PRD1YCL057W YPR195CQ06594 109 aa3.17□□□□□ -1.9
PRD1YCL057W YKL183C-AQ3E765 70 aa3.17□□□□□ -1.9
PRD1YCL057W RPS28AQ3E7X9 67 aaPredicted RBP3.17□□□□□ -1.9
PRD1YCL057W TDA8Q6B2U8 126 aa3.17□□□□□ -1.9
PRD1YCL057W Q0297Q9ZZV8 51 aa3.17□□□□□ -1.9
PRD1YCL057W KTI11Q3E840 82 aa3.17□□□□□ -1.9
PRD1YCL057W RPL29P05747 59 aaPredicted RBP3.16□□□□□ -1.9
PRD1YCL057W ICS3P47034 131 aa3.16□□□□□ -1.9
PRD1YCL057W YOL014WQ08110 124 aa3.16□□□□□ -1.9
PRD1YCL057W YHR212W-AP0CX91 67 aa3.16□□□□□ -1.9
PRD1YCL057W YOR268CQ08734 132 aa3.16□□□□□ -1.9
PRD1YCL057W YOR314WQ12506 109 aa3.16□□□□□ -1.9
PRD1YCL057W RRT15Q3E811 62 aa3.15□□□□□ -1.91
PRD1YCL057W UTP20P35194 2493 aaKnown RBP3.15□□□□□ -1.91
PRD1YCL057W AQY2P0CD90 149 aa3.14□□□□□ -1.91
PRD1YCL057W YAL064WP39711 94 aa3.14□□□□□ -1.91
PRD1YCL057W RPL26AP05743 127 aaKnown RBP3.14□□□□□ -1.91
PRD1YCL057W RPL26BP53221 127 aaKnown RBP3.14□□□□□ -1.91
PRD1YCL057W YMR320WQ04897 101 aa3.14□□□□□ -1.91
PRD1YCL057W YGR240C-AQ3E786 66 aa3.14□□□□□ -1.91
PRD1YCL057W YOL166W-AQ8TGJ1 51 aa3.13□□□□□ -1.91
PRD1YCL057W FYV5P25585 152 aa3.13□□□□□ -1.91
PRD1YCL057W YDL241WQ07738 123 aa3.13□□□□□ -1.91
PRD1YCL057W YLR412C-AQ3E742 68 aa3.13□□□□□ -1.91
PRD1YCL057W RPC10P40422 70 aa3.12□□□□□ -1.91
PRD1YCL057W YBR230W-AQ3E762 66 aa3.12□□□□□ -1.91
PRD1YCL057W YJL127C-BQ3E828 52 aa3.12□□□□□ -1.91
PRD1YCL057W YHR213W-BQ8TGK1 99 aa3.12□□□□□ -1.91
PRD1YCL057W RPL36BO14455 100 aaKnown RBP3.11□□□□□ -1.91
PRD1YCL057W RPL36AP05745 100 aaPredicted RBP3.11□□□□□ -1.91
PRD1YCL057W YBL039W-BP0C268 59 aa3.11□□□□□ -1.91
PRD1YCL057W YHL005CP38752 130 aa3.11□□□□□ -1.91
PRD1YCL057W MEC1P38111 2368 aa3.11□□□□□ -1.91
PRD1YCL057W COX23P38824 151 aa3.11□□□□□ -1.91
PRD1YCL057W YGR164WP53291 111 aa3.11□□□□□ -1.91
PRD1YCL057W YLR162WQ06235 118 aa3.11□□□□□ -1.91
PRD1YCL057W YGR121W-AQ3E816 71 aa3.11□□□□□ -1.91
PRD1YCL057W RPS30AP0CX33 63 aaKnown RBP3.1□□□□□ -1.91
PRD1YCL057W RPS30BP0CX34 63 aaKnown RBP3.1□□□□□ -1.91
PRD1YCL057W YIL102CP40488 101 aa3.1□□□□□ -1.91
PRD1YCL057W RDS3Q06835 107 aaPredicted RBP3.1□□□□□ -1.91
PRD1YCL057W YDR182W-AQ3E796 67 aa3.1□□□□□ -1.91
PRD1YCL057W YOR381W-AQ3E804 55 aa3.1□□□□□ -1.91
PRD1YCL057W SFT1P43682 97 aa3.1□□□□□ -1.91
PRD1YCL057W YJL133C-AQ3E7A3 74 aa3.1□□□□□ -1.91
PRD1YCL057W YPR010C-AA5Z2X5 72 aa3.09□□□□□ -1.91
PRD1YCL057W YDR274CP87283 123 aa3.09□□□□□ -1.91
PRD1YCL057W RPL33AP05744 107 aaKnown RBP3.08□□□□□ -1.92
PRD1YCL057W RPL33BP41056 107 aaKnown RBP3.08□□□□□ -1.92
PRD1YCL057W LIP1Q03579 150 aa3.08□□□□□ -1.92
PRD1YCL057W YAR023CD6VPM8 179 aa3.07□□□□□ -1.92
PRD1YCL057W SPC1P46965 94 aa3.07□□□□□ -1.92
PRD1YCL057W NUM1Q00402 2748 aa3.07□□□□□ -1.92
PRD1YCL057W YLR307C-AQ3E825 87 aa3.07□□□□□ -1.92
PRD1YCL057W YNL042W-BQ3E7Z2 85 aa3.06□□□□□ -1.92
PRD1YCL057W YGR035W-AQ45U48 73 aa3.06□□□□□ -1.92
PRD1YCL057W MIC10Q96VH5 97 aa3.06□□□□□ -1.92
PRD1YCL057W Q0032Q9ZZX7 96 aa3.06□□□□□ -1.92
PRD1YCL057W YJL144WP47009 104 aa3.05□□□□□ -1.92
PRD1YCL057W SGF11Q03067 99 aa3.05□□□□□ -1.92
PRD1YCL057W YMR122CQ03879 124 aa3.05□□□□□ -1.92
PRD1YCL057W YNL277W-AQ3E7Z0 62 aa3.05□□□□□ -1.92
PRD1YCL057W YHR007C-AQ07074 71 aa3.04□□□□□ -1.92
PRD1YCL057W BSC4P53841 131 aa3.04□□□□□ -1.92
PRD1YCL057W SNA2P56508 79 aa3.04□□□□□ -1.92
PRD1YCL057W YLL066W-BQ8TGJ7 56 aa3.04□□□□□ -1.92
PRD1YCL057W YDR010CQ12426 110 aa3.02□□□□□ -1.93
PRD1YCL057W YOL013W-AP0C272 63 aaPredicted RBP3.02□□□□□ -1.93
PRD1YCL057W YGL034CP53186 121 aa3.02□□□□□ -1.93
PRD1YCL057W YER188C-AP0C0V2 99 aa3.01□□□□□ -1.93
PRD1YCL057W OST5Q92316 86 aa3.01□□□□□ -1.93
PRD1YCL057W DDR2P89113 61 aa3.01□□□□□ -1.93
PRD1YCL057W YPR153WQ06537 140 aa3.01□□□□□ -1.93
PRD1YCL057W YOR072WQ08486 104 aa3.01□□□□□ -1.93
PRD1YCL057W YKL065W-AQ2V2P2 73 aa3.01□□□□□ -1.93
PRD1YCL057W RTC6O14464 93 aa2.99□□□□□ -1.93
PRD1YCL057W YAR064WP39563 99 aa2.99□□□□□ -1.93
PRD1YCL057W YBL008W-AQ3E821 79 aa2.99□□□□□ -1.93
PRD1YCL057W TOR1P35169 2470 aa2.99□□□□□ -1.93
PRD1YCL057W YLR157W-DP0CE99 70 aa2.98□□□□□ -1.93
PRD1YCL057W YGL193CP53097 103 aa2.98□□□□□ -1.93
PRD1YCL057W YOR376W-AQ3E805 51 aa2.98□□□□□ -1.93
PRD1YCL057W RPL43AP0CX25 92 aaKnown RBP2.96□□□□□ -1.93
PRD1YCL057W RPL43BP0CX26 92 aa2.96□□□□□ -1.93
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 10.8 ms