RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000629983.2

CAPNS1-217, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 799 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-217ENST00000629983 MRPL45Q9BRJ2 306 aaKnown RBP29.14■■■□□ 2.26
CAPNS1-217ENST00000629983 PANK4Q9NVE7 773 aa29.14■■■□□ 2.26
CAPNS1-217ENST00000629983 OPHN1O60890 802 aa29.13■■■□□ 2.25
CAPNS1-217ENST00000629983 GNL1P36915 607 aaPredicted RBP29.13■■■□□ 2.25
CAPNS1-217ENST00000629983 GAD2Q05329 585 aa29.13■■■□□ 2.25
CAPNS1-217ENST00000629983 SEMA3BQ13214 749 aa29.13■■■□□ 2.25
CAPNS1-217ENST00000629983 TRMT11Q7Z4G4 463 aaKnown RBP29.13■■■□□ 2.25
CAPNS1-217ENST00000629983 PIP4P1Q86T03 277 aa29.13■■■□□ 2.25
CAPNS1-217ENST00000629983 CBWD2Q8IUF1 395 aa29.13■■■□□ 2.25
CAPNS1-217ENST00000629983 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP29.13■■■□□ 2.25
CAPNS1-217ENST00000629983 CLIC4Q9Y696 253 aa29.13■■■□□ 2.25
CAPNS1-217ENST00000629983 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP29.12■■■□□ 2.25
CAPNS1-217ENST00000629983 KIAA0391O15091 583 aaKnown RBP29.12■■■□□ 2.25
CAPNS1-217ENST00000629983 HOXD12P35452 270 aa29.12■■■□□ 2.25
CAPNS1-217ENST00000629983 SLC36A4Q6YBV0 504 aa29.12■■■□□ 2.25
CAPNS1-217ENST00000629983 ZNF513Q8N8E2 541 aaPredicted RBP29.12■■■□□ 2.25
CAPNS1-217ENST00000629983 FBXO32Q969P5 355 aa29.12■■■□□ 2.25
CAPNS1-217ENST00000629983 ELOVL4Q9GZR5 314 aa29.12■■■□□ 2.25
CAPNS1-217ENST00000629983 SH3BP1Q9Y3L3 701 aa29.12■■■□□ 2.25
CAPNS1-217ENST00000629983 ZZEF1O43149 2961 aa29.11■■■□□ 2.25
CAPNS1-217ENST00000629983 ZBTB24O43167 697 aaPredicted RBP29.11■■■□□ 2.25
CAPNS1-217ENST00000629983 CHRM1P11229 460 aaPredicted RBP29.11■■■□□ 2.25
CAPNS1-217ENST00000629983 STAT6P42226 847 aa29.11■■■□□ 2.25
CAPNS1-217ENST00000629983 WASP42768 502 aa29.11■■■□□ 2.25
CAPNS1-217ENST00000629983 LRSAM1Q6UWE0 723 aa29.11■■■□□ 2.25
CAPNS1-217ENST00000629983 CLIC6Q96NY7 704 aa29.11■■■□□ 2.25
CAPNS1-217ENST00000629983 ZNF518BQ9C0D4 1074 aa29.11■■■□□ 2.25
CAPNS1-217ENST00000629983 FBXO2Q9UK22 296 aaPredicted RBP29.11■■■□□ 2.25
CAPNS1-217ENST00000629983 HELZP42694 1942 aaKnown RBP29.1■■■□□ 2.25
CAPNS1-217ENST00000629983 ANAPC1Q9H1A4 1944 aa29.1■■■□□ 2.25
CAPNS1-217ENST00000629983 E2F8A0AVK6 867 aa29.1■■■□□ 2.25
CAPNS1-217ENST00000629983 H0Y626 953 aa29.1■■■□□ 2.25
CAPNS1-217ENST00000629983 TRIM16O95361 564 aa29.1■■■□□ 2.25
CAPNS1-217ENST00000629983 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP29.1■■■□□ 2.25
CAPNS1-217ENST00000629983 HOXB2P14652 356 aa29.1■■■□□ 2.25
CAPNS1-217ENST00000629983 YWHAQP27348 245 aa29.1■■■□□ 2.25
CAPNS1-217ENST00000629983 CACNA2D1P54289 1103 aa29.1■■■□□ 2.25
CAPNS1-217ENST00000629983 TNNC1P63316 161 aa29.1■■■□□ 2.25
CAPNS1-217ENST00000629983 PREPLQ4J6C6 727 aaPredicted RBP29.1■■■□□ 2.25
CAPNS1-217ENST00000629983 C10orf76Q5T2E6 689 aa29.1■■■□□ 2.25
CAPNS1-217ENST00000629983 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa29.1■■■□□ 2.25
CAPNS1-217ENST00000629983 NUDT18Q6ZVK8 323 aa29.1■■■□□ 2.25
CAPNS1-217ENST00000629983 STXBP4Q6ZWJ1 553 aa29.1■■■□□ 2.25
CAPNS1-217ENST00000629983 RABEPKQ7Z6M1 372 aa29.1■■■□□ 2.25
CAPNS1-217ENST00000629983 WDR49Q8IV35 697 aa29.1■■■□□ 2.25
CAPNS1-217ENST00000629983 CHCHD4Q8N4Q1 142 aa29.1■■■□□ 2.25
CAPNS1-217ENST00000629983 PDZD8Q8NEN9 1154 aa29.1■■■□□ 2.25
CAPNS1-217ENST00000629983 PANK2Q9BZ23 570 aa29.1■■■□□ 2.25
CAPNS1-217ENST00000629983 CALCOCO1Q9P1Z2 691 aa29.1■■■□□ 2.25
CAPNS1-217ENST00000629983 DEC1Q9P2X7 70 aa29.1■■■□□ 2.25
CAPNS1-217ENST00000629983 A0A0A0MRY4 1105 aa29.09■■■□□ 2.25
CAPNS1-217ENST00000629983 UPK3BL1B0FP48 263 aa29.09■■■□□ 2.25
CAPNS1-217ENST00000629983 UPK3BL2E5RIL1 263 aa29.09■■■□□ 2.25
CAPNS1-217ENST00000629983 SERPINF2P08697 491 aa29.09■■■□□ 2.25
CAPNS1-217ENST00000629983 DLATP10515 647 aaKnown RBP29.09■■■□□ 2.25
CAPNS1-217ENST00000629983 PTPN1P18031 435 aaKnown RBP29.09■■■□□ 2.25
CAPNS1-217ENST00000629983 ZNF33AQ06730 810 aa29.09■■■□□ 2.25
CAPNS1-217ENST00000629983 ANO4Q32M45 955 aa29.09■■■□□ 2.25
CAPNS1-217ENST00000629983 PEAR1Q5VY43 1037 aaPredicted RBP29.09■■■□□ 2.25
CAPNS1-217ENST00000629983 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa29.09■■■□□ 2.25
CAPNS1-217ENST00000629983 CCDC65Q8IXS2 484 aa29.09■■■□□ 2.25
CAPNS1-217ENST00000629983 MINDY1Q8N5J2 469 aa29.09■■■□□ 2.25
CAPNS1-217ENST00000629983 ERLEC1Q96DZ1 483 aa29.09■■■□□ 2.25
CAPNS1-217ENST00000629983 DPEP3Q9H4B8 488 aa29.09■■■□□ 2.25
CAPNS1-217ENST00000629983 SPEGQ15772 3267 aa29.09■■■□□ 2.25
CAPNS1-217ENST00000629983 ASPMQ8IZT6 3477 aa29.08■■■□□ 2.25
CAPNS1-217ENST00000629983 CLDN5O00501 218 aa29.08■■■□□ 2.25
CAPNS1-217ENST00000629983 TULP3O75386 442 aa29.08■■■□□ 2.25
CAPNS1-217ENST00000629983 CLSTN1O94985 981 aa29.08■■■□□ 2.25
CAPNS1-217ENST00000629983 IRF1P10914 325 aa29.08■■■□□ 2.25
CAPNS1-217ENST00000629983 GABRG2P18507 467 aa29.08■■■□□ 2.25
CAPNS1-217ENST00000629983 TNNI1P19237 187 aa29.08■■■□□ 2.25
CAPNS1-217ENST00000629983 NUP93Q8N1F7 819 aa29.08■■■□□ 2.25
CAPNS1-217ENST00000629983 PHTF2Q8N3S3 785 aa29.08■■■□□ 2.25
CAPNS1-217ENST00000629983 OR2I1PQ8NGU4 316 aa29.08■■■□□ 2.25
CAPNS1-217ENST00000629983 OTUB2Q96DC9 234 aa29.08■■■□□ 2.25
CAPNS1-217ENST00000629983 NACA2Q9H009 215 aa29.08■■■□□ 2.25
CAPNS1-217ENST00000629983 HSPBP1Q9NZL4 362 aa29.08■■■□□ 2.25
CAPNS1-217ENST00000629983 SRPRBQ9Y5M8 271 aaKnown RBP29.08■■■□□ 2.25
CAPNS1-217ENST00000629983 ASCC3Q8N3C0 2202 aaKnown RBP29.08■■■□□ 2.25
CAPNS1-217ENST00000629983 PKD1L2Q7Z442 2459 aa29.08■■■□□ 2.25
CAPNS1-217ENST00000629983 FRMD3A2A2Y4 597 aa29.07■■■□□ 2.24
CAPNS1-217ENST00000629983 A8MXQ7 604 aa29.07■■■□□ 2.24
CAPNS1-217ENST00000629983 COCHO43405 550 aa29.07■■■□□ 2.24
CAPNS1-217ENST00000629983 TACC1O75410 805 aa29.07■■■□□ 2.24
CAPNS1-217ENST00000629983 RTN3O95197 1032 aaPredicted RBP29.07■■■□□ 2.24
CAPNS1-217ENST00000629983 FAM193AP78312 1265 aa29.07■■■□□ 2.24
CAPNS1-217ENST00000629983 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP29.07■■■□□ 2.24
CAPNS1-217ENST00000629983 HECTD3Q5T447 861 aa29.07■■■□□ 2.24
CAPNS1-217ENST00000629983 RDH13Q8NBN7 331 aa29.07■■■□□ 2.24
CAPNS1-217ENST00000629983 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa29.07■■■□□ 2.24
CAPNS1-217ENST00000629983 TMEM30AQ9NV96 361 aa29.07■■■□□ 2.24
CAPNS1-217ENST00000629983 NME7Q9Y5B8 376 aa29.07■■■□□ 2.24
CAPNS1-217ENST00000629983 HOXC11O43248 304 aaPredicted RBP29.06■■■□□ 2.24
CAPNS1-217ENST00000629983 WDR72Q3MJ13 1102 aa29.06■■■□□ 2.24
CAPNS1-217ENST00000629983 BBS7Q8IWZ6 715 aa29.06■■■□□ 2.24
CAPNS1-217ENST00000629983 ETFBKMTQ8IXQ9 262 aa29.06■■■□□ 2.24
CAPNS1-217ENST00000629983 TERB1Q8NA31 727 aa29.06■■■□□ 2.24
CAPNS1-217ENST00000629983 MED10Q9BTT4 135 aa29.06■■■□□ 2.24
CAPNS1-217ENST00000629983 B3GNT5Q9BYG0 378 aa29.06■■■□□ 2.24
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