RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000618056.4

PMS1-220, Transcript of PMS1 homolog 1, mismatch repair system component, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PMS1, Length 1,468 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS1-220ENST00000618056 GTPBP10A4D1E9 387 aaKnown RBP26.28■■□□□ 1.8
PMS1-220ENST00000618056 PAEPP09466 180 aa26.28■■□□□ 1.8
PMS1-220ENST00000618056 TARSP26639 723 aaKnown RBP26.28■■□□□ 1.8
PMS1-220ENST00000618056 KIF11P52732 1056 aa26.28■■□□□ 1.8
PMS1-220ENST00000618056 PDGFRLQ15198 375 aa26.28■■□□□ 1.8
PMS1-220ENST00000618056 ITPRIPL2Q3MIP1 535 aa26.28■■□□□ 1.8
PMS1-220ENST00000618056 TMEM270Q6UE05 265 aa26.28■■□□□ 1.8
PMS1-220ENST00000618056 RALGPS2Q86X27 583 aaPredicted RBP26.28■■□□□ 1.8
PMS1-220ENST00000618056 ARHGEF19Q8IW93 802 aa26.28■■□□□ 1.8
PMS1-220ENST00000618056 ZNF687Q8N1G0 1237 aa26.28■■□□□ 1.8
PMS1-220ENST00000618056 KAT5Q92993 513 aa26.28■■□□□ 1.8
PMS1-220ENST00000618056 JAKMIP2Q96AA8 810 aa26.28■■□□□ 1.8
PMS1-220ENST00000618056 CLDN23Q96B33 292 aa26.28■■□□□ 1.8
PMS1-220ENST00000618056 VDRP11473 427 aa26.27■■□□□ 1.8
PMS1-220ENST00000618056 MAGEA9P43362 315 aa26.27■■□□□ 1.8
PMS1-220ENST00000618056 MTIF2P46199 727 aaKnown RBP26.27■■□□□ 1.8
PMS1-220ENST00000618056 KPNA1P52294 538 aaPredicted RBP26.27■■□□□ 1.8
PMS1-220ENST00000618056 ZXDBP98169 803 aa26.27■■□□□ 1.8
PMS1-220ENST00000618056 TNK2Q07912 1038 aa26.27■■□□□ 1.8
PMS1-220ENST00000618056 HECTD3Q5T447 861 aa26.27■■□□□ 1.8
PMS1-220ENST00000618056 RRAGAQ7L523 313 aa26.27■■□□□ 1.8
PMS1-220ENST00000618056 FAM3CQ92520 227 aa26.27■■□□□ 1.8
PMS1-220ENST00000618056 IRF2BPLQ9H1B7 796 aa26.27■■□□□ 1.8
PMS1-220ENST00000618056 HPS4Q9NQG7 708 aa26.27■■□□□ 1.8
PMS1-220ENST00000618056 TLR8Q9NR97 1041 aaKnown RBP26.27■■□□□ 1.8
PMS1-220ENST00000618056 PCDHB4Q9Y5E5 795 aa26.27■■□□□ 1.8
PMS1-220ENST00000618056 USP3Q9Y6I4 520 aa26.27■■□□□ 1.8
PMS1-220ENST00000618056 NCAM2O15394 837 aa26.26■■□□□ 1.79
PMS1-220ENST00000618056 CTHP32929 405 aa26.26■■□□□ 1.79
PMS1-220ENST00000618056 SLC8A3P57103 927 aa26.26■■□□□ 1.79
PMS1-220ENST00000618056 FZD5Q13467 585 aa26.26■■□□□ 1.79
PMS1-220ENST00000618056 RUNX3Q13761 415 aa26.26■■□□□ 1.79
PMS1-220ENST00000618056 TRIM65Q6PJ69 517 aa26.26■■□□□ 1.79
PMS1-220ENST00000618056 TTC30AQ86WT1 665 aa26.26■■□□□ 1.79
PMS1-220ENST00000618056 OSCP1Q8WVF1 389 aa26.26■■□□□ 1.79
PMS1-220ENST00000618056 TSPAN16Q9UKR8 245 aa26.26■■□□□ 1.79
PMS1-220ENST00000618056 MYOFQ9NZM1 2061 aa26.26■■□□□ 1.79
PMS1-220ENST00000618056 SPECC1L-ADORA2AF8WAN1 911 aa26.25■■□□□ 1.79
PMS1-220ENST00000618056 LEFTY2O00292 366 aa26.25■■□□□ 1.79
PMS1-220ENST00000618056 COCHO43405 550 aa26.25■■□□□ 1.79
PMS1-220ENST00000618056 CD19P15391 556 aa26.25■■□□□ 1.79
PMS1-220ENST00000618056 PLA2G5P39877 138 aa26.25■■□□□ 1.79
PMS1-220ENST00000618056 RPS9P46781 194 aaKnown RBP26.25■■□□□ 1.79
PMS1-220ENST00000618056 BCAT1P54687 386 aa26.25■■□□□ 1.79
PMS1-220ENST00000618056 MAN2A1Q16706 1144 aa26.25■■□□□ 1.79
PMS1-220ENST00000618056 TRIM68Q6AZZ1 485 aa26.25■■□□□ 1.79
PMS1-220ENST00000618056 GBP6Q6ZN66 633 aa26.25■■□□□ 1.79
PMS1-220ENST00000618056 CCDC186Q7Z3E2 898 aa26.25■■□□□ 1.79
PMS1-220ENST00000618056 KREMEN1Q96MU8 473 aa26.25■■□□□ 1.79
PMS1-220ENST00000618056 EBF3Q9H4W6 596 aa26.25■■□□□ 1.79
PMS1-220ENST00000618056 DUS2Q9NX74 493 aaKnown RBP26.25■■□□□ 1.79
PMS1-220ENST00000618056 CNTN6Q9UQ52 1028 aa26.25■■□□□ 1.79
PMS1-220ENST00000618056 CPQQ9Y646 472 aa26.25■■□□□ 1.79
PMS1-220ENST00000618056 O00370 1275 aa26.24■■□□□ 1.79
PMS1-220ENST00000618056 MBL2P11226 248 aaPredicted RBP26.24■■□□□ 1.79
PMS1-220ENST00000618056 SOX9P48436 509 aa26.24■■□□□ 1.79
PMS1-220ENST00000618056 ZNF132P52740 706 aa26.24■■□□□ 1.79
PMS1-220ENST00000618056 NHLH1Q02575 133 aa26.24■■□□□ 1.79
PMS1-220ENST00000618056 GOLGA7BQ2TAP0 167 aa26.24■■□□□ 1.79
PMS1-220ENST00000618056 RAB41Q5JT25 222 aa26.24■■□□□ 1.79
PMS1-220ENST00000618056 CCDC183Q5T5S1 534 aa26.24■■□□□ 1.79
PMS1-220ENST00000618056 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP26.24■■□□□ 1.79
PMS1-220ENST00000618056 ENOX1Q8TC92 643 aaKnown RBP26.24■■□□□ 1.79
PMS1-220ENST00000618056 FAM122AQ96E09 287 aa26.24■■□□□ 1.79
PMS1-220ENST00000618056 FAM81BQ96LP2 452 aa26.24■■□□□ 1.79
PMS1-220ENST00000618056 CRACR2AQ9BSW2 395 aa26.24■■□□□ 1.79
PMS1-220ENST00000618056 CCSER2Q9H7U1 834 aa26.24■■□□□ 1.79
PMS1-220ENST00000618056 CYLDQ9NQC7 956 aa26.24■■□□□ 1.79
PMS1-220ENST00000618056 HESX1Q9UBX0 185 aa26.24■■□□□ 1.79
PMS1-220ENST00000618056 MYO15AQ9UKN7 3530 aa26.24■■□□□ 1.79
PMS1-220ENST00000618056 RNF225M0QZC1 329 aaPredicted RBP26.23■■□□□ 1.79
PMS1-220ENST00000618056 CYP26A1O43174 497 aa26.23■■□□□ 1.79
PMS1-220ENST00000618056 IFNAR2P48551 515 aa26.23■■□□□ 1.79
PMS1-220ENST00000618056 PGFP49763 221 aa26.23■■□□□ 1.79
PMS1-220ENST00000618056 EXOC3L4Q17RC7 722 aa26.23■■□□□ 1.79
PMS1-220ENST00000618056 PIGZQ86VD9 579 aa26.23■■□□□ 1.79
PMS1-220ENST00000618056 RBBP8NLQ8NC74 664 aaPredicted RBP26.23■■□□□ 1.79
PMS1-220ENST00000618056 NDRG2Q9UN36 371 aaKnown RBP26.23■■□□□ 1.79
PMS1-220ENST00000618056 OTOL1A6NHN0 477 aaPredicted RBP26.23■■□□□ 1.79
PMS1-220ENST00000618056 XPO1O14980 1071 aaKnown RBP26.23■■□□□ 1.79
PMS1-220ENST00000618056 TLR5O60602 858 aa26.23■■□□□ 1.79
PMS1-220ENST00000618056 ARSAP15289 507 aa26.23■■□□□ 1.79
PMS1-220ENST00000618056 PSEN1P49768 467 aa26.23■■□□□ 1.79
PMS1-220ENST00000618056 BST2Q10589 180 aaKnown RBP26.23■■□□□ 1.79
PMS1-220ENST00000618056 EML3Q32P44 896 aa26.23■■□□□ 1.79
PMS1-220ENST00000618056 PKDCCQ504Y2 493 aa26.23■■□□□ 1.79
PMS1-220ENST00000618056 TXNDC11Q6PKC3 985 aa26.23■■□□□ 1.79
PMS1-220ENST00000618056 SASS6Q6UVJ0 657 aa26.23■■□□□ 1.79
PMS1-220ENST00000618056 LCLAT1Q6UWP7 414 aa26.23■■□□□ 1.79
PMS1-220ENST00000618056 ENOSF1Q7L5Y1 443 aa26.23■■□□□ 1.79
PMS1-220ENST00000618056 ZNF276Q8N554 614 aa26.23■■□□□ 1.79
PMS1-220ENST00000618056 TTC8Q8TAM2 541 aa26.23■■□□□ 1.79
PMS1-220ENST00000618056 TFAP2BQ92481 460 aa26.23■■□□□ 1.79
PMS1-220ENST00000618056 ATP2A3Q93084 1043 aa26.23■■□□□ 1.79
PMS1-220ENST00000618056 ZFRQ96KR1 1074 aaKnown RBP26.23■■□□□ 1.79
PMS1-220ENST00000618056 TUBGCP2Q9BSJ2 902 aa26.23■■□□□ 1.79
PMS1-220ENST00000618056 UBE2TQ9NPD8 197 aaPredicted RBP26.23■■□□□ 1.79
PMS1-220ENST00000618056 WNT6Q9Y6F9 365 aa26.23■■□□□ 1.79
PMS1-220ENST00000618056 FANCMQ8IYD8 2048 aa26.22■■□□□ 1.79
PMS1-220ENST00000618056 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP26.22■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.2 ms