RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000616122.4

SYNCRIP-204, Transcript of synaptotagmin binding cytoplasmic RNA interacting protein, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SYNCRIP, Length 6,764 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNCRIP-204ENST00000616122 ATICP31939 592 aa5.85□□□□□ -1.47
SYNCRIP-204ENST00000616122 ICAM3P32942 547 aa5.85□□□□□ -1.47
SYNCRIP-204ENST00000616122 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
SYNCRIP-204ENST00000616122 FAAP100Q0VG06 881 aa5.85□□□□□ -1.47
SYNCRIP-204ENST00000616122 AP1B1Q10567 949 aa5.85□□□□□ -1.47
SYNCRIP-204ENST00000616122 DPYSL3Q14195 570 aa5.85□□□□□ -1.47
SYNCRIP-204ENST00000616122 ACAP1Q15027 740 aa5.85□□□□□ -1.47
SYNCRIP-204ENST00000616122 MAP3K21Q5TCX8 1036 aa5.85□□□□□ -1.47
SYNCRIP-204ENST00000616122 NOTUMQ6P988 496 aa5.85□□□□□ -1.47
SYNCRIP-204ENST00000616122 DLK2Q6UY11 383 aa5.85□□□□□ -1.47
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SYNCRIP-204ENST00000616122 FRMD8P1Q9BZ68 369 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
SYNCRIP-204ENST00000616122 SHCBP1LQ9BZQ2 653 aa5.85□□□□□ -1.47
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SYNCRIP-204ENST00000616122 CDKN2BP42772 138 aa5.85□□□□□ -1.47
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SYNCRIP-204ENST00000616122 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
SYNCRIP-204ENST00000616122 APPL2Q8NEU8 664 aa5.85□□□□□ -1.47
SYNCRIP-204ENST00000616122 DEPDC1BQ8WUY9 529 aa5.85□□□□□ -1.47
SYNCRIP-204ENST00000616122 CCDC195A0A1B0GUA6 201 aa5.85□□□□□ -1.47
SYNCRIP-204ENST00000616122 SPECC1L-ADORA2AF8WAN1 911 aa5.85□□□□□ -1.47
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SYNCRIP-204ENST00000616122 SLC45A4Q5BKX6 768 aa5.85□□□□□ -1.47
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SYNCRIP-204ENST00000616122 DDX1Q92499 740 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
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SYNCRIP-204ENST00000616122 EPAS1Q99814 870 aa5.85□□□□□ -1.47
SYNCRIP-204ENST00000616122 RNPEPQ9H4A4 650 aa5.85□□□□□ -1.47
SYNCRIP-204ENST00000616122 CXorf56Q9H5V9 222 aa5.85□□□□□ -1.47
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SYNCRIP-204ENST00000616122 FZD8Q9H461 694 aa5.85□□□□□ -1.47
SYNCRIP-204ENST00000616122 PRDM12Q9H4Q4 367 aa5.85□□□□□ -1.47
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SYNCRIP-204ENST00000616122 SOWAHBA6NEL2 793 aa5.85□□□□□ -1.47
SYNCRIP-204ENST00000616122 M0QYT0 321 aa5.85□□□□□ -1.47
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SYNCRIP-204ENST00000616122 TAC1P20366 129 aa5.85□□□□□ -1.47
SYNCRIP-204ENST00000616122 IVDP26440 423 aa5.85□□□□□ -1.47
SYNCRIP-204ENST00000616122 SERPINB3P29508 390 aa5.85□□□□□ -1.47
SYNCRIP-204ENST00000616122 ADCYAP1R1P41586 468 aa5.85□□□□□ -1.47
SYNCRIP-204ENST00000616122 RPS6KA2Q15349 733 aa5.85□□□□□ -1.47
SYNCRIP-204ENST00000616122 GOLGA7BQ2TAP0 167 aa5.85□□□□□ -1.47
SYNCRIP-204ENST00000616122 C1orf146Q5VVC0 180 aa5.85□□□□□ -1.47
SYNCRIP-204ENST00000616122 RFX8Q6ZV50 586 aa5.85□□□□□ -1.47
SYNCRIP-204ENST00000616122 LONP2Q86WA8 852 aa5.85□□□□□ -1.47
SYNCRIP-204ENST00000616122 CNPY4Q8N129 248 aa5.85□□□□□ -1.47
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SYNCRIP-204ENST00000616122 SLC2A14Q8TDB8 520 aa5.85□□□□□ -1.47
SYNCRIP-204ENST00000616122 CPT1BQ92523 772 aa5.85□□□□□ -1.47
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SYNCRIP-204ENST00000616122 PPP1R12AO14974 1030 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
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SYNCRIP-204ENST00000616122 SPRP35270 261 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
SYNCRIP-204ENST00000616122 BCAT1P54687 386 aa5.85□□□□□ -1.47
SYNCRIP-204ENST00000616122 NCALDP61601 193 aa5.85□□□□□ -1.47
SYNCRIP-204ENST00000616122 ITKQ08881 620 aa5.85□□□□□ -1.47
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