RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592483.5

CAPNS1-214, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5

Gene CAPNS1, Length 431 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-214ENST00000592483 ACO1P21399 889 aaKnown RBP25.04■■□□□ 1.6
CAPNS1-214ENST00000592483 APBA1Q02410 837 aa25.04■■□□□ 1.6
CAPNS1-214ENST00000592483 RAPGEF1Q13905 1077 aa25.04■■□□□ 1.6
CAPNS1-214ENST00000592483 MRPL58Q14197 206 aaKnown RBP25.04■■□□□ 1.6
CAPNS1-214ENST00000592483 GRM2Q14416 872 aa25.04■■□□□ 1.6
CAPNS1-214ENST00000592483 SLC5A9Q2M3M2 681 aa25.04■■□□□ 1.6
CAPNS1-214ENST00000592483 TMC6Q7Z403 805 aa25.04■■□□□ 1.6
CAPNS1-214ENST00000592483 ELMO3Q96BJ8 720 aa25.04■■□□□ 1.6
CAPNS1-214ENST00000592483 ARID3AQ99856 593 aa25.04■■□□□ 1.6
CAPNS1-214ENST00000592483 MRPL45Q9BRJ2 306 aaKnown RBP25.04■■□□□ 1.6
CAPNS1-214ENST00000592483 ZFP14Q9HCL3 533 aa25.04■■□□□ 1.6
CAPNS1-214ENST00000592483 IMPACTQ9P2X3 320 aa25.04■■□□□ 1.6
CAPNS1-214ENST00000592483 CAPN11Q9UMQ6 739 aa25.04■■□□□ 1.6
CAPNS1-214ENST00000592483 BACE2Q9Y5Z0 518 aa25.04■■□□□ 1.6
CAPNS1-214ENST00000592483 PIAS3Q9Y6X2 628 aa25.04■■□□□ 1.6
CAPNS1-214ENST00000592483 K7ESF4 209 aa25.03■■□□□ 1.6
CAPNS1-214ENST00000592483 FCARP24071 287 aa25.03■■□□□ 1.6
CAPNS1-214ENST00000592483 GNL1P36915 607 aaPredicted RBP25.03■■□□□ 1.6
CAPNS1-214ENST00000592483 STAT1P42224 750 aa25.03■■□□□ 1.6
CAPNS1-214ENST00000592483 CDH8P55286 799 aa25.03■■□□□ 1.6
CAPNS1-214ENST00000592483 JAM2P57087 298 aa25.03■■□□□ 1.6
CAPNS1-214ENST00000592483 ZBED6P86452 979 aa25.03■■□□□ 1.6
CAPNS1-214ENST00000592483 DRAP1Q14919 205 aaPredicted RBP25.03■■□□□ 1.6
CAPNS1-214ENST00000592483 ARHGAP44Q17R89 818 aa25.03■■□□□ 1.6
CAPNS1-214ENST00000592483 OR6B3Q8NGW1 331 aa25.03■■□□□ 1.6
CAPNS1-214ENST00000592483 KAT5Q92993 513 aa25.03■■□□□ 1.6
CAPNS1-214ENST00000592483 LOXL4Q96JB6 756 aa25.03■■□□□ 1.6
CAPNS1-214ENST00000592483 TNIP3Q96KP6 325 aa25.03■■□□□ 1.6
CAPNS1-214ENST00000592483 ACBD6Q9BR61 282 aa25.03■■□□□ 1.6
CAPNS1-214ENST00000592483 ZNF334Q9HCZ1 680 aaPredicted RBP25.03■■□□□ 1.6
CAPNS1-214ENST00000592483 NLRC4Q9NPP4 1024 aa25.03■■□□□ 1.6
CAPNS1-214ENST00000592483 RXFP3Q9NSD7 469 aa25.03■■□□□ 1.6
CAPNS1-214ENST00000592483 DDX43Q9NXZ2 648 aaKnown RBP25.03■■□□□ 1.6
CAPNS1-214ENST00000592483 LUC7L2Q9Y383 392 aaKnown RBP25.03■■□□□ 1.6
CAPNS1-214ENST00000592483 PCDHB4Q9Y5E5 795 aa25.03■■□□□ 1.6
CAPNS1-214ENST00000592483 OR6C75A6NL08 312 aa25.02■■□□□ 1.6
CAPNS1-214ENST00000592483 A8MXQ7 604 aa25.02■■□□□ 1.6
CAPNS1-214ENST00000592483 F8VZ95 297 aa25.02■■□□□ 1.6
CAPNS1-214ENST00000592483 GYPCP04921 128 aa25.02■■□□□ 1.6
CAPNS1-214ENST00000592483 CCDC172P0C7W6 258 aa25.02■■□□□ 1.6
CAPNS1-214ENST00000592483 CD58P19256 250 aa25.02■■□□□ 1.6
CAPNS1-214ENST00000592483 OR1D2P34982 312 aa25.02■■□□□ 1.6
CAPNS1-214ENST00000592483 RAP1GAPP47736 663 aa25.02■■□□□ 1.6
CAPNS1-214ENST00000592483 TBX2Q13207 712 aaPredicted RBP25.02■■□□□ 1.6
CAPNS1-214ENST00000592483 HEATR6Q6AI08 1181 aaKnown RBP25.02■■□□□ 1.6
CAPNS1-214ENST00000592483 DRC7Q8IY82 874 aa25.02■■□□□ 1.6
CAPNS1-214ENST00000592483 NT5C1AQ9BXI3 368 aa25.02■■□□□ 1.6
CAPNS1-214ENST00000592483 ARRDC1-AS1Q9H2J1 176 aa25.02■■□□□ 1.6
CAPNS1-214ENST00000592483 MTRRQ9UBK8 725 aa25.02■■□□□ 1.6
CAPNS1-214ENST00000592483 CDH9Q9ULB4 789 aa25.02■■□□□ 1.6
CAPNS1-214ENST00000592483 TMEM8BA6NDV4 472 aa25.01■■□□□ 1.59
CAPNS1-214ENST00000592483 AXIN1O15169 862 aa25.01■■□□□ 1.59
CAPNS1-214ENST00000592483 PAEPP09466 180 aa25.01■■□□□ 1.59
CAPNS1-214ENST00000592483 HOXA6P31267 233 aa25.01■■□□□ 1.59
CAPNS1-214ENST00000592483 BPIFB4P59827 614 aa25.01■■□□□ 1.59
CAPNS1-214ENST00000592483 FAM78AQ5JUQ0 283 aa25.01■■□□□ 1.59
CAPNS1-214ENST00000592483 CNGA4Q8IV77 575 aa25.01■■□□□ 1.59
CAPNS1-214ENST00000592483 FAM71AQ8IYT1 594 aa25.01■■□□□ 1.59
CAPNS1-214ENST00000592483 BAP1Q92560 729 aa25.01■■□□□ 1.59
CAPNS1-214ENST00000592483 SYN2Q92777 582 aaPredicted RBP25.01■■□□□ 1.59
CAPNS1-214ENST00000592483 AJAP1Q9UKB5 411 aaPredicted RBP25.01■■□□□ 1.59
CAPNS1-214ENST00000592483 KIAA1257Q9ULG3 409 aa25.01■■□□□ 1.59
CAPNS1-214ENST00000592483 TIMM13Q9Y5L4 95 aaPredicted RBP25.01■■□□□ 1.59
CAPNS1-214ENST00000592483 SETXQ7Z333 2677 aaKnown RBP25■■□□□ 1.59
CAPNS1-214ENST00000592483 CEBPBP17676 345 aa25■■□□□ 1.59
CAPNS1-214ENST00000592483 PTPN2P17706 415 aa25■■□□□ 1.59
CAPNS1-214ENST00000592483 SOX5P35711 763 aa25■■□□□ 1.59
CAPNS1-214ENST00000592483 ZNF132P52740 706 aa25■■□□□ 1.59
CAPNS1-214ENST00000592483 NDST1P52848 882 aa25■■□□□ 1.59
CAPNS1-214ENST00000592483 MLLT6P55198 1093 aaPredicted RBP25■■□□□ 1.59
CAPNS1-214ENST00000592483 TSPY1Q01534 308 aa25■■□□□ 1.59
CAPNS1-214ENST00000592483 CTXN3Q4LDR2 81 aa25■■□□□ 1.59
CAPNS1-214ENST00000592483 TMEM270Q6UE05 265 aa25■■□□□ 1.59
CAPNS1-214ENST00000592483 OSTM1Q86WC4 334 aa25■■□□□ 1.59
CAPNS1-214ENST00000592483 CRYBG2Q8N1P7 616 aa25■■□□□ 1.59
CAPNS1-214ENST00000592483 RBBP8NLQ8NC74 664 aaPredicted RBP25■■□□□ 1.59
CAPNS1-214ENST00000592483 GPR88Q9GZN0 384 aa25■■□□□ 1.59
CAPNS1-214ENST00000592483 VWA8A3KMH1 1905 aa25■■□□□ 1.59
CAPNS1-214ENST00000592483 COL4A2P08572 1712 aa24.99■■□□□ 1.59
CAPNS1-214ENST00000592483 KRT5P13647 590 aa24.99■■□□□ 1.59
CAPNS1-214ENST00000592483 PSMC3P17980 439 aa24.99■■□□□ 1.59
CAPNS1-214ENST00000592483 GDI1P31150 447 aa24.99■■□□□ 1.59
CAPNS1-214ENST00000592483 SMARCB1Q12824 385 aa24.99■■□□□ 1.59
CAPNS1-214ENST00000592483 LRRC32Q14392 662 aa24.99■■□□□ 1.59
CAPNS1-214ENST00000592483 ARID5BQ14865 1188 aa24.99■■□□□ 1.59
CAPNS1-214ENST00000592483 MAPRE1Q15691 268 aaKnown RBP24.99■■□□□ 1.59
CAPNS1-214ENST00000592483 PSAPL1Q6NUJ1 521 aa24.99■■□□□ 1.59
CAPNS1-214ENST00000592483 WHAMMQ8TF30 809 aa24.99■■□□□ 1.59
CAPNS1-214ENST00000592483 TMEM176AQ96HP8 235 aa24.99■■□□□ 1.59
CAPNS1-214ENST00000592483 FOXN3O00409 490 aaPredicted RBP24.98■■□□□ 1.59
CAPNS1-214ENST00000592483 MICAL2O94851 1124 aa24.98■■□□□ 1.59
CAPNS1-214ENST00000592483 FERP16591 822 aa24.98■■□□□ 1.59
CAPNS1-214ENST00000592483 CASP14P31944 242 aa24.98■■□□□ 1.59
CAPNS1-214ENST00000592483 CCDC6Q16204 474 aa24.98■■□□□ 1.59
CAPNS1-214ENST00000592483 SLC8B1Q6J4K2 584 aa24.98■■□□□ 1.59
CAPNS1-214ENST00000592483 DCP1BQ8IZD4 617 aaKnown RBP24.98■■□□□ 1.59
CAPNS1-214ENST00000592483 ASB16Q96NS5 453 aa24.98■■□□□ 1.59
CAPNS1-214ENST00000592483 SYT15Q9BQS2 421 aa24.98■■□□□ 1.59
CAPNS1-214ENST00000592483 SPAG17Q6Q759 2223 aa24.97■■□□□ 1.59
CAPNS1-214ENST00000592483 TICRRQ7Z2Z1 1910 aa24.97■■□□□ 1.59
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