RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591041.5

CAPNS1-212, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 3

Gene CAPNS1, Length 812 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-212ENST00000591041 PDK2Q15119 407 aa23.69■■□□□ 1.38
CAPNS1-212ENST00000591041 USP41Q3LFD5 358 aa23.69■■□□□ 1.38
CAPNS1-212ENST00000591041 PAQR9Q6ZVX9 377 aa23.69■■□□□ 1.38
CAPNS1-212ENST00000591041 VSIG1Q86XK7 387 aa23.69■■□□□ 1.38
CAPNS1-212ENST00000591041 ARHGAP18Q8N392 663 aa23.69■■□□□ 1.38
CAPNS1-212ENST00000591041 KCTD6Q8NC69 237 aa23.69■■□□□ 1.38
CAPNS1-212ENST00000591041 SPPL2BQ8TCT7 592 aa23.69■■□□□ 1.38
CAPNS1-212ENST00000591041 LPIN3Q9BQK8 851 aa23.69■■□□□ 1.38
CAPNS1-212ENST00000591041 MAK16Q9BXY0 300 aaKnown RBP23.69■■□□□ 1.38
CAPNS1-212ENST00000591041 OSBPL8Q9BZF1 889 aa23.69■■□□□ 1.38
CAPNS1-212ENST00000591041 MTIF3Q9H2K0 278 aaKnown RBP23.69■■□□□ 1.38
CAPNS1-212ENST00000591041 ARFGAP3Q9NP61 516 aa23.69■■□□□ 1.38
CAPNS1-212ENST00000591041 UTP11Q9Y3A2 253 aaKnown RBP23.69■■□□□ 1.38
CAPNS1-212ENST00000591041 PIK3R2O00459 728 aa23.68■■□□□ 1.38
CAPNS1-212ENST00000591041 ZBED1O96006 694 aa23.68■■□□□ 1.38
CAPNS1-212ENST00000591041 F9P00740 461 aa23.68■■□□□ 1.38
CAPNS1-212ENST00000591041 BDNFP23560 247 aa23.68■■□□□ 1.38
CAPNS1-212ENST00000591041 PPM1AP35813 382 aa23.68■■□□□ 1.38
CAPNS1-212ENST00000591041 GRIK1P39086 918 aa23.68■■□□□ 1.38
CAPNS1-212ENST00000591041 TAS2R40P59535 323 aa23.68■■□□□ 1.38
CAPNS1-212ENST00000591041 OGDHQ02218 1023 aa23.68■■□□□ 1.38
CAPNS1-212ENST00000591041 ZNF252P-AS1Q0IIN9 211 aa23.68■■□□□ 1.38
CAPNS1-212ENST00000591041 SLC39A12Q504Y0 691 aa23.68■■□□□ 1.38
CAPNS1-212ENST00000591041 TFDP3Q5H9I0 405 aa23.68■■□□□ 1.38
CAPNS1-212ENST00000591041 RAB41Q5JT25 222 aa23.68■■□□□ 1.38
CAPNS1-212ENST00000591041 KIAA0319Q5VV43 1072 aa23.68■■□□□ 1.38
CAPNS1-212ENST00000591041 KIAA1841Q6NSI8 718 aa23.68■■□□□ 1.38
CAPNS1-212ENST00000591041 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP23.68■■□□□ 1.38
CAPNS1-212ENST00000591041 SYDE1Q6ZW31 735 aaPredicted RBP23.68■■□□□ 1.38
CAPNS1-212ENST00000591041 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP23.68■■□□□ 1.383e-7■■□□□ 11.7
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CAPNS1-212ENST00000591041 EIF1ADQ8N9N8 165 aaKnown RBP23.68■■□□□ 1.38
CAPNS1-212ENST00000591041 MAGOHBQ96A72 148 aaKnown RBP23.68■■□□□ 1.38
CAPNS1-212ENST00000591041 CEP295NLQ96MC4 621 aa23.68■■□□□ 1.38
CAPNS1-212ENST00000591041 PKMYT1Q99640 499 aa23.68■■□□□ 1.38
CAPNS1-212ENST00000591041 SMOQ99835 787 aa23.68■■□□□ 1.38
CAPNS1-212ENST00000591041 DDX23Q9BUQ8 820 aaKnown RBP23.68■■□□□ 1.38
CAPNS1-212ENST00000591041 ANKZF1Q9H8Y5 726 aa23.68■■□□□ 1.38
CAPNS1-212ENST00000591041 PRDM16Q9HAZ2 1276 aa23.68■■□□□ 1.38
CAPNS1-212ENST00000591041 NGRNQ9NPE2 291 aaKnown RBP23.68■■□□□ 1.38
CAPNS1-212ENST00000591041 EHD2Q9NZN4 543 aa23.68■■□□□ 1.38
CAPNS1-212ENST00000591041 TSC2P49815 1807 aa23.68■■□□□ 1.38
CAPNS1-212ENST00000591041 SCN5AQ14524 2016 aa23.67■■□□□ 1.38
CAPNS1-212ENST00000591041 LRRD1A4D1F6 860 aa23.67■■□□□ 1.38
CAPNS1-212ENST00000591041 CPB1P15086 417 aa23.67■■□□□ 1.38
CAPNS1-212ENST00000591041 CSF2RAP15509 400 aa23.67■■□□□ 1.38
CAPNS1-212ENST00000591041 AIF1P55008 147 aa23.67■■□□□ 1.38
CAPNS1-212ENST00000591041 CREMQ03060 361 aa23.67■■□□□ 1.38
CAPNS1-212ENST00000591041 TFDP2Q14188 446 aa23.67■■□□□ 1.38
CAPNS1-212ENST00000591041 MRPL58Q14197 206 aaKnown RBP23.67■■□□□ 1.38
CAPNS1-212ENST00000591041 BTG3Q14201 252 aaPredicted RBP23.67■■□□□ 1.38
CAPNS1-212ENST00000591041 SLC25A52Q3SY17 297 aa23.67■■□□□ 1.38
CAPNS1-212ENST00000591041 BEND5Q7L4P6 421 aa23.67■■□□□ 1.38
CAPNS1-212ENST00000591041 C12orf50Q8NA57 414 aaPredicted RBP23.67■■□□□ 1.38
CAPNS1-212ENST00000591041 OR10T2Q8NGX3 314 aa23.67■■□□□ 1.38
CAPNS1-212ENST00000591041 FAM172AQ8WUF8 416 aa23.67■■□□□ 1.38
CAPNS1-212ENST00000591041 HNRNPLLQ8WVV9 542 aaKnown RBP23.67■■□□□ 1.38
CAPNS1-212ENST00000591041 TSC1Q92574 1164 aa23.67■■□□□ 1.38
CAPNS1-212ENST00000591041 TMEM169Q96HH4 297 aa23.67■■□□□ 1.38
CAPNS1-212ENST00000591041 FBXO44Q9H4M3 255 aa23.67■■□□□ 1.38
CAPNS1-212ENST00000591041 ZWILCHQ9H900 591 aa23.67■■□□□ 1.38
CAPNS1-212ENST00000591041 COMMD8Q9NX08 183 aa23.67■■□□□ 1.38
CAPNS1-212ENST00000591041 SMARCAL1Q9NZC9 954 aa23.67■■□□□ 1.38
CAPNS1-212ENST00000591041 TRIM43BA6NCK2 446 aa23.66■■□□□ 1.38
CAPNS1-212ENST00000591041 NDC80O14777 642 aa23.66■■□□□ 1.38
CAPNS1-212ENST00000591041 TRUB2O95900 331 aaKnown RBP23.66■■□□□ 1.38
CAPNS1-212ENST00000591041 FGBP02675 491 aa23.66■■□□□ 1.38
CAPNS1-212ENST00000591041 MIPP30301 263 aa23.66■■□□□ 1.38
CAPNS1-212ENST00000591041 RDXP35241 583 aaKnown RBP23.66■■□□□ 1.38
CAPNS1-212ENST00000591041 RPL10AP62906 217 aaKnown RBP23.66■■□□□ 1.38
CAPNS1-212ENST00000591041 DR1Q01658 176 aa23.66■■□□□ 1.38
CAPNS1-212ENST00000591041 FPGSQ05932 587 aa23.66■■□□□ 1.38
CAPNS1-212ENST00000591041 KRT81Q14533 505 aa23.66■■□□□ 1.38
CAPNS1-212ENST00000591041 NAA30Q147X3 362 aaPredicted RBP23.66■■□□□ 1.38
CAPNS1-212ENST00000591041 CCDC14Q49A88 953 aa23.66■■□□□ 1.38
CAPNS1-212ENST00000591041 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP23.66■■□□□ 1.38
CAPNS1-212ENST00000591041 SPOCD1Q6ZMY3 1216 aa23.66■■□□□ 1.38
CAPNS1-212ENST00000591041 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP23.66■■□□□ 1.38
CAPNS1-212ENST00000591041 C8orf48Q96LL4 319 aa23.66■■□□□ 1.38
CAPNS1-212ENST00000591041 SLITRK1Q96PX8 696 aa23.66■■□□□ 1.38
CAPNS1-212ENST00000591041 YME1L1Q96TA2 773 aa23.66■■□□□ 1.38
CAPNS1-212ENST00000591041 LRRC1Q9BTT6 524 aa23.66■■□□□ 1.38
CAPNS1-212ENST00000591041 SSX2IPQ9Y2D8 614 aa23.66■■□□□ 1.38
CAPNS1-212ENST00000591041 LAMA3Q16787 3333 aa23.65■■□□□ 1.38
CAPNS1-212ENST00000591041 GRAP2O75791 330 aa23.65■■□□□ 1.38
CAPNS1-212ENST00000591041 HEXIM1O94992 359 aaKnown RBP23.65■■□□□ 1.38
CAPNS1-212ENST00000591041 GAS8O95995 478 aa23.65■■□□□ 1.38
CAPNS1-212ENST00000591041 RALAP11233 206 aa23.65■■□□□ 1.38
CAPNS1-212ENST00000591041 H2AFXP16104 143 aaPredicted RBP23.65■■□□□ 1.38
CAPNS1-212ENST00000591041 TNFRSF8P28908 595 aa23.65■■□□□ 1.38
CAPNS1-212ENST00000591041 FLT3P36888 993 aa23.65■■□□□ 1.38
CAPNS1-212ENST00000591041 GATMP50440 423 aa23.65■■□□□ 1.38
CAPNS1-212ENST00000591041 DAOAP59103 153 aa23.65■■□□□ 1.38
CAPNS1-212ENST00000591041 WDR5P61964 334 aaKnown RBP23.65■■□□□ 1.38
CAPNS1-212ENST00000591041 SLC25A11Q02978 314 aaKnown RBP23.65■■□□□ 1.38
CAPNS1-212ENST00000591041 CUL1Q13616 776 aa23.65■■□□□ 1.38
CAPNS1-212ENST00000591041 CYP1B1Q16678 543 aa23.65■■□□□ 1.38
CAPNS1-212ENST00000591041 TCTN1Q2MV58 587 aa23.65■■□□□ 1.38
CAPNS1-212ENST00000591041 SCYL2Q6P3W7 929 aa23.65■■□□□ 1.38
CAPNS1-212ENST00000591041 ULBP1Q9BZM6 244 aa23.65■■□□□ 1.38
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