RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589969.1

NFIC-209, Transcript of nuclear factor I C, humanhuman

TSL 3

Gene NFIC, Length 614 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIC-209ENST00000589969 RTKNQ9BST9 563 aa21.9■■□□□ 1.1
NFIC-209ENST00000589969 DNAI2Q9GZS0 605 aa21.9■■□□□ 1.1
NFIC-209ENST00000589969 KRT82Q9NSB4 513 aa21.9■■□□□ 1.1
NFIC-209ENST00000589969 CFAP97Q9P2B7 532 aa21.9■■□□□ 1.1
NFIC-209ENST00000589969 E2F8A0AVK6 867 aa21.89■■□□□ 1.09
NFIC-209ENST00000589969 FAM92AA1XBS5 289 aa21.89■■□□□ 1.09
NFIC-209ENST00000589969 APBB3O95704 486 aa21.89■■□□□ 1.09
NFIC-209ENST00000589969 HLA-DRAP01903 254 aa21.89■■□□□ 1.09
NFIC-209ENST00000589969 PRR29P0C7W0 189 aa21.89■■□□□ 1.09
NFIC-209ENST00000589969 CCDC192P0DO97 292 aa21.89■■□□□ 1.09
NFIC-209ENST00000589969 PXNP49023 591 aaPredicted RBP21.89■■□□□ 1.09
NFIC-209ENST00000589969 NDST1P52848 882 aa21.89■■□□□ 1.09
NFIC-209ENST00000589969 ATXN1P54253 815 aaKnown RBP21.89■■□□□ 1.09
NFIC-209ENST00000589969 SCAMP5Q8TAC9 235 aa21.89■■□□□ 1.09
NFIC-209ENST00000589969 NETO1Q8TDF5 533 aa21.89■■□□□ 1.09
NFIC-209ENST00000589969 EZH1Q92800 747 aaPredicted RBP21.89■■□□□ 1.09
NFIC-209ENST00000589969 OTUB2Q96DC9 234 aa21.89■■□□□ 1.09
NFIC-209ENST00000589969 CHAMP1Q96JM3 812 aa21.89■■□□□ 1.09
NFIC-209ENST00000589969 FBXO44Q9H4M3 255 aa21.89■■□□□ 1.09
NFIC-209ENST00000589969 CYP3A43Q9HB55 503 aa21.89■■□□□ 1.09
NFIC-209ENST00000589969 EBF1Q9UH73 591 aa21.89■■□□□ 1.09
NFIC-209ENST00000589969 CHORDC1Q9UHD1 332 aaPredicted RBP21.89■■□□□ 1.09
NFIC-209ENST00000589969 AXIN1O15169 862 aa21.88■■□□□ 1.09
NFIC-209ENST00000589969 COCHO43405 550 aa21.88■■□□□ 1.09
NFIC-209ENST00000589969 ZNF202O95125 648 aa21.88■■□□□ 1.09
NFIC-209ENST00000589969 ADH1CP00326 375 aa21.88■■□□□ 1.09
NFIC-209ENST00000589969 CYP17A1P05093 508 aa21.88■■□□□ 1.09
NFIC-209ENST00000589969 PSMC2P35998 433 aaKnown RBP21.88■■□□□ 1.09
NFIC-209ENST00000589969 OPRD1P41143 372 aa21.88■■□□□ 1.09
NFIC-209ENST00000589969 EIF2DP41214 584 aaKnown RBP21.88■■□□□ 1.09
NFIC-209ENST00000589969 ASPAP45381 313 aa21.88■■□□□ 1.09
NFIC-209ENST00000589969 DMC1Q14565 340 aa21.88■■□□□ 1.09
NFIC-209ENST00000589969 DHCR24Q15392 516 aa21.88■■□□□ 1.09
NFIC-209ENST00000589969 C1orf220Q5T0J3 134 aa21.88■■□□□ 1.09
NFIC-209ENST00000589969 FAM186BQ8IYM0 893 aa21.88■■□□□ 1.09
NFIC-209ENST00000589969 CCDC150Q8NCX0 1101 aa21.88■■□□□ 1.09
NFIC-209ENST00000589969 SLC2A14Q8TDB8 520 aa21.88■■□□□ 1.09
NFIC-209ENST00000589969 DUSP9Q99956 384 aaKnown RBP21.88■■□□□ 1.09
NFIC-209ENST00000589969 CSNK1G1Q9HCP0 422 aa21.88■■□□□ 1.09
NFIC-209ENST00000589969 ZDHHC11BP0C7U3 371 aa21.87■■□□□ 1.09
NFIC-209ENST00000589969 HOXC13P31276 330 aa21.87■■□□□ 1.09
NFIC-209ENST00000589969 INCA1Q0VD86 236 aa21.87■■□□□ 1.09
NFIC-209ENST00000589969 ADAM9Q13443 819 aa21.87■■□□□ 1.09
NFIC-209ENST00000589969 PRR23CQ6ZRP0 262 aa21.87■■□□□ 1.09
NFIC-209ENST00000589969 USP33Q8TEY7 942 aa21.87■■□□□ 1.09
NFIC-209ENST00000589969 ELMO3Q96BJ8 720 aa21.87■■□□□ 1.09
NFIC-209ENST00000589969 ZC3H10Q96K80 434 aaKnown RBP21.87■■□□□ 1.09
NFIC-209ENST00000589969 HHIPQ96QV1 700 aa21.87■■□□□ 1.09
NFIC-209ENST00000589969 MAPK8IP1Q9UQF2 711 aa21.87■■□□□ 1.09
NFIC-209ENST00000589969 DYNC1LI1Q9Y6G9 523 aaKnown RBP21.87■■□□□ 1.09
NFIC-209ENST00000589969 HELZP42694 1942 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
NFIC-209ENST00000589969 PALM2-AKAP2B1ALY0 433 aaPredicted RBP21.86■■□□□ 1.09
NFIC-209ENST00000589969 FAM200BP0CF97 657 aa21.86■■□□□ 1.09
NFIC-209ENST00000589969 CCDC130P13994 396 aa21.86■■□□□ 1.09
NFIC-209ENST00000589969 GTF2H1P32780 548 aa21.86■■□□□ 1.09
NFIC-209ENST00000589969 GAB4Q2WGN9 574 aa21.86■■□□□ 1.09
NFIC-209ENST00000589969 SPOPLQ6IQ16 392 aa21.86■■□□□ 1.09
NFIC-209ENST00000589969 RHBDF2Q6PJF5 856 aa21.86■■□□□ 1.09
NFIC-209ENST00000589969 PNKPQ96T60 521 aa21.86■■□□□ 1.09
NFIC-209ENST00000589969 HNRNPABQ99729 332 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
NFIC-209ENST00000589969 SMOQ99835 787 aa21.86■■□□□ 1.09
NFIC-209ENST00000589969 NT5C1AQ9BXI3 368 aa21.86■■□□□ 1.09
NFIC-209ENST00000589969 NACA2Q9H009 215 aa21.86■■□□□ 1.09
NFIC-209ENST00000589969 TLR8Q9NR97 1041 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
NFIC-209ENST00000589969 GMIPQ9P107 970 aa21.86■■□□□ 1.09
NFIC-209ENST00000589969 SH3BP1Q9Y3L3 701 aa21.86■■□□□ 1.09
NFIC-209ENST00000589969 PCDHGA5Q9Y5G8 931 aa21.86■■□□□ 1.09
NFIC-209ENST00000589969 MED19A0JLT2 244 aaPredicted RBP21.85■■□□□ 1.09
NFIC-209ENST00000589969 K7EQS6 105 aa21.85■■□□□ 1.09
NFIC-209ENST00000589969 GCLMP48507 274 aa21.85■■□□□ 1.09
NFIC-209ENST00000589969 MAP3K7CLP57077 242 aa21.85■■□□□ 1.09
NFIC-209ENST00000589969 MRPS21P82921 87 aaKnown RBP21.85■■□□□ 1.09
NFIC-209ENST00000589969 EDRF1Q3B7T1 1238 aa21.85■■□□□ 1.09
NFIC-209ENST00000589969 HSF5Q4G112 596 aaPredicted RBP21.85■■□□□ 1.09
NFIC-209ENST00000589969 PREPLQ4J6C6 727 aaPredicted RBP21.85■■□□□ 1.09
NFIC-209ENST00000589969 KBTBD6Q86V97 674 aa21.85■■□□□ 1.09
NFIC-209ENST00000589969 C12orf29Q8N999 325 aa21.85■■□□□ 1.09
NFIC-209ENST00000589969 ZMIZ2Q8NF64 920 aa21.85■■□□□ 1.09
NFIC-209ENST00000589969 TSTD1Q8NFU3 115 aa21.85■■□□□ 1.09
NFIC-209ENST00000589969 TAS1R2Q8TE23 839 aa21.85■■□□□ 1.09
NFIC-209ENST00000589969 FAXDC2Q96IV6 333 aa21.85■■□□□ 1.09
NFIC-209ENST00000589969 ZFRQ96KR1 1074 aaKnown RBP21.85■■□□□ 1.09
NFIC-209ENST00000589969 NIF3L1Q9GZT8 377 aa21.85■■□□□ 1.09
NFIC-209ENST00000589969 GOLPH3LQ9H4A5 285 aa21.85■■□□□ 1.09
NFIC-209ENST00000589969 TMEM8AQ9HCN3 771 aa21.85■■□□□ 1.09
NFIC-209ENST00000589969 POLR3BQ9NW08 1133 aaPredicted RBP21.85■■□□□ 1.09
NFIC-209ENST00000589969 HMGXB4Q9UGU5 601 aa21.85■■□□□ 1.09
NFIC-209ENST00000589969 SLC30A4O14863 429 aa21.84■■□□□ 1.09
NFIC-209ENST00000589969 EPN2O95208 641 aa21.84■■□□□ 1.09
NFIC-209ENST00000589969 TRIM49P0CI25 452 aa21.84■■□□□ 1.09
NFIC-209ENST00000589969 TRIM49CP0CI26 452 aa21.84■■□□□ 1.09
NFIC-209ENST00000589969 ADH5P11766 374 aa21.84■■□□□ 1.09
NFIC-209ENST00000589969 MCCD1P59942 119 aaPredicted RBP21.84■■□□□ 1.09
NFIC-209ENST00000589969 PPP3CAQ08209 521 aa21.84■■□□□ 1.09
NFIC-209ENST00000589969 ORC1Q13415 861 aa21.84■■□□□ 1.09
NFIC-209ENST00000589969 ZCWPW2Q504Y3 356 aa21.84■■□□□ 1.09
NFIC-209ENST00000589969 C2orf27AQ580R0 203 aa21.84■■□□□ 1.09
NFIC-209ENST00000589969 C11orf74Q86VG3 221 aa21.84■■□□□ 1.09
NFIC-209ENST00000589969 TTC39CQ8N584 583 aa21.84■■□□□ 1.09
NFIC-209ENST00000589969 CYFIP2Q96F07 1278 aa21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22 ms