RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588374.1

EFTUD2-211, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 3

Gene EFTUD2, Length 524 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-211ENST00000588374 FAM81BQ96LP2 452 aa7.18□□□□□ -1.26
EFTUD2-211ENST00000588374 ZSWIM1Q9BR11 485 aa7.18□□□□□ -1.26
EFTUD2-211ENST00000588374 LSM14BQ9BX40 385 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
EFTUD2-211ENST00000588374 UBXN6Q9BZV1 441 aa7.18□□□□□ -1.26
EFTUD2-211ENST00000588374 HSD3B7Q9H2F3 369 aa7.18□□□□□ -1.26
EFTUD2-211ENST00000588374 MFSD1Q9H3U5 465 aa7.18□□□□□ -1.26
EFTUD2-211ENST00000588374 FBXO44Q9H4M3 255 aa7.18□□□□□ -1.26
EFTUD2-211ENST00000588374 TRPV4Q9HBA0 871 aa7.18□□□□□ -1.26
EFTUD2-211ENST00000588374 CBX8Q9HC52 389 aa7.18□□□□□ -1.26
EFTUD2-211ENST00000588374 ACP6Q9NPH0 428 aa7.18□□□□□ -1.26
EFTUD2-211ENST00000588374 C11orf16Q9NQ32 467 aa7.18□□□□□ -1.26
EFTUD2-211ENST00000588374 GKN1Q9NS71 199 aa7.18□□□□□ -1.26
EFTUD2-211ENST00000588374 TDP1Q9NUW8 608 aa7.18□□□□□ -1.26
EFTUD2-211ENST00000588374 THG1LQ9NWX6 298 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
EFTUD2-211ENST00000588374 IL37Q9NZH6 218 aa7.18□□□□□ -1.26
EFTUD2-211ENST00000588374 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
EFTUD2-211ENST00000588374 GMIPQ9P107 970 aa7.18□□□□□ -1.26
EFTUD2-211ENST00000588374 WNT16Q9UBV4 365 aa7.18□□□□□ -1.26
EFTUD2-211ENST00000588374 APEX2Q9UBZ4 518 aa7.18□□□□□ -1.26
EFTUD2-211ENST00000588374 LIMA1Q9UHB6 759 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
EFTUD2-211ENST00000588374 AJAP1Q9UKB5 411 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
EFTUD2-211ENST00000588374 CCL26Q9Y258 94 aa7.18□□□□□ -1.26
EFTUD2-211ENST00000588374 HELZP42694 1942 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
EFTUD2-211ENST00000588374 NCANO14594 1321 aa7.18□□□□□ -1.26
EFTUD2-211ENST00000588374 A0A0C4DFX4 3053 aa7.18□□□□□ -1.26
EFTUD2-211ENST00000588374 A0A1W2PQH9 124 aa7.17□□□□□ -1.26
EFTUD2-211ENST00000588374 KRBA1A5PL33 1030 aa7.17□□□□□ -1.26
EFTUD2-211ENST00000588374 LRRC10BA6NIK2 292 aa7.17□□□□□ -1.26
EFTUD2-211ENST00000588374 SOBPA7XYQ1 873 aa7.17□□□□□ -1.26
EFTUD2-211ENST00000588374 O00370 1275 aa7.17□□□□□ -1.26
EFTUD2-211ENST00000588374 CYP26A1O43174 497 aa7.17□□□□□ -1.26
EFTUD2-211ENST00000588374 THAP12O43422 761 aa7.17□□□□□ -1.26
EFTUD2-211ENST00000588374 PNMA6AP0CW24 399 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
EFTUD2-211ENST00000588374 MBL2P11226 248 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
EFTUD2-211ENST00000588374 CD72P21854 359 aa7.17□□□□□ -1.26
EFTUD2-211ENST00000588374 WEE1P30291 646 aa7.17□□□□□ -1.26
EFTUD2-211ENST00000588374 CLCN1P35523 988 aa7.17□□□□□ -1.26
EFTUD2-211ENST00000588374 RGS7P49802 495 aa7.17□□□□□ -1.26
EFTUD2-211ENST00000588374 TKTL1P51854 596 aa7.17□□□□□ -1.26
EFTUD2-211ENST00000588374 KIF11P52732 1056 aa7.17□□□□□ -1.26
EFTUD2-211ENST00000588374 PTK2Q05397 1052 aa7.17□□□□□ -1.26
EFTUD2-211ENST00000588374 BST2Q10589 180 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
EFTUD2-211ENST00000588374 RAPGEF1Q13905 1077 aa7.17□□□□□ -1.26
EFTUD2-211ENST00000588374 DRAP1Q14919 205 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
EFTUD2-211ENST00000588374 IQCB1Q15051 598 aa7.17□□□□□ -1.26
EFTUD2-211ENST00000588374 HECTD3Q5T447 861 aa7.17□□□□□ -1.26
EFTUD2-211ENST00000588374 DENND1BQ6P3S1 775 aa7.17□□□□□ -1.26
EFTUD2-211ENST00000588374 LCLAT1Q6UWP7 414 aa7.17□□□□□ -1.26
EFTUD2-211ENST00000588374 HFE2Q6ZVN8 426 aa7.17□□□□□ -1.26
EFTUD2-211ENST00000588374 LUZP1Q86V48 1076 aa7.17□□□□□ -1.26
EFTUD2-211ENST00000588374 PIGZQ86VD9 579 aa7.17□□□□□ -1.26
EFTUD2-211ENST00000588374 PDZD8Q8NEN9 1154 aa7.17□□□□□ -1.26
EFTUD2-211ENST00000588374 FLCNQ8NFG4 579 aa7.17□□□□□ -1.26
EFTUD2-211ENST00000588374 BPIFB1Q8TDL5 484 aa7.17□□□□□ -1.26
EFTUD2-211ENST00000588374 CSGALNACT1Q8TDX6 532 aa7.17□□□□□ -1.26
EFTUD2-211ENST00000588374 OVCA2Q8WZ82 227 aa7.17□□□□□ -1.26
EFTUD2-211ENST00000588374 IRF7Q92985 503 aa7.17□□□□□ -1.26
EFTUD2-211ENST00000588374 SECISBP2LQ93073 1101 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
EFTUD2-211ENST00000588374 BPIFA3Q9BQP9 254 aa7.17□□□□□ -1.26
EFTUD2-211ENST00000588374 LINC00597Q9H2U6 94 aa7.17□□□□□ -1.26
EFTUD2-211ENST00000588374 CCSER2Q9H7U1 834 aa7.17□□□□□ -1.26
EFTUD2-211ENST00000588374 NMUR1Q9HB89 426 aa7.17□□□□□ -1.26
EFTUD2-211ENST00000588374 LRRC4Q9HBW1 653 aa7.17□□□□□ -1.26
EFTUD2-211ENST00000588374 SLC2A4RGQ9NR83 387 aa7.17□□□□□ -1.26
EFTUD2-211ENST00000588374 TLR8Q9NR97 1041 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
EFTUD2-211ENST00000588374 HEBP1Q9NRV9 189 aa7.17□□□□□ -1.26
EFTUD2-211ENST00000588374 SMPD4Q9NXE4 827 aa7.17□□□□□ -1.26
EFTUD2-211ENST00000588374 ZMYM5Q9UJ78 669 aa7.17□□□□□ -1.26
EFTUD2-211ENST00000588374 NUDT5Q9UKK9 219 aa7.17□□□□□ -1.26
EFTUD2-211ENST00000588374 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP7.17□□□□□ -1.26
EFTUD2-211ENST00000588374 CNTN6Q9UQ52 1028 aa7.17□□□□□ -1.26
EFTUD2-211ENST00000588374 SCML2Q9UQR0 700 aa7.17□□□□□ -1.26
EFTUD2-211ENST00000588374 FHOD1Q9Y613 1164 aa7.17□□□□□ -1.26
EFTUD2-211ENST00000588374 COL4A3Q01955 1670 aa7.16□□□□□ -1.26
EFTUD2-211ENST00000588374 FAM92AA1XBS5 289 aa7.16□□□□□ -1.26
EFTUD2-211ENST00000588374 PRR33A8MZF0 331 aa7.16□□□□□ -1.26
EFTUD2-211ENST00000588374 M0QYV0 167 aa7.16□□□□□ -1.26
EFTUD2-211ENST00000588374 LEFTY2O00292 366 aa7.16□□□□□ -1.26
EFTUD2-211ENST00000588374 XPO1O14980 1071 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
EFTUD2-211ENST00000588374 CHADO15335 359 aa7.16□□□□□ -1.26
EFTUD2-211ENST00000588374 TEX33O43247 280 aa7.16□□□□□ -1.26
EFTUD2-211ENST00000588374 COCHO43405 550 aa7.16□□□□□ -1.26
EFTUD2-211ENST00000588374 MED7O43513 233 aa7.16□□□□□ -1.26
EFTUD2-211ENST00000588374 PI15O43692 258 aa7.16□□□□□ -1.26
EFTUD2-211ENST00000588374 TBX18O95935 607 aa7.16□□□□□ -1.26
EFTUD2-211ENST00000588374 RARGP13631 454 aa7.16□□□□□ -1.26
EFTUD2-211ENST00000588374 UCHL3P15374 230 aa7.16□□□□□ -1.26
EFTUD2-211ENST00000588374 ZNF18P17022 549 aa7.16□□□□□ -1.26
EFTUD2-211ENST00000588374 RFX1P22670 979 aa7.16□□□□□ -1.26
EFTUD2-211ENST00000588374 GNA15P30679 374 aa7.16□□□□□ -1.26
EFTUD2-211ENST00000588374 ATP5C1P36542 298 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
EFTUD2-211ENST00000588374 KPNA1P52294 538 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
EFTUD2-211ENST00000588374 ZNF132P52740 706 aa7.16□□□□□ -1.26
EFTUD2-211ENST00000588374 BCAT1P54687 386 aa7.16□□□□□ -1.26
EFTUD2-211ENST00000588374 POLR2FP61218 127 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
EFTUD2-211ENST00000588374 TPM4P67936 248 aa7.16□□□□□ -1.26
EFTUD2-211ENST00000588374 ZXDBP98169 803 aa7.16□□□□□ -1.26
EFTUD2-211ENST00000588374 PFKPQ01813 784 aa7.16□□□□□ -1.26
EFTUD2-211ENST00000588374 SYCP1Q15431 976 aa7.16□□□□□ -1.26
EFTUD2-211ENST00000588374 STILQ15468 1287 aa7.16□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.8 ms