RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583289.5

PTPRM-215, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, human

TSL 5

Gene PTPRM, Length 792 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPRM-215	ENST00000583289	RUBCN	Q92622	972 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289	SYN2	Q92777	582 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289	CHFR	Q96EP1	664 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289	CEP95	Q96GE4	821 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289	MTMR9	Q96QG7	549 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289	MED15	Q96RN5	788 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289	ERGIC2	Q96RQ1	377 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289	TUBGCP2	Q9BSJ2	902 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289	IDI2	Q9BXS1	227 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289	OSBPL2	Q9H1P3	480 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289	VPS16	Q9H269	839 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289	PSTPIP2	Q9H939	334 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289	VAT1L	Q9HCJ6	419 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289	ABHD10	Q9NUJ1	306 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289	INTS13	Q9NVM9	706 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289	KCMF1	Q9P0J7	381 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289	RNF14	Q9UBS8	474 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289	POLL	Q9UGP5	575 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289	SAP30BP	Q9UHR5	308 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289	PCDHA12	Q9UN75	941 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289	RABGAP1	Q9Y3P9	1069 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289	DAAM1	Q9Y4D1	1078 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289	MRFAP1	Q9Y605	127 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289	NAV1	Q8NEY1	1877 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289	BAZ2B	Q9UIF8	2168 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289	ANO9	A1A5B4	782 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289	CTAGE15	A4D2H0	777 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289	EIF3CL	B5ME19	914 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289	POLRMT	O00411	1230 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289	PSMD14	O00487	310 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289	PES1	O00541	588 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289	MAFG	O15525	162 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289	TEX33	O43247	280 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289	KLRC4	O43908	158 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289	ENTPD3	O75355	529 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289	NDUFA10	O95299	355 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289	GYPC	P04921	128 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289	CTAGE8	P0CG41	777 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289	FLT3	P36888	993 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289	TEC	P42680	631 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289	BCAR1	P56945	870 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289	BPIFB4	P59827	614 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289	KIF5A	Q12840	1032 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289	EPHA7	Q15375	998 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289	TXNRD1	Q16881	649 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289	ERCC6L	Q2NKX8	1250 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289	ZNF569	Q5MCW4	686 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289	HYI	Q5T013	277 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289	C10orf76	Q5T2E6	689 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289	HAUS3	Q68CZ6	603 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289	TTI2	Q6NXR4	508 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289	TMEM179	Q6ZVK1	233 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289	RSRC2	Q7L4I2	434 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289	KRT27	Q7Z3Y8	459 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289	BMP8A	Q7Z5Y6	402 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289	CTAGE6	Q86UF2	777 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289	CTAGE4	Q8IX94	777 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289	LILRB2	Q8N423	598 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289	NEU4	Q8WWR8	484 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289	LARP4B	Q92615	738 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289	NKD2	Q969F2	451 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289	MIEF2	Q96C03	454 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289	MTMR8	Q96EF0	704 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289	DYDC2	Q96IM9	177 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289	CCDC42	Q96M95	316 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289	FAM20A	Q96MK3	541 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289	PIGS	Q96S52	555 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289	EIF3C	Q99613	913 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289	NAPG	Q99747	312 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289	MXD3	Q9BW11	206 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289	VPS33B	Q9H267	617 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289	BLZF1	Q9H2G9	400 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289	POLR3B	Q9NW08	1133 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289	CEP72	Q9P209	647 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289	DDX25	Q9UHL0	483 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289	SH3BP1	Q9Y3L3	701 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289	BZW2	Q9Y6E2	419 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289	TNRC6C	Q9HCJ0	1690 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289	AFF2	P51816	1311 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289	TARSL2	A2RTX5	802 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289		A6NNZ2	444 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289		H0YIN7	160 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289	OPA1	O60313	960 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289	TACC1	O75410	805 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289	GOLGA8H	P0CJ92	632 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289	ANXA13	P27216	316 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289	CCT6A	P40227	531 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289	STAT3	P40763	770 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289	SLC1A4	P43007	532 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289	CBX1	P83916	185 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289	ITIH3	Q06033	890 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289	DMTN	Q08495	405 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289	ADCY1	Q08828	1119 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289	RRP1B	Q14684	758 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289	ELF2	Q15723	593 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289	CDC37	Q16543	378 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289	MEA1	Q16626	185 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289	MAN2A1	Q16706	1144 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289	EDRF1	Q3B7T1	1238 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PTPRM-215	ENST00000583289	TUBB8	Q3ZCM7	444 aa		4.94	□□□□□ -1.62

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