RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563200.5

PPP4C-205, Transcript of protein phosphatase 4 catalytic subunit, human

TSL 5

Gene PPP4C, Length 1,447 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PPP4C-205	ENST00000563200	CPA6	Q8N4T0	437 aa		23.07	■■□□□ 1.28
PPP4C-205	ENST00000563200	CCDC150	Q8NCX0	1101 aa		23.07	■■□□□ 1.28
PPP4C-205	ENST00000563200	ATP2A3	Q93084	1043 aa		23.07	■■□□□ 1.28
PPP4C-205	ENST00000563200	FBXO32	Q969P5	355 aa		23.07	■■□□□ 1.28
PPP4C-205	ENST00000563200	DHTKD1	Q96HY7	919 aa	Predicted RBP	23.07	■■□□□ 1.28
PPP4C-205	ENST00000563200	LINC00597	Q9H2U6	94 aa		23.07	■■□□□ 1.28
PPP4C-205	ENST00000563200	FBRSL1	Q9HCM7	1045 aa	Known RBP	23.07	■■□□□ 1.28
PPP4C-205	ENST00000563200	C2orf42	Q9NWW7	574 aa		23.07	■■□□□ 1.28
PPP4C-205	ENST00000563200	ABL1	P00519	1130 aa		23.06	■■□□□ 1.28
PPP4C-205	ENST00000563200	CD58	P19256	250 aa		23.06	■■□□□ 1.28
PPP4C-205	ENST00000563200	IFNAR2	P48551	515 aa		23.06	■■□□□ 1.28
PPP4C-205	ENST00000563200	MAP3K7CL	P57077	242 aa		23.06	■■□□□ 1.28
PPP4C-205	ENST00000563200	NAIF1	Q69YI7	327 aa	Predicted RBP	23.06	■■□□□ 1.28
PPP4C-205	ENST00000563200	ISM2	Q6H9L7	571 aa		23.06	■■□□□ 1.28
PPP4C-205	ENST00000563200	CLEC20A	Q6ZU45	233 aa		23.06	■■□□□ 1.28
PPP4C-205	ENST00000563200	TTC16	Q8NEE8	873 aa		23.06	■■□□□ 1.28
PPP4C-205	ENST00000563200	CYFIP2	Q96F07	1278 aa		23.06	■■□□□ 1.28
PPP4C-205	ENST00000563200	CHORDC1	Q9UHD1	332 aa	Predicted RBP	23.06	■■□□□ 1.28
PPP4C-205	ENST00000563200	CPQ	Q9Y646	472 aa		23.06	■■□□□ 1.28
PPP4C-205	ENST00000563200	HHLA1	C9JL84	531 aa		23.05	■■□□□ 1.28
PPP4C-205	ENST00000563200	PSMA7	O14818	248 aa		23.05	■■□□□ 1.28
PPP4C-205	ENST00000563200	TUB	P50607	506 aa		23.05	■■□□□ 1.28
PPP4C-205	ENST00000563200	AMPD2	Q01433	879 aa		23.05	■■□□□ 1.28
PPP4C-205	ENST00000563200	ATRIP	Q8WXE1	791 aa		23.05	■■□□□ 1.28
PPP4C-205	ENST00000563200	SLC35C1	Q96A29	364 aa		23.05	■■□□□ 1.28
PPP4C-205	ENST00000563200	ZFR	Q96KR1	1074 aa	Known RBP	23.05	■■□□□ 1.28
PPP4C-205	ENST00000563200	CEP250	Q9BV73	2442 aa		23.04	■■□□□ 1.28
PPP4C-205	ENST00000563200	PPP1R3G	B7ZBB8	358 aa		23.04	■■□□□ 1.28
PPP4C-205	ENST00000563200		K7ESF4	209 aa		23.04	■■□□□ 1.28
PPP4C-205	ENST00000563200	COCH	O43405	550 aa		23.04	■■□□□ 1.28
PPP4C-205	ENST00000563200	FAM200B	P0CF97	657 aa		23.04	■■□□□ 1.28
PPP4C-205	ENST00000563200	ADORA2B	P29275	332 aa		23.04	■■□□□ 1.28
PPP4C-205	ENST00000563200	PGF	P49763	221 aa		23.04	■■□□□ 1.28
PPP4C-205	ENST00000563200	GALK1	P51570	392 aa		23.04	■■□□□ 1.28
PPP4C-205	ENST00000563200	GRSF1	Q12849	480 aa	Known RBP eCLIP	23.04	■■□□□ 1.28
PPP4C-205	ENST00000563200	MORC3	Q14149	939 aa		23.04	■■□□□ 1.28
PPP4C-205	ENST00000563200	PPP2R5D	Q14738	602 aa		23.04	■■□□□ 1.28
PPP4C-205	ENST00000563200	DCAF17	Q5H9S7	520 aa	Predicted RBP	23.04	■■□□□ 1.28
PPP4C-205	ENST00000563200	TATDN2	Q93075	761 aa		23.04	■■□□□ 1.28
PPP4C-205	ENST00000563200	ARID3A	Q99856	593 aa		23.04	■■□□□ 1.28
PPP4C-205	ENST00000563200	DUSP9	Q99956	384 aa	Known RBP	23.04	■■□□□ 1.28
PPP4C-205	ENST00000563200	FAM124B	Q9H5Z6	455 aa	Predicted RBP	23.04	■■□□□ 1.28
PPP4C-205	ENST00000563200	SMPD4	Q9NXE4	827 aa		23.04	■■□□□ 1.28
PPP4C-205	ENST00000563200	GMIP	Q9P107	970 aa		23.04	■■□□□ 1.28
PPP4C-205	ENST00000563200	ARMCX3	Q9UH62	379 aa	Predicted RBP	23.04	■■□□□ 1.28
PPP4C-205	ENST00000563200	TRIM21	P19474	475 aa	Known RBP	23.03	■■□□□ 1.28
PPP4C-205	ENST00000563200	PPP1R2	P41236	205 aa		23.03	■■□□□ 1.28
PPP4C-205	ENST00000563200	STIM1	Q13586	685 aa		23.03	■■□□□ 1.28
PPP4C-205	ENST00000563200	HECTD3	Q5T447	861 aa		23.03	■■□□□ 1.28
PPP4C-205	ENST00000563200	FOXR2	Q6PJQ5	311 aa		23.03	■■□□□ 1.28
PPP4C-205	ENST00000563200	GPRIN1	Q7Z2K8	1008 aa		23.03	■■□□□ 1.28
PPP4C-205	ENST00000563200	P2RY13	Q9BPV8	354 aa		23.03	■■□□□ 1.28
PPP4C-205	ENST00000563200	EPC1	Q9H2F5	836 aa		23.03	■■□□□ 1.28
PPP4C-205	ENST00000563200	PNPLA8	Q9NP80	782 aa		23.03	■■□□□ 1.28
PPP4C-205	ENST00000563200	CISH	Q9NSE2	258 aa		23.03	■■□□□ 1.28
PPP4C-205	ENST00000563200	MYO16	Q9Y6X6	1858 aa		23.03	■■□□□ 1.28
PPP4C-205	ENST00000563200	MYOF	Q9NZM1	2061 aa		23.02	■■□□□ 1.28
PPP4C-205	ENST00000563200	EGF	P01133	1207 aa		23.02	■■□□□ 1.28
PPP4C-205	ENST00000563200	NRL	P54845	237 aa		23.02	■■□□□ 1.28
PPP4C-205	ENST00000563200	GAB4	Q2WGN9	574 aa		23.02	■■□□□ 1.28
PPP4C-205	ENST00000563200	PPP1R26	Q5T8A7	1209 aa	Predicted RBP	23.02	■■□□□ 1.28
PPP4C-205	ENST00000563200	TCERG1L	Q5VWI1	586 aa		23.02	■■□□□ 1.28
PPP4C-205	ENST00000563200	TTI2	Q6NXR4	508 aa		23.02	■■□□□ 1.28
PPP4C-205	ENST00000563200	PKN3	Q6P5Z2	889 aa		23.02	■■□□□ 1.28
PPP4C-205	ENST00000563200	FILIP1	Q7Z7B0	1213 aa		23.02	■■□□□ 1.28
PPP4C-205	ENST00000563200	ADGRG2	Q8IZP9	1017 aa		23.02	■■□□□ 1.28
PPP4C-205	ENST00000563200	TTC39C	Q8N584	583 aa		23.02	■■□□□ 1.28
PPP4C-205	ENST00000563200	SLC4A11	Q8NBS3	891 aa		23.02	■■□□□ 1.28
PPP4C-205	ENST00000563200	EZH1	Q92800	747 aa	Predicted RBP	23.02	■■□□□ 1.28
PPP4C-205	ENST00000563200	CEP63	Q96MT8	703 aa		23.02	■■□□□ 1.28
PPP4C-205	ENST00000563200	FBXO44	Q9H4M3	255 aa		23.02	■■□□□ 1.28
PPP4C-205	ENST00000563200	CCSER2	Q9H7U1	834 aa		23.02	■■□□□ 1.28
PPP4C-205	ENST00000563200	MBL2	P11226	248 aa	Predicted RBP	23.01	■■□□□ 1.27
PPP4C-205	ENST00000563200	DRD1	P21728	446 aa		23.01	■■□□□ 1.27
PPP4C-205	ENST00000563200	RAD23B	P54727	409 aa		23.01	■■□□□ 1.27
PPP4C-205	ENST00000563200	ZNF394	Q53GI3	561 aa		23.01	■■□□□ 1.27
PPP4C-205	ENST00000563200	CFAP97	Q9P2B7	532 aa		23.01	■■□□□ 1.27
PPP4C-205	ENST00000563200	SCML2	Q9UQR0	700 aa		23.01	■■□□□ 1.27
PPP4C-205	ENST00000563200	KIAA1549L	Q6ZVL6	1849 aa		23.01	■■□□□ 1.27
PPP4C-205	ENST00000563200	NFATC1	O95644	943 aa		23	■■□□□ 1.27
PPP4C-205	ENST00000563200	HOXA6	P31267	233 aa		23	■■□□□ 1.27
PPP4C-205	ENST00000563200	DMWD	Q09019	674 aa		23	■■□□□ 1.27
PPP4C-205	ENST00000563200	NR1H3	Q13133	447 aa		23	■■□□□ 1.27
PPP4C-205	ENST00000563200	DDX42	Q86XP3	938 aa	Known RBP eCLIP	23	■■□□□ 1.27
PPP4C-205	ENST00000563200	CD101	Q93033	1021 aa		23	■■□□□ 1.27
PPP4C-205	ENST00000563200	DUSP16	Q9BY84	665 aa		23	■■□□□ 1.27
PPP4C-205	ENST00000563200	METTL14	Q9HCE5	456 aa	Known RBP	23	■■□□□ 1.27
PPP4C-205	ENST00000563200	CHURC1-FNTB	B4DL54	471 aa		22.99	■■□□□ 1.27
PPP4C-205	ENST00000563200	HOXC13	P31276	330 aa		22.99	■■□□□ 1.27
PPP4C-205	ENST00000563200	OPRD1	P41143	372 aa		22.99	■■□□□ 1.27
PPP4C-205	ENST00000563200	NELFB	Q8WX92	580 aa		22.99	■■□□□ 1.27
PPP4C-205	ENST00000563200	TMEM176A	Q96HP8	235 aa		22.99	■■□□□ 1.27
PPP4C-205	ENST00000563200	HEXIM2	Q96MH2	286 aa	Known RBP	22.99	■■□□□ 1.27
PPP4C-205	ENST00000563200	CYLD	Q9NQC7	956 aa		22.99	■■□□□ 1.27
PPP4C-205	ENST00000563200	OSER1	Q9NX31	292 aa		22.99	■■□□□ 1.27
PPP4C-205	ENST00000563200	E2F8	A0AVK6	867 aa		22.99	■■□□□ 1.27
PPP4C-205	ENST00000563200	SLC9A3R1	O14745	358 aa	Predicted RBP	22.99	■■□□□ 1.27
PPP4C-205	ENST00000563200	SCAMP3	O14828	347 aa	Known RBP	22.99	■■□□□ 1.27
PPP4C-205	ENST00000563200	PMM2	O15305	246 aa		22.99	■■□□□ 1.27
PPP4C-205	ENST00000563200	TLR5	O60602	858 aa		22.99	■■□□□ 1.27

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