RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000562866.1

VPS9D1-AS1-202, VPS9D1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene VPS9D1-AS1, Length 1,753 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 TGM2P21980 687 aa22.3■■□□□ 1.16
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VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 RPL34P49207 117 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 ARL4CP56559 192 aa22.3■■□□□ 1.16
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 ATP11AP98196 1134 aa22.3■■□□□ 1.16
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 HIF1AQ16665 826 aa22.3■■□□□ 1.16
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 CHADLQ6NUI6 762 aa22.3■■□□□ 1.16
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 SCYL2Q6P3W7 929 aa22.3■■□□□ 1.16
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 SLC26A9Q7LBE3 791 aa22.3■■□□□ 1.16
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 CPLX4Q7Z7G2 160 aa22.3■■□□□ 1.16
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 SMG8Q8ND04 991 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 HSFY1Q96LI6 401 aa22.3■■□□□ 1.16
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 RNF157Q96PX1 679 aa22.3■■□□□ 1.16
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP22.3■■□□□ 1.16
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 ACTL7BQ9Y614 415 aa22.3■■□□□ 1.16
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VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 PDGFRBP09619 1106 aa22.29■■□□□ 1.16
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 FGFR1P11362 822 aa22.29■■□□□ 1.16
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VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 CCDC38Q502W7 563 aa22.29■■□□□ 1.16
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VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 RSPH3Q86UC2 560 aa22.29■■□□□ 1.16
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 HACE1Q8IYU2 909 aa22.29■■□□□ 1.16
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 ADGRF2Q8IZF7 708 aa22.29■■□□□ 1.16
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP22.29■■□□□ 1.16
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VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 ADORA2BP29275 332 aa22.28■■□□□ 1.16
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 GDF10P55107 478 aa22.28■■□□□ 1.16
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 SLC8A3P57103 927 aa22.28■■□□□ 1.16
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 PPARDQ03181 441 aa22.28■■□□□ 1.16
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 TDRPQ86YL5 185 aa22.28■■□□□ 1.16
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 UNC45BQ8IWX7 931 aa22.28■■□□□ 1.16
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 NAT8LQ8N9F0 302 aa22.28■■□□□ 1.16
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 NAALADL1Q9UQQ1 740 aa22.28■■□□□ 1.16
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 TRBV21OR9-2A0A075B6F4 123 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.16
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 CFAP69A5D8W1 941 aa22.27■■□□□ 1.16
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 APOL1O14791 398 aa22.27■■□□□ 1.16
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 RPLP2P05387 115 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 SLC10A3P09131 477 aa22.27■■□□□ 1.16
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 CCDC130P13994 396 aa22.27■■□□□ 1.16
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 PDIA2Q13087 525 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 MMRN1Q13201 1228 aa22.27■■□□□ 1.16
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 GKAP1Q5VSY0 366 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.16
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VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 ZBED8Q8IZ13 594 aa22.27■■□□□ 1.16
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 FAM71DQ8N9W8 422 aa22.27■■□□□ 1.16
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 CPT1BQ92523 772 aa22.27■■□□□ 1.16
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 ZNF670Q9BS34 389 aa22.27■■□□□ 1.16
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 SLC38A7Q9NVC3 462 aa22.27■■□□□ 1.16
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 TRPV2Q9Y5S1 764 aa22.27■■□□□ 1.16
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 C6orf222P0C671 652 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.16
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VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 PHBP35232 272 aa22.27■■□□□ 1.16
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 PSMC4P43686 418 aa22.27■■□□□ 1.16
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VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 SOX4Q06945 474 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.16
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 SREBF2Q12772 1141 aa22.27■■□□□ 1.16
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 VPS37BQ9H9H4 285 aa22.27■■□□□ 1.16
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 PCDH18Q9HCL0 1135 aa22.27■■□□□ 1.16
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 RNF19AQ9NV58 838 aa22.27■■□□□ 1.16
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VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 GABBR2O75899 941 aa22.26■■□□□ 1.15
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 TSHRP16473 764 aa22.26■■□□□ 1.15
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 LMO2P25791 158 aa22.26■■□□□ 1.15
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 ATP5OP48047 213 aa22.26■■□□□ 1.15
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 GJA9P57773 515 aa22.26■■□□□ 1.15
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VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 TADA2BQ86TJ2 420 aa22.26■■□□□ 1.15
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 SAPCD2Q86UD0 394 aa22.26■■□□□ 1.15
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VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 SLC2A14Q8TDB8 520 aa22.26■■□□□ 1.15
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 CENPIQ92674 756 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 ZNF317Q96PQ6 595 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
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VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 CTNNAL1Q9UBT7 734 aa22.26■■□□□ 1.15
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 TMEM120BA0PK00 339 aa22.25■■□□□ 1.15
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 XPO1O14980 1071 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 ZFXP17010 805 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
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VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 EFHC1Q5JVL4 640 aa22.25■■□□□ 1.15
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 MFSD14CQ5VZR4 134 aa22.25■■□□□ 1.15
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 SLC9A4Q6AI14 798 aa22.25■■□□□ 1.15
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 CCDC13Q8IYE1 715 aa22.25■■□□□ 1.15
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 PLD5Q8N7P1 536 aa22.25■■□□□ 1.15
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 ATP11CQ8NB49 1132 aa22.25■■□□□ 1.15
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 B3GALNT2Q8NCR0 500 aa22.25■■□□□ 1.15
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 ARRDC4Q8NCT1 418 aa22.25■■□□□ 1.15
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 DYDC1Q8WWB3 177 aa22.25■■□□□ 1.15
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 PPP1R10Q96QC0 940 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 HNRNPABQ99729 332 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 PRMT1Q99873 361 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 B3GNT5Q9BYG0 378 aa22.25■■□□□ 1.15
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 C10orf88Q9H8K7 445 aa22.25■■□□□ 1.15
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