RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560725.1

TMOD3-208, Transcript of tropomodulin 3, humanhuman

TSL 4

Gene TMOD3, Length 544 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3-208ENST00000560725 LZTS1Q9Y250 596 aa6.84□□□□□ -1.31
TMOD3-208ENST00000560725 GPR52Q9Y2T5 361 aa6.84□□□□□ -1.31
TMOD3-208ENST00000560725 ZNF536O15090 1300 aa6.83□□□□□ -1.32
TMOD3-208ENST00000560725 ABCC6O95255 1503 aa6.83□□□□□ -1.32
TMOD3-208ENST00000560725 A0A087WZ62 844 aa6.83□□□□□ -1.32
TMOD3-208ENST00000560725 NPEPPSL1A6NEC2 478 aa6.83□□□□□ -1.32
TMOD3-208ENST00000560725 CYP27B1O15528 508 aa6.83□□□□□ -1.32
TMOD3-208ENST00000560725 PRSS23O95084 383 aa6.83□□□□□ -1.32
TMOD3-208ENST00000560725 ITGA5P08648 1049 aa6.83□□□□□ -1.32
TMOD3-208ENST00000560725 CD53P19397 219 aa6.83□□□□□ -1.32
TMOD3-208ENST00000560725 YY1P25490 414 aa6.83□□□□□ -1.32
TMOD3-208ENST00000560725 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
TMOD3-208ENST00000560725 LRPAP1P30533 357 aa6.83□□□□□ -1.32
TMOD3-208ENST00000560725 KRT17Q04695 432 aa6.83□□□□□ -1.32
TMOD3-208ENST00000560725 SLC15A2Q16348 729 aa6.83□□□□□ -1.32
TMOD3-208ENST00000560725 PLAG1Q6DJT9 500 aa6.83□□□□□ -1.32
TMOD3-208ENST00000560725 TCTN3Q6NUS6 607 aa6.83□□□□□ -1.32
TMOD3-208ENST00000560725 ZDHHC24Q6UX98 284 aa6.83□□□□□ -1.32
TMOD3-208ENST00000560725 GATAD2AQ86YP4 633 aa6.83□□□□□ -1.32
TMOD3-208ENST00000560725 SYT12Q8IV01 421 aa6.83□□□□□ -1.32
TMOD3-208ENST00000560725 PSD4Q8NDX1 1056 aa6.83□□□□□ -1.32
TMOD3-208ENST00000560725 IP6K1Q92551 441 aa6.83□□□□□ -1.32
TMOD3-208ENST00000560725 TTYH3Q9C0H2 523 aa6.83□□□□□ -1.32
TMOD3-208ENST00000560725 PPP4R1LQ9P1A2 415 aa6.83□□□□□ -1.32
TMOD3-208ENST00000560725 ZNF69Q9UC07 566 aa6.83□□□□□ -1.32
TMOD3-208ENST00000560725 TONSLQ96HA7 1378 aa6.82□□□□□ -1.32
TMOD3-208ENST00000560725 COL18A1P39060 1754 aa6.82□□□□□ -1.32
TMOD3-208ENST00000560725 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa6.82□□□□□ -1.32
TMOD3-208ENST00000560725 AQP12BA6NM10 295 aa6.82□□□□□ -1.32
TMOD3-208ENST00000560725 CAPN14A8MX76 684 aa6.82□□□□□ -1.32
TMOD3-208ENST00000560725 GOLGA6L6A8MZA4 724 aa6.82□□□□□ -1.32
TMOD3-208ENST00000560725 HMGB1P1B2RPK0 211 aaPredicted RBP6.82□□□□□ -1.32
TMOD3-208ENST00000560725 E7ENX8 843 aa6.82□□□□□ -1.32
TMOD3-208ENST00000560725 H7C4K7 107 aa6.82□□□□□ -1.32
TMOD3-208ENST00000560725 M0R3H8 397 aa6.82□□□□□ -1.32
TMOD3-208ENST00000560725 DCLK1O15075 740 aa6.82□□□□□ -1.32
TMOD3-208ENST00000560725 IRAK2O43187 625 aa6.82□□□□□ -1.32
TMOD3-208ENST00000560725 RRP9O43818 475 aaKnown RBP6.82□□□□□ -1.32
TMOD3-208ENST00000560725 VPS4BO75351 444 aa6.82□□□□□ -1.32
TMOD3-208ENST00000560725 DHRS4L1P0CG22 281 aa6.82□□□□□ -1.32
TMOD3-208ENST00000560725 CNR2P34972 360 aa6.82□□□□□ -1.32
TMOD3-208ENST00000560725 PTDSS1P48651 473 aaKnown RBP6.82□□□□□ -1.32
TMOD3-208ENST00000560725 RABGGTBP53611 331 aa6.82□□□□□ -1.32
TMOD3-208ENST00000560725 ITGA8P53708 1063 aa6.82□□□□□ -1.32
TMOD3-208ENST00000560725 TAP2Q03519 686 aa6.82□□□□□ -1.32
TMOD3-208ENST00000560725 MAPKAPK3Q16644 382 aa6.82□□□□□ -1.32
TMOD3-208ENST00000560725 FAM102AQ5T9C2 384 aaPredicted RBP6.82□□□□□ -1.32
TMOD3-208ENST00000560725 FCRL6Q6DN72 434 aa6.82□□□□□ -1.32
TMOD3-208ENST00000560725 MRNIPQ6NTE8 343 aa6.82□□□□□ -1.32
TMOD3-208ENST00000560725 MZT2AQ6P582 158 aa6.82□□□□□ -1.32
TMOD3-208ENST00000560725 PTF1AQ7RTS3 328 aa6.82□□□□□ -1.32
TMOD3-208ENST00000560725 CIR1Q86X95 450 aaPredicted RBP6.82□□□□□ -1.32
TMOD3-208ENST00000560725 GSPT2Q8IYD1 628 aaKnown RBP6.82□□□□□ -1.32
TMOD3-208ENST00000560725 SYT8Q8NBV8 401 aa6.82□□□□□ -1.32
TMOD3-208ENST00000560725 POC1BQ8TC44 478 aa6.82□□□□□ -1.32
TMOD3-208ENST00000560725 TBC1D20Q96BZ9 403 aa6.82□□□□□ -1.32
TMOD3-208ENST00000560725 MARS2Q96GW9 593 aaKnown RBP6.82□□□□□ -1.32
TMOD3-208ENST00000560725 MRPS18AQ9NVS2 196 aaKnown RBP6.82□□□□□ -1.32
TMOD3-208ENST00000560725 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP6.82□□□□□ -1.32
TMOD3-208ENST00000560725 CA14Q9ULX7 337 aa6.82□□□□□ -1.32
TMOD3-208ENST00000560725 ATP11BQ9Y2G3 1177 aa6.82□□□□□ -1.32
TMOD3-208ENST00000560725 RAD54BQ9Y620 910 aa6.82□□□□□ -1.32
TMOD3-208ENST00000560725 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP6.82□□□□□ -1.32
TMOD3-208ENST00000560725 PIK3C2AO00443 1686 aa6.81□□□□□ -1.32
TMOD3-208ENST00000560725 RREB1Q92766 1687 aa6.81□□□□□ -1.32
TMOD3-208ENST00000560725 TRIM38O00635 465 aa6.81□□□□□ -1.32
TMOD3-208ENST00000560725 GLP2RO95838 553 aa6.81□□□□□ -1.32
TMOD3-208ENST00000560725 PLATP00750 562 aa6.81□□□□□ -1.32
TMOD3-208ENST00000560725 SPATA31D3P0C874 917 aa6.81□□□□□ -1.32
TMOD3-208ENST00000560725 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP6.81□□□□□ -1.32
TMOD3-208ENST00000560725 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP6.81□□□□□ -1.32
TMOD3-208ENST00000560725 POLE2P56282 527 aa6.81□□□□□ -1.32
TMOD3-208ENST00000560725 ARL4CP56559 192 aa6.81□□□□□ -1.32
TMOD3-208ENST00000560725 NHLH2Q02577 135 aa6.81□□□□□ -1.32
TMOD3-208ENST00000560725 NPY5RQ15761 445 aa6.81□□□□□ -1.32
TMOD3-208ENST00000560725 SLC5A9Q2M3M2 681 aa6.81□□□□□ -1.32
TMOD3-208ENST00000560725 C1QL3Q5VWW1 255 aa6.81□□□□□ -1.32
TMOD3-208ENST00000560725 METRNLQ641Q3 311 aa6.81□□□□□ -1.32
TMOD3-208ENST00000560725 TANGO2Q6ICL3 276 aa6.81□□□□□ -1.32
TMOD3-208ENST00000560725 CRTC1Q6UUV9 634 aa6.81□□□□□ -1.32
TMOD3-208ENST00000560725 KIAA0408Q6ZU52 694 aa6.81□□□□□ -1.32
TMOD3-208ENST00000560725 SPATA31D4Q6ZUB0 917 aa6.81□□□□□ -1.32
TMOD3-208ENST00000560725 LRRC56Q8IYG6 542 aaPredicted RBP6.81□□□□□ -1.32
TMOD3-208ENST00000560725 GALNT15Q8N3T1 639 aa6.81□□□□□ -1.32
TMOD3-208ENST00000560725 OR56A1Q8NGH5 318 aa6.81□□□□□ -1.32
TMOD3-208ENST00000560725 EID2BQ96D98 161 aa6.81□□□□□ -1.32
TMOD3-208ENST00000560725 COG3Q96JB2 828 aa6.81□□□□□ -1.32
TMOD3-208ENST00000560725 DCLRE1CQ96SD1 692 aaKnown RBP6.81□□□□□ -1.32
TMOD3-208ENST00000560725 SAGE1Q9NXZ1 904 aa6.81□□□□□ -1.32
TMOD3-208ENST00000560725 RNF181Q9P0P0 153 aa6.81□□□□□ -1.32
TMOD3-208ENST00000560725 DKK4Q9UBT3 224 aa6.81□□□□□ -1.32
TMOD3-208ENST00000560725 CDY1Q9Y6F8 540 aa6.81□□□□□ -1.32
TMOD3-208ENST00000560725 DUSP10Q9Y6W6 482 aa6.81□□□□□ -1.32
TMOD3-208ENST00000560725 PEAK1Q9H792 1746 aa6.81□□□□□ -1.32
TMOD3-208ENST00000560725 KCNA2P16389 499 aa6.8□□□□□ -1.32
TMOD3-208ENST00000560725 ITGALP20701 1170 aa6.8□□□□□ -1.32
TMOD3-208ENST00000560725 SLC5A2P31639 672 aa6.8□□□□□ -1.32
TMOD3-208ENST00000560725 PXNP49023 591 aaPredicted RBP6.8□□□□□ -1.32
TMOD3-208ENST00000560725 LILRA4P59901 499 aa6.8□□□□□ -1.32
TMOD3-208ENST00000560725 NSUN2Q08J23 767 aaKnown RBP eCLIP6.8□□□□□ -1.32
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