RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556687.5

RBM23-222, Transcript of RNA binding motif protein 23, human

TSL 2

Gene RBM23, Length 1,124 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM23-222	ENST00000556687	KIAA1468	Q9P260	1216 aa		12.96	□□□□□ -0.33
RBM23-222	ENST00000556687	FBXO4	Q9UKT5	387 aa		12.96	□□□□□ -0.33
RBM23-222	ENST00000556687	CPQ	Q9Y646	472 aa		12.96	□□□□□ -0.33
RBM23-222	ENST00000556687	MYOF	Q9NZM1	2061 aa		12.95	□□□□□ -0.34
RBM23-222	ENST00000556687	FAM92A	A1XBS5	289 aa		12.95	□□□□□ -0.34
RBM23-222	ENST00000556687	PRR23A	A6NEV1	266 aa		12.95	□□□□□ -0.34
RBM23-222	ENST00000556687	SCAMP3	O14828	347 aa	Known RBP	12.95	□□□□□ -0.34
RBM23-222	ENST00000556687	COCH	O43405	550 aa		12.95	□□□□□ -0.34
RBM23-222	ENST00000556687	ZDHHC11B	P0C7U3	371 aa		12.95	□□□□□ -0.34
RBM23-222	ENST00000556687	MBL2	P11226	248 aa	Predicted RBP	12.95	□□□□□ -0.34
RBM23-222	ENST00000556687	PFKL	P17858	780 aa		12.95	□□□□□ -0.34
RBM23-222	ENST00000556687	HOXC13	P31276	330 aa		12.95	□□□□□ -0.34
RBM23-222	ENST00000556687	GJA4	P35212	333 aa		12.95	□□□□□ -0.34
RBM23-222	ENST00000556687	IFNAR2	P48551	515 aa		12.95	□□□□□ -0.34
RBM23-222	ENST00000556687	FMO5	P49326	533 aa		12.95	□□□□□ -0.34
RBM23-222	ENST00000556687	PDE6C	P51160	858 aa		12.95	□□□□□ -0.34
RBM23-222	ENST00000556687	GALK1	P51570	392 aa		12.95	□□□□□ -0.34
RBM23-222	ENST00000556687	RAD23B	P54727	409 aa		12.95	□□□□□ -0.34
RBM23-222	ENST00000556687	CCIN	Q13939	588 aa		12.95	□□□□□ -0.34
RBM23-222	ENST00000556687	EML3	Q32P44	896 aa		12.95	□□□□□ -0.34
RBM23-222	ENST00000556687	CCDC40	Q4G0X9	1142 aa		12.95	□□□□□ -0.34
RBM23-222	ENST00000556687	C1orf228	Q6PIY5	440 aa		12.95	□□□□□ -0.34
RBM23-222	ENST00000556687		Q6ZS52	159 aa		12.95	□□□□□ -0.34
RBM23-222	ENST00000556687	SLC4A11	Q8NBS3	891 aa		12.95	□□□□□ -0.34
RBM23-222	ENST00000556687	PDZD8	Q8NEN9	1154 aa		12.95	□□□□□ -0.34
RBM23-222	ENST00000556687	OVCA2	Q8WZ82	227 aa		12.95	□□□□□ -0.34
RBM23-222	ENST00000556687	TMEM176A	Q96HP8	235 aa		12.95	□□□□□ -0.34
RBM23-222	ENST00000556687	FAXDC2	Q96IV6	333 aa		12.95	□□□□□ -0.34
RBM23-222	ENST00000556687	CCSER2	Q9H7U1	834 aa		12.95	□□□□□ -0.34
RBM23-222	ENST00000556687	METTL14	Q9HCE5	456 aa	Known RBP	12.95	□□□□□ -0.34
RBM23-222	ENST00000556687	C2orf42	Q9NWW7	574 aa		12.95	□□□□□ -0.34
RBM23-222	ENST00000556687	COMMD8	Q9NX08	183 aa		12.95	□□□□□ -0.34
RBM23-222	ENST00000556687	RIF1	Q5UIP0	2472 aa	Known RBP	12.95	□□□□□ -0.34
RBM23-222	ENST00000556687	MYO16	Q9Y6X6	1858 aa		12.94	□□□□□ -0.34
RBM23-222	ENST00000556687	BICDL2	A1A5D9	508 aa		12.94	□□□□□ -0.34
RBM23-222	ENST00000556687	TRDMT1	O14717	391 aa	Known RBP	12.94	□□□□□ -0.34
RBM23-222	ENST00000556687	TRIM21	P19474	475 aa	Known RBP	12.94	□□□□□ -0.34
RBM23-222	ENST00000556687	ACO1	P21399	889 aa	Known RBP	12.94	□□□□□ -0.34
RBM23-222	ENST00000556687	ANP32A	P39687	249 aa	Known RBP	12.94	□□□□□ -0.34
RBM23-222	ENST00000556687	SATB1	Q01826	763 aa		12.94	□□□□□ -0.34
RBM23-222	ENST00000556687	PAK1	Q13153	545 aa		12.94	□□□□□ -0.34
RBM23-222	ENST00000556687	CUL2	Q13617	745 aa		12.94	□□□□□ -0.34
RBM23-222	ENST00000556687	LRRC32	Q14392	662 aa		12.94	□□□□□ -0.34
RBM23-222	ENST00000556687	ZNF528	Q3MIS6	628 aa		12.94	□□□□□ -0.34
RBM23-222	ENST00000556687	TMEM196	Q5HYL7	178 aa		12.94	□□□□□ -0.34
RBM23-222	ENST00000556687	DGKK	Q5KSL6	1271 aa		12.94	□□□□□ -0.34
RBM23-222	ENST00000556687	HECTD3	Q5T447	861 aa		12.94	□□□□□ -0.34
RBM23-222	ENST00000556687	SNX30	Q5VWJ9	437 aa		12.94	□□□□□ -0.34
RBM23-222	ENST00000556687	FSTL4	Q6MZW2	842 aa		12.94	□□□□□ -0.34
RBM23-222	ENST00000556687	FOXR2	Q6PJQ5	311 aa		12.94	□□□□□ -0.34
RBM23-222	ENST00000556687	MAMSTR	Q6ZN01	415 aa		12.94	□□□□□ -0.34
RBM23-222	ENST00000556687	WBP2	Q969T9	261 aa		12.94	□□□□□ -0.34
RBM23-222	ENST00000556687	MED15	Q96RN5	788 aa		12.94	□□□□□ -0.34
RBM23-222	ENST00000556687	SRRT	Q9BXP5	876 aa	Known RBP	12.94	□□□□□ -0.34
RBM23-222	ENST00000556687	DUSP16	Q9BY84	665 aa		12.94	□□□□□ -0.34
RBM23-222	ENST00000556687	PRMT8	Q9NR22	394 aa	Predicted RBP	12.94	□□□□□ -0.34
RBM23-222	ENST00000556687	CFAP97	Q9P2B7	532 aa		12.94	□□□□□ -0.34
RBM23-222	ENST00000556687	PTPRZ1	P23471	2315 aa	Predicted RBP	12.94	□□□□□ -0.34
RBM23-222	ENST00000556687	TBX18	O95935	607 aa		12.93	□□□□□ -0.34
RBM23-222	ENST00000556687	TDGF1	P13385	188 aa		12.93	□□□□□ -0.34
RBM23-222	ENST00000556687	CXCL12	P48061	93 aa		12.93	□□□□□ -0.34
RBM23-222	ENST00000556687	PKN3	Q6P5Z2	889 aa		12.93	□□□□□ -0.34
RBM23-222	ENST00000556687	ADGRG2	Q8IZP9	1017 aa		12.93	□□□□□ -0.34
RBM23-222	ENST00000556687	SPEM1	Q8N4L4	309 aa		12.93	□□□□□ -0.34
RBM23-222	ENST00000556687	CPA6	Q8N4T0	437 aa		12.93	□□□□□ -0.34
RBM23-222	ENST00000556687	TTC39C	Q8N584	583 aa		12.93	□□□□□ -0.34
RBM23-222	ENST00000556687	UBR7	Q8N806	425 aa		12.93	□□□□□ -0.34
RBM23-222	ENST00000556687	TRIML1	Q8N9V2	468 aa		12.93	□□□□□ -0.34
RBM23-222	ENST00000556687	LMO3	Q8TAP4	145 aa		12.93	□□□□□ -0.34
RBM23-222	ENST00000556687	NELL1	Q92832	810 aa		12.93	□□□□□ -0.34
RBM23-222	ENST00000556687	ATP2A3	Q93084	1043 aa		12.93	□□□□□ -0.34
RBM23-222	ENST00000556687	ZFR	Q96KR1	1074 aa	Known RBP	12.93	□□□□□ -0.34
RBM23-222	ENST00000556687	FBXO44	Q9H4M3	255 aa		12.93	□□□□□ -0.34
RBM23-222	ENST00000556687	NMUR1	Q9HB89	426 aa		12.93	□□□□□ -0.34
RBM23-222	ENST00000556687	OSER1	Q9NX31	292 aa		12.93	□□□□□ -0.34
RBM23-222	ENST00000556687	WDR87	Q6ZQQ6	2873 aa		12.92	□□□□□ -0.34
RBM23-222	ENST00000556687	FAM186A	A6NE01	2351 aa		12.92	□□□□□ -0.34
RBM23-222	ENST00000556687	PMM2	O15305	246 aa		12.92	□□□□□ -0.34
RBM23-222	ENST00000556687	CYP26A1	O43174	497 aa		12.92	□□□□□ -0.34
RBM23-222	ENST00000556687	EGF	P01133	1207 aa		12.92	□□□□□ -0.34
RBM23-222	ENST00000556687	CCR3	P51677	355 aa		12.92	□□□□□ -0.34
RBM23-222	ENST00000556687	KIF11	P52732	1056 aa		12.92	□□□□□ -0.34
RBM23-222	ENST00000556687	KCNH2	Q12809	1159 aa		12.92	□□□□□ -0.34
RBM23-222	ENST00000556687	GAB4	Q2WGN9	574 aa		12.92	□□□□□ -0.34
RBM23-222	ENST00000556687	ARHGAP17	Q68EM7	881 aa		12.92	□□□□□ -0.34
RBM23-222	ENST00000556687	TRIM59	Q8IWR1	403 aa		12.92	□□□□□ -0.34
RBM23-222	ENST00000556687	ZBTB44	Q8NCP5	570 aa		12.92	□□□□□ -0.34
RBM23-222	ENST00000556687	EZH1	Q92800	747 aa	Predicted RBP	12.92	□□□□□ -0.34
RBM23-222	ENST00000556687	KAT5	Q92993	513 aa		12.92	□□□□□ -0.34
RBM23-222	ENST00000556687	P2RY13	Q9BPV8	354 aa		12.92	□□□□□ -0.34
RBM23-222	ENST00000556687	IER2	Q9BTL4	223 aa		12.92	□□□□□ -0.34
RBM23-222	ENST00000556687	DNAI2	Q9GZS0	605 aa		12.92	□□□□□ -0.34
RBM23-222	ENST00000556687	TLR8	Q9NR97	1041 aa	Known RBP	12.92	□□□□□ -0.34
RBM23-222	ENST00000556687	ZSCAN32	Q9NX65	697 aa		12.92	□□□□□ -0.34
RBM23-222	ENST00000556687	NUDT5	Q9UKK9	219 aa		12.92	□□□□□ -0.34
RBM23-222	ENST00000556687	SCML2	Q9UQR0	700 aa		12.92	□□□□□ -0.34
RBM23-222	ENST00000556687		A0A1W2PQH9	124 aa		12.91	□□□□□ -0.34
RBM23-222	ENST00000556687	ANTXRL	A6NF34	631 aa		12.91	□□□□□ -0.34
RBM23-222	ENST00000556687	RNF225	M0QZC1	329 aa	Predicted RBP	12.91	□□□□□ -0.34
RBM23-222	ENST00000556687	TULP2	O00295	520 aa		12.91	□□□□□ -0.34

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