RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000540486.5

TRAPPC1-202, Transcript of trafficking protein particle complex 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene TRAPPC1, Length 759 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC1-202ENST00000540486 USP25Q9UHP3 1055 aa9.52□□□□□ -0.89
TRAPPC1-202ENST00000540486 PCOLCE2Q9UKZ9 415 aa9.52□□□□□ -0.89
TRAPPC1-202ENST00000540486 STYXL1Q9Y6J8 313 aa9.52□□□□□ -0.89
TRAPPC1-202ENST00000540486 ATXN2Q99700 1313 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
TRAPPC1-202ENST00000540486 GOLGA4Q13439 2230 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
TRAPPC1-202ENST00000540486 TEX15Q9BXT5 2789 aa9.51□□□□□ -0.89
TRAPPC1-202ENST00000540486 A0A0B4J269 797 aa9.51□□□□□ -0.89
TRAPPC1-202ENST00000540486 GCNT3O95395 438 aa9.51□□□□□ -0.89
TRAPPC1-202ENST00000540486 HARSP12081 509 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
TRAPPC1-202ENST00000540486 HLA-EP13747 358 aa9.51□□□□□ -0.89
TRAPPC1-202ENST00000540486 SCP2P22307 547 aa9.51□□□□□ -0.89
TRAPPC1-202ENST00000540486 CDC25CP30307 473 aa9.51□□□□□ -0.89
TRAPPC1-202ENST00000540486 TNFSF9P41273 254 aa9.51□□□□□ -0.89
TRAPPC1-202ENST00000540486 LIG4P49917 911 aa9.51□□□□□ -0.89
TRAPPC1-202ENST00000540486 DPYDQ12882 1025 aa9.51□□□□□ -0.89
TRAPPC1-202ENST00000540486 MAP7D1Q3KQU3 841 aa9.51□□□□□ -0.89
TRAPPC1-202ENST00000540486 TAF1BQ53T94 588 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
TRAPPC1-202ENST00000540486 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
TRAPPC1-202ENST00000540486 SLC36A4Q6YBV0 504 aa9.51□□□□□ -0.89
TRAPPC1-202ENST00000540486 EPM2AIP1Q7L775 607 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
TRAPPC1-202ENST00000540486 CPA6Q8N4T0 437 aa9.51□□□□□ -0.89
TRAPPC1-202ENST00000540486 ZSWIM2Q8NEG5 633 aa9.51□□□□□ -0.89
TRAPPC1-202ENST00000540486 OR2I1PQ8NGU4 316 aa9.51□□□□□ -0.89
TRAPPC1-202ENST00000540486 ZNF507Q8TCN5 953 aa9.51□□□□□ -0.89
TRAPPC1-202ENST00000540486 HVCN1Q96D96 273 aa9.51□□□□□ -0.89
TRAPPC1-202ENST00000540486 ACAP3Q96P50 834 aa9.51□□□□□ -0.89
TRAPPC1-202ENST00000540486 CDC6Q99741 560 aa9.51□□□□□ -0.89
TRAPPC1-202ENST00000540486 SLC46A2Q9BY10 475 aa9.51□□□□□ -0.89
TRAPPC1-202ENST00000540486 ZDHHC5Q9C0B5 715 aa9.51□□□□□ -0.89
TRAPPC1-202ENST00000540486 ECT2Q9H8V3 914 aa9.51□□□□□ -0.89
TRAPPC1-202ENST00000540486 KIF9Q9HAQ2 790 aa9.51□□□□□ -0.89
TRAPPC1-202ENST00000540486 SLC38A7Q9NVC3 462 aa9.51□□□□□ -0.89
TRAPPC1-202ENST00000540486 NUB1Q9Y5A7 615 aa9.51□□□□□ -0.89
TRAPPC1-202ENST00000540486 TRIP11Q15643 1979 aa9.5□□□□□ -0.89
TRAPPC1-202ENST00000540486 KNTC1P50748 2209 aa9.5□□□□□ -0.89
TRAPPC1-202ENST00000540486 SMIM28A0A1B0GU29 152 aa9.5□□□□□ -0.89
TRAPPC1-202ENST00000540486 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa9.5□□□□□ -0.89
TRAPPC1-202ENST00000540486 PODXLO00592 558 aa9.5□□□□□ -0.89
TRAPPC1-202ENST00000540486 HNRNPDLO14979 420 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
TRAPPC1-202ENST00000540486 ADRB2P07550 413 aa9.5□□□□□ -0.89
TRAPPC1-202ENST00000540486 ARSAP15289 507 aa9.5□□□□□ -0.89
TRAPPC1-202ENST00000540486 RPL9P32969 192 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
TRAPPC1-202ENST00000540486 ABCD1P33897 745 aa9.5□□□□□ -0.89
TRAPPC1-202ENST00000540486 AVPR1AP37288 418 aa9.5□□□□□ -0.89
TRAPPC1-202ENST00000540486 MRPS21P82921 87 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
TRAPPC1-202ENST00000540486 ZNF33AQ06730 810 aa9.5□□□□□ -0.89
TRAPPC1-202ENST00000540486 SOX4Q06945 474 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
TRAPPC1-202ENST00000540486 BFSP1Q12934 665 aa9.5□□□□□ -0.89
TRAPPC1-202ENST00000540486 STK4Q13043 487 aa9.5□□□□□ -0.89
TRAPPC1-202ENST00000540486 DUSP4Q13115 394 aa9.5□□□□□ -0.89
TRAPPC1-202ENST00000540486 NR1H3Q13133 447 aa9.5□□□□□ -0.89
TRAPPC1-202ENST00000540486 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP9.5□□□□□ -0.89
TRAPPC1-202ENST00000540486 TUSC1Q2TAM9 212 aa9.5□□□□□ -0.89
TRAPPC1-202ENST00000540486 HSF5Q4G112 596 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
TRAPPC1-202ENST00000540486 C2orf27AQ580R0 203 aa9.5□□□□□ -0.89
TRAPPC1-202ENST00000540486 GLRA4Q5JXX5 417 aa9.5□□□□□ -0.89
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TRAPPC1-202ENST00000540486 BRICD5Q6PL45 260 aa9.5□□□□□ -0.89
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TRAPPC1-202ENST00000540486 SCFD1Q8WVM8 642 aa9.5□□□□□ -0.89
TRAPPC1-202ENST00000540486 BAP1Q92560 729 aa9.5□□□□□ -0.89
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TRAPPC1-202ENST00000540486 SUSD3Q96L08 255 aa9.5□□□□□ -0.89
TRAPPC1-202ENST00000540486 GCNAQ96QF7 691 aa9.5□□□□□ -0.89
TRAPPC1-202ENST00000540486 ACCSQ96QU6 501 aa9.5□□□□□ -0.89
TRAPPC1-202ENST00000540486 CCDC94Q9BW85 323 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
TRAPPC1-202ENST00000540486 FAM124BQ9H5Z6 455 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
TRAPPC1-202ENST00000540486 GOLGA2P5Q9HBQ8 144 aa9.5□□□□□ -0.89
TRAPPC1-202ENST00000540486 SLC39A2Q9NP94 309 aa9.5□□□□□ -0.89
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TRAPPC1-202ENST00000540486 CPSF3Q9UKF6 684 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
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TRAPPC1-202ENST00000540486 OGTO15294 1046 aa9.49□□□□□ -0.89
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TRAPPC1-202ENST00000540486 CLTAP09496 248 aa9.49□□□□□ -0.89
TRAPPC1-202ENST00000540486 ZNF883P0CG24 379 aa9.49□□□□□ -0.89
TRAPPC1-202ENST00000540486 C6P13671 934 aa9.49□□□□□ -0.89
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TRAPPC1-202ENST00000540486 DDX6P26196 483 aaKnown RBP eCLIP9.49□□□□□ -0.89
TRAPPC1-202ENST00000540486 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP9.49□□□□□ -0.89
TRAPPC1-202ENST00000540486 ACOT2P49753 483 aa9.49□□□□□ -0.89
TRAPPC1-202ENST00000540486 RHDQ02161 417 aa9.49□□□□□ -0.89
TRAPPC1-202ENST00000540486 RPL6Q02878 288 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
TRAPPC1-202ENST00000540486 FAM160A1Q05DH4 1040 aa9.49□□□□□ -0.89
TRAPPC1-202ENST00000540486 SPAG1Q07617 926 aa9.49□□□□□ -0.89
TRAPPC1-202ENST00000540486 GPR17Q13304 367 aa9.49□□□□□ -0.89
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