RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000522045.5

SGCE-211, Transcript of sarcoglycan epsilon, humanhuman

TSL 3

Gene SGCE, Length 408 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCE-211ENST00000522045 DPH1Q9BZG8 443 aa5.96□□□□□ -1.46
SGCE-211ENST00000522045 SNX15Q9NRS6 342 aa5.96□□□□□ -1.46
SGCE-211ENST00000522045 DRG1Q9Y295 367 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
SGCE-211ENST00000522045 SMARCA4P51532 1647 aa5.96□□□□□ -1.46
SGCE-211ENST00000522045 FAM90A10PA6NDY2 464 aa5.95□□□□□ -1.46
SGCE-211ENST00000522045 AP1G1O43747 822 aa5.95□□□□□ -1.46
SGCE-211ENST00000522045 NCLP19338 710 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
SGCE-211ENST00000522045 PRKAR1BP31321 381 aa5.95□□□□□ -1.46
SGCE-211ENST00000522045 MTHFSP49914 203 aa5.95□□□□□ -1.46
SGCE-211ENST00000522045 BCAT1P54687 386 aa5.95□□□□□ -1.46
SGCE-211ENST00000522045 LINC00205P59089 165 aa5.95□□□□□ -1.46
SGCE-211ENST00000522045 SLC13A2Q13183 592 aa5.95□□□□□ -1.46
SGCE-211ENST00000522045 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
SGCE-211ENST00000522045 TMEM65Q6PI78 240 aa5.95□□□□□ -1.46
SGCE-211ENST00000522045 CAMSAP3Q9P1Y5 1249 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
SGCE-211ENST00000522045 USP22Q9UPT9 525 aa5.95□□□□□ -1.46
SGCE-211ENST00000522045 PAXBP1Q9Y5B6 917 aa5.95□□□□□ -1.46
SGCE-211ENST00000522045 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa5.95□□□□□ -1.46
SGCE-211ENST00000522045 SMARCA2P51531 1590 aa5.94□□□□□ -1.46
SGCE-211ENST00000522045 EEA1Q15075 1411 aa5.94□□□□□ -1.46
SGCE-211ENST00000522045 TBC1D4O60343 1298 aa5.94□□□□□ -1.46
SGCE-211ENST00000522045 UBXN7O94888 489 aa5.94□□□□□ -1.46
SGCE-211ENST00000522045 ABLIM3O94929 683 aa5.94□□□□□ -1.46
SGCE-211ENST00000522045 HOXD9P28356 352 aaPredicted RBP5.94□□□□□ -1.46
SGCE-211ENST00000522045 EPHA3P29320 983 aa5.94□□□□□ -1.46
SGCE-211ENST00000522045 CCKARP32238 428 aa5.94□□□□□ -1.46
SGCE-211ENST00000522045 COPB1P53618 953 aaKnown RBP5.94□□□□□ -1.46
SGCE-211ENST00000522045 ZNF91Q05481 1191 aa5.94□□□□□ -1.46
SGCE-211ENST00000522045 LARS2Q15031 903 aaKnown RBP5.94□□□□□ -1.46
SGCE-211ENST00000522045 PTCHD3Q3KNS1 767 aa5.94□□□□□ -1.46
SGCE-211ENST00000522045 ANO7Q6IWH7 933 aa5.94□□□□□ -1.46
SGCE-211ENST00000522045 MAP4K1Q92918 833 aa5.94□□□□□ -1.46
SGCE-211ENST00000522045 SIGLEC11Q96RL6 698 aa5.94□□□□□ -1.46
SGCE-211ENST00000522045 FOXP1Q9H334 677 aaPredicted RBP5.94□□□□□ -1.46
SGCE-211ENST00000522045 NMRK2Q9NPI5 230 aa5.94□□□□□ -1.46
SGCE-211ENST00000522045 GABBR1Q9UBS5 961 aa5.94□□□□□ -1.46
SGCE-211ENST00000522045 PNMA8BQ9ULN7 279 aaPredicted RBP5.94□□□□□ -1.46
SGCE-211ENST00000522045 IGKV2D-30A0A075B6S6 120 aa5.93□□□□□ -1.46
SGCE-211ENST00000522045 OAZ2O95190 189 aa5.93□□□□□ -1.46
SGCE-211ENST00000522045 HSPA6P17066 643 aa5.93□□□□□ -1.46
SGCE-211ENST00000522045 DIO1P49895 249 aa5.93□□□□□ -1.46
SGCE-211ENST00000522045 NT5C1BQ96P26 610 aa5.93□□□□□ -1.46
SGCE-211ENST00000522045 VN1R3Q9BXE9 311 aa5.93□□□□□ -1.46
SGCE-211ENST00000522045 LPAR3Q9UBY5 353 aa5.93□□□□□ -1.46
SGCE-211ENST00000522045 ZMYM2Q9UBW7 1377 aa5.93□□□□□ -1.46
SGCE-211ENST00000522045 TTC3P53804 2025 aa5.92□□□□□ -1.46
SGCE-211ENST00000522045 TMEM233B4DJY2 109 aa5.92□□□□□ -1.46
SGCE-211ENST00000522045 PHGDHO43175 533 aaKnown RBP5.92□□□□□ -1.46
SGCE-211ENST00000522045 SRGAP2O75044 1071 aa5.92□□□□□ -1.46
SGCE-211ENST00000522045 KITP10721 976 aa5.92□□□□□ -1.46
SGCE-211ENST00000522045 APEHP13798 732 aaKnown RBP5.92□□□□□ -1.46
SGCE-211ENST00000522045 ID2Q02363 134 aa5.92□□□□□ -1.46
SGCE-211ENST00000522045 MIDNQ504T8 468 aa5.92□□□□□ -1.46
SGCE-211ENST00000522045 AWAT1Q58HT5 328 aa5.92□□□□□ -1.46
SGCE-211ENST00000522045 DCDC5Q6ZRR9 648 aa5.92□□□□□ -1.46
SGCE-211ENST00000522045 LINC01465Q8N7H1 131 aa5.92□□□□□ -1.46
SGCE-211ENST00000522045 DNAJB14Q8TBM8 379 aa5.92□□□□□ -1.46
SGCE-211ENST00000522045 HS6ST2Q96MM7 605 aa5.92□□□□□ -1.46
SGCE-211ENST00000522045 AIFM3Q96NN9 605 aa5.92□□□□□ -1.46
SGCE-211ENST00000522045 PPP1R9BQ96SB3 815 aa5.92□□□□□ -1.46
SGCE-211ENST00000522045 ZMAT3Q9HA38 289 aaKnown RBP5.92□□□□□ -1.46
SGCE-211ENST00000522045 MAFFQ9ULX9 164 aa5.92□□□□□ -1.46
SGCE-211ENST00000522045 CDY1Q9Y6F8 540 aa5.92□□□□□ -1.46
SGCE-211ENST00000522045 TMPRSS11DO60235 418 aa5.91□□□□□ -1.46
SGCE-211ENST00000522045 CREB1P16220 341 aa5.91□□□□□ -1.46
SGCE-211ENST00000522045 SRSF1Q07955 248 aaKnown RBP eCLIP5.91□□□□□ -1.46
SGCE-211ENST00000522045 INSCQ1MX18 579 aa5.91□□□□□ -1.46
SGCE-211ENST00000522045 TMTC4Q5T4D3 741 aa5.91□□□□□ -1.46
SGCE-211ENST00000522045 DCAF12L1Q5VU92 463 aa5.91□□□□□ -1.46
SGCE-211ENST00000522045 VSTM1Q6UX27 236 aa5.91□□□□□ -1.46
SGCE-211ENST00000522045 DEF8Q6ZN54 512 aa5.91□□□□□ -1.46
SGCE-211ENST00000522045 LIX1LQ8IVB5 337 aa5.91□□□□□ -1.46
SGCE-211ENST00000522045 MAFAQ8NHW3 353 aaPredicted RBP5.91□□□□□ -1.46
SGCE-211ENST00000522045 TRIM5Q9C035 493 aa5.91□□□□□ -1.46
SGCE-211ENST00000522045 ZNF518BQ9C0D4 1074 aa5.91□□□□□ -1.46
SGCE-211ENST00000522045 SMURF2Q9HAU4 748 aa5.91□□□□□ -1.46
SGCE-211ENST00000522045 XPNPEP3Q9NQH7 507 aa5.91□□□□□ -1.46
SGCE-211ENST00000522045 POT1Q9NUX5 634 aa5.91□□□□□ -1.46
SGCE-211ENST00000522045 PEG3Q9GZU2 1588 aa5.91□□□□□ -1.46
SGCE-211ENST00000522045 MARCH6O60337 910 aa5.9□□□□□ -1.46
SGCE-211ENST00000522045 TLR2O60603 784 aa5.9□□□□□ -1.46
SGCE-211ENST00000522045 RASAL1O95294 804 aa5.9□□□□□ -1.46
SGCE-211ENST00000522045 EN2P19622 333 aaPredicted RBP5.9□□□□□ -1.46
SGCE-211ENST00000522045 UQCRC1P31930 480 aa5.9□□□□□ -1.46
SGCE-211ENST00000522045 KCNB1Q14721 858 aa5.9□□□□□ -1.46
SGCE-211ENST00000522045 CACHD1Q5VU97 1274 aa5.9□□□□□ -1.46
SGCE-211ENST00000522045 RANBP10Q6VN20 620 aa5.9□□□□□ -1.46
SGCE-211ENST00000522045 PIP4P1Q86T03 277 aa5.9□□□□□ -1.46
SGCE-211ENST00000522045 ADAMTS15Q8TE58 950 aa5.9□□□□□ -1.46
SGCE-211ENST00000522045 SPSB4Q96A44 273 aa5.9□□□□□ -1.46
SGCE-211ENST00000522045 CTHRC1Q96CG8 243 aa5.9□□□□□ -1.46
SGCE-211ENST00000522045 MARK4Q96L34 752 aa5.9□□□□□ -1.46
SGCE-211ENST00000522045 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa5.9□□□□□ -1.46
SGCE-211ENST00000522045 RHOBTB2Q9BYZ6 727 aa5.9□□□□□ -1.46
SGCE-211ENST00000522045 TRIM36Q9NQ86 728 aa5.9□□□□□ -1.46
SGCE-211ENST00000522045 A1CFQ9NQ94 594 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.46
SGCE-211ENST00000522045 TMEM184CQ9NVA4 438 aa5.9□□□□□ -1.46
SGCE-211ENST00000522045 MGAT4CQ9UBM8 478 aa5.9□□□□□ -1.46
SGCE-211ENST00000522045 CCDC88BA6NC98 1476 aa5.9□□□□□ -1.47
SGCE-211ENST00000522045 E2F8A0AVK6 867 aa5.89□□□□□ -1.47
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