RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514231.1

PDE4D-221, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 3

Gene PDE4D, Length 733 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-221ENST00000514231 GFOD2Q3B7J2 385 aa6.31□□□□□ -1.4
PDE4D-221ENST00000514231 TMEM63BQ5T3F8 832 aa6.31□□□□□ -1.4
PDE4D-221ENST00000514231 MORN5Q5VZ52 161 aa6.31□□□□□ -1.4
PDE4D-221ENST00000514231 C11orf87Q6NUJ2 197 aa6.31□□□□□ -1.4
PDE4D-221ENST00000514231 CCDC149Q6ZUS6 474 aa6.31□□□□□ -1.4
PDE4D-221ENST00000514231 GALNT16Q8N428 558 aa6.31□□□□□ -1.4
PDE4D-221ENST00000514231 ADAMTS18Q8TE60 1221 aa6.31□□□□□ -1.4
PDE4D-221ENST00000514231 CTHRC1Q96CG8 243 aa6.31□□□□□ -1.4
PDE4D-221ENST00000514231 VN1R3Q9BXE9 311 aa6.31□□□□□ -1.4
PDE4D-221ENST00000514231 TRIM36Q9NQ86 728 aa6.31□□□□□ -1.4
PDE4D-221ENST00000514231 OGDHLQ9ULD0 1010 aa6.31□□□□□ -1.4
PDE4D-221ENST00000514231 G3BP2Q9UN86 482 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
PDE4D-221ENST00000514231 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa6.3□□□□□ -1.4
PDE4D-221ENST00000514231 BTBD19C9JJ37 291 aa6.3□□□□□ -1.4
PDE4D-221ENST00000514231 H7C4K7 107 aa6.3□□□□□ -1.4
PDE4D-221ENST00000514231 TPP1O14773 563 aa6.3□□□□□ -1.4
PDE4D-221ENST00000514231 MGEA5O60502 916 aa6.3□□□□□ -1.4
PDE4D-221ENST00000514231 SRGAP2O75044 1071 aa6.3□□□□□ -1.4
PDE4D-221ENST00000514231 FPR3P25089 353 aa6.3□□□□□ -1.4
PDE4D-221ENST00000514231 PTDSS1P48651 473 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
PDE4D-221ENST00000514231 RENBPP51606 427 aa6.3□□□□□ -1.4
PDE4D-221ENST00000514231 FAM193AP78312 1265 aa6.3□□□□□ -1.4
PDE4D-221ENST00000514231 TIAL1Q01085 375 aaKnown RBP eCLIP6.3□□□□□ -1.4
PDE4D-221ENST00000514231 SLC29A2Q14542 456 aa6.3□□□□□ -1.4
PDE4D-221ENST00000514231 KIAA0753Q2KHM9 967 aa6.3□□□□□ -1.4
PDE4D-221ENST00000514231 ZNF750Q32MQ0 723 aa6.3□□□□□ -1.4
PDE4D-221ENST00000514231 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
PDE4D-221ENST00000514231 C4orf46Q504U0 113 aa6.3□□□□□ -1.4
PDE4D-221ENST00000514231 CACHD1Q5VU97 1274 aa6.3□□□□□ -1.4
PDE4D-221ENST00000514231 SERPINA13PQ6UXR4 307 aa6.3□□□□□ -1.4
PDE4D-221ENST00000514231 DPY19L3Q6ZPD9 716 aa6.3□□□□□ -1.4
PDE4D-221ENST00000514231 PTCHD4Q6ZW05 846 aa6.3□□□□□ -1.4
PDE4D-221ENST00000514231 BCDIN3DQ7Z5W3 292 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
PDE4D-221ENST00000514231 KCTD20Q7Z5Y7 419 aa6.3□□□□□ -1.4
PDE4D-221ENST00000514231 C5orf34Q96MH7 638 aa6.3□□□□□ -1.4
PDE4D-221ENST00000514231 FYTTD1Q96QD9 318 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
PDE4D-221ENST00000514231 SH2D3AQ9BRG2 576 aa6.3□□□□□ -1.4
PDE4D-221ENST00000514231 STK31Q9BXU1 1019 aa6.3□□□□□ -1.4
PDE4D-221ENST00000514231 ZNF287Q9HBT7 754 aa6.3□□□□□ -1.4
PDE4D-221ENST00000514231 VSTM5A8MXK1 200 aa6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-221ENST00000514231 CES2O00748 559 aa6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-221ENST00000514231 RRP9O43818 475 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-221ENST00000514231 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-221ENST00000514231 TXNP10599 105 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-221ENST00000514231 PHKG2P15735 406 aa6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-221ENST00000514231 RPL17P18621 184 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-221ENST00000514231 ALDH5A1P51649 535 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-221ENST00000514231 RPS16P62249 146 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-221ENST00000514231 PSG6Q00889 435 aa6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-221ENST00000514231 GRM3Q14832 879 aa6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-221ENST00000514231 DAZAP2Q15038 168 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-221ENST00000514231 DENND2CQ68D51 928 aa6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-221ENST00000514231 RPL36ALQ969Q0 106 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-221ENST00000514231 MSLNLQ96KJ4 702 aa6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-221ENST00000514231 CCDC17Q96LX7 622 aa6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-221ENST00000514231 CHST8Q9H2A9 424 aa6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-221ENST00000514231 FAM83DQ9H4H8 585 aa6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-221ENST00000514231 HDAC9Q9UKV0 1011 aa6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-221ENST00000514231 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
PDE4D-221ENST00000514231 WDR17Q8IZU2 1322 aa6.28□□□□□ -1.4
PDE4D-221ENST00000514231 INMTO95050 263 aa6.28□□□□□ -1.4
PDE4D-221ENST00000514231 MT-CO3P00414 261 aa6.28□□□□□ -1.4
PDE4D-221ENST00000514231 CYP2A6P11509 494 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
PDE4D-221ENST00000514231 BTF3P20290 206 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
PDE4D-221ENST00000514231 CPT1AP50416 773 aa6.28□□□□□ -1.4
PDE4D-221ENST00000514231 GATMP50440 423 aa6.28□□□□□ -1.4
PDE4D-221ENST00000514231 FAM187BQ17R55 369 aa6.28□□□□□ -1.4
PDE4D-221ENST00000514231 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa6.28□□□□□ -1.4
PDE4D-221ENST00000514231 SESTD1Q86VW0 696 aa6.28□□□□□ -1.4
PDE4D-221ENST00000514231 YAF2Q8IY57 180 aa6.28□□□□□ -1.4
PDE4D-221ENST00000514231 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
PDE4D-221ENST00000514231 IPCEF1Q8WWN9 437 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
PDE4D-221ENST00000514231 ZBTB45Q96K62 511 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
PDE4D-221ENST00000514231 PRSS22Q9GZN4 317 aa6.28□□□□□ -1.4
PDE4D-221ENST00000514231 ASIC5Q9NY37 505 aa6.28□□□□□ -1.4
PDE4D-221ENST00000514231 DKK4Q9UBT3 224 aa6.28□□□□□ -1.4
PDE4D-221ENST00000514231 SMIM35A0A1B0GVV1 85 aa6.27□□□□□ -1.41
PDE4D-221ENST00000514231 AQP7P3A6NL99 342 aa6.27□□□□□ -1.41
PDE4D-221ENST00000514231 PIAS2O75928 621 aa6.27□□□□□ -1.41
PDE4D-221ENST00000514231 USP1O94782 785 aa6.27□□□□□ -1.41
PDE4D-221ENST00000514231 ACVR2AP27037 513 aa6.27□□□□□ -1.41
PDE4D-221ENST00000514231 MTHFSP49914 203 aa6.27□□□□□ -1.41
PDE4D-221ENST00000514231 PPP4R4Q6NUP7 873 aa6.27□□□□□ -1.41
PDE4D-221ENST00000514231 ZNF813Q6ZN06 617 aa6.27□□□□□ -1.41
PDE4D-221ENST00000514231 TTC8Q8TAM2 541 aa6.27□□□□□ -1.41
PDE4D-221ENST00000514231 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
PDE4D-221ENST00000514231 ZNF668Q96K58 619 aaPredicted RBP6.27□□□□□ -1.41
PDE4D-221ENST00000514231 MMS19Q96T76 1030 aa6.27□□□□□ -1.41
PDE4D-221ENST00000514231 PRDM11Q9NQV5 511 aa6.27□□□□□ -1.41
PDE4D-221ENST00000514231 SNX15Q9NRS6 342 aa6.27□□□□□ -1.41
PDE4D-221ENST00000514231 GAR1Q9NY12 217 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
PDE4D-221ENST00000514231 OBP2AQ9NY56 170 aa6.27□□□□□ -1.41
PDE4D-221ENST00000514231 MGAT4CQ9UBM8 478 aa6.27□□□□□ -1.41
PDE4D-221ENST00000514231 CAPN11Q9UMQ6 739 aa6.27□□□□□ -1.41
PDE4D-221ENST00000514231 RAB27BO00194 218 aa6.26□□□□□ -1.41
PDE4D-221ENST00000514231 SPRY2O43597 315 aa6.26□□□□□ -1.41
PDE4D-221ENST00000514231 IL1R1P14778 569 aa6.26□□□□□ -1.41
PDE4D-221ENST00000514231 CD19P15391 556 aa6.26□□□□□ -1.41
PDE4D-221ENST00000514231 CREB1P16220 341 aa6.26□□□□□ -1.41
PDE4D-221ENST00000514231 TPH1P17752 444 aa6.26□□□□□ -1.41
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 62.4 ms