RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511595.5

FAM53C-209, Transcript of family with sequence similarity 53 member C, human

TSL 3

Gene FAM53C, Length 551 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FAM53C-209	ENST00000511595	ZNF813	Q6ZN06	617 aa		4.37	□□□□□ -1.71
FAM53C-209	ENST00000511595	CHST15	Q7LFX5	561 aa	Predicted RBP	4.37	□□□□□ -1.71
FAM53C-209	ENST00000511595	DGKH	Q86XP1	1220 aa		4.37	□□□□□ -1.71
FAM53C-209	ENST00000511595	ZDHHC17	Q8IUH5	632 aa		4.37	□□□□□ -1.71
FAM53C-209	ENST00000511595	MPP5	Q8N3R9	675 aa		4.37	□□□□□ -1.71
FAM53C-209	ENST00000511595	NANOGP1	Q8N7R0	232 aa		4.37	□□□□□ -1.71
FAM53C-209	ENST00000511595	DNAJC5G	Q8N7S2	189 aa		4.37	□□□□□ -1.71
FAM53C-209	ENST00000511595	PRSS3P2	Q8NHM4	247 aa		4.37	□□□□□ -1.71
FAM53C-209	ENST00000511595	ZNF398	Q8TD17	642 aa		4.37	□□□□□ -1.71
FAM53C-209	ENST00000511595	LRTOMT	Q8WZ04	291 aa		4.37	□□□□□ -1.71
FAM53C-209	ENST00000511595	TIFA	Q96CG3	184 aa		4.37	□□□□□ -1.71
FAM53C-209	ENST00000511595	SUCLG2	Q96I99	432 aa		4.37	□□□□□ -1.71
FAM53C-209	ENST00000511595	C8orf48	Q96LL4	319 aa		4.37	□□□□□ -1.71
FAM53C-209	ENST00000511595	MESP1	Q9BRJ9	268 aa		4.37	□□□□□ -1.71
FAM53C-209	ENST00000511595	C22orf23	Q9BZE7	217 aa		4.37	□□□□□ -1.71
FAM53C-209	ENST00000511595	TRNAU1AP	Q9NX07	287 aa	Known RBP	4.37	□□□□□ -1.71
FAM53C-209	ENST00000511595	ASIC5	Q9NY37	505 aa		4.37	□□□□□ -1.71
FAM53C-209	ENST00000511595	SHOC2	Q9UQ13	582 aa		4.37	□□□□□ -1.71
FAM53C-209	ENST00000511595	FER1L4	A9Z1Z3	1794 aa		4.36	□□□□□ -1.71
FAM53C-209	ENST00000511595	LY6G6E	A0A0G2JKS1	128 aa		4.36	□□□□□ -1.71
FAM53C-209	ENST00000511595	GOLIM4	O00461	696 aa		4.36	□□□□□ -1.71
FAM53C-209	ENST00000511595	SOCS2	O14508	198 aa		4.36	□□□□□ -1.71
FAM53C-209	ENST00000511595	TBX3	O15119	743 aa		4.36	□□□□□ -1.71
FAM53C-209	ENST00000511595	MAP4K4	O95819	1239 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
FAM53C-209	ENST00000511595	HRG	P04196	525 aa		4.36	□□□□□ -1.71
FAM53C-209	ENST00000511595	DLD	P09622	509 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
FAM53C-209	ENST00000511595	RHCE	P18577	417 aa		4.36	□□□□□ -1.71
FAM53C-209	ENST00000511595	EN2	P19622	333 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
FAM53C-209	ENST00000511595	ADORA2A	P29274	412 aa		4.36	□□□□□ -1.71
FAM53C-209	ENST00000511595	LRPAP1	P30533	357 aa		4.36	□□□□□ -1.71
FAM53C-209	ENST00000511595	SLC11A2	P49281	568 aa		4.36	□□□□□ -1.71
FAM53C-209	ENST00000511595	PDE6C	P51160	858 aa		4.36	□□□□□ -1.71
FAM53C-209	ENST00000511595	ARFIP2	P53365	341 aa		4.36	□□□□□ -1.71
FAM53C-209	ENST00000511595	SUMO3	P55854	103 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
FAM53C-209	ENST00000511595	RHD	Q02161	417 aa		4.36	□□□□□ -1.71
FAM53C-209	ENST00000511595	SLC13A2	Q13183	592 aa		4.36	□□□□□ -1.71
FAM53C-209	ENST00000511595	RAB32	Q13637	225 aa		4.36	□□□□□ -1.71
FAM53C-209	ENST00000511595	DEPDC1	Q5TB30	811 aa		4.36	□□□□□ -1.71
FAM53C-209	ENST00000511595	ABRA	Q8N0Z2	381 aa		4.36	□□□□□ -1.71
FAM53C-209	ENST00000511595	SLC15A4	Q8N697	577 aa		4.36	□□□□□ -1.71
FAM53C-209	ENST00000511595	C16orf52	Q8NHV5	167 aa		4.36	□□□□□ -1.71
FAM53C-209	ENST00000511595	VCPIP1	Q96JH7	1222 aa		4.36	□□□□□ -1.71
FAM53C-209	ENST00000511595	ADGRE3	Q9BY15	652 aa		4.36	□□□□□ -1.71
FAM53C-209	ENST00000511595	CIPC	Q9C0C6	399 aa		4.36	□□□□□ -1.71
FAM53C-209	ENST00000511595	LRRC27	Q9C0I9	530 aa		4.36	□□□□□ -1.71
FAM53C-209	ENST00000511595	EBF3	Q9H4W6	596 aa		4.36	□□□□□ -1.71
FAM53C-209	ENST00000511595	SACM1L	Q9NTJ5	587 aa		4.36	□□□□□ -1.71
FAM53C-209	ENST00000511595	CCNL1	Q9UK58	526 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
FAM53C-209	ENST00000511595	OGDHL	Q9ULD0	1010 aa		4.36	□□□□□ -1.71
FAM53C-209	ENST00000511595	USP19	O94966	1318 aa		4.36	□□□□□ -1.71
FAM53C-209	ENST00000511595	KIF3B	O15066	747 aa		4.35	□□□□□ -1.71
FAM53C-209	ENST00000511595	FRS3	O43559	492 aa		4.35	□□□□□ -1.71
FAM53C-209	ENST00000511595	USP1	O94782	785 aa		4.35	□□□□□ -1.71
FAM53C-209	ENST00000511595	VNN1	O95497	513 aa		4.35	□□□□□ -1.71
FAM53C-209	ENST00000511595	FGB	P02675	491 aa		4.35	□□□□□ -1.71
FAM53C-209	ENST00000511595	PRKCB	P05771	671 aa		4.35	□□□□□ -1.71
FAM53C-209	ENST00000511595	SNHG28	P0DPA3	235 aa		4.35	□□□□□ -1.71
FAM53C-209	ENST00000511595	CYP2C9	P11712	490 aa		4.35	□□□□□ -1.71
FAM53C-209	ENST00000511595	XRCC6	P12956	609 aa	Known RBP eCLIP	4.35	□□□□□ -1.71
FAM53C-209	ENST00000511595	ZKSCAN1	P17029	563 aa	Predicted RBP	4.35	□□□□□ -1.71
FAM53C-209	ENST00000511595	PEX2	P28328	305 aa		4.35	□□□□□ -1.71
FAM53C-209	ENST00000511595	PLCD1	P51178	756 aa		4.35	□□□□□ -1.71
FAM53C-209	ENST00000511595	ALDH5A1	P51649	535 aa	Predicted RBP	4.35	□□□□□ -1.71
FAM53C-209	ENST00000511595	DGKE	P52429	567 aa		4.35	□□□□□ -1.71
FAM53C-209	ENST00000511595	HTRA4	P83105	476 aa	Predicted RBP	4.35	□□□□□ -1.71
FAM53C-209	ENST00000511595	CTBP1	Q13363	440 aa		4.35	□□□□□ -1.71
FAM53C-209	ENST00000511595	POLD3	Q15054	466 aa	Predicted RBP	4.35	□□□□□ -1.71
FAM53C-209	ENST00000511595	GPR162	Q16538	588 aa		4.35	□□□□□ -1.71
FAM53C-209	ENST00000511595	CERKL	Q49MI3	558 aa	Predicted RBP	4.35	□□□□□ -1.71
FAM53C-209	ENST00000511595	KRTAP5-11	Q6L8G4	156 aa		4.35	□□□□□ -1.71
FAM53C-209	ENST00000511595	KRTAP5-6	Q6L8G9	129 aa	Predicted RBP	4.35	□□□□□ -1.71
FAM53C-209	ENST00000511595	BCDIN3D	Q7Z5W3	292 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
FAM53C-209	ENST00000511595	MRPL10	Q7Z7H8	261 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
FAM53C-209	ENST00000511595	CAND1	Q86VP6	1230 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
FAM53C-209	ENST00000511595	SLC15A3	Q8IY34	581 aa		4.35	□□□□□ -1.71
FAM53C-209	ENST00000511595	OSCP1	Q8WVF1	389 aa		4.35	□□□□□ -1.71
FAM53C-209	ENST00000511595	TTC17	Q96AE7	1141 aa		4.35	□□□□□ -1.71
FAM53C-209	ENST00000511595	FAM118B	Q9BPY3	351 aa		4.35	□□□□□ -1.71
FAM53C-209	ENST00000511595	MS4A7	Q9GZW8	240 aa	Predicted RBP	4.35	□□□□□ -1.71
FAM53C-209	ENST00000511595	CPNE7	Q9UBL6	633 aa		4.35	□□□□□ -1.71
FAM53C-209	ENST00000511595	LRP12	Q9Y561	859 aa		4.35	□□□□□ -1.71
FAM53C-209	ENST00000511595	PCDHGB6	Q9Y5F9	930 aa		4.35	□□□□□ -1.71
FAM53C-209	ENST00000511595	SNX14	Q9Y5W7	946 aa		4.35	□□□□□ -1.71
FAM53C-209	ENST00000511595		A0A087WWL8	130 aa		4.34	□□□□□ -1.71
FAM53C-209	ENST00000511595	ISM1	B1AKI9	464 aa		4.34	□□□□□ -1.71
FAM53C-209	ENST00000511595	UBE2Q2L	H0YL09	131 aa		4.34	□□□□□ -1.71
FAM53C-209	ENST00000511595		H3BNC9	293 aa		4.34	□□□□□ -1.71
FAM53C-209	ENST00000511595	AP4M1	O00189	453 aa		4.34	□□□□□ -1.71
FAM53C-209	ENST00000511595	A1BG	P04217	495 aa		4.34	□□□□□ -1.71
FAM53C-209	ENST00000511595	KCNA3	P22001	575 aa		4.34	□□□□□ -1.71
FAM53C-209	ENST00000511595	TKT	P29401	623 aa	Known RBP	4.34	□□□□□ -1.71
FAM53C-209	ENST00000511595	PSG6	Q00889	435 aa		4.34	□□□□□ -1.71
FAM53C-209	ENST00000511595	E2F1	Q01094	437 aa		4.34	□□□□□ -1.71
FAM53C-209	ENST00000511595	KRT17	Q04695	432 aa		4.34	□□□□□ -1.71
FAM53C-209	ENST00000511595	GALE	Q14376	348 aa		4.34	□□□□□ -1.71
FAM53C-209	ENST00000511595	TWIST1	Q15672	202 aa		4.34	□□□□□ -1.71
FAM53C-209	ENST00000511595	CNGA2	Q16280	664 aa		4.34	□□□□□ -1.71
FAM53C-209	ENST00000511595	FAM187B	Q17R55	369 aa		4.34	□□□□□ -1.71
FAM53C-209	ENST00000511595	C10orf25	Q5T742	122 aa		4.34	□□□□□ -1.71
FAM53C-209	ENST00000511595	DPY19L3	Q6ZPD9	716 aa		4.34	□□□□□ -1.71

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