RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496055.5

RABGGTB-213, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 2

Gene RABGGTB, Length 3,863 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-213ENST00000496055 SFI1A8K8P3 1242 aa4.78□□□□□ -1.64
RABGGTB-213ENST00000496055 SGK1O00141 431 aa4.78□□□□□ -1.64
RABGGTB-213ENST00000496055 STK25O00506 426 aa4.78□□□□□ -1.64
RABGGTB-213ENST00000496055 ANP32DO95626 131 aa4.78□□□□□ -1.64
RABGGTB-213ENST00000496055 IGHA2P01877 340 aa4.78□□□□□ -1.64
RABGGTB-213ENST00000496055 ENO2P09104 434 aaPredicted RBP4.78□□□□□ -1.64
RABGGTB-213ENST00000496055 FGRP09769 529 aa4.78□□□□□ -1.64
RABGGTB-213ENST00000496055 THPOP40225 353 aa4.78□□□□□ -1.64
RABGGTB-213ENST00000496055 ADH7P40394 386 aa4.78□□□□□ -1.64
RABGGTB-213ENST00000496055 RPIAP49247 311 aa4.78□□□□□ -1.64
RABGGTB-213ENST00000496055 TMED10P49755 219 aaKnown RBP4.78□□□□□ -1.64
RABGGTB-213ENST00000496055 RABGGTBP53611 331 aa4.78□□□□□ -1.64
RABGGTB-213ENST00000496055 HAND2P61296 217 aa4.78□□□□□ -1.64
RABGGTB-213ENST00000496055 CDC16Q13042 620 aa4.78□□□□□ -1.64
RABGGTB-213ENST00000496055 GEN1Q17RS7 908 aa4.78□□□□□ -1.64
RABGGTB-213ENST00000496055 SLC45A4Q5BKX6 768 aa4.78□□□□□ -1.64
RABGGTB-213ENST00000496055 SPOUT1Q5T280 376 aaKnown RBP4.78□□□□□ -1.64
RABGGTB-213ENST00000496055 RASIP1Q5U651 963 aa4.78□□□□□ -1.64
RABGGTB-213ENST00000496055 FYB2Q5VWT5 728 aa4.78□□□□□ -1.64
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RABGGTB-213ENST00000496055 ZBTB33Q86T24 672 aa4.78□□□□□ -1.64
RABGGTB-213ENST00000496055 FUKQ8N0W3 1084 aa4.78□□□□□ -1.64
RABGGTB-213ENST00000496055 ZNF619Q8N2I2 560 aa4.78□□□□□ -1.64
RABGGTB-213ENST00000496055 FIBCD1Q8N539 461 aa4.78□□□□□ -1.64
RABGGTB-213ENST00000496055 EHBP1Q8NDI1 1231 aa4.78□□□□□ -1.64
RABGGTB-213ENST00000496055 LILRB4Q8NHJ6 448 aa4.78□□□□□ -1.64
RABGGTB-213ENST00000496055 SLC9A6Q92581 669 aa4.78□□□□□ -1.64
RABGGTB-213ENST00000496055 ANKS1AQ92625 1134 aa4.78□□□□□ -1.64
RABGGTB-213ENST00000496055 TMIGD2Q96BF3 282 aa4.78□□□□□ -1.64
RABGGTB-213ENST00000496055 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP4.78□□□□□ -1.64
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RABGGTB-213ENST00000496055 C11orf84Q9BUA3 381 aaPredicted RBP4.78□□□□□ -1.64
RABGGTB-213ENST00000496055 RHBGQ9H310 441 aa4.78□□□□□ -1.64
RABGGTB-213ENST00000496055 DENND2DQ9H6A0 471 aaPredicted RBP4.78□□□□□ -1.64
RABGGTB-213ENST00000496055 TBCCD1Q9NVR7 557 aa4.78□□□□□ -1.64
RABGGTB-213ENST00000496055 PDP2Q9P2J9 529 aa4.78□□□□□ -1.64
RABGGTB-213ENST00000496055 NFKBIL1Q9UBC1 381 aaPredicted RBP4.78□□□□□ -1.64
RABGGTB-213ENST00000496055 GGA2Q9UJY4 613 aa4.78□□□□□ -1.64
RABGGTB-213ENST00000496055 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa4.78□□□□□ -1.64
RABGGTB-213ENST00000496055 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa4.77□□□□□ -1.65
RABGGTB-213ENST00000496055 J3KRW8 73 aa4.77□□□□□ -1.65
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RABGGTB-213ENST00000496055 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP4.77□□□□□ -1.65
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RABGGTB-213ENST00000496055 ADSLP30566 484 aaPredicted RBP4.77□□□□□ -1.65
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RABGGTB-213ENST00000496055 PCP4P48539 62 aa4.77□□□□□ -1.65
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RABGGTB-213ENST00000496055 ENPEPQ07075 957 aa4.77□□□□□ -1.65
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RABGGTB-213ENST00000496055 SGSM1Q2NKQ1 1148 aa4.77□□□□□ -1.65
RABGGTB-213ENST00000496055 STXBP5Q5T5C0 1151 aa4.77□□□□□ -1.65
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RABGGTB-213ENST00000496055 KLC3Q6P597 504 aa4.77□□□□□ -1.65
RABGGTB-213ENST00000496055 CYP4V2Q6ZWL3 525 aaPredicted RBP4.77□□□□□ -1.65
RABGGTB-213ENST00000496055 PLA2G4DQ86XP0 818 aa4.77□□□□□ -1.65
RABGGTB-213ENST00000496055 GLYCTKQ8IVS8 523 aa4.77□□□□□ -1.65
RABGGTB-213ENST00000496055 CBARPQ8N350 705 aaPredicted RBP4.77□□□□□ -1.65
RABGGTB-213ENST00000496055 LRRN4CLQ8ND94 238 aa4.77□□□□□ -1.65
RABGGTB-213ENST00000496055 OR6P1Q8NGX9 317 aa4.77□□□□□ -1.65
RABGGTB-213ENST00000496055 TNFRSF25Q93038 417 aa4.77□□□□□ -1.65
RABGGTB-213ENST00000496055 COL26A1Q96A83 441 aa4.77□□□□□ -1.65
RABGGTB-213ENST00000496055 TBATAQ96M53 351 aa4.77□□□□□ -1.65
RABGGTB-213ENST00000496055 NAA15Q9BXJ9 866 aaKnown RBP4.77□□□□□ -1.65
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RABGGTB-213ENST00000496055 PDGFCQ9NRA1 345 aa4.77□□□□□ -1.65
RABGGTB-213ENST00000496055 CTNNAL1Q9UBT7 734 aa4.77□□□□□ -1.65
RABGGTB-213ENST00000496055 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP4.77□□□□□ -1.65
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RABGGTB-213ENST00000496055 MACROD2A1Z1Q3 448 aa4.77□□□□□ -1.65
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RABGGTB-213ENST00000496055 E7EVH7 732 aa4.77□□□□□ -1.65
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RABGGTB-213ENST00000496055 RAD51BO15315 384 aa4.77□□□□□ -1.65
RABGGTB-213ENST00000496055 ICMTO60725 284 aa4.77□□□□□ -1.65
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RABGGTB-213ENST00000496055 SNRPAP09012 282 aaKnown RBP4.77□□□□□ -1.65
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RABGGTB-213ENST00000496055 CYP3A7P24462 503 aa4.77□□□□□ -1.65
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RABGGTB-213ENST00000496055 PPARGP37231 505 aaPredicted RBP4.77□□□□□ -1.65
RABGGTB-213ENST00000496055 PLA2G5P39877 138 aa4.77□□□□□ -1.65
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