RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493660.5

SMARCE1-211, Transcript of SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily e, member 1, humanhuman

TSL 3

Gene SMARCE1, Length 2,284 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1-211ENST00000493660 HNRNPUL1Q9BUJ2 856 aaKnown RBP eCLIP7.58□□□□□ -1.2
SMARCE1-211ENST00000493660 CCDC28BQ9BUN5 200 aa7.58□□□□□ -1.2
SMARCE1-211ENST00000493660 DNAI2Q9GZS0 605 aa7.58□□□□□ -1.2
SMARCE1-211ENST00000493660 MIS12Q9H081 205 aa7.58□□□□□ -1.2
SMARCE1-211ENST00000493660 CARD9Q9H257 536 aa7.58□□□□□ -1.2
SMARCE1-211ENST00000493660 CISHQ9NSE2 258 aa7.58□□□□□ -1.2
SMARCE1-211ENST00000493660 GDAP2Q9NXN4 497 aa7.58□□□□□ -1.2
SMARCE1-211ENST00000493660 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP7.58□□□□□ -1.2
SMARCE1-211ENST00000493660 KLK14Q9P0G3 267 aa7.58□□□□□ -1.2
SMARCE1-211ENST00000493660 ADAMTS1Q9UHI8 967 aa7.58□□□□□ -1.2
SMARCE1-211ENST00000493660 SLC12A4Q9UP95 1085 aa7.58□□□□□ -1.2
SMARCE1-211ENST00000493660 EFR3BQ9Y2G0 817 aa7.58□□□□□ -1.2
SMARCE1-211ENST00000493660 FNDC1Q4ZHG4 1894 aaPredicted RBP7.58□□□□□ -1.2
SMARCE1-211ENST00000493660 ARL5CA6NH57 179 aa7.58□□□□□ -1.2
SMARCE1-211ENST00000493660 SUPT3HO75486 399 aa7.58□□□□□ -1.2
SMARCE1-211ENST00000493660 HNRNPCP07910 306 aaKnown RBP eCLIP7.58□□□□□ -1.2
SMARCE1-211ENST00000493660 CLTBP09497 229 aa7.58□□□□□ -1.2
SMARCE1-211ENST00000493660 MSL3P1P0C860 447 aa7.58□□□□□ -1.2
SMARCE1-211ENST00000493660 ACADSP16219 412 aa7.58□□□□□ -1.2
SMARCE1-211ENST00000493660 CHRNB2P17787 502 aa7.58□□□□□ -1.2
SMARCE1-211ENST00000493660 TAF6P49848 677 aa7.58□□□□□ -1.2
SMARCE1-211ENST00000493660 TUBP50607 506 aa7.58□□□□□ -1.2
SMARCE1-211ENST00000493660 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP7.58□□□□□ -1.2
SMARCE1-211ENST00000493660 GPNMBQ14956 572 aa7.58□□□□□ -1.2
SMARCE1-211ENST00000493660 WDR72Q3MJ13 1102 aa7.58□□□□□ -1.2
SMARCE1-211ENST00000493660 GLRA4Q5JXX5 417 aa7.58□□□□□ -1.2
SMARCE1-211ENST00000493660 CCDC122Q5T0U0 273 aa7.58□□□□□ -1.2
SMARCE1-211ENST00000493660 OR52E8Q6IFG1 317 aa7.58□□□□□ -1.2
SMARCE1-211ENST00000493660 ALKBH5Q6P6C2 394 aaKnown RBP7.58□□□□□ -1.2
SMARCE1-211ENST00000493660 DPH6Q7L8W6 267 aa7.58□□□□□ -1.2
SMARCE1-211ENST00000493660 TTC30AQ86WT1 665 aa7.58□□□□□ -1.2
SMARCE1-211ENST00000493660 GSTCDQ8NEC7 633 aa7.58□□□□□ -1.2
SMARCE1-211ENST00000493660 SPATA18Q8TC71 538 aa7.58□□□□□ -1.2
SMARCE1-211ENST00000493660 DIS3LQ8TF46 1054 aaKnown RBP7.58□□□□□ -1.2
SMARCE1-211ENST00000493660 LINC01599Q8WXQ3 324 aa7.58□□□□□ -1.2
SMARCE1-211ENST00000493660 DDX1Q92499 740 aaKnown RBP7.58□□□□□ -1.2
SMARCE1-211ENST00000493660 PTPRN2Q92932 1015 aa7.58□□□□□ -1.2
SMARCE1-211ENST00000493660 C18orf25Q96B23 403 aaPredicted RBP7.58□□□□□ -1.2
SMARCE1-211ENST00000493660 GAD1Q99259 594 aa7.58□□□□□ -1.2
SMARCE1-211ENST00000493660 CXCL16Q9H2A7 254 aa7.58□□□□□ -1.2
SMARCE1-211ENST00000493660 TMEM161AQ9NX61 479 aa7.58□□□□□ -1.2
SMARCE1-211ENST00000493660 DKK3Q9UBP4 350 aa7.58□□□□□ -1.2
SMARCE1-211ENST00000493660 ALPK3Q96L96 1907 aa7.58□□□□□ -1.2
SMARCE1-211ENST00000493660 TTC3P53804 2025 aa7.57□□□□□ -1.2
SMARCE1-211ENST00000493660 A0A0A6YYK5 440 aaPredicted RBP7.57□□□□□ -1.2
SMARCE1-211ENST00000493660 CCT8L1PA6NM43 557 aa7.57□□□□□ -1.2
SMARCE1-211ENST00000493660 HMGB1P1B2RPK0 211 aaPredicted RBP7.57□□□□□ -1.2
SMARCE1-211ENST00000493660 IQCJ-SCHIP1C9J366 451 aaPredicted RBP7.57□□□□□ -1.2
SMARCE1-211ENST00000493660 TTI1O43156 1089 aa7.57□□□□□ -1.2
SMARCE1-211ENST00000493660 HOXA2O43364 376 aa7.57□□□□□ -1.2
SMARCE1-211ENST00000493660 TACC1O75410 805 aa7.57□□□□□ -1.2
SMARCE1-211ENST00000493660 H2AFZP0C0S5 128 aa7.57□□□□□ -1.2
SMARCE1-211ENST00000493660 GNA15P30679 374 aa7.57□□□□□ -1.2
SMARCE1-211ENST00000493660 GSTT1P30711 240 aa7.57□□□□□ -1.2
SMARCE1-211ENST00000493660 ATP1A2P50993 1020 aa7.57□□□□□ -1.2
SMARCE1-211ENST00000493660 GUCY2FP51841 1108 aa7.57□□□□□ -1.2
SMARCE1-211ENST00000493660 PDE1BQ01064 536 aa7.57□□□□□ -1.2
SMARCE1-211ENST00000493660 AMPD2Q01433 879 aa7.57□□□□□ -1.2
SMARCE1-211ENST00000493660 FMO1Q01740 532 aa7.57□□□□□ -1.2
SMARCE1-211ENST00000493660 GUCY1A3Q02108 690 aa7.57□□□□□ -1.2
SMARCE1-211ENST00000493660 CYP27A1Q02318 531 aa7.57□□□□□ -1.2
SMARCE1-211ENST00000493660 BCL2A1Q16548 175 aa7.57□□□□□ -1.2
SMARCE1-211ENST00000493660 SCARA3Q6AZY7 606 aa7.57□□□□□ -1.2
SMARCE1-211ENST00000493660 EMBQ6PCB8 327 aa7.57□□□□□ -1.2
SMARCE1-211ENST00000493660 TMEM270Q6UE05 265 aa7.57□□□□□ -1.2
SMARCE1-211ENST00000493660 H2AFVQ71UI9 128 aa7.57□□□□□ -1.2
SMARCE1-211ENST00000493660 LIMS2Q7Z4I7 341 aa7.57□□□□□ -1.2
SMARCE1-211ENST00000493660 RTN4RL1Q86UN2 441 aaPredicted RBP7.57□□□□□ -1.2
SMARCE1-211ENST00000493660 SLC47A2Q86VL8 602 aa7.57□□□□□ -1.2
SMARCE1-211ENST00000493660 GLYCTKQ8IVS8 523 aa7.57□□□□□ -1.2
SMARCE1-211ENST00000493660 SLC35F6Q8N357 371 aa7.57□□□□□ -1.2
SMARCE1-211ENST00000493660 RNF10Q8N5U6 811 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
SMARCE1-211ENST00000493660 URGCPQ8TCY9 931 aa7.57□□□□□ -1.2
SMARCE1-211ENST00000493660 ARL8AQ96BM9 186 aa7.57□□□□□ -1.2
SMARCE1-211ENST00000493660 CGREF1Q99674 301 aa7.57□□□□□ -1.2
SMARCE1-211ENST00000493660 ISCUQ9H1K1 167 aa7.57□□□□□ -1.2
SMARCE1-211ENST00000493660 MRPL46Q9H2W6 279 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
SMARCE1-211ENST00000493660 SYNCQ9H7C4 482 aa7.57□□□□□ -1.2
SMARCE1-211ENST00000493660 TBCCD1Q9NVR7 557 aa7.57□□□□□ -1.2
SMARCE1-211ENST00000493660 KANSL3Q9P2N6 904 aa7.57□□□□□ -1.2
SMARCE1-211ENST00000493660 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
SMARCE1-211ENST00000493660 SCOCQ9UIL1 159 aa7.57□□□□□ -1.2
SMARCE1-211ENST00000493660 KIAA1257Q9ULG3 409 aa7.57□□□□□ -1.2
SMARCE1-211ENST00000493660 POLIQ9UNA4 740 aa7.57□□□□□ -1.2
SMARCE1-211ENST00000493660 COMMD3-BMI1R4GMX3 469 aa7.57□□□□□ -1.2
SMARCE1-211ENST00000493660 HTTP42858 3142 aa7.57□□□□□ -1.2
SMARCE1-211ENST00000493660 NCANO14594 1321 aa7.57□□□□□ -1.2
SMARCE1-211ENST00000493660 KIAA0355O15063 1070 aa7.57□□□□□ -1.2
SMARCE1-211ENST00000493660 MED7O43513 233 aa7.57□□□□□ -1.2
SMARCE1-211ENST00000493660 CILPO75339 1184 aa7.57□□□□□ -1.2
SMARCE1-211ENST00000493660 TMEM253P0C7T8 217 aa7.57□□□□□ -1.2
SMARCE1-211ENST00000493660 NQO1P15559 274 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
SMARCE1-211ENST00000493660 PCK1P35558 622 aa7.57□□□□□ -1.2
SMARCE1-211ENST00000493660 PMS2P54278 862 aa7.57□□□□□ -1.2
SMARCE1-211ENST00000493660 EPHB4P54760 987 aa7.57□□□□□ -1.2
SMARCE1-211ENST00000493660 MTTPP55157 894 aa7.57□□□□□ -1.2
SMARCE1-211ENST00000493660 SOX4Q06945 474 aaPredicted RBP7.57□□□□□ -1.2
SMARCE1-211ENST00000493660 LSAMPQ13449 338 aa7.57□□□□□ -1.2
SMARCE1-211ENST00000493660 TCEAL1Q15170 157 aa7.57□□□□□ -1.2
SMARCE1-211ENST00000493660 STILQ15468 1287 aa7.57□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.4 ms