RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480447.5

NOP56-212, Transcript of NOP56 ribonucleoprotein, humanhuman

TSL 2

Gene NOP56, Length 651 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOP56-212ENST00000480447 AASDHQ4L235 1098 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
NOP56-212ENST00000480447 USP39Q53GS9 565 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
NOP56-212ENST00000480447 PPM1JQ5JR12 505 aa6.7□□□□□ -1.34
NOP56-212ENST00000480447 SPDYCQ5MJ68 293 aa6.7□□□□□ -1.34
NOP56-212ENST00000480447 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
NOP56-212ENST00000480447 WSCD1Q658N2 575 aa6.7□□□□□ -1.34
NOP56-212ENST00000480447 LMBRD2Q68DH5 695 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
NOP56-212ENST00000480447 VSTM1Q6UX27 236 aa6.7□□□□□ -1.34
NOP56-212ENST00000480447 SYT13Q7L8C5 426 aa6.7□□□□□ -1.34
NOP56-212ENST00000480447 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP6.7□□□□□ -1.34
NOP56-212ENST00000480447 SPATA2LQ8IUW3 424 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
NOP56-212ENST00000480447 PDCL2Q8N4E4 241 aa6.7□□□□□ -1.34
NOP56-212ENST00000480447 CSGALNACT2Q8N6G5 542 aa6.7□□□□□ -1.34
NOP56-212ENST00000480447 MAB21L3Q8N8X9 362 aa6.7□□□□□ -1.34
NOP56-212ENST00000480447 OSCP1Q8WVF1 389 aa6.7□□□□□ -1.34
NOP56-212ENST00000480447 USP13Q92995 863 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
NOP56-212ENST00000480447 RSPRY1Q96DX4 576 aa6.7□□□□□ -1.34
NOP56-212ENST00000480447 FIZ1Q96SL8 496 aa6.7□□□□□ -1.34
NOP56-212ENST00000480447 DUSP9Q99956 384 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
NOP56-212ENST00000480447 P2RY13Q9BPV8 354 aa6.7□□□□□ -1.34
NOP56-212ENST00000480447 FAM213AQ9BRX8 229 aa6.7□□□□□ -1.34
NOP56-212ENST00000480447 STRA6Q9BX79 667 aa6.7□□□□□ -1.34
NOP56-212ENST00000480447 CRISPLD1Q9H336 500 aa6.7□□□□□ -1.34
NOP56-212ENST00000480447 NEUROD4Q9HD90 331 aa6.7□□□□□ -1.34
NOP56-212ENST00000480447 PARD6AQ9NPB6 346 aa6.7□□□□□ -1.34
NOP56-212ENST00000480447 TIMMDC1Q9NPL8 285 aa6.7□□□□□ -1.34
NOP56-212ENST00000480447 BLOC1S4Q9NUP1 217 aa6.7□□□□□ -1.34
NOP56-212ENST00000480447 DUS2Q9NX74 493 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
NOP56-212ENST00000480447 RBAKQ9NYW8 714 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
NOP56-212ENST00000480447 ANGPTL2Q9UKU9 493 aa6.7□□□□□ -1.34
NOP56-212ENST00000480447 SRPRBQ9Y5M8 271 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
NOP56-212ENST00000480447 FANCMQ8IYD8 2048 aa6.7□□□□□ -1.34
NOP56-212ENST00000480447 USP24Q9UPU5 2620 aa6.7□□□□□ -1.34
NOP56-212ENST00000480447 VWA8A3KMH1 1905 aa6.7□□□□□ -1.34
NOP56-212ENST00000480447 MYH15Q9Y2K3 1946 aa6.7□□□□□ -1.34
NOP56-212ENST00000480447 FREM2Q5SZK8 3169 aa6.69□□□□□ -1.34
NOP56-212ENST00000480447 FAM187AA6NFU0 413 aa6.69□□□□□ -1.34
NOP56-212ENST00000480447 ZNF233A6NK53 670 aa6.69□□□□□ -1.34
NOP56-212ENST00000480447 ANKRD63C9JTQ0 380 aa6.69□□□□□ -1.34
NOP56-212ENST00000480447 GABRDO14764 452 aa6.69□□□□□ -1.34
NOP56-212ENST00000480447 AXIN1O15169 862 aa6.69□□□□□ -1.34
NOP56-212ENST00000480447 ALDH1A2O94788 518 aa6.69□□□□□ -1.34
NOP56-212ENST00000480447 EPN2O95208 641 aa6.69□□□□□ -1.34
NOP56-212ENST00000480447 GCNT3O95395 438 aa6.69□□□□□ -1.34
NOP56-212ENST00000480447 PRAMEF12O95522 483 aa6.69□□□□□ -1.34
NOP56-212ENST00000480447 NFATC1O95644 943 aa6.69□□□□□ -1.34
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NOP56-212ENST00000480447 TNNC2P02585 160 aa6.69□□□□□ -1.34
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NOP56-212ENST00000480447 TMEM191BP0C7N4 346 aa6.69□□□□□ -1.34
NOP56-212ENST00000480447 RHOQP17081 205 aa6.69□□□□□ -1.34
NOP56-212ENST00000480447 HMGA1P17096 107 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
NOP56-212ENST00000480447 TRIM21P19474 475 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
NOP56-212ENST00000480447 ANXA13P27216 316 aa6.69□□□□□ -1.34
NOP56-212ENST00000480447 MSX1P28360 303 aa6.69□□□□□ -1.34
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NOP56-212ENST00000480447 MTF1Q14872 753 aa6.69□□□□□ -1.34
NOP56-212ENST00000480447 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
NOP56-212ENST00000480447 ARSJQ5FYB0 599 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
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NOP56-212ENST00000480447 HEATR6Q6AI08 1181 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
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NOP56-212ENST00000480447 SLC39A4Q6P5W5 647 aa6.69□□□□□ -1.34
NOP56-212ENST00000480447 TXNDC11Q6PKC3 985 aa6.69□□□□□ -1.34
NOP56-212ENST00000480447 CRELD2Q6UXH1 353 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
NOP56-212ENST00000480447 LRRTM3Q86VH5 581 aa6.69□□□□□ -1.34
NOP56-212ENST00000480447 BRSK2Q8IWQ3 736 aa6.69□□□□□ -1.34
NOP56-212ENST00000480447 CCDC65Q8IXS2 484 aa6.69□□□□□ -1.34
NOP56-212ENST00000480447 ANKRD36BP1Q96IX9 119 aa6.69□□□□□ -1.34
NOP56-212ENST00000480447 CHAMP1Q96JM3 812 aa6.69□□□□□ -1.34
NOP56-212ENST00000480447 ZFYVE19Q96K21 471 aa6.69□□□□□ -1.34
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NOP56-212ENST00000480447 LRRC3BQ96PB8 259 aa6.69□□□□□ -1.34
NOP56-212ENST00000480447 LPIN3Q9BQK8 851 aa6.69□□□□□ -1.34
NOP56-212ENST00000480447 CNTNAP3Q9BZ76 1288 aa6.69□□□□□ -1.34
NOP56-212ENST00000480447 CUEDC2Q9H467 287 aa6.69□□□□□ -1.34
NOP56-212ENST00000480447 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
NOP56-212ENST00000480447 EBF3Q9H4W6 596 aa6.69□□□□□ -1.34
NOP56-212ENST00000480447 ECT2Q9H8V3 914 aa6.69□□□□□ -1.34
NOP56-212ENST00000480447 DDX43Q9NXZ2 648 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
NOP56-212ENST00000480447 CGNQ9P2M7 1197 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
NOP56-212ENST00000480447 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
NOP56-212ENST00000480447 CDH9Q9ULB4 789 aa6.69□□□□□ -1.34
NOP56-212ENST00000480447 ARHGAP26Q9UNA1 814 aa6.69□□□□□ -1.34
NOP56-212ENST00000480447 AGAP1Q9UPQ3 857 aa6.69□□□□□ -1.34
NOP56-212ENST00000480447 DYNC1LI1Q9Y6G9 523 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
NOP56-212ENST00000480447 MIA3Q5JRA6 1907 aa6.69□□□□□ -1.34
NOP56-212ENST00000480447 NOTCH4Q99466 2003 aa6.69□□□□□ -1.34
NOP56-212ENST00000480447 SPEGQ15772 3267 aa6.68□□□□□ -1.34
NOP56-212ENST00000480447 A6NHS1 94 aa6.68□□□□□ -1.34
NOP56-212ENST00000480447 MYMKA6NI61 221 aa6.68□□□□□ -1.34
NOP56-212ENST00000480447 PALM2-AKAP2B1ALY0 433 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
NOP56-212ENST00000480447 NRG2O14511 850 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
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