RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000473257.1

ACTB-209, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 3

Gene ACTB, Length 556 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-209ENST00000473257 FREM2Q5SZK8 3169 aa11.93□□□□□ -0.5
ACTB-209ENST00000473257 COCHO43405 550 aa11.93□□□□□ -0.5
ACTB-209ENST00000473257 ADAM23O75077 832 aa11.93□□□□□ -0.5
ACTB-209ENST00000473257 KAT7O95251 611 aa11.93□□□□□ -0.5
ACTB-209ENST00000473257 TCF3P15923 654 aa11.93□□□□□ -0.5
ACTB-209ENST00000473257 PDCP20941 246 aa11.93□□□□□ -0.5
ACTB-209ENST00000473257 SHC2P98077 582 aa11.93□□□□□ -0.5
ACTB-209ENST00000473257 STK38Q15208 465 aa11.93□□□□□ -0.5
ACTB-209ENST00000473257 SHC4Q6S5L8 630 aa11.93□□□□□ -0.5
ACTB-209ENST00000473257 PAQR9Q6ZVX9 377 aa11.93□□□□□ -0.5
ACTB-209ENST00000473257 DPH6Q7L8W6 267 aa11.93□□□□□ -0.5
ACTB-209ENST00000473257 MIB1Q86YT6 1006 aa11.93□□□□□ -0.5
ACTB-209ENST00000473257 DEFB124Q8NES8 71 aa11.93□□□□□ -0.5
ACTB-209ENST00000473257 SPATA18Q8TC71 538 aa11.93□□□□□ -0.5
ACTB-209ENST00000473257 SCFD1Q8WVM8 642 aa11.93□□□□□ -0.5
ACTB-209ENST00000473257 ZFRQ96KR1 1074 aaKnown RBP11.93□□□□□ -0.5
ACTB-209ENST00000473257 CNOT6LQ96LI5 555 aaKnown RBP11.93□□□□□ -0.5
ACTB-209ENST00000473257 CGRRF1Q99675 332 aa11.93□□□□□ -0.5
ACTB-209ENST00000473257 SDCBP2Q9H190 292 aa11.93□□□□□ -0.5
ACTB-209ENST00000473257 XYLT2Q9H1B5 865 aa11.93□□□□□ -0.5
ACTB-209ENST00000473257 ARHGEF4Q9NR80 690 aa11.93□□□□□ -0.5
ACTB-209ENST00000473257 GMIPQ9P107 970 aa11.93□□□□□ -0.5
ACTB-209ENST00000473257 HCN2Q9UL51 889 aa11.93□□□□□ -0.5
ACTB-209ENST00000473257 ITPR1Q14643 2758 aa11.92□□□□□ -0.5
ACTB-209ENST00000473257 TCRBV21S2A2A0A5A6 115 aa11.92□□□□□ -0.5
ACTB-209ENST00000473257 A8MXQ7 604 aa11.92□□□□□ -0.5
ACTB-209ENST00000473257 TRIM66O15016 1216 aa11.92□□□□□ -0.5
ACTB-209ENST00000473257 KHNYNO15037 678 aaKnown RBP11.92□□□□□ -0.5
ACTB-209ENST00000473257 CLSTN1O94985 981 aa11.92□□□□□ -0.5
ACTB-209ENST00000473257 OLFM2O95897 454 aa11.92□□□□□ -0.5
ACTB-209ENST00000473257 ADH5P11766 374 aa11.92□□□□□ -0.5
ACTB-209ENST00000473257 KIR2DL1P43626 348 aaPredicted RBP11.92□□□□□ -0.5
ACTB-209ENST00000473257 NASPP49321 788 aaPredicted RBP11.92□□□□□ -0.5
ACTB-209ENST00000473257 TNNC1P63316 161 aa11.92□□□□□ -0.5
ACTB-209ENST00000473257 NOP14P78316 857 aaKnown RBP11.92□□□□□ -0.5
ACTB-209ENST00000473257 PSMD6Q15008 389 aa11.92□□□□□ -0.5
ACTB-209ENST00000473257 MAPRE1Q15691 268 aaKnown RBP11.92□□□□□ -0.5
ACTB-209ENST00000473257 FAM26FQ5R3K3 315 aa11.92□□□□□ -0.5
ACTB-209ENST00000473257 TDRD10Q5VZ19 366 aaKnown RBP11.92□□□□□ -0.5
ACTB-209ENST00000473257 TMEM25Q86YD3 366 aa11.92□□□□□ -0.5
ACTB-209ENST00000473257 BBS7Q8IWZ6 715 aa11.92□□□□□ -0.5
ACTB-209ENST00000473257 PHTF2Q8N3S3 785 aa11.92□□□□□ -0.5
ACTB-209ENST00000473257 LINC00301Q8NCQ3 95 aa11.92□□□□□ -0.5
ACTB-209ENST00000473257 B3GALNT2Q8NCR0 500 aa11.92□□□□□ -0.5
ACTB-209ENST00000473257 OR2I1PQ8NGU4 316 aa11.92□□□□□ -0.5
ACTB-209ENST00000473257 OLIG1Q8TAK6 271 aa11.92□□□□□ -0.5
ACTB-209ENST00000473257 ZNF507Q8TCN5 953 aa11.92□□□□□ -0.5
ACTB-209ENST00000473257 FBXO32Q969P5 355 aa11.92□□□□□ -0.5
ACTB-209ENST00000473257 EXOC4Q96A65 974 aa11.92□□□□□ -0.5
ACTB-209ENST00000473257 C8orf48Q96LL4 319 aa11.92□□□□□ -0.5
ACTB-209ENST00000473257 PNKPQ96T60 521 aa11.92□□□□□ -0.5
ACTB-209ENST00000473257 MED10Q9BTT4 135 aa11.92□□□□□ -0.5
ACTB-209ENST00000473257 SLC39A2Q9NP94 309 aa11.92□□□□□ -0.5
ACTB-209ENST00000473257 TMEM9BQ9NQ34 198 aa11.92□□□□□ -0.5
ACTB-209ENST00000473257 KBTBD4Q9NVX7 518 aa11.92□□□□□ -0.5
ACTB-209ENST00000473257 BCCIPQ9P287 314 aaKnown RBP eCLIP11.92□□□□□ -0.5
ACTB-209ENST00000473257 HMGXB4Q9UGU5 601 aa11.92□□□□□ -0.5
ACTB-209ENST00000473257 PI4KAP42356 2102 aa11.92□□□□□ -0.5
ACTB-209ENST00000473257 SPTLC2O15270 562 aa11.91□□□□□ -0.5
ACTB-209ENST00000473257 MAP3K13O43283 966 aa11.91□□□□□ -0.5
ACTB-209ENST00000473257 TACC1O75410 805 aa11.91□□□□□ -0.5
ACTB-209ENST00000473257 TBX18O95935 607 aa11.91□□□□□ -0.5
ACTB-209ENST00000473257 APODP05090 189 aa11.91□□□□□ -0.5
ACTB-209ENST00000473257 CCDC130P13994 396 aa11.91□□□□□ -0.5
ACTB-209ENST00000473257 ITPKAP23677 461 aa11.91□□□□□ -0.5
ACTB-209ENST00000473257 YWHAQP27348 245 aa11.91□□□□□ -0.5
ACTB-209ENST00000473257 P2RY2P41231 377 aa11.91□□□□□ -0.5
ACTB-209ENST00000473257 FAM35AQ86V20 835 aa11.91□□□□□ -0.5
ACTB-209ENST00000473257 PGBD3Q8N328 593 aa11.91□□□□□ -0.5
ACTB-209ENST00000473257 JAKMIP2Q96AA8 810 aa11.91□□□□□ -0.5
ACTB-209ENST00000473257 ACOX2Q99424 681 aa11.91□□□□□ -0.5
ACTB-209ENST00000473257 SLC6A17Q9H1V8 727 aa11.91□□□□□ -0.5
ACTB-209ENST00000473257 TNMDQ9H2S6 317 aa11.91□□□□□ -0.5
ACTB-209ENST00000473257 CD93Q9NPY3 652 aa11.91□□□□□ -0.5
ACTB-209ENST00000473257 WASF3Q9UPY6 502 aa11.91□□□□□ -0.5
ACTB-209ENST00000473257 ANKRD11Q6UB99 2663 aaPredicted RBP11.91□□□□□ -0.5
ACTB-209ENST00000473257 BAHCC1Q9P281 2608 aa11.9□□□□□ -0.5
ACTB-209ENST00000473257 ADAMTS9Q9P2N4 1935 aa11.9□□□□□ -0.5
ACTB-209ENST00000473257 SPAARA0A1B0GVQ0 90 aa11.9□□□□□ -0.5
ACTB-209ENST00000473257 TNFRSF10BO14763 440 aa11.9□□□□□ -0.5
ACTB-209ENST00000473257 KIAA0391O15091 583 aaKnown RBP11.9□□□□□ -0.5
ACTB-209ENST00000473257 STX6O43752 255 aa11.9□□□□□ -0.5
ACTB-209ENST00000473257 PHACTR2O75167 634 aa11.9□□□□□ -0.5
ACTB-209ENST00000473257 BEST1O76090 585 aa11.9□□□□□ -0.5
ACTB-209ENST00000473257 VNN1O95497 513 aa11.9□□□□□ -0.5
ACTB-209ENST00000473257 ADH1CP00326 375 aa11.9□□□□□ -0.5
ACTB-209ENST00000473257 AFMP43652 599 aa11.9□□□□□ -0.5
ACTB-209ENST00000473257 SLC5A3P53794 718 aa11.9□□□□□ -0.5
ACTB-209ENST00000473257 DLG4P78352 724 aa11.9□□□□□ -0.5
ACTB-209ENST00000473257 MRPS21P82921 87 aaKnown RBP11.9□□□□□ -0.5
ACTB-209ENST00000473257 TRPC3Q13507 836 aa11.9□□□□□ -0.5
ACTB-209ENST00000473257 CUL4BQ13620 913 aa11.9□□□□□ -0.5
ACTB-209ENST00000473257 SURF1Q15526 300 aa11.9□□□□□ -0.5
ACTB-209ENST00000473257 MAP7D1Q3KQU3 841 aa11.9□□□□□ -0.5
ACTB-209ENST00000473257 TRIM61Q5EBN2 209 aa11.9□□□□□ -0.5
ACTB-209ENST00000473257 DAB2IPQ5VWQ8 1189 aa11.9□□□□□ -0.5
ACTB-209ENST00000473257 UNQ6494/PRO21346Q6UXR6 183 aa11.9□□□□□ -0.5
ACTB-209ENST00000473257 STXBP4Q6ZWJ1 553 aa11.9□□□□□ -0.5
ACTB-209ENST00000473257 ACOT1Q86TX2 421 aa11.9□□□□□ -0.5
ACTB-209ENST00000473257 NUP93Q8N1F7 819 aa11.9□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.5 ms