RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469307.4

PGAP2-215, Transcript of post-GPI attachment to proteins 2, human

TSL 3

Gene PGAP2, Length 798 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PGAP2-215	ENST00000469307	SECISBP2L	Q93073	1101 aa	Known RBP	13.09	□□□□□ -0.31
PGAP2-215	ENST00000469307	KCNK16	Q96T55	309 aa		13.09	□□□□□ -0.31
PGAP2-215	ENST00000469307	IMPG2	Q9BZV3	1241 aa		13.09	□□□□□ -0.31
PGAP2-215	ENST00000469307	NIF3L1	Q9GZT8	377 aa		13.09	□□□□□ -0.31
PGAP2-215	ENST00000469307	LINC00597	Q9H2U6	94 aa		13.09	□□□□□ -0.31
PGAP2-215	ENST00000469307	FBXO44	Q9H4M3	255 aa		13.09	□□□□□ -0.31
PGAP2-215	ENST00000469307	TBC1D14	Q9P2M4	693 aa		13.09	□□□□□ -0.31
PGAP2-215	ENST00000469307	HMGXB4	Q9UGU5	601 aa		13.09	□□□□□ -0.31
PGAP2-215	ENST00000469307	EBF1	Q9UH73	591 aa		13.09	□□□□□ -0.31
PGAP2-215	ENST00000469307	WNT6	Q9Y6F9	365 aa		13.09	□□□□□ -0.31
PGAP2-215	ENST00000469307	SPAG17	Q6Q759	2223 aa		13.08	□□□□□ -0.32
PGAP2-215	ENST00000469307	TULP1	O00294	542 aa	Predicted RBP	13.08	□□□□□ -0.32
PGAP2-215	ENST00000469307	PMM2	O15305	246 aa		13.08	□□□□□ -0.32
PGAP2-215	ENST00000469307	GREM1	O60565	184 aa		13.08	□□□□□ -0.32
PGAP2-215	ENST00000469307	AP1G2	O75843	785 aa		13.08	□□□□□ -0.32
PGAP2-215	ENST00000469307	EGF	P01133	1207 aa		13.08	□□□□□ -0.32
PGAP2-215	ENST00000469307	KRT13	P13646	458 aa		13.08	□□□□□ -0.32
PGAP2-215	ENST00000469307	OPRD1	P41143	372 aa		13.08	□□□□□ -0.32
PGAP2-215	ENST00000469307	PIK3CA	P42336	1068 aa		13.08	□□□□□ -0.32
PGAP2-215	ENST00000469307	GCLM	P48507	274 aa		13.08	□□□□□ -0.32
PGAP2-215	ENST00000469307	DMWD	Q09019	674 aa		13.08	□□□□□ -0.32
PGAP2-215	ENST00000469307	HECTD3	Q5T447	861 aa		13.08	□□□□□ -0.32
PGAP2-215	ENST00000469307	ZNF658	Q5TYW1	1059 aa	Predicted RBP	13.08	□□□□□ -0.32
PGAP2-215	ENST00000469307	SPOPL	Q6IQ16	392 aa		13.08	□□□□□ -0.32
PGAP2-215	ENST00000469307	SCARA5	Q6ZMJ2	495 aa		13.08	□□□□□ -0.32
PGAP2-215	ENST00000469307	DCLK2	Q8N568	766 aa		13.08	□□□□□ -0.32
PGAP2-215	ENST00000469307	SCAMP5	Q8TAC9	235 aa		13.08	□□□□□ -0.32
PGAP2-215	ENST00000469307	SLC2A14	Q8TDB8	520 aa		13.08	□□□□□ -0.32
PGAP2-215	ENST00000469307	FBXO32	Q969P5	355 aa		13.08	□□□□□ -0.32
PGAP2-215	ENST00000469307	LOXL4	Q96JB6	756 aa		13.08	□□□□□ -0.32
PGAP2-215	ENST00000469307	TWNK	Q96RR1	684 aa		13.08	□□□□□ -0.32
PGAP2-215	ENST00000469307	NT5C1A	Q9BXI3	368 aa		13.08	□□□□□ -0.32
PGAP2-215	ENST00000469307	GDPD2	Q9HCC8	539 aa		13.08	□□□□□ -0.32
PGAP2-215	ENST00000469307	CYLD	Q9NQC7	956 aa		13.08	□□□□□ -0.32
PGAP2-215	ENST00000469307	KRT82	Q9NSB4	513 aa		13.08	□□□□□ -0.32
PGAP2-215	ENST00000469307	SCML2	Q9UQR0	700 aa		13.08	□□□□□ -0.32
PGAP2-215	ENST00000469307	CPQ	Q9Y646	472 aa		13.08	□□□□□ -0.32
PGAP2-215	ENST00000469307	SPTBN2	O15020	2390 aa		13.07	□□□□□ -0.32
PGAP2-215	ENST00000469307	KIAA1549L	Q6ZVL6	1849 aa		13.07	□□□□□ -0.32
PGAP2-215	ENST00000469307	PRR5-ARHGAP8	B1AHC4	643 aa		13.07	□□□□□ -0.32
PGAP2-215	ENST00000469307	CETN3	O15182	167 aa		13.07	□□□□□ -0.32
PGAP2-215	ENST00000469307	COCH	O43405	550 aa		13.07	□□□□□ -0.32
PGAP2-215	ENST00000469307	STX10	O60499	249 aa		13.07	□□□□□ -0.32
PGAP2-215	ENST00000469307	FOXD2	O60548	495 aa	Predicted RBP	13.07	□□□□□ -0.32
PGAP2-215	ENST00000469307	RNF40	O75150	1001 aa		13.07	□□□□□ -0.32
PGAP2-215	ENST00000469307	BEST1	O76090	585 aa		13.07	□□□□□ -0.32
PGAP2-215	ENST00000469307	CYP17A1	P05093	508 aa		13.07	□□□□□ -0.32
PGAP2-215	ENST00000469307	TRIM49	P0CI25	452 aa		13.07	□□□□□ -0.32
PGAP2-215	ENST00000469307	TRIM49C	P0CI26	452 aa		13.07	□□□□□ -0.32
PGAP2-215	ENST00000469307	CCDC130	P13994	396 aa		13.07	□□□□□ -0.32
PGAP2-215	ENST00000469307	SDHB	P21912	280 aa		13.07	□□□□□ -0.32
PGAP2-215	ENST00000469307	PRCP	P42785	496 aa		13.07	□□□□□ -0.32
PGAP2-215	ENST00000469307	FNTB	P49356	437 aa		13.07	□□□□□ -0.32
PGAP2-215	ENST00000469307	ARHGAP8	P85298	464 aa		13.07	□□□□□ -0.32
PGAP2-215	ENST00000469307	LRRC63	Q05C16	580 aa		13.07	□□□□□ -0.32
PGAP2-215	ENST00000469307	PNOC	Q13519	176 aa		13.07	□□□□□ -0.32
PGAP2-215	ENST00000469307	PUM1	Q14671	1186 aa	Known RBP eCLIP	13.07	□□□□□ -0.32
PGAP2-215	ENST00000469307	HSF5	Q4G112	596 aa	Predicted RBP	13.07	□□□□□ -0.32
PGAP2-215	ENST00000469307	NAIF1	Q69YI7	327 aa	Predicted RBP	13.07	□□□□□ -0.32
PGAP2-215	ENST00000469307	CLEC20A	Q6ZU45	233 aa		13.07	□□□□□ -0.32
PGAP2-215	ENST00000469307	PHTF2	Q8N3S3	785 aa		13.07	□□□□□ -0.32
PGAP2-215	ENST00000469307	C12orf29	Q8N999	325 aa		13.07	□□□□□ -0.32
PGAP2-215	ENST00000469307	FBXL13	Q8NEE6	735 aa		13.07	□□□□□ -0.32
PGAP2-215	ENST00000469307	ACD	Q96AP0	544 aa		13.07	□□□□□ -0.32
PGAP2-215	ENST00000469307	RMDN1	Q96DB5	314 aa		13.07	□□□□□ -0.32
PGAP2-215	ENST00000469307	ZC3H10	Q96K80	434 aa	Known RBP	13.07	□□□□□ -0.32
PGAP2-215	ENST00000469307	UBXN6	Q9BZV1	441 aa		13.07	□□□□□ -0.32
PGAP2-215	ENST00000469307	NCDN	Q9UBB6	729 aa		13.07	□□□□□ -0.32
PGAP2-215	ENST00000469307	MAPK8IP1	Q9UQF2	711 aa		13.07	□□□□□ -0.32
PGAP2-215	ENST00000469307	PCDHA5	Q9Y5H7	936 aa		13.07	□□□□□ -0.32
PGAP2-215	ENST00000469307	USP3	Q9Y6I4	520 aa		13.07	□□□□□ -0.32
PGAP2-215	ENST00000469307	LAMA1	P25391	3075 aa		13.07	□□□□□ -0.32
PGAP2-215	ENST00000469307		K7EQS6	105 aa		13.06	□□□□□ -0.32
PGAP2-215	ENST00000469307	HOXC11	O43248	304 aa	Predicted RBP	13.06	□□□□□ -0.32
PGAP2-215	ENST00000469307	FAM200B	P0CF97	657 aa		13.06	□□□□□ -0.32
PGAP2-215	ENST00000469307	TRIM21	P19474	475 aa	Known RBP	13.06	□□□□□ -0.32
PGAP2-215	ENST00000469307	MXI1	P50539	228 aa		13.06	□□□□□ -0.32
PGAP2-215	ENST00000469307	FKBP3	Q00688	224 aa	Known RBP	13.06	□□□□□ -0.32
PGAP2-215	ENST00000469307	LMNB2	Q03252	620 aa		13.06	□□□□□ -0.32
PGAP2-215	ENST00000469307	DHCR24	Q15392	516 aa		13.06	□□□□□ -0.32
PGAP2-215	ENST00000469307	RHBDF2	Q6PJF5	856 aa		13.06	□□□□□ -0.32
PGAP2-215	ENST00000469307	HTR3D	Q70Z44	454 aa		13.06	□□□□□ -0.32
PGAP2-215	ENST00000469307	FILIP1	Q7Z7B0	1213 aa		13.06	□□□□□ -0.32
PGAP2-215	ENST00000469307	ETFBKMT	Q8IXQ9	262 aa		13.06	□□□□□ -0.32
PGAP2-215	ENST00000469307	KIAA2013	Q8IYS2	634 aa		13.06	□□□□□ -0.32
PGAP2-215	ENST00000469307	USP33	Q8TEY7	942 aa		13.06	□□□□□ -0.32
PGAP2-215	ENST00000469307	GAB3	Q8WWW8	586 aa		13.06	□□□□□ -0.32
PGAP2-215	ENST00000469307	SEMA4D	Q92854	862 aa		13.06	□□□□□ -0.32
PGAP2-215	ENST00000469307	ELMO3	Q96BJ8	720 aa		13.06	□□□□□ -0.32
PGAP2-215	ENST00000469307	PARD6A	Q9NPB6	346 aa		13.06	□□□□□ -0.32
PGAP2-215	ENST00000469307	GMEB2	Q9UKD1	530 aa		13.06	□□□□□ -0.32
PGAP2-215	ENST00000469307	RAB23	Q9ULC3	237 aa		13.06	□□□□□ -0.32
PGAP2-215	ENST00000469307	CNOT1	A5YKK6	2376 aa	Known RBP	13.06	□□□□□ -0.32
PGAP2-215	ENST00000469307	MYO16	Q9Y6X6	1858 aa		13.06	□□□□□ -0.32
PGAP2-215	ENST00000469307	SMC2	O95347	1197 aa		13.05	□□□□□ -0.32
PGAP2-215	ENST00000469307	ADH1C	P00326	375 aa		13.05	□□□□□ -0.32
PGAP2-215	ENST00000469307	EPB41	P11171	864 aa	Known RBP	13.05	□□□□□ -0.32
PGAP2-215	ENST00000469307	PPP1R2	P41236	205 aa		13.05	□□□□□ -0.32
PGAP2-215	ENST00000469307	PSEN1	P49768	467 aa		13.05	□□□□□ -0.32
PGAP2-215	ENST00000469307	KIF11	P52732	1056 aa		13.05	□□□□□ -0.32

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