RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460766.5

IMP4-208, Transcript of IMP4, U3 small nucleolar ribonucleoprotein, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene IMP4, Length 2,379 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMP4-208ENST00000460766 TMEM237Q96Q45 408 aa21.36■■□□□ 1.01
IMP4-208ENST00000460766 KBTBD13C9JR72 458 aa21.36■■□□□ 1.01
IMP4-208ENST00000460766 AVILO75366 819 aa21.36■■□□□ 1.01
IMP4-208ENST00000460766 MT-ND3P03897 115 aa21.36■■□□□ 1.01
IMP4-208ENST00000460766 ZC3H12AQ5D1E8 599 aaKnown RBP21.36■■□□□ 1.01
IMP4-208ENST00000460766 ZNF484Q5JVG2 852 aa21.36■■□□□ 1.01
IMP4-208ENST00000460766 FYB2Q5VWT5 728 aa21.36■■□□□ 1.01
IMP4-208ENST00000460766 GPATCH11Q8N954 259 aa21.36■■□□□ 1.01
IMP4-208ENST00000460766 BANPQ8N9N5 519 aa21.36■■□□□ 1.01
IMP4-208ENST00000460766 DPP3Q9NY33 737 aa21.36■■□□□ 1.01
IMP4-208ENST00000460766 HAO1Q9UJM8 370 aa21.36■■□□□ 1.01
IMP4-208ENST00000460766 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP21.35■■□□□ 1.01
IMP4-208ENST00000460766 ANK1P16157 1881 aa21.35■■□□□ 1.01
IMP4-208ENST00000460766 TCRBV9S1A1TA0A576 114 aa21.35■■□□□ 1.01
IMP4-208ENST00000460766 LGALS2P05162 132 aa21.35■■□□□ 1.01
IMP4-208ENST00000460766 PTK7Q13308 1070 aa21.35■■□□□ 1.01
IMP4-208ENST00000460766 ACCSLQ4AC99 568 aa21.35■■□□□ 1.01
IMP4-208ENST00000460766 NLRP7Q8WX94 980 aa21.35■■□□□ 1.01
IMP4-208ENST00000460766 NT5C1AQ9BXI3 368 aa21.35■■□□□ 1.01
IMP4-208ENST00000460766 ALG13Q9NP73 1137 aaKnown RBP21.35■■□□□ 1.01
IMP4-208ENST00000460766 RAB6BQ9NRW1 208 aa21.35■■□□□ 1.01
IMP4-208ENST00000460766 GPATCH2LQ9NWQ4 482 aa21.35■■□□□ 1.01
IMP4-208ENST00000460766 HEY1Q9Y5J3 304 aa21.35■■□□□ 1.01
IMP4-208ENST00000460766 CXCL11O14625 94 aa21.34■■□□□ 1.01
IMP4-208ENST00000460766 TM9SF1O15321 606 aa21.34■■□□□ 1.01
IMP4-208ENST00000460766 ENDOD1O94919 500 aa21.34■■□□□ 1.01
IMP4-208ENST00000460766 RBP5P82980 135 aa21.34■■□□□ 1.01
IMP4-208ENST00000460766 INCA1Q0VD86 236 aa21.34■■□□□ 1.01
IMP4-208ENST00000460766 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP21.34■■□□□ 1.01
IMP4-208ENST00000460766 KBTBD12Q3ZCT8 623 aa21.34■■□□□ 1.01
IMP4-208ENST00000460766 ZNF449Q6P9G9 518 aa21.34■■□□□ 1.01
IMP4-208ENST00000460766 LCLAT1Q6UWP7 414 aa21.34■■□□□ 1.01
IMP4-208ENST00000460766 ALKBH8Q96BT7 664 aaKnown RBP21.34■■□□□ 1.01
IMP4-208ENST00000460766 RNF157Q96PX1 679 aa21.34■■□□□ 1.01
IMP4-208ENST00000460766 RAB3IPQ96QF0 476 aaPredicted RBP21.34■■□□□ 1.01
IMP4-208ENST00000460766 NGRNQ9NPE2 291 aaKnown RBP21.34■■□□□ 1.01
IMP4-208ENST00000460766 ITGA11Q9UKX5 1188 aa21.34■■□□□ 1.01
IMP4-208ENST00000460766 MGAMO43451 1857 aa21.34■■□□□ 1.01
IMP4-208ENST00000460766 KCNN4O15554 427 aa21.34■■□□□ 1.01
IMP4-208ENST00000460766 ATP5HO75947 161 aa21.34■■□□□ 1.01
IMP4-208ENST00000460766 MAP3K6O95382 1288 aa21.34■■□□□ 1.01
IMP4-208ENST00000460766 TSHRP16473 764 aa21.34■■□□□ 1.01
IMP4-208ENST00000460766 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP21.34■■□□□ 1.01
IMP4-208ENST00000460766 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP21.34■■□□□ 1.01
IMP4-208ENST00000460766 POU5F1BQ06416 359 aa21.34■■□□□ 1.01
IMP4-208ENST00000460766 KCNJ11Q14654 390 aa21.34■■□□□ 1.01
IMP4-208ENST00000460766 GOLGA7BQ2TAP0 167 aa21.34■■□□□ 1.01
IMP4-208ENST00000460766 MAP7D3Q8IWC1 876 aa21.34■■□□□ 1.01
IMP4-208ENST00000460766 ACAP3Q96P50 834 aa21.34■■□□□ 1.01
IMP4-208ENST00000460766 IQANK1A0A1B0GTG1 560 aa21.33■■□□□ 1.01
IMP4-208ENST00000460766 LPXNO60711 386 aa21.33■■□□□ 1.01
IMP4-208ENST00000460766 INHBAP08476 426 aa21.33■■□□□ 1.01
IMP4-208ENST00000460766 ZNF286BP0CG31 522 aa21.33■■□□□ 1.01
IMP4-208ENST00000460766 ARHGAP1Q07960 439 aa21.33■■□□□ 1.01
IMP4-208ENST00000460766 OVGP1Q12889 678 aa21.33■■□□□ 1.01
IMP4-208ENST00000460766 CCDC14Q49A88 953 aa21.33■■□□□ 1.01
IMP4-208ENST00000460766 KIF12Q96FN5 646 aa21.33■■□□□ 1.01
IMP4-208ENST00000460766 MIS12Q9H081 205 aa21.33■■□□□ 1.01
IMP4-208ENST00000460766 TEX264Q9Y6I9 313 aa21.33■■□□□ 1.01
IMP4-208ENST00000460766 PFKMP08237 780 aa21.33■■□□□ 1
IMP4-208ENST00000460766 ARMCX2Q7L311 632 aa21.33■■□□□ 1
IMP4-208ENST00000460766 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa21.33■■□□□ 1
IMP4-208ENST00000460766 PLD5Q8N7P1 536 aa21.33■■□□□ 1
IMP4-208ENST00000460766 CFAP36Q96G28 342 aa21.33■■□□□ 1
IMP4-208ENST00000460766 TACO1Q9BSH4 297 aaKnown RBP21.33■■□□□ 1
IMP4-208ENST00000460766 LRMDAQ9H2I8 198 aa21.33■■□□□ 1
IMP4-208ENST00000460766 MANSC1Q9H8J5 431 aa21.33■■□□□ 1
IMP4-208ENST00000460766 CYLDQ9NQC7 956 aa21.33■■□□□ 1
IMP4-208ENST00000460766 DCTN4Q9UJW0 460 aa21.33■■□□□ 1
IMP4-208ENST00000460766 TRBV21OR9-2A0A075B6F4 123 aaPredicted RBP21.32■■□□□ 1
IMP4-208ENST00000460766 ANP32DO95626 131 aa21.32■■□□□ 1
IMP4-208ENST00000460766 TROVE2P10155 538 aaKnown RBP eCLIP21.32■■□□□ 1
IMP4-208ENST00000460766 FAAP100Q0VG06 881 aa21.32■■□□□ 1
IMP4-208ENST00000460766 FAXCQ5TGI0 409 aa21.32■■□□□ 1
IMP4-208ENST00000460766 NLRP9Q7RTR0 991 aa21.32■■□□□ 1
IMP4-208ENST00000460766 CCDC125Q86Z20 511 aa21.32■■□□□ 1
IMP4-208ENST00000460766 UTP4Q969X6 686 aaKnown RBP21.32■■□□□ 1
IMP4-208ENST00000460766 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP21.32■■□□□ 1
IMP4-208ENST00000460766 SERAC1Q96JX3 654 aa21.32■■□□□ 1
IMP4-208ENST00000460766 MROH8Q9H579 483 aa21.32■■□□□ 1
IMP4-208ENST00000460766 USP29Q9HBJ7 922 aa21.32■■□□□ 1
IMP4-208ENST00000460766 C2CD2Q9Y426 696 aa21.32■■□□□ 1
IMP4-208ENST00000460766 SPDYE5A6NIY4 337 aa21.32■■□□□ 1
IMP4-208ENST00000460766 ASB14A6NK59 587 aa21.32■■□□□ 1
IMP4-208ENST00000460766 CHADO15335 359 aa21.32■■□□□ 1
IMP4-208ENST00000460766 CBX6O95503 412 aa21.32■■□□□ 1
IMP4-208ENST00000460766 RPSAP08865 295 aaKnown RBP21.32■■□□□ 1
IMP4-208ENST00000460766 OSBPP22059 807 aa21.32■■□□□ 1
IMP4-208ENST00000460766 CCND1P24385 295 aa21.32■■□□□ 1
IMP4-208ENST00000460766 BCAR1P56945 870 aa21.32■■□□□ 1
IMP4-208ENST00000460766 TAF1BQ53T94 588 aaPredicted RBP21.32■■□□□ 1
IMP4-208ENST00000460766 PPP1R26Q5T8A7 1209 aaPredicted RBP21.32■■□□□ 1
IMP4-208ENST00000460766 PMF1Q6P1K2 205 aa21.32■■□□□ 1
IMP4-208ENST00000460766 ZNF276Q8N554 614 aa21.32■■□□□ 1
IMP4-208ENST00000460766 FAM172AQ8WUF8 416 aa21.32■■□□□ 1
IMP4-208ENST00000460766 LRRN4Q8WUT4 740 aa21.32■■□□□ 1
IMP4-208ENST00000460766 SLC44A1Q8WWI5 657 aa21.32■■□□□ 1
IMP4-208ENST00000460766 VPS11Q9H270 941 aa21.32■■□□□ 1
IMP4-208ENST00000460766 EBF2Q9HAK2 575 aa21.32■■□□□ 1
IMP4-208ENST00000460766 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP21.32■■□□□ 1
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