RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000458961.1

SNORD109B-201, Transcript of small nucleolar RNA, C/D box 109B, humanhuman

BASIC

Gene SNORD109B, Length 67 nt, Biotype snoRNA, Subcellular localisation Nucleolus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNORD109B-201ENST00000458961 RPL6Q02878 288 aaKnown RBP2.89□□□□□ -1.95
SNORD109B-201ENST00000458961 GAD2Q05329 585 aa2.89□□□□□ -1.95
SNORD109B-201ENST00000458961 LMAN2Q12907 356 aa2.89□□□□□ -1.95
SNORD109B-201ENST00000458961 ORC1Q13415 861 aa2.89□□□□□ -1.95
SNORD109B-201ENST00000458961 BIRC3Q13489 604 aa2.89□□□□□ -1.95
SNORD109B-201ENST00000458961 TRPC3Q13507 836 aa2.89□□□□□ -1.95
SNORD109B-201ENST00000458961 ALCAMQ13740 583 aa2.89□□□□□ -1.95
SNORD109B-201ENST00000458961 COL9A2Q14055 689 aaPredicted RBP2.89□□□□□ -1.95
SNORD109B-201ENST00000458961 STK38Q15208 465 aa2.89□□□□□ -1.95
SNORD109B-201ENST00000458961 SURF1Q15526 300 aa2.89□□□□□ -1.95
SNORD109B-201ENST00000458961 MAPRE1Q15691 268 aaKnown RBP2.89□□□□□ -1.95
SNORD109B-201ENST00000458961 ANO4Q32M45 955 aa2.89□□□□□ -1.95
SNORD109B-201ENST00000458961 MAP7D1Q3KQU3 841 aa2.89□□□□□ -1.95
SNORD109B-201ENST00000458961 WDR72Q3MJ13 1102 aa2.89□□□□□ -1.95
SNORD109B-201ENST00000458961 EOGTQ5NDL2 527 aa2.89□□□□□ -1.95
SNORD109B-201ENST00000458961 LY6G5CQ5SRR4 150 aa2.89□□□□□ -1.95
SNORD109B-201ENST00000458961 C10orf76Q5T2E6 689 aa2.89□□□□□ -1.95
SNORD109B-201ENST00000458961 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP2.89□□□□□ -1.95
SNORD109B-201ENST00000458961 ERICH6BQ5W0A0 696 aa2.89□□□□□ -1.95
SNORD109B-201ENST00000458961 LYSMD4Q5XG99 296 aa2.89□□□□□ -1.95
SNORD109B-201ENST00000458961 BTBD8Q5XKL5 378 aa2.89□□□□□ -1.95
SNORD109B-201ENST00000458961 RHBDF2Q6PJF5 856 aa2.89□□□□□ -1.95
SNORD109B-201ENST00000458961 VSTM1Q6UX27 236 aa2.89□□□□□ -1.95
SNORD109B-201ENST00000458961 SCARA5Q6ZMJ2 495 aa2.89□□□□□ -1.95
SNORD109B-201ENST00000458961 STXBP4Q6ZWJ1 553 aa2.89□□□□□ -1.95
SNORD109B-201ENST00000458961 DPH6Q7L8W6 267 aa2.89□□□□□ -1.95
SNORD109B-201ENST00000458961 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa2.89□□□□□ -1.95
SNORD109B-201ENST00000458961 RASSF3Q86WH2 238 aa2.89□□□□□ -1.95
SNORD109B-201ENST00000458961 WDR49Q8IV35 697 aa2.89□□□□□ -1.95
SNORD109B-201ENST00000458961 NELFCDQ8IXH7 590 aa2.89□□□□□ -1.95
SNORD109B-201ENST00000458961 ADGRG2Q8IZP9 1017 aa2.89□□□□□ -1.95
SNORD109B-201ENST00000458961 NUP93Q8N1F7 819 aa2.89□□□□□ -1.95
SNORD109B-201ENST00000458961 HDDC3Q8N4P3 179 aa2.89□□□□□ -1.95
SNORD109B-201ENST00000458961 IL17RCQ8NAC3 791 aa2.89□□□□□ -1.95
SNORD109B-201ENST00000458961 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa2.89□□□□□ -1.95
SNORD109B-201ENST00000458961 B3GALNT2Q8NCR0 500 aa2.89□□□□□ -1.95
SNORD109B-201ENST00000458961 OR2I1PQ8NGU4 316 aa2.89□□□□□ -1.95
SNORD109B-201ENST00000458961 SCAMP5Q8TAC9 235 aa2.89□□□□□ -1.95
SNORD109B-201ENST00000458961 OLIG1Q8TAK6 271 aa2.89□□□□□ -1.95
SNORD109B-201ENST00000458961 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP2.89□□□□□ -1.95
SNORD109B-201ENST00000458961 ZCCHC14Q8WYQ9 949 aaKnown RBP2.89□□□□□ -1.95
SNORD109B-201ENST00000458961 FBXO32Q969P5 355 aa2.89□□□□□ -1.95
SNORD109B-201ENST00000458961 WBP2Q969T9 261 aa2.89□□□□□ -1.95
SNORD109B-201ENST00000458961 JAKMIP2Q96AA8 810 aa2.89□□□□□ -1.95
SNORD109B-201ENST00000458961 CCDC127Q96BQ5 260 aa2.89□□□□□ -1.95
SNORD109B-201ENST00000458961 DHX58Q96C10 678 aa2.89□□□□□ -1.95
SNORD109B-201ENST00000458961 C8orf48Q96LL4 319 aa2.89□□□□□ -1.95
SNORD109B-201ENST00000458961 SLITRK1Q96PX8 696 aa2.89□□□□□ -1.95
SNORD109B-201ENST00000458961 USP28Q96RU2 1077 aa2.89□□□□□ -1.95
SNORD109B-201ENST00000458961 FNBP1Q96RU3 617 aa2.89□□□□□ -1.95
SNORD109B-201ENST00000458961 KCNK16Q96T55 309 aa2.89□□□□□ -1.95
SNORD109B-201ENST00000458961 CGRRF1Q99675 332 aa2.89□□□□□ -1.95
SNORD109B-201ENST00000458961 SCNM1Q9BWG6 230 aa2.89□□□□□ -1.95
SNORD109B-201ENST00000458961 TTLL2Q9BWV7 592 aa2.89□□□□□ -1.95
SNORD109B-201ENST00000458961 B3GNT5Q9BYG0 378 aa2.89□□□□□ -1.95
SNORD109B-201ENST00000458961 ELOVL4Q9GZR5 314 aa2.89□□□□□ -1.95
SNORD109B-201ENST00000458961 NACA2Q9H009 215 aa2.89□□□□□ -1.95
SNORD109B-201ENST00000458961 SLC32A1Q9H598 525 aa2.89□□□□□ -1.95
SNORD109B-201ENST00000458961 SMYD3Q9H7B4 428 aa2.89□□□□□ -1.95
SNORD109B-201ENST00000458961 CCSER2Q9H7U1 834 aa2.89□□□□□ -1.95
SNORD109B-201ENST00000458961 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP2.89□□□□□ -1.95
SNORD109B-201ENST00000458961 POLMQ9NP87 494 aaPredicted RBP2.89□□□□□ -1.95
SNORD109B-201ENST00000458961 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP2.89□□□□□ -1.95
SNORD109B-201ENST00000458961 OLFML3Q9NRN5 406 aa2.89□□□□□ -1.95
SNORD109B-201ENST00000458961 TMEM74BQ9NUR3 256 aa2.89□□□□□ -1.95
SNORD109B-201ENST00000458961 TMEM30AQ9NV96 361 aa2.89□□□□□ -1.95
SNORD109B-201ENST00000458961 EHD2Q9NZN4 543 aa2.89□□□□□ -1.95
SNORD109B-201ENST00000458961 GMIPQ9P107 970 aa2.89□□□□□ -1.95
SNORD109B-201ENST00000458961 CALCOCO1Q9P1Z2 691 aa2.89□□□□□ -1.95
SNORD109B-201ENST00000458961 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP2.89□□□□□ -1.95
SNORD109B-201ENST00000458961 CHORDC1Q9UHD1 332 aaPredicted RBP2.89□□□□□ -1.95
SNORD109B-201ENST00000458961 KLK13Q9UKR3 277 aa2.89□□□□□ -1.95
SNORD109B-201ENST00000458961 SH3BP1Q9Y3L3 701 aa2.89□□□□□ -1.95
SNORD109B-201ENST00000458961 SRPRBQ9Y5M8 271 aaKnown RBP2.89□□□□□ -1.95
SNORD109B-201ENST00000458961 DMXL2Q8TDJ6 3036 aa2.89□□□□□ -1.95
SNORD109B-201ENST00000458961 ATP8B3O60423 1300 aa2.89□□□□□ -1.95
SNORD109B-201ENST00000458961 FAM208BQ5VWN6 2430 aa2.89□□□□□ -1.95
SNORD109B-201ENST00000458961 BAHCC1Q9P281 2608 aa2.89□□□□□ -1.95
SNORD109B-201ENST00000458961 CACNA1EQ15878 2313 aa2.88□□□□□ -1.95
SNORD109B-201ENST00000458961 E2F8A0AVK6 867 aa2.88□□□□□ -1.95
SNORD109B-201ENST00000458961 SRRM3A6NNA2 597 aaPredicted RBP2.88□□□□□ -1.95
SNORD109B-201ENST00000458961 NEDD8-MDP1E9PL57 170 aa2.88□□□□□ -1.95
SNORD109B-201ENST00000458961 TNFRSF10BO14763 440 aa2.88□□□□□ -1.95
SNORD109B-201ENST00000458961 KIAA0391O15091 583 aaKnown RBP2.88□□□□□ -1.95
SNORD109B-201ENST00000458961 MDM4O15151 490 aa2.88□□□□□ -1.95
SNORD109B-201ENST00000458961 ZBTB24O43167 697 aaPredicted RBP2.88□□□□□ -1.95
SNORD109B-201ENST00000458961 TGFB1I1O43294 461 aa2.88□□□□□ -1.95
SNORD109B-201ENST00000458961 AP5Z1O43299 807 aa2.88□□□□□ -1.95
SNORD109B-201ENST00000458961 EXOC3O60645 756 aa2.88□□□□□ -1.95
SNORD109B-201ENST00000458961 OPHN1O60890 802 aa2.88□□□□□ -1.95
SNORD109B-201ENST00000458961 NDUFS2O75306 463 aa2.88□□□□□ -1.95
SNORD109B-201ENST00000458961 TULP3O75386 442 aa2.88□□□□□ -1.95
SNORD109B-201ENST00000458961 TACC1O75410 805 aa2.88□□□□□ -1.95
SNORD109B-201ENST00000458961 AP1G2O75843 785 aa2.88□□□□□ -1.95
SNORD109B-201ENST00000458961 RTN3O95197 1032 aaPredicted RBP2.88□□□□□ -1.95
SNORD109B-201ENST00000458961 OLFM2O95897 454 aa2.88□□□□□ -1.95
SNORD109B-201ENST00000458961 TBX18O95935 607 aa2.88□□□□□ -1.95
SNORD109B-201ENST00000458961 OAS1P00973 400 aaKnown RBP2.88□□□□□ -1.95
SNORD109B-201ENST00000458961 CHRM1P11229 460 aaPredicted RBP2.88□□□□□ -1.95
SNORD109B-201ENST00000458961 CCDC130P13994 396 aa2.88□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.2 ms