RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000444040.6

SHQ1-202, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor, humanhuman

TSL 2

Gene SHQ1, Length 2,844 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHQ1-202ENST00000444040 TFDP2Q14188 446 aa16.71■□□□□ 0.27
SHQ1-202ENST00000444040 CDO1Q16878 200 aa16.71■□□□□ 0.27
SHQ1-202ENST00000444040 ZNF792Q3KQV3 632 aa16.71■□□□□ 0.27
SHQ1-202ENST00000444040 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP16.71■□□□□ 0.271e-6■□□□□ 9.8
SHQ1-202ENST00000444040 THOC1Q96FV9 657 aaKnown RBP16.71■□□□□ 0.27
SHQ1-202ENST00000444040 CHMP2BQ9UQN3 213 aa16.71■□□□□ 0.27
SHQ1-202ENST00000444040 TEX264Q9Y6I9 313 aa16.71■□□□□ 0.27
SHQ1-202ENST00000444040 HGSO14964 777 aaPredicted RBP16.7■□□□□ 0.26
SHQ1-202ENST00000444040 PRPSAP2O60256 369 aa16.7■□□□□ 0.26
SHQ1-202ENST00000444040 UNC5CO95185 931 aa16.7■□□□□ 0.26
SHQ1-202ENST00000444040 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP16.7■□□□□ 0.26
SHQ1-202ENST00000444040 PPP1R26Q5T8A7 1209 aaPredicted RBP16.7■□□□□ 0.26
SHQ1-202ENST00000444040 HHATQ5VTY9 493 aa16.7■□□□□ 0.26
SHQ1-202ENST00000444040 PMF1Q6P1K2 205 aa16.7■□□□□ 0.26
SHQ1-202ENST00000444040 OLFML1Q6UWY5 402 aa16.7■□□□□ 0.26
SHQ1-202ENST00000444040 KIF2BQ8N4N8 673 aa16.7■□□□□ 0.26
SHQ1-202ENST00000444040 BANPQ8N9N5 519 aa16.7■□□□□ 0.26
SHQ1-202ENST00000444040 NLRP7Q8WX94 980 aa16.7■□□□□ 0.26
SHQ1-202ENST00000444040 ZNF75CPQ92670 426 aaPredicted RBP16.7■□□□□ 0.26
SHQ1-202ENST00000444040 MIS12Q9H081 205 aa16.7■□□□□ 0.26
SHQ1-202ENST00000444040 CXCL16Q9H2A7 254 aa16.7■□□□□ 0.26
SHQ1-202ENST00000444040 CYLDQ9NQC7 956 aa16.7■□□□□ 0.26
SHQ1-202ENST00000444040 TRIM33Q9UPN9 1127 aa16.7■□□□□ 0.26
SHQ1-202ENST00000444040 CHKBQ9Y259 395 aa16.7■□□□□ 0.26
SHQ1-202ENST00000444040 USH1CQ9Y6N9 552 aa16.7■□□□□ 0.26
SHQ1-202ENST00000444040 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP16.7■□□□□ 0.26
SHQ1-202ENST00000444040 DPYSL4O14531 572 aa16.7■□□□□ 0.26
SHQ1-202ENST00000444040 KRT16P08779 473 aa16.7■□□□□ 0.26
SHQ1-202ENST00000444040 CYP2C8P10632 490 aa16.7■□□□□ 0.26
SHQ1-202ENST00000444040 ALADP13716 330 aa16.7■□□□□ 0.26
SHQ1-202ENST00000444040 GJA5P36382 358 aa16.7■□□□□ 0.26
SHQ1-202ENST00000444040 TTC30AQ86WT1 665 aa16.7■□□□□ 0.26
SHQ1-202ENST00000444040 PLD5Q8N7P1 536 aa16.7■□□□□ 0.26
SHQ1-202ENST00000444040 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP16.7■□□□□ 0.26
SHQ1-202ENST00000444040 KIF12Q96FN5 646 aa16.7■□□□□ 0.26
SHQ1-202ENST00000444040 CYTH2Q99418 400 aa16.7■□□□□ 0.26
SHQ1-202ENST00000444040 MYLK2Q9H1R3 596 aa16.7■□□□□ 0.26
SHQ1-202ENST00000444040 SBF1O95248 1867 aa16.7■□□□□ 0.26
SHQ1-202ENST00000444040 ADRA1DP25100 572 aa16.69■□□□□ 0.26
SHQ1-202ENST00000444040 SLC8A1P32418 973 aa16.69■□□□□ 0.26
SHQ1-202ENST00000444040 GRM5P41594 1212 aa16.69■□□□□ 0.26
SHQ1-202ENST00000444040 RGS7P49802 495 aa16.69■□□□□ 0.26
SHQ1-202ENST00000444040 STILQ15468 1287 aa16.69■□□□□ 0.26
SHQ1-202ENST00000444040 GOLGA7BQ2TAP0 167 aa16.69■□□□□ 0.26
SHQ1-202ENST00000444040 MARCH8Q5T0T0 291 aa16.69■□□□□ 0.26
SHQ1-202ENST00000444040 FAM182AQ5T1J6 154 aa16.69■□□□□ 0.26
SHQ1-202ENST00000444040 AGGF1Q8N302 714 aaeCLIP16.69■□□□□ 0.26
SHQ1-202ENST00000444040 PQLC3Q8N755 202 aa16.69■□□□□ 0.26
SHQ1-202ENST00000444040 C10orf82Q8WW14 230 aa16.69■□□□□ 0.26
SHQ1-202ENST00000444040 RTP4Q96DX8 246 aa16.69■□□□□ 0.26
SHQ1-202ENST00000444040 NME7Q9Y5B8 376 aa16.69■□□□□ 0.26
SHQ1-202ENST00000444040 TCRBV9S1A1TA0A576 114 aa16.69■□□□□ 0.26
SHQ1-202ENST00000444040 CHADO15335 359 aa16.69■□□□□ 0.26
SHQ1-202ENST00000444040 ATP11AP98196 1134 aa16.69■□□□□ 0.26
SHQ1-202ENST00000444040 PDK2Q15119 407 aa16.69■□□□□ 0.26
SHQ1-202ENST00000444040 BOLA3Q53S33 107 aa16.69■□□□□ 0.26
SHQ1-202ENST00000444040 C1orf228Q6PIY5 440 aa16.69■□□□□ 0.26
SHQ1-202ENST00000444040 OTOAQ7RTW8 1153 aa16.69■□□□□ 0.26
SHQ1-202ENST00000444040 CCDC125Q86Z20 511 aa16.69■□□□□ 0.26
SHQ1-202ENST00000444040 TCP10LQ8TDR4 215 aa16.69■□□□□ 0.26
SHQ1-202ENST00000444040 USP6NLQ92738 828 aa16.69■□□□□ 0.26
SHQ1-202ENST00000444040 ALKBH8Q96BT7 664 aaKnown RBP16.69■□□□□ 0.26
SHQ1-202ENST00000444040 MRPL45Q9BRJ2 306 aaKnown RBP16.69■□□□□ 0.26
SHQ1-202ENST00000444040 SLC4A5Q9BY07 1137 aa16.69■□□□□ 0.26
SHQ1-202ENST00000444040 KATNBL1Q9H079 304 aa16.69■□□□□ 0.26
SHQ1-202ENST00000444040 VTA1Q9NP79 307 aa16.69■□□□□ 0.26
SHQ1-202ENST00000444040 H3BRB1 525 aa16.69■□□□□ 0.26
SHQ1-202ENST00000444040 GABBR2O75899 941 aa16.69■□□□□ 0.26
SHQ1-202ENST00000444040 ATP2A2P16615 1042 aaKnown RBP16.69■□□□□ 0.26
SHQ1-202ENST00000444040 ADCYAP1R1P41586 468 aa16.69■□□□□ 0.26
SHQ1-202ENST00000444040 TMEM110Q86TL2 294 aa16.69■□□□□ 0.26
SHQ1-202ENST00000444040 CEP57Q86XR8 500 aa16.69■□□□□ 0.26
SHQ1-202ENST00000444040 MAP7D3Q8IWC1 876 aa16.69■□□□□ 0.26
SHQ1-202ENST00000444040 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP16.69■□□□□ 0.26
SHQ1-202ENST00000444040 PCDH18Q9HCL0 1135 aa16.69■□□□□ 0.26
SHQ1-202ENST00000444040 GPATCH2LQ9NWQ4 482 aa16.69■□□□□ 0.26
SHQ1-202ENST00000444040 KBTBD13C9JR72 458 aa16.68■□□□□ 0.26
SHQ1-202ENST00000444040 H7C0C1 242 aa16.68■□□□□ 0.26
SHQ1-202ENST00000444040 TM9SF1O15321 606 aa16.68■□□□□ 0.26
SHQ1-202ENST00000444040 ATP5OP48047 213 aa16.68■□□□□ 0.26
SHQ1-202ENST00000444040 SLC9A4Q6AI14 798 aa16.68■□□□□ 0.26
SHQ1-202ENST00000444040 TRAF3IP1Q8TDR0 691 aaPredicted RBP16.68■□□□□ 0.26
SHQ1-202ENST00000444040 SLC35F5Q8WV83 523 aa16.68■□□□□ 0.26
SHQ1-202ENST00000444040 TEKT4Q8WW24 435 aa16.68■□□□□ 0.26
SHQ1-202ENST00000444040 ERP27Q96DN0 273 aa16.68■□□□□ 0.26
SHQ1-202ENST00000444040 KLF6Q99612 283 aaPredicted RBP16.68■□□□□ 0.26
SHQ1-202ENST00000444040 C12orf65Q9H3J6 166 aaKnown RBP16.68■□□□□ 0.26
SHQ1-202ENST00000444040 PAK5Q9P286 719 aa16.68■□□□□ 0.26
SHQ1-202ENST00000444040 PLXNA1Q9UIW2 1896 aa16.68■□□□□ 0.26
SHQ1-202ENST00000444040 GOLGA8RI6L899 631 aa16.68■□□□□ 0.26
SHQ1-202ENST00000444040 PPEF2O14830 753 aa16.68■□□□□ 0.26
SHQ1-202ENST00000444040 AVILO75366 819 aa16.68■□□□□ 0.26
SHQ1-202ENST00000444040 C1QAP02745 245 aa16.68■□□□□ 0.26
SHQ1-202ENST00000444040 ADORA2AP29274 412 aa16.68■□□□□ 0.26
SHQ1-202ENST00000444040 GBP2P32456 591 aaPredicted RBP16.68■□□□□ 0.26
SHQ1-202ENST00000444040 SLC6A3Q01959 620 aa16.68■□□□□ 0.26
SHQ1-202ENST00000444040 KRT81Q14533 505 aa16.68■□□□□ 0.26
SHQ1-202ENST00000444040 CA9Q16790 459 aa16.68■□□□□ 0.26
SHQ1-202ENST00000444040 KBTBD12Q3ZCT8 623 aa16.68■□□□□ 0.26
SHQ1-202ENST00000444040 SYCP2LQ5T4T6 812 aa16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32 ms