RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000434982.2

ANKRD55-202, Transcript of ankyrin repeat domain 55, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene ANKRD55, Length 1,518 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD55-202ENST00000434982 SURF1Q15526 300 aa8.92□□□□□ -0.98
ANKRD55-202ENST00000434982 DUOXA2Q1HG44 320 aa8.92□□□□□ -0.98
ANKRD55-202ENST00000434982 SOWAHAQ2M3V2 549 aa8.92□□□□□ -0.98
ANKRD55-202ENST00000434982 ARHGAP15Q53QZ3 475 aa8.92□□□□□ -0.98
ANKRD55-202ENST00000434982 ZNF852Q6ZMS4 543 aa8.92□□□□□ -0.98
ANKRD55-202ENST00000434982 Q6ZNB5 142 aa8.92□□□□□ -0.98
ANKRD55-202ENST00000434982 WDR49Q8IV35 697 aa8.92□□□□□ -0.98
ANKRD55-202ENST00000434982 ADGRF2Q8IZF7 708 aa8.92□□□□□ -0.98
ANKRD55-202ENST00000434982 MAML2Q8IZL2 1156 aaPredicted RBP8.92□□□□□ -0.98
ANKRD55-202ENST00000434982 TOP6BLQ8N6T0 577 aa8.92□□□□□ -0.98
ANKRD55-202ENST00000434982 DEPDC1BQ8WUY9 529 aa8.92□□□□□ -0.98
ANKRD55-202ENST00000434982 DNASE1L2Q92874 299 aa8.92□□□□□ -0.98
ANKRD55-202ENST00000434982 NKD2Q969F2 451 aaPredicted RBP8.92□□□□□ -0.98
ANKRD55-202ENST00000434982 PAGE5Q96GU1 130 aa8.92□□□□□ -0.98
ANKRD55-202ENST00000434982 HPDLQ96IR7 371 aa8.92□□□□□ -0.98
ANKRD55-202ENST00000434982 ZFYVE19Q96K21 471 aa8.92□□□□□ -0.98
ANKRD55-202ENST00000434982 SPATA32Q96LK8 384 aa8.92□□□□□ -0.98
ANKRD55-202ENST00000434982 LRRC3BQ96PB8 259 aa8.92□□□□□ -0.98
ANKRD55-202ENST00000434982 GCNAQ96QF7 691 aa8.92□□□□□ -0.98
ANKRD55-202ENST00000434982 FNBP1Q96RU3 617 aa8.92□□□□□ -0.98
ANKRD55-202ENST00000434982 KIAA1586Q9HCI6 787 aa8.92□□□□□ -0.98
ANKRD55-202ENST00000434982 GDAP2Q9NXN4 497 aa8.92□□□□□ -0.98
ANKRD55-202ENST00000434982 FOXD3Q9UJU5 478 aaPredicted RBP8.92□□□□□ -0.98
ANKRD55-202ENST00000434982 PIAS3Q9Y6X2 628 aa8.92□□□□□ -0.98
ANKRD55-202ENST00000434982 UBE4BO95155 1302 aa8.91□□□□□ -0.98
ANKRD55-202ENST00000434982 MYBPHLA2RUH7 354 aa8.91□□□□□ -0.98
ANKRD55-202ENST00000434982 EIF1AYO14602 144 aaKnown RBP8.91□□□□□ -0.98
ANKRD55-202ENST00000434982 KLRC4O43908 158 aa8.91□□□□□ -0.98
ANKRD55-202ENST00000434982 PRAMEF12O95522 483 aa8.91□□□□□ -0.98
ANKRD55-202ENST00000434982 FGF19O95750 216 aa8.91□□□□□ -0.98
ANKRD55-202ENST00000434982 PDGFRBP09619 1106 aa8.91□□□□□ -0.98
ANKRD55-202ENST00000434982 SLFN14P0C7P3 912 aa8.91□□□□□ -0.98
ANKRD55-202ENST00000434982 HMGA1P17096 107 aaKnown RBP8.91□□□□□ -0.98
ANKRD55-202ENST00000434982 CDC25CP30307 473 aa8.91□□□□□ -0.98
ANKRD55-202ENST00000434982 SOX9P48436 509 aa8.91□□□□□ -0.98
ANKRD55-202ENST00000434982 PSMC1P62191 440 aaKnown RBP8.91□□□□□ -0.98
ANKRD55-202ENST00000434982 CYP24A1Q07973 514 aa8.91□□□□□ -0.98
ANKRD55-202ENST00000434982 STK4Q13043 487 aa8.91□□□□□ -0.98
ANKRD55-202ENST00000434982 FZD5Q13467 585 aa8.91□□□□□ -0.98
ANKRD55-202ENST00000434982 HS2ST1Q7LGA3 356 aa8.91□□□□□ -0.98
ANKRD55-202ENST00000434982 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa8.91□□□□□ -0.98
ANKRD55-202ENST00000434982 ZNF438Q7Z4V0 828 aa8.91□□□□□ -0.98
ANKRD55-202ENST00000434982 SPATA2LQ8IUW3 424 aaPredicted RBP8.91□□□□□ -0.98
ANKRD55-202ENST00000434982 XXYLT1Q8NBI6 393 aa8.91□□□□□ -0.98
ANKRD55-202ENST00000434982 CSGALNACT1Q8TDX6 532 aa8.91□□□□□ -0.98
ANKRD55-202ENST00000434982 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP8.91□□□□□ -0.98
ANKRD55-202ENST00000434982 KBTBD7Q8WVZ9 684 aa8.91□□□□□ -0.98
ANKRD55-202ENST00000434982 FAM3CQ92520 227 aa8.91□□□□□ -0.98
ANKRD55-202ENST00000434982 E2F7Q96AV8 911 aa8.91□□□□□ -0.98
ANKRD55-202ENST00000434982 MMS19Q96T76 1030 aa8.91□□□□□ -0.98
ANKRD55-202ENST00000434982 PKMYT1Q99640 499 aa8.91□□□□□ -0.98
ANKRD55-202ENST00000434982 CGRRF1Q99675 332 aa8.91□□□□□ -0.98
ANKRD55-202ENST00000434982 SLC46A2Q9BY10 475 aa8.91□□□□□ -0.98
ANKRD55-202ENST00000434982 OSBPL6Q9BZF3 934 aa8.91□□□□□ -0.98
ANKRD55-202ENST00000434982 TASP1Q9H6P5 420 aa8.91□□□□□ -0.98
ANKRD55-202ENST00000434982 MIA3Q5JRA6 1907 aa8.91□□□□□ -0.98
ANKRD55-202ENST00000434982 PIEZO1Q92508 2521 aa8.91□□□□□ -0.98
ANKRD55-202ENST00000434982 TICRRQ7Z2Z1 1910 aa8.9□□□□□ -0.98
ANKRD55-202ENST00000434982 SLC38A8A6NNN8 435 aa8.9□□□□□ -0.98
ANKRD55-202ENST00000434982 ARNTLO00327 626 aa8.9□□□□□ -0.98
ANKRD55-202ENST00000434982 MAN2B1O00754 1011 aa8.9□□□□□ -0.98
ANKRD55-202ENST00000434982 GABRDO14764 452 aa8.9□□□□□ -0.98
ANKRD55-202ENST00000434982 KHNYNO15037 678 aaKnown RBP8.9□□□□□ -0.98
ANKRD55-202ENST00000434982 CHADO15335 359 aa8.9□□□□□ -0.98
ANKRD55-202ENST00000434982 LAMTOR5O43504 91 aa8.9□□□□□ -0.98
ANKRD55-202ENST00000434982 EXOC3O60645 756 aa8.9□□□□□ -0.98
ANKRD55-202ENST00000434982 CMA1P23946 247 aa8.9□□□□□ -0.98
ANKRD55-202ENST00000434982 CCNE1P24864 410 aa8.9□□□□□ -0.98
ANKRD55-202ENST00000434982 LHX1P48742 406 aa8.9□□□□□ -0.98
ANKRD55-202ENST00000434982 CASP4P49662 377 aa8.9□□□□□ -0.98
ANKRD55-202ENST00000434982 KPNA1P52294 538 aaPredicted RBP8.9□□□□□ -0.98
ANKRD55-202ENST00000434982 NLRP12P59046 1061 aa8.9□□□□□ -0.98
ANKRD55-202ENST00000434982 SNRPFP62306 86 aaKnown RBP8.9□□□□□ -0.98
ANKRD55-202ENST00000434982 KRT85P78386 507 aa8.9□□□□□ -0.98
ANKRD55-202ENST00000434982 CSTF1Q05048 431 aaKnown RBP8.9□□□□□ -0.98
ANKRD55-202ENST00000434982 PSMD6Q15008 389 aa8.9□□□□□ -0.98
ANKRD55-202ENST00000434982 NFE2Q16621 373 aaPredicted RBP8.9□□□□□ -0.98
ANKRD55-202ENST00000434982 KNOP1Q1ED39 458 aaKnown RBP8.9□□□□□ -0.98
ANKRD55-202ENST00000434982 BMT2Q1RMZ1 405 aa8.9□□□□□ -0.98
ANKRD55-202ENST00000434982 TXNDC8Q6A555 127 aa8.9□□□□□ -0.98
ANKRD55-202ENST00000434982 TSSK4Q6SA08 328 aa8.9□□□□□ -0.98
ANKRD55-202ENST00000434982 TMEM150AQ86TG1 271 aa8.9□□□□□ -0.98
ANKRD55-202ENST00000434982 SCN4BQ8IWT1 228 aa8.9□□□□□ -0.98
ANKRD55-202ENST00000434982 MAB21L3Q8N8X9 362 aa8.9□□□□□ -0.98
ANKRD55-202ENST00000434982 KIAA0895Q8NCT3 520 aa8.9□□□□□ -0.98
ANKRD55-202ENST00000434982 TTC16Q8NEE8 873 aa8.9□□□□□ -0.98
ANKRD55-202ENST00000434982 MYLPFQ96A32 169 aa8.9□□□□□ -0.98
ANKRD55-202ENST00000434982 CLDN23Q96B33 292 aa8.9□□□□□ -0.98
ANKRD55-202ENST00000434982 ELMO3Q96BJ8 720 aa8.9□□□□□ -0.98
ANKRD55-202ENST00000434982 NELL2Q99435 816 aa8.9□□□□□ -0.98
ANKRD55-202ENST00000434982 SYT15Q9BQS2 421 aa8.9□□□□□ -0.98
ANKRD55-202ENST00000434982 MRPL45Q9BRJ2 306 aaKnown RBP8.9□□□□□ -0.98
ANKRD55-202ENST00000434982 GSX2Q9BZM3 304 aa8.9□□□□□ -0.98
ANKRD55-202ENST00000434982 LMAN1LQ9HAT1 526 aa8.9□□□□□ -0.98
ANKRD55-202ENST00000434982 CRTAC1Q9NQ79 661 aa8.9□□□□□ -0.98
ANKRD55-202ENST00000434982 EXOC1Q9NV70 894 aa8.9□□□□□ -0.98
ANKRD55-202ENST00000434982 GTSE1Q9NYZ3 720 aa8.9□□□□□ -0.98
ANKRD55-202ENST00000434982 MRPS17Q9Y2R5 130 aaKnown RBP8.9□□□□□ -0.98
ANKRD55-202ENST00000434982 VPS13AQ96RL7 3174 aa8.9□□□□□ -0.98
ANKRD55-202ENST00000434982 CACNA1HO95180 2353 aa8.9□□□□□ -0.98
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.4 ms