RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428064.5

LIMS1-208, Transcript of LIM zinc finger domain containing 1, humanhuman

TSL 2

Gene LIMS1, Length 637 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMS1-208ENST00000428064 SLC5A3P53794 718 aa22.26■■□□□ 1.15
LIMS1-208ENST00000428064 SCARA5Q6ZMJ2 495 aa22.26■■□□□ 1.15
LIMS1-208ENST00000428064 SV2AQ7L0J3 742 aa22.26■■□□□ 1.15
LIMS1-208ENST00000428064 KBTBD6Q86V97 674 aa22.26■■□□□ 1.15
LIMS1-208ENST00000428064 CRYBG2Q8N1P7 616 aa22.26■■□□□ 1.15
LIMS1-208ENST00000428064 USP33Q8TEY7 942 aa22.26■■□□□ 1.15
LIMS1-208ENST00000428064 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
LIMS1-208ENST00000428064 OTUB2Q96DC9 234 aa22.26■■□□□ 1.15
LIMS1-208ENST00000428064 ZFRQ96KR1 1074 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
LIMS1-208ENST00000428064 MED10Q9BTT4 135 aa22.26■■□□□ 1.15
LIMS1-208ENST00000428064 TBC1D14Q9P2M4 693 aa22.26■■□□□ 1.15
LIMS1-208ENST00000428064 ZDHHC9Q9Y397 364 aa22.26■■□□□ 1.15
LIMS1-208ENST00000428064 LOC105378220A0A1B0GUY1 285 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
LIMS1-208ENST00000428064 K7EQS6 105 aa22.25■■□□□ 1.15
LIMS1-208ENST00000428064 CLSTN1O94985 981 aa22.25■■□□□ 1.15
LIMS1-208ENST00000428064 MBL2P11226 248 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
LIMS1-208ENST00000428064 ASPAP45381 313 aa22.25■■□□□ 1.15
LIMS1-208ENST00000428064 LIMK1P53667 647 aa22.25■■□□□ 1.15
LIMS1-208ENST00000428064 DHCR24Q15392 516 aa22.25■■□□□ 1.15
LIMS1-208ENST00000428064 C1orf220Q5T0J3 134 aa22.25■■□□□ 1.15
LIMS1-208ENST00000428064 KRT82Q9NSB4 513 aa22.25■■□□□ 1.15
LIMS1-208ENST00000428064 SMPD4Q9NXE4 827 aa22.25■■□□□ 1.15
LIMS1-208ENST00000428064 CFAP97Q9P2B7 532 aa22.25■■□□□ 1.15
LIMS1-208ENST00000428064 ATG2BQ96BY7 2078 aa22.24■■□□□ 1.15
LIMS1-208ENST00000428064 COCHO43405 550 aa22.24■■□□□ 1.15
LIMS1-208ENST00000428064 ADH1CP00326 375 aa22.24■■□□□ 1.15
LIMS1-208ENST00000428064 ZNF806P0C7X5 589 aa22.24■■□□□ 1.15
LIMS1-208ENST00000428064 NDUFA8P51970 172 aa22.24■■□□□ 1.15
LIMS1-208ENST00000428064 DPYDQ12882 1025 aa22.24■■□□□ 1.15
LIMS1-208ENST00000428064 IFRD2Q12894 506 aaPredicted RBP22.24■■□□□ 1.15
LIMS1-208ENST00000428064 HSF5Q4G112 596 aaPredicted RBP22.24■■□□□ 1.15
LIMS1-208ENST00000428064 PLA2G2CQ5R387 149 aa22.24■■□□□ 1.15
LIMS1-208ENST00000428064 HECTD3Q5T447 861 aa22.24■■□□□ 1.15
LIMS1-208ENST00000428064 CEP135Q66GS9 1140 aa22.24■■□□□ 1.15
LIMS1-208ENST00000428064 INTS8Q75QN2 995 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
LIMS1-208ENST00000428064 ACOT1Q86TX2 421 aa22.24■■□□□ 1.15
LIMS1-208ENST00000428064 SCAMP5Q8TAC9 235 aa22.24■■□□□ 1.15
LIMS1-208ENST00000428064 SCAND2PQ9GZW5 306 aaPredicted RBP22.24■■□□□ 1.15
LIMS1-208ENST00000428064 ARRDC1-AS1Q9H2J1 176 aa22.24■■□□□ 1.15
LIMS1-208ENST00000428064 POLR3BQ9NW08 1133 aaPredicted RBP22.24■■□□□ 1.15
LIMS1-208ENST00000428064 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa22.24■■□□□ 1.15
LIMS1-208ENST00000428064 A0A0A0MRY4 1105 aa22.23■■□□□ 1.15
LIMS1-208ENST00000428064 A0A1W2PQ27 194 aa22.23■■□□□ 1.15
LIMS1-208ENST00000428064 A0A1W2PQ64 194 aa22.23■■□□□ 1.15
LIMS1-208ENST00000428064 A0A1W2PQD8 194 aa22.23■■□□□ 1.15
LIMS1-208ENST00000428064 AP1G2O75843 785 aa22.23■■□□□ 1.15
LIMS1-208ENST00000428064 TRIM21P19474 475 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
LIMS1-208ENST00000428064 NR2F2P24468 414 aa22.23■■□□□ 1.15
LIMS1-208ENST00000428064 PIK3CAP42336 1068 aa22.23■■□□□ 1.15
LIMS1-208ENST00000428064 VAMP7P51809 220 aa22.23■■□□□ 1.15
LIMS1-208ENST00000428064 NDST1P52848 882 aa22.23■■□□□ 1.15
LIMS1-208ENST00000428064 MCCD1P59942 119 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
LIMS1-208ENST00000428064 MRPS21P82921 87 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
LIMS1-208ENST00000428064 INCA1Q0VD86 236 aa22.23■■□□□ 1.15
LIMS1-208ENST00000428064 PLK5Q496M5 336 aa22.23■■□□□ 1.15
LIMS1-208ENST00000428064 RHBDF2Q6PJF5 856 aa22.23■■□□□ 1.15
LIMS1-208ENST00000428064 C11orf74Q86VG3 221 aa22.23■■□□□ 1.15
LIMS1-208ENST00000428064 RASSF3Q86WH2 238 aa22.23■■□□□ 1.15
LIMS1-208ENST00000428064 GUF1Q8N442 669 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
LIMS1-208ENST00000428064 ZMIZ2Q8NF64 920 aa22.23■■□□□ 1.15
LIMS1-208ENST00000428064 SMOQ99835 787 aa22.23■■□□□ 1.15
LIMS1-208ENST00000428064 FBXO44Q9H4M3 255 aa22.23■■□□□ 1.15
LIMS1-208ENST00000428064 MMP17Q9ULZ9 603 aa22.23■■□□□ 1.15
LIMS1-208ENST00000428064 PALM2-AKAP2B1ALY0 433 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
LIMS1-208ENST00000428064 HLA-DRAP01903 254 aa22.22■■□□□ 1.15
LIMS1-208ENST00000428064 PRR29P0C7W0 189 aa22.22■■□□□ 1.15
LIMS1-208ENST00000428064 ADH5P11766 374 aa22.22■■□□□ 1.15
LIMS1-208ENST00000428064 CCDC130P13994 396 aa22.22■■□□□ 1.15
LIMS1-208ENST00000428064 TSTD1Q8NFU3 115 aa22.22■■□□□ 1.15
LIMS1-208ENST00000428064 SLC2A14Q8TDB8 520 aa22.22■■□□□ 1.15
LIMS1-208ENST00000428064 PNKPQ96T60 521 aa22.22■■□□□ 1.15
LIMS1-208ENST00000428064 IMPG2Q9BZV3 1241 aa22.22■■□□□ 1.15
LIMS1-208ENST00000428064 DUSP15Q9H1R2 295 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
LIMS1-208ENST00000428064 PNPLA8Q9NP80 782 aa22.22■■□□□ 1.15
LIMS1-208ENST00000428064 HMGXB4Q9UGU5 601 aa22.22■■□□□ 1.15
LIMS1-208ENST00000428064 CHORDC1Q9UHD1 332 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
LIMS1-208ENST00000428064 NCOR2Q9Y618 2525 aa22.21■■□□□ 1.15
LIMS1-208ENST00000428064 DCDC2BA2VCK2 349 aa22.21■■□□□ 1.15
LIMS1-208ENST00000428064 GDF9O60383 454 aa22.21■■□□□ 1.15
LIMS1-208ENST00000428064 CHRM1P11229 460 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
LIMS1-208ENST00000428064 ELF2Q15723 593 aa22.21■■□□□ 1.15
LIMS1-208ENST00000428064 KRBA2Q6ZNG9 492 aa22.21■■□□□ 1.15
LIMS1-208ENST00000428064 C12orf50Q8NA57 414 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
LIMS1-208ENST00000428064 DDX1Q92499 740 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
LIMS1-208ENST00000428064 ELMO3Q96BJ8 720 aa22.21■■□□□ 1.15
LIMS1-208ENST00000428064 CNOT6LQ96LI5 555 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
LIMS1-208ENST00000428064 CCSER2Q9H7U1 834 aa22.21■■□□□ 1.15
LIMS1-208ENST00000428064 CYP3A43Q9HB55 503 aa22.21■■□□□ 1.15
LIMS1-208ENST00000428064 GMIPQ9P107 970 aa22.21■■□□□ 1.15
LIMS1-208ENST00000428064 HOXC11O43248 304 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
LIMS1-208ENST00000428064 BEST1O76090 585 aa22.2■■□□□ 1.14
LIMS1-208ENST00000428064 RHOBTB1O94844 696 aa22.2■■□□□ 1.14
LIMS1-208ENST00000428064 KAT7O95251 611 aa22.2■■□□□ 1.14
LIMS1-208ENST00000428064 APODP05090 189 aa22.2■■□□□ 1.14
LIMS1-208ENST00000428064 RPL13P26373 211 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
LIMS1-208ENST00000428064 MPLP40238 635 aa22.2■■□□□ 1.14
LIMS1-208ENST00000428064 DGKEP52429 567 aa22.2■■□□□ 1.14
LIMS1-208ENST00000428064 GAD2Q05329 585 aa22.2■■□□□ 1.14
LIMS1-208ENST00000428064 CRY1Q16526 586 aa22.2■■□□□ 1.14
LIMS1-208ENST00000428064 AASDHQ4L235 1098 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
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