RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426951.5

RBM39-211, Transcript of RNA binding motif protein 39, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene RBM39, Length 840 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM39-211ENST00000426951 DNAJB11Q9UBS4 358 aa5.05□□□□□ -1.6
RBM39-211ENST00000426951 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
RBM39-211ENST00000426951 USP22Q9UPT9 525 aa5.05□□□□□ -1.6
RBM39-211ENST00000426951 DRG1Q9Y295 367 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
RBM39-211ENST00000426951 KAT6AQ92794 2004 aa5.05□□□□□ -1.6
RBM39-211ENST00000426951 CCDC151A5D8V7 595 aa5.04□□□□□ -1.6
RBM39-211ENST00000426951 ORC4O43929 436 aa5.04□□□□□ -1.6
RBM39-211ENST00000426951 RHOBTB3O94955 611 aa5.04□□□□□ -1.6
RBM39-211ENST00000426951 LDHAP00338 332 aaKnown RBP5.04□□□□□ -1.6
RBM39-211ENST00000426951 LMNAP02545 664 aaKnown RBP5.04□□□□□ -1.6
RBM39-211ENST00000426951 JUPP14923 745 aa5.04□□□□□ -1.6
RBM39-211ENST00000426951 NDUFB7P17568 137 aa5.04□□□□□ -1.6
RBM39-211ENST00000426951 ENGP17813 658 aa5.04□□□□□ -1.6
RBM39-211ENST00000426951 PCSK6P29122 969 aa5.04□□□□□ -1.6
RBM39-211ENST00000426951 CYP2C18P33260 490 aa5.04□□□□□ -1.6
RBM39-211ENST00000426951 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP5.04□□□□□ -1.6
RBM39-211ENST00000426951 TECP42680 631 aa5.04□□□□□ -1.6
RBM39-211ENST00000426951 FAXCQ5TGI0 409 aa5.04□□□□□ -1.6
RBM39-211ENST00000426951 RAP1GAP2Q684P5 730 aa5.04□□□□□ -1.6
RBM39-211ENST00000426951 MZT2AQ6P582 158 aa5.04□□□□□ -1.6
RBM39-211ENST00000426951 KIAA0408Q6ZU52 694 aa5.04□□□□□ -1.6
RBM39-211ENST00000426951 ZNF551Q7Z340 670 aaPredicted RBP5.04□□□□□ -1.6
RBM39-211ENST00000426951 C11orf44Q8N8P7 122 aa5.04□□□□□ -1.6
RBM39-211ENST00000426951 ZNF668Q96K58 619 aaPredicted RBP5.04□□□□□ -1.6
RBM39-211ENST00000426951 SNX27Q96L92 541 aa5.04□□□□□ -1.6
RBM39-211ENST00000426951 GDF15Q99988 308 aa5.04□□□□□ -1.6
RBM39-211ENST00000426951 VN1R3Q9BXE9 311 aa5.04□□□□□ -1.6
RBM39-211ENST00000426951 EIF2AQ9BY44 585 aaKnown RBP5.04□□□□□ -1.6
RBM39-211ENST00000426951 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP5.04□□□□□ -1.6
RBM39-211ENST00000426951 IKZF4Q9H2S9 585 aa5.04□□□□□ -1.6
RBM39-211ENST00000426951 SERTAD4Q9NUC0 356 aa5.04□□□□□ -1.6
RBM39-211ENST00000426951 RGL1Q9NZL6 768 aa5.04□□□□□ -1.6
RBM39-211ENST00000426951 ZMYND8Q9ULU4 1186 aaPredicted RBP5.04□□□□□ -1.6
RBM39-211ENST00000426951 LRCH1Q9Y2L9 728 aa5.04□□□□□ -1.6
RBM39-211ENST00000426951 DMRT1Q9Y5R6 373 aa5.04□□□□□ -1.6
RBM39-211ENST00000426951 COMMD10Q9Y6G5 202 aa5.04□□□□□ -1.6
RBM39-211ENST00000426951 F5H423 210 aaPredicted RBP5.03□□□□□ -1.6
RBM39-211ENST00000426951 AP4M1O00189 453 aa5.03□□□□□ -1.6
RBM39-211ENST00000426951 PSMD9O00233 223 aa5.03□□□□□ -1.6
RBM39-211ENST00000426951 EXOC5O00471 708 aa5.03□□□□□ -1.6
RBM39-211ENST00000426951 KCNQ3O43525 872 aa5.03□□□□□ -1.6
RBM39-211ENST00000426951 PLA2G6O60733 806 aa5.03□□□□□ -1.6
RBM39-211ENST00000426951 SNX2O60749 519 aa5.03□□□□□ -1.6
RBM39-211ENST00000426951 COQ9O75208 318 aa5.03□□□□□ -1.6
RBM39-211ENST00000426951 ONECUT2O95948 504 aa5.03□□□□□ -1.6
RBM39-211ENST00000426951 IDEP14735 1019 aa5.03□□□□□ -1.6
RBM39-211ENST00000426951 RARRES1P49788 294 aa5.03□□□□□ -1.6
RBM39-211ENST00000426951 TPTEP56180 551 aa5.03□□□□□ -1.6
RBM39-211ENST00000426951 TGFB2P61812 414 aa5.03□□□□□ -1.6
RBM39-211ENST00000426951 TIAL1Q01085 375 aaKnown RBP eCLIP5.03□□□□□ -1.61e-6■■□□□ 13.4
RBM39-211ENST00000426951 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP5.03□□□□□ -1.6
RBM39-211ENST00000426951 STARD3Q14849 445 aa5.03□□□□□ -1.6
RBM39-211ENST00000426951 GGT6Q6P531 493 aa5.03□□□□□ -1.6
RBM39-211ENST00000426951 PCSK4Q6UW60 755 aa5.03□□□□□ -1.6
RBM39-211ENST00000426951 OLFML1Q6UWY5 402 aa5.03□□□□□ -1.6
RBM39-211ENST00000426951 CLEC9AQ6UXN8 241 aa5.03□□□□□ -1.6
RBM39-211ENST00000426951 CCDC28AQ8IWP9 274 aa5.03□□□□□ -1.6
RBM39-211ENST00000426951 MUL1Q969V5 352 aa5.03□□□□□ -1.6
RBM39-211ENST00000426951 CHFRQ96EP1 664 aa5.03□□□□□ -1.6
RBM39-211ENST00000426951 FAM227BQ96M60 508 aa5.03□□□□□ -1.6
RBM39-211ENST00000426951 CRB3Q9BUF7 120 aa5.03□□□□□ -1.6
RBM39-211ENST00000426951 SELENOOQ9BVL4 669 aa5.03□□□□□ -1.6
RBM39-211ENST00000426951 WDR12Q9GZL7 423 aaKnown RBP5.03□□□□□ -1.6
RBM39-211ENST00000426951 ZBTB26Q9HCK0 441 aa5.03□□□□□ -1.6
RBM39-211ENST00000426951 IL17RBQ9NRM6 502 aa5.03□□□□□ -1.6
RBM39-211ENST00000426951 DLL3Q9NYJ7 618 aa5.03□□□□□ -1.6
RBM39-211ENST00000426951 SLC39A10Q9ULF5 831 aa5.03□□□□□ -1.6
RBM39-211ENST00000426951 MAGED2Q9UNF1 606 aaPredicted RBP5.03□□□□□ -1.6
RBM39-211ENST00000426951 SH2B3Q9UQQ2 575 aa5.03□□□□□ -1.6
RBM39-211ENST00000426951 ADAMTS3O15072 1205 aa5.02□□□□□ -1.61
RBM39-211ENST00000426951 ARP10275 920 aa5.02□□□□□ -1.61
RBM39-211ENST00000426951 PECAM1P16284 738 aaPredicted RBP5.02□□□□□ -1.61
RBM39-211ENST00000426951 EGR1P18146 543 aa5.02□□□□□ -1.61
RBM39-211ENST00000426951 MST1P26927 711 aa5.02□□□□□ -1.61
RBM39-211ENST00000426951 TIRAPP58753 221 aa5.02□□□□□ -1.61
RBM39-211ENST00000426951 GPS1Q13098 491 aa5.02□□□□□ -1.61
RBM39-211ENST00000426951 CYP1B1Q16678 543 aa5.02□□□□□ -1.61
RBM39-211ENST00000426951 ERCC6LQ2NKX8 1250 aa5.02□□□□□ -1.61
RBM39-211ENST00000426951 TSTD2Q5T7W7 516 aa5.02□□□□□ -1.61
RBM39-211ENST00000426951 USP17L6PQ6QN14 398 aa5.02□□□□□ -1.61
RBM39-211ENST00000426951 RASAL3Q86YV0 1011 aa5.02□□□□□ -1.61
RBM39-211ENST00000426951 CYP2W1Q8TAV3 490 aa5.02□□□□□ -1.61
RBM39-211ENST00000426951 CAGE1Q8TC20 777 aa5.02□□□□□ -1.61
RBM39-211ENST00000426951 IPO4Q8TEX9 1081 aaKnown RBP5.02□□□□□ -1.61
RBM39-211ENST00000426951 POF1BQ8WVV4 589 aa5.02□□□□□ -1.61
RBM39-211ENST00000426951 TMEM41AQ96HV5 264 aa5.02□□□□□ -1.61
RBM39-211ENST00000426951 PRR25Q96S07 402 aa5.02□□□□□ -1.61
RBM39-211ENST00000426951 HAPLN3Q96S86 360 aa5.02□□□□□ -1.61
RBM39-211ENST00000426951 TTLL2Q9BWV7 592 aa5.02□□□□□ -1.61
RBM39-211ENST00000426951 STK33Q9BYT3 514 aa5.02□□□□□ -1.61
RBM39-211ENST00000426951 WDR26Q9H7D7 661 aa5.02□□□□□ -1.61
RBM39-211ENST00000426951 VPS51Q9UID3 782 aa5.02□□□□□ -1.61
RBM39-211ENST00000426951 RIMKLBQ9ULI2 386 aa5.02□□□□□ -1.61
RBM39-211ENST00000426951 SLC27A6Q9Y2P4 619 aa5.02□□□□□ -1.61
RBM39-211ENST00000426951 A0A087WV62 115 aa5.01□□□□□ -1.61
RBM39-211ENST00000426951 H0YIZ8 118 aa5.01□□□□□ -1.61
RBM39-211ENST00000426951 QSOX1O00391 747 aa5.01□□□□□ -1.61
RBM39-211ENST00000426951 HNRNPDLO14979 420 aaKnown RBP5.01□□□□□ -1.61
RBM39-211ENST00000426951 FAM163BP0C2L3 166 aa5.01□□□□□ -1.61
RBM39-211ENST00000426951 RBL1P28749 1068 aa5.01□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.4 ms