RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000419445.5

PGGT1B-203, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PGGT1B, Length 9,545 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-203ENST00000419445 PLIN3O60664 434 aa3.79□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 CST8O60676 142 aa3.79□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 CCDC22O60826 627 aa3.79□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP3.79□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 PIK3CAP42336 1068 aa3.79□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP3.79□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 CLNS1AP54105 237 aaKnown RBP3.79□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 PDE1BQ01064 536 aa3.79□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 ROR2Q01974 943 aaKnown RBP3.79□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 APOFQ13790 326 aa3.79□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 XKR3Q5GH77 459 aa3.79□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 KCNT1Q5JUK3 1230 aa3.79□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 EMC1Q8N766 993 aa3.79□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 CYTH2Q99418 400 aa3.79□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 CCDC28BQ9BUN5 200 aa3.79□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 ZCWPW2A0A1B0GU75 182 aa3.79□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP3.79□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 PEX10O60683 326 aa3.79□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 PTPRAP18433 802 aa3.79□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 NF2P35240 595 aa3.79□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 BPIFB4P59827 614 aa3.79□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 IL9RQ01113 521 aa3.79□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 UGT2A3Q6UWM9 527 aa3.79□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 PPIL6Q8IXY8 311 aa3.79□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 MICAL1Q8TDZ2 1067 aa3.79□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 DNAJC9Q8WXX5 260 aa3.79□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 RBM41Q96IZ5 413 aaKnown RBP3.79□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 ETNK2Q9NVF9 386 aa3.79□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 ARMCX1Q9P291 453 aa3.79□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 MCM3APO60318 1980 aa3.78□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 MAFO75444 373 aaPredicted RBP3.78□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 RBP3P10745 1247 aa3.78□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 GLDCP23378 1020 aa3.78□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 HARS2P49590 506 aaKnown RBP3.78□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP3.78□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 GPS1Q13098 491 aa3.78□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 HP1BP3Q5SSJ5 553 aaPredicted RBP3.78□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 STXBP5Q5T5C0 1151 aa3.78□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP3.78□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 MAMDC4Q6UXC1 1216 aa3.78□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 UNC5AQ6ZN44 842 aa3.78□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 APBB1IPQ7Z5R6 666 aaPredicted RBP3.78□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 FBF1Q8TES7 1133 aa3.78□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 FAM167BQ9BTA0 163 aa3.78□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP3.78□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP3.78□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 SBDSQ9Y3A5 250 aaKnown RBP eCLIP3.78□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 SORBS2O94875 1100 aaKnown RBP3.78□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 ERBB2P04626 1255 aa3.78□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 SUPT20HL2P0C7V6 817 aa3.78□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 PCSK6P29122 969 aa3.78□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 MTTPP55157 894 aa3.78□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 NIPAL4Q0D2K0 466 aa3.78□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 CCNIQ14094 377 aa3.78□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa3.78□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 SEZ6Q53EL9 994 aa3.78□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 LBX2Q6XYB7 198 aa3.78□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 BHLHA9Q7RTU4 235 aa3.78□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 TMEM110Q86TL2 294 aa3.78□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 ALYREFQ86V81 257 aaKnown RBP3.78□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 CLPTM1LQ96KA5 538 aa3.78□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 ACO2Q99798 780 aaKnown RBP3.78□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 EPAS1Q99814 870 aa3.78□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 KCNK4Q9NYG8 393 aa3.78□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 HEY2Q9UBP5 337 aa3.78□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 ADAMTS6Q9UKP5 1117 aa3.78□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 C2CD2Q9Y426 696 aa3.78□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 GTF3C5Q9Y5Q8 519 aaPredicted RBP3.78□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 CLRN2A0PK11 232 aa3.78□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 ACOT8O14734 319 aa3.78□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 LGR5O75473 907 aa3.78□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 JUNP05412 331 aaKnown RBP3.78□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 SLC34A1Q06495 639 aa3.78□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 PDIA2Q13087 525 aaKnown RBP3.78□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 IHHQ14623 411 aa3.78□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 RINLQ6ZS11 566 aa3.78□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 METTL25Q8N6Q8 603 aa3.78□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 RIN3Q8TB24 985 aa3.78□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 KCNV2Q8TDN2 545 aa3.78□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 GRK7Q8WTQ7 553 aa3.78□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 CFAP57Q96MR6 1250 aa3.78□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 MCEEQ96PE7 176 aa3.78□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 NR1H4Q96RI1 486 aaPredicted RBP3.78□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 SENP6Q9GZR1 1112 aaPredicted RBP3.78□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 ANLNQ9NQW6 1124 aa3.78□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 AGO2Q9UKV8 859 aaKnown RBP3.78□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 CCPG1Q9ULG6 757 aa3.78□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 HBS1LQ9Y450 684 aaKnown RBP3.78□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 PRR5-ARHGAP8B1AHC4 643 aa3.78□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 BPGMP07738 259 aa3.78□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 NAMPTP43490 491 aa3.78□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 PSMD8P48556 350 aa3.78□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 ARHGAP8P85298 464 aa3.78□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 GBE1Q04446 702 aa3.78□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 NCOA4Q13772 614 aa3.78□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 TMED2Q15363 201 aa3.78□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 CWF19L1Q69YN2 538 aaKnown RBP3.78□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 FBXL19Q6PCT2 694 aa3.78□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa3.78□□□□□ -1.8
PGGT1B-203ENST00000419445 SLC26A11Q86WA9 606 aa3.78□□□□□ -1.8
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