RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000417536.5

SH3BP1-202, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP1, Length 2,858 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-202ENST00000417536 SERAC1Q96JX3 654 aa19.49■□□□□ 0.71
SH3BP1-202ENST00000417536 SPATA33Q96N06 139 aa19.49■□□□□ 0.71
SH3BP1-202ENST00000417536 TRIM55Q9BYV6 548 aa19.49■□□□□ 0.71
SH3BP1-202ENST00000417536 PHACTR1Q9C0D0 580 aa19.49■□□□□ 0.71
SH3BP1-202ENST00000417536 IKBKGQ9Y6K9 419 aa19.49■□□□□ 0.71
SH3BP1-202ENST00000417536 KBTBD13C9JR72 458 aa19.49■□□□□ 0.71
SH3BP1-202ENST00000417536 APOC4-APOC2K7ER74 178 aa19.49■□□□□ 0.71
SH3BP1-202ENST00000417536 TRAFD1O14545 582 aaPredicted RBP19.49■□□□□ 0.71
SH3BP1-202ENST00000417536 TNNC2P02585 160 aa19.49■□□□□ 0.71
SH3BP1-202ENST00000417536 APOC2P02655 101 aa19.49■□□□□ 0.71
SH3BP1-202ENST00000417536 TXNP10599 105 aaKnown RBP19.49■□□□□ 0.71
SH3BP1-202ENST00000417536 YWHAGP61981 247 aaKnown RBP eCLIP19.49■□□□□ 0.715e-10■■■■■ 34.7
SH3BP1-202ENST00000417536 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa19.49■□□□□ 0.71
SH3BP1-202ENST00000417536 KBTBD12Q3ZCT8 623 aa19.49■□□□□ 0.71
SH3BP1-202ENST00000417536 FRMD8P1Q9BZ68 369 aaPredicted RBP19.49■□□□□ 0.71
SH3BP1-202ENST00000417536 TRIM6Q9C030 488 aaPredicted RBP19.49■□□□□ 0.71
SH3BP1-202ENST00000417536 TCRBV9S1A1TA0A576 114 aa19.48■□□□□ 0.71
SH3BP1-202ENST00000417536 AVILO75366 819 aa19.48■□□□□ 0.71
SH3BP1-202ENST00000417536 FAAP100Q0VG06 881 aa19.48■□□□□ 0.71
SH3BP1-202ENST00000417536 TAZQ16635 292 aa19.48■□□□□ 0.71
SH3BP1-202ENST00000417536 TMEM132AQ24JP5 1023 aa19.48■□□□□ 0.71
SH3BP1-202ENST00000417536 RFWD3Q6PCD5 774 aa19.48■□□□□ 0.71
SH3BP1-202ENST00000417536 ZNF398Q8TD17 642 aa19.48■□□□□ 0.71
SH3BP1-202ENST00000417536 SAR1AQ9NR31 198 aa19.48■□□□□ 0.71
SH3BP1-202ENST00000417536 ARL8BQ9NVJ2 186 aa19.48■□□□□ 0.71
SH3BP1-202ENST00000417536 CPA4Q9UI42 421 aa19.48■□□□□ 0.71
SH3BP1-202ENST00000417536 KAT6AQ92794 2004 aa19.48■□□□□ 0.71
SH3BP1-202ENST00000417536 ABLIM1O14639 778 aa19.48■□□□□ 0.71
SH3BP1-202ENST00000417536 NEBLO76041 1014 aa19.48■□□□□ 0.71
SH3BP1-202ENST00000417536 HAUS5O94927 633 aa19.48■□□□□ 0.71
SH3BP1-202ENST00000417536 CST9Q5W186 159 aa19.48■□□□□ 0.71
SH3BP1-202ENST00000417536 DARS2Q6PI48 645 aaKnown RBP19.48■□□□□ 0.71
SH3BP1-202ENST00000417536 ARMCX2Q7L311 632 aa19.48■□□□□ 0.71
SH3BP1-202ENST00000417536 DPH6Q7L8W6 267 aa19.48■□□□□ 0.71
SH3BP1-202ENST00000417536 FNIP1Q8TF40 1166 aa19.48■□□□□ 0.71
SH3BP1-202ENST00000417536 PRR11Q96HE9 360 aaPredicted RBP19.48■□□□□ 0.71
SH3BP1-202ENST00000417536 ANKRD36BP1Q96IX9 119 aa19.48■□□□□ 0.71
SH3BP1-202ENST00000417536 FBXO6Q9NRD1 293 aaPredicted RBP19.48■□□□□ 0.71
SH3BP1-202ENST00000417536 HMGXB4Q9UGU5 601 aa19.48■□□□□ 0.71
SH3BP1-202ENST00000417536 USP18Q9UMW8 372 aa19.48■□□□□ 0.71
SH3BP1-202ENST00000417536 IQANK1A0A1B0GTG1 560 aa19.47■□□□□ 0.71
SH3BP1-202ENST00000417536 C11orf97A0A1B0GVM6 126 aaPredicted RBP19.47■□□□□ 0.71
SH3BP1-202ENST00000417536 C2orf71A6NGG8 1288 aa19.47■□□□□ 0.71
SH3BP1-202ENST00000417536 MED7O43513 233 aa19.47■□□□□ 0.71
SH3BP1-202ENST00000417536 RNF8O76064 485 aa19.47■□□□□ 0.71
SH3BP1-202ENST00000417536 SLC25A27O95847 323 aa19.47■□□□□ 0.71
SH3BP1-202ENST00000417536 INHBAP08476 426 aa19.47■□□□□ 0.71
SH3BP1-202ENST00000417536 PYGBP11216 843 aa19.47■□□□□ 0.71
SH3BP1-202ENST00000417536 ABL2P42684 1182 aa19.47■□□□□ 0.71
SH3BP1-202ENST00000417536 ARFIP2P53365 341 aa19.47■□□□□ 0.71
SH3BP1-202ENST00000417536 WASHC2DQ5SRD0 308 aa19.47■□□□□ 0.71
SH3BP1-202ENST00000417536 ZBTB8OSQ8IWT0 167 aa19.47■□□□□ 0.71
SH3BP1-202ENST00000417536 FAXDC2Q96IV6 333 aa19.47■□□□□ 0.71
SH3BP1-202ENST00000417536 TWNKQ96RR1 684 aa19.47■□□□□ 0.71
SH3BP1-202ENST00000417536 LHX5Q9H2C1 402 aa19.47■□□□□ 0.71
SH3BP1-202ENST00000417536 LNPEPQ9UIQ6 1025 aa19.47■□□□□ 0.71
SH3BP1-202ENST00000417536 LRRC37A2A6NM11 1700 aa19.47■□□□□ 0.71
SH3BP1-202ENST00000417536 PIK3R2O00459 728 aa19.47■□□□□ 0.71
SH3BP1-202ENST00000417536 B4GALT5O43286 388 aa19.47■□□□□ 0.71
SH3BP1-202ENST00000417536 BGNP21810 368 aa19.47■□□□□ 0.71
SH3BP1-202ENST00000417536 SERPINB3P29508 390 aa19.47■□□□□ 0.71
SH3BP1-202ENST00000417536 ZBTB16Q05516 673 aa19.47■□□□□ 0.71
SH3BP1-202ENST00000417536 SURF1Q15526 300 aa19.47■□□□□ 0.71
SH3BP1-202ENST00000417536 SPDYAQ5MJ70 313 aa19.47■□□□□ 0.71
SH3BP1-202ENST00000417536 SH3PXD2AQ5TCZ1 1133 aa19.47■□□□□ 0.71
SH3BP1-202ENST00000417536 FAM160B1Q5W0V3 765 aa19.47■□□□□ 0.71
SH3BP1-202ENST00000417536 TMEM192Q8IY95 271 aa19.47■□□□□ 0.71
SH3BP1-202ENST00000417536 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa19.47■□□□□ 0.71
SH3BP1-202ENST00000417536 LENG1Q96BZ8 264 aaPredicted RBP19.47■□□□□ 0.71
SH3BP1-202ENST00000417536 SPDL1Q96EA4 605 aa19.47■□□□□ 0.71
SH3BP1-202ENST00000417536 CADM1Q9BY67 442 aaKnown RBP19.47■□□□□ 0.71
SH3BP1-202ENST00000417536 SDCBP2Q9H190 292 aa19.47■□□□□ 0.71
SH3BP1-202ENST00000417536 DNAJC25-GNG10A0A024R161 153 aa19.46■□□□□ 0.71
SH3BP1-202ENST00000417536 TRUB2O95900 331 aaKnown RBP19.46■□□□□ 0.71
SH3BP1-202ENST00000417536 ZNF286BP0CG31 522 aa19.46■□□□□ 0.71
SH3BP1-202ENST00000417536 ADCYAP1R1P41586 468 aa19.46■□□□□ 0.71
SH3BP1-202ENST00000417536 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP19.46■□□□□ 0.71
SH3BP1-202ENST00000417536 ROR1Q01973 937 aa19.46■□□□□ 0.71
SH3BP1-202ENST00000417536 RAB6CQ53S08 254 aa19.46■□□□□ 0.71
SH3BP1-202ENST00000417536 CMASQ8NFW8 434 aaPredicted RBP19.46■□□□□ 0.71
SH3BP1-202ENST00000417536 TMEM120AQ9BXJ8 343 aa19.46■□□□□ 0.71
SH3BP1-202ENST00000417536 RAB6CQ9H0N0 254 aa19.46■□□□□ 0.71
SH3BP1-202ENST00000417536 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP19.46■□□□□ 0.71
SH3BP1-202ENST00000417536 HUNKP57058 714 aa19.46■□□□□ 0.71
SH3BP1-202ENST00000417536 ZNF667Q5HYK9 610 aa19.46■□□□□ 0.71
SH3BP1-202ENST00000417536 CFAP36Q96G28 342 aa19.46■□□□□ 0.71
SH3BP1-202ENST00000417536 PEBP4Q96S96 227 aa19.46■□□□□ 0.71
SH3BP1-202ENST00000417536 LBHD1Q9BQE6 289 aaPredicted RBP19.46■□□□□ 0.71
SH3BP1-202ENST00000417536 FAM155BO75949 473 aa19.46■□□□□ 0.71
SH3BP1-202ENST00000417536 CXCL8P10145 99 aa19.46■□□□□ 0.71
SH3BP1-202ENST00000417536 PTDSS1P48651 473 aaKnown RBP19.46■□□□□ 0.71
SH3BP1-202ENST00000417536 CDH6P55285 790 aa19.46■□□□□ 0.71
SH3BP1-202ENST00000417536 FAM102AQ5T9C2 384 aaPredicted RBP19.46■□□□□ 0.71
SH3BP1-202ENST00000417536 IER5Q5VY09 327 aa19.46■□□□□ 0.71
SH3BP1-202ENST00000417536 EEF1DP3Q658K8 133 aa19.46■□□□□ 0.71
SH3BP1-202ENST00000417536 METTL7BQ6UX53 244 aa19.46■□□□□ 0.71
SH3BP1-202ENST00000417536 APOPT1Q96IL0 206 aa19.46■□□□□ 0.71
SH3BP1-202ENST00000417536 NLRP4Q96MN2 994 aa19.46■□□□□ 0.71
SH3BP1-202ENST00000417536 GPR20Q99678 358 aa19.46■□□□□ 0.71
SH3BP1-202ENST00000417536 SMYD3Q9H7B4 428 aa19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 55.9 ms