RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000413164.6

SLC13A3-204, Transcript of solute carrier family 13 member 3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SLC13A3, Length 2,008 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC13A3-204ENST00000413164 PPIL6Q8IXY8 311 aa21.84■■□□□ 1.09
SLC13A3-204ENST00000413164 NME8Q8N427 588 aa21.84■■□□□ 1.09
SLC13A3-204ENST00000413164 NAT8LQ8N9F0 302 aa21.84■■□□□ 1.09
SLC13A3-204ENST00000413164 TEKT4Q8WW24 435 aa21.84■■□□□ 1.09
SLC13A3-204ENST00000413164 LPIN3Q9BQK8 851 aa21.84■■□□□ 1.09
SLC13A3-204ENST00000413164 KATNAL1Q9BW62 490 aa21.84■■□□□ 1.09
SLC13A3-204ENST00000413164 AP5M1Q9H0R1 490 aa21.84■■□□□ 1.09
SLC13A3-204ENST00000413164 KLK14Q9P0G3 267 aa21.84■■□□□ 1.09
SLC13A3-204ENST00000413164 IL4RP24394 825 aa21.83■■□□□ 1.09
SLC13A3-204ENST00000413164 PNPLA4P41247 253 aa21.83■■□□□ 1.09
SLC13A3-204ENST00000413164 SNX16P57768 344 aa21.83■■□□□ 1.09
SLC13A3-204ENST00000413164 PURAQ00577 322 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.09
SLC13A3-204ENST00000413164 SOX4Q06945 474 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.09
SLC13A3-204ENST00000413164 NOMO1Q15155 1222 aa21.83■■□□□ 1.09
SLC13A3-204ENST00000413164 CDO1Q16878 200 aa21.83■■□□□ 1.09
SLC13A3-204ENST00000413164 BOLA3Q53S33 107 aa21.83■■□□□ 1.09
SLC13A3-204ENST00000413164 MICALCLQ6ZW33 695 aa21.83■■□□□ 1.09
SLC13A3-204ENST00000413164 CENPUQ71F23 418 aa21.83■■□□□ 1.09
SLC13A3-204ENST00000413164 RIBC1Q8N443 379 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.09
SLC13A3-204ENST00000413164 ANKRD52Q8NB46 1076 aa21.83■■□□□ 1.09
SLC13A3-204ENST00000413164 SMG8Q8ND04 991 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.09
SLC13A3-204ENST00000413164 SPATA18Q8TC71 538 aa21.83■■□□□ 1.09
SLC13A3-204ENST00000413164 RSAD2Q8WXG1 361 aa21.83■■□□□ 1.09
SLC13A3-204ENST00000413164 APBA2Q99767 749 aa21.83■■□□□ 1.09
SLC13A3-204ENST00000413164 B3GNT5Q9BYG0 378 aa21.83■■□□□ 1.09
SLC13A3-204ENST00000413164 C17orf102A2RUQ5 167 aa21.82■■□□□ 1.08
SLC13A3-204ENST00000413164 MCF2LO15068 1137 aa21.82■■□□□ 1.08
SLC13A3-204ENST00000413164 RBP3P10745 1247 aa21.82■■□□□ 1.08
SLC13A3-204ENST00000413164 GCAP28676 217 aa21.82■■□□□ 1.08
SLC13A3-204ENST00000413164 ATP11AP98196 1134 aa21.82■■□□□ 1.08
SLC13A3-204ENST00000413164 PDK2Q15119 407 aa21.82■■□□□ 1.08
SLC13A3-204ENST00000413164 FAM47CQ5HY64 1035 aa21.82■■□□□ 1.08
SLC13A3-204ENST00000413164 VSIG1Q86XK7 387 aa21.82■■□□□ 1.08
SLC13A3-204ENST00000413164 ZNF560Q96MR9 790 aa21.82■■□□□ 1.08
SLC13A3-204ENST00000413164 RNF157Q96PX1 679 aa21.82■■□□□ 1.08
SLC13A3-204ENST00000413164 TBCBQ99426 244 aa21.82■■□□□ 1.08
SLC13A3-204ENST00000413164 PRMT1Q99873 361 aaKnown RBP21.82■■□□□ 1.08
SLC13A3-204ENST00000413164 C11orf84Q9BUA3 381 aaPredicted RBP21.82■■□□□ 1.08
SLC13A3-204ENST00000413164 IPPQ9Y573 584 aa21.82■■□□□ 1.08
SLC13A3-204ENST00000413164 TMEM120BA0PK00 339 aa21.82■■□□□ 1.08
SLC13A3-204ENST00000413164 XPOTO43592 962 aaKnown RBP21.82■■□□□ 1.08
SLC13A3-204ENST00000413164 LMO2P25791 158 aa21.82■■□□□ 1.08
SLC13A3-204ENST00000413164 SDC4P31431 198 aa21.82■■□□□ 1.08
SLC13A3-204ENST00000413164 TFDP2Q14188 446 aa21.82■■□□□ 1.08
SLC13A3-204ENST00000413164 FSCN1Q16658 493 aaKnown RBP21.82■■□□□ 1.08
SLC13A3-204ENST00000413164 ANKRD22Q5VYY1 191 aa21.82■■□□□ 1.08
SLC13A3-204ENST00000413164 ARCQ7LC44 396 aa21.82■■□□□ 1.08
SLC13A3-204ENST00000413164 TDRPQ86YL5 185 aa21.82■■□□□ 1.08
SLC13A3-204ENST00000413164 ARRDC4Q8NCT1 418 aa21.82■■□□□ 1.08
SLC13A3-204ENST00000413164 FAM172AQ8WUF8 416 aa21.82■■□□□ 1.08
SLC13A3-204ENST00000413164 MAML1Q92585 1016 aa21.82■■□□□ 1.08
SLC13A3-204ENST00000413164 GABRQQ9UN88 632 aa21.82■■□□□ 1.08
SLC13A3-204ENST00000413164 ACTL7BQ9Y614 415 aa21.82■■□□□ 1.08
SLC13A3-204ENST00000413164 DYNC1LI1Q9Y6G9 523 aaKnown RBP21.82■■□□□ 1.08
SLC13A3-204ENST00000413164 FOXO6A8MYZ6 492 aa21.81■■□□□ 1.08
SLC13A3-204ENST00000413164 GNL1P36915 607 aaPredicted RBP21.81■■□□□ 1.08
SLC13A3-204ENST00000413164 SCNN1AP37088 669 aa21.81■■□□□ 1.08
SLC13A3-204ENST00000413164 BCAT1P54687 386 aa21.81■■□□□ 1.08
SLC13A3-204ENST00000413164 BST2Q10589 180 aaKnown RBP21.81■■□□□ 1.08
SLC13A3-204ENST00000413164 HIF1AQ16665 826 aa21.81■■□□□ 1.08
SLC13A3-204ENST00000413164 ZNF618Q5T7W0 954 aa21.81■■□□□ 1.08
SLC13A3-204ENST00000413164 MAP7D3Q8IWC1 876 aa21.81■■□□□ 1.08
SLC13A3-204ENST00000413164 C10orf67Q8IYJ2 551 aa21.81■■□□□ 1.08
SLC13A3-204ENST00000413164 ZBED8Q8IZ13 594 aa21.81■■□□□ 1.08
SLC13A3-204ENST00000413164 FAM71DQ8N9W8 422 aa21.81■■□□□ 1.08
SLC13A3-204ENST00000413164 SEC16BQ96JE7 1060 aa21.81■■□□□ 1.08
SLC13A3-204ENST00000413164 BEGAINQ9BUH8 593 aa21.81■■□□□ 1.08
SLC13A3-204ENST00000413164 MAK16Q9BXY0 300 aaKnown RBP21.81■■□□□ 1.08
SLC13A3-204ENST00000413164 CYLDQ9NQC7 956 aa21.81■■□□□ 1.08
SLC13A3-204ENST00000413164 THSD7BQ9C0I4 1608 aa21.81■■□□□ 1.08
SLC13A3-204ENST00000413164 SMAPO00193 183 aa21.8■■□□□ 1.08
SLC13A3-204ENST00000413164 MDM4O15151 490 aa21.8■■□□□ 1.08
SLC13A3-204ENST00000413164 CCDC130P13994 396 aa21.8■■□□□ 1.08
SLC13A3-204ENST00000413164 STIP1P31948 543 aaKnown RBP21.8■■□□□ 1.08
SLC13A3-204ENST00000413164 MAGEA9P43362 315 aa21.8■■□□□ 1.08
SLC13A3-204ENST00000413164 PTPN9P43378 593 aa21.8■■□□□ 1.08
SLC13A3-204ENST00000413164 TAF6P49848 677 aa21.8■■□□□ 1.08
SLC13A3-204ENST00000413164 HDAC4P56524 1084 aa21.8■■□□□ 1.08
SLC13A3-204ENST00000413164 PDIA2Q13087 525 aaKnown RBP21.8■■□□□ 1.08
SLC13A3-204ENST00000413164 NPNTQ6UXI9 565 aa21.8■■□□□ 1.08
SLC13A3-204ENST00000413164 SLC26A9Q7LBE3 791 aa21.8■■□□□ 1.08
SLC13A3-204ENST00000413164 CPLX4Q7Z7G2 160 aa21.8■■□□□ 1.08
SLC13A3-204ENST00000413164 CD99L2Q8TCZ2 262 aa21.8■■□□□ 1.08
SLC13A3-204ENST00000413164 NCAPGQ9BPX3 1015 aa21.8■■□□□ 1.08
SLC13A3-204ENST00000413164 GOLGA2P5Q9HBQ8 144 aa21.8■■□□□ 1.08
SLC13A3-204ENST00000413164 NGRNQ9NPE2 291 aaKnown RBP21.8■■□□□ 1.08
SLC13A3-204ENST00000413164 E7ESA3 106 aa21.8■■□□□ 1.08
SLC13A3-204ENST00000413164 PDGFRBP09619 1106 aa21.8■■□□□ 1.08
SLC13A3-204ENST00000413164 GNAT1P11488 350 aa21.8■■□□□ 1.08
SLC13A3-204ENST00000413164 FLT3LGP49771 235 aa21.8■■□□□ 1.08
SLC13A3-204ENST00000413164 GAD2Q05329 585 aa21.8■■□□□ 1.08
SLC13A3-204ENST00000413164 MPP2Q14168 576 aa21.8■■□□□ 1.08
SLC13A3-204ENST00000413164 GKAP1Q5VSY0 366 aaPredicted RBP21.8■■□□□ 1.08
SLC13A3-204ENST00000413164 PQLC3Q8N755 202 aa21.8■■□□□ 1.08
SLC13A3-204ENST00000413164 C7orf31Q8N865 590 aa21.8■■□□□ 1.08
SLC13A3-204ENST00000413164 APPL2Q8NEU8 664 aa21.8■■□□□ 1.08
SLC13A3-204ENST00000413164 CENPIQ92674 756 aaPredicted RBP21.8■■□□□ 1.08
SLC13A3-204ENST00000413164 P3H4Q92791 437 aa21.8■■□□□ 1.08
SLC13A3-204ENST00000413164 PCDH18Q9HCL0 1135 aa21.8■■□□□ 1.08
SLC13A3-204ENST00000413164 TBK1Q9UHD2 729 aa21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.9 ms