RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000375175.1

TMOD1-202, Transcript of tropomodulin 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene TMOD1, Length 2,516 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD1-202ENST00000375175 EEF1DP3Q658K8 133 aa13.76□□□□□ -0.21
TMOD1-202ENST00000375175 TRIM74Q86UV6 250 aa13.76□□□□□ -0.21
TMOD1-202ENST00000375175 TRIM73Q86UV7 250 aa13.76□□□□□ -0.21
TMOD1-202ENST00000375175 FBXO41Q8TF61 875 aa13.76□□□□□ -0.21
TMOD1-202ENST00000375175 SLC16A10Q8TF71 515 aa13.76□□□□□ -0.21
TMOD1-202ENST00000375175 LHX5Q9H2C1 402 aa13.76□□□□□ -0.21
TMOD1-202ENST00000375175 RPF1Q9H9Y2 349 aaKnown RBP13.76□□□□□ -0.21
TMOD1-202ENST00000375175 XPO7Q9UIA9 1087 aaKnown RBP13.76□□□□□ -0.21
TMOD1-202ENST00000375175 EFR3BQ9Y2G0 817 aa13.76□□□□□ -0.21
TMOD1-202ENST00000375175 RPS6KL1Q9Y6S9 549 aa13.76□□□□□ -0.21
TMOD1-202ENST00000375175 TYROBPO43914 113 aa13.75□□□□□ -0.21
TMOD1-202ENST00000375175 ERBB2P04626 1255 aa13.75□□□□□ -0.21
TMOD1-202ENST00000375175 GSTA2P09210 222 aa13.75□□□□□ -0.21
TMOD1-202ENST00000375175 TGFB3P10600 412 aa13.75□□□□□ -0.21
TMOD1-202ENST00000375175 DYNC1I2Q13409 638 aaKnown RBP13.75□□□□□ -0.21
TMOD1-202ENST00000375175 TAF1BQ53T94 588 aaPredicted RBP13.75□□□□□ -0.21
TMOD1-202ENST00000375175 DSTYKQ6XUX3 929 aa13.75□□□□□ -0.21
TMOD1-202ENST00000375175 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa13.75□□□□□ -0.21
TMOD1-202ENST00000375175 RIOX2Q8IUF8 465 aa13.75□□□□□ -0.21
TMOD1-202ENST00000375175 TMEM192Q8IY95 271 aa13.75□□□□□ -0.21
TMOD1-202ENST00000375175 PDIK1LQ8N165 341 aa13.75□□□□□ -0.21
TMOD1-202ENST00000375175 NAT8LQ8N9F0 302 aa13.75□□□□□ -0.21
TMOD1-202ENST00000375175 ZNF75CPQ92670 426 aaPredicted RBP13.75□□□□□ -0.21
TMOD1-202ENST00000375175 PAFAH2Q99487 392 aa13.75□□□□□ -0.21
TMOD1-202ENST00000375175 KLF6Q99612 283 aaPredicted RBP13.75□□□□□ -0.21
TMOD1-202ENST00000375175 FRMD8P1Q9BZ68 369 aaPredicted RBP13.75□□□□□ -0.21
TMOD1-202ENST00000375175 ACKR2O00590 384 aa13.75□□□□□ -0.21
TMOD1-202ENST00000375175 B4GALT4O60513 344 aa13.75□□□□□ -0.21
TMOD1-202ENST00000375175 DCTN3O75935 186 aa13.75□□□□□ -0.21
TMOD1-202ENST00000375175 LMNAP02545 664 aaKnown RBP13.75□□□□□ -0.21
TMOD1-202ENST00000375175 SKIP12755 728 aa13.75□□□□□ -0.21
TMOD1-202ENST00000375175 MIPP30301 263 aa13.75□□□□□ -0.21
TMOD1-202ENST00000375175 GSTT1P30711 240 aa13.75□□□□□ -0.21
TMOD1-202ENST00000375175 SYCP2LQ5T4T6 812 aa13.75□□□□□ -0.21
TMOD1-202ENST00000375175 GADL1Q6ZQY3 521 aa13.75□□□□□ -0.21
TMOD1-202ENST00000375175 C4orf50Q6ZRC1 276 aa13.75□□□□□ -0.21
TMOD1-202ENST00000375175 XYLT1Q86Y38 959 aa13.75□□□□□ -0.21
TMOD1-202ENST00000375175 SH3TC2Q8TF17 1288 aa13.75□□□□□ -0.21
TMOD1-202ENST00000375175 FZD9O00144 591 aa13.74□□□□□ -0.21
TMOD1-202ENST00000375175 MCF2LO15068 1137 aa13.74□□□□□ -0.21
TMOD1-202ENST00000375175 ZWINTO95229 277 aa13.74□□□□□ -0.21
TMOD1-202ENST00000375175 ARIH2O95376 493 aa13.74□□□□□ -0.21
TMOD1-202ENST00000375175 RBP3P10745 1247 aa13.74□□□□□ -0.21
TMOD1-202ENST00000375175 EDNRBP24530 442 aa13.74□□□□□ -0.21
TMOD1-202ENST00000375175 NRLP54845 237 aa13.74□□□□□ -0.21
TMOD1-202ENST00000375175 KLHL38Q2WGJ6 581 aa13.74□□□□□ -0.21
TMOD1-202ENST00000375175 SH3D19Q5HYK7 790 aa13.74□□□□□ -0.21
TMOD1-202ENST00000375175 DARS2Q6PI48 645 aaKnown RBP13.74□□□□□ -0.21
TMOD1-202ENST00000375175 RGS9BPQ6ZS82 235 aa13.74□□□□□ -0.21
TMOD1-202ENST00000375175 KLHL23Q8NBE8 558 aa13.74□□□□□ -0.21
TMOD1-202ENST00000375175 C10orf82Q8WW14 230 aa13.74□□□□□ -0.21
TMOD1-202ENST00000375175 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa13.74□□□□□ -0.21
TMOD1-202ENST00000375175 GPR20Q99678 358 aa13.74□□□□□ -0.21
TMOD1-202ENST00000375175 SPATC1LQ9H0A9 340 aa13.74□□□□□ -0.21
TMOD1-202ENST00000375175 SDCBP2Q9H190 292 aa13.74□□□□□ -0.21
TMOD1-202ENST00000375175 SMYD3Q9H7B4 428 aa13.74□□□□□ -0.21
TMOD1-202ENST00000375175 CHMP2BQ9UQN3 213 aa13.74□□□□□ -0.21
TMOD1-202ENST00000375175 M0QYV0 167 aa13.74□□□□□ -0.21
TMOD1-202ENST00000375175 PIK3R2O00459 728 aa13.74□□□□□ -0.21
TMOD1-202ENST00000375175 GAS2O43903 313 aaKnown RBP13.74□□□□□ -0.21
TMOD1-202ENST00000375175 TMEM63AO94886 807 aa13.74□□□□□ -0.21
TMOD1-202ENST00000375175 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP13.74□□□□□ -0.21
TMOD1-202ENST00000375175 PGK2P07205 417 aa13.74□□□□□ -0.21
TMOD1-202ENST00000375175 ADRA1DP25100 572 aa13.74□□□□□ -0.21
TMOD1-202ENST00000375175 PTPN4P29074 926 aa13.74□□□□□ -0.21
TMOD1-202ENST00000375175 RASSF2P50749 326 aa13.74□□□□□ -0.21
TMOD1-202ENST00000375175 CLCN3P51790 818 aa13.74□□□□□ -0.21
TMOD1-202ENST00000375175 RASA2Q15283 850 aa13.74□□□□□ -0.21
TMOD1-202ENST00000375175 ADGRD1Q6QNK2 874 aa13.74□□□□□ -0.21
TMOD1-202ENST00000375175 LRRC74BQ6ZQY2 392 aa13.74□□□□□ -0.21
TMOD1-202ENST00000375175 EXOC8Q8IYI6 725 aa13.74□□□□□ -0.21
TMOD1-202ENST00000375175 SPATA18Q8TC71 538 aa13.74□□□□□ -0.21
TMOD1-202ENST00000375175 FNIP1Q8TF40 1166 aa13.74□□□□□ -0.21
TMOD1-202ENST00000375175 HEXIM2Q96MH2 286 aaKnown RBP13.74□□□□□ -0.21
TMOD1-202ENST00000375175 GBP5Q96PP8 586 aa13.74□□□□□ -0.21
TMOD1-202ENST00000375175 TWNKQ96RR1 684 aa13.74□□□□□ -0.21
TMOD1-202ENST00000375175 DDX50Q9BQ39 737 aaKnown RBP13.74□□□□□ -0.21
TMOD1-202ENST00000375175 ADPGKQ9BRR6 497 aa13.74□□□□□ -0.21
TMOD1-202ENST00000375175 C12orf65Q9H3J6 166 aaKnown RBP13.74□□□□□ -0.21
TMOD1-202ENST00000375175 CHCHD3Q9NX63 227 aaKnown RBP13.74□□□□□ -0.21
TMOD1-202ENST00000375175 HMGXB4Q9UGU5 601 aa13.74□□□□□ -0.21
TMOD1-202ENST00000375175 USP18Q9UMW8 372 aa13.74□□□□□ -0.21
TMOD1-202ENST00000375175 NUMBLQ9Y6R0 609 aa13.74□□□□□ -0.21
TMOD1-202ENST00000375175 ZBTB42B2RXF5 422 aa13.73□□□□□ -0.21
TMOD1-202ENST00000375175 TRAFD1O14545 582 aaPredicted RBP13.73□□□□□ -0.21
TMOD1-202ENST00000375175 CSDE1O75534 798 aaKnown RBP13.73□□□□□ -0.21
TMOD1-202ENST00000375175 MICAL2O94851 1124 aa13.73□□□□□ -0.21
TMOD1-202ENST00000375175 TRUB2O95900 331 aaKnown RBP13.73□□□□□ -0.21
TMOD1-202ENST00000375175 ITGB3P05106 788 aa13.73□□□□□ -0.21
TMOD1-202ENST00000375175 NFICP08651 508 aa13.73□□□□□ -0.21
TMOD1-202ENST00000375175 UBTFL6P0CB48 400 aaPredicted RBP13.73□□□□□ -0.21
TMOD1-202ENST00000375175 PROZP22891 400 aa13.73□□□□□ -0.21
TMOD1-202ENST00000375175 OCRLQ01968 901 aa13.73□□□□□ -0.21
TMOD1-202ENST00000375175 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP13.73□□□□□ -0.21
TMOD1-202ENST00000375175 DPYSL3Q14195 570 aa13.73□□□□□ -0.21
TMOD1-202ENST00000375175 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP13.73□□□□□ -0.21
TMOD1-202ENST00000375175 FAM182AQ5T1J6 154 aa13.73□□□□□ -0.21
TMOD1-202ENST00000375175 FAM102AQ5T9C2 384 aaPredicted RBP13.73□□□□□ -0.21
TMOD1-202ENST00000375175 FYB2Q5VWT5 728 aa13.73□□□□□ -0.21
TMOD1-202ENST00000375175 EFCAB12Q6NXP0 572 aa13.73□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.1 ms